Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467196
- Subject:
- XM_006505967.2
- Aligned Length:
- 3414
- Identities:
- 2712
- Gaps:
- 384
Alignment
Query 1 ---------------------------------------ATGAAGGTGAAGGAGGAGAAGGCTGGGGTAGGAAA 35
|||||||||.|.|||||||||||||||||...|||
Sbjct 1 ATGGAACTCTCTCATGGCTGTCACAGCATATCAAGGGTGATGAAGGTGGACGAGGAGAAGGCTGGGGTCAAAAA 74
Query 36 GCTGGACCACACTAACCACAGGAGG--------------AGATTTCC--------------------------- 68
||||||||.|||.|.|.|||.|||| ||||||||
Sbjct 75 GCTGGACCCCACAAGCTACAAGAGGAGACAGCCAGAACAAGATTTCCCTTCAATTCATATTGGGTTTCCAGTTC 148
Query 69 -------------------------------------------------------------------------- 68
Sbjct 149 CCAGTTACTCTCAAAGAAAAAGCGACTCAAAGGGACATCTTTCAGGCCTGCAAAAAGTCCAGTGGTCCCTGAAA 222
Query 69 ----------------------------------GGATCAG--------------------------------- 75
|||||||
Sbjct 223 CCAGGCAAGCCTCAGCAGGAGCTGGCTGGCCCAGGGATCAGGGCCAGCAGCCAGGGAGGTGCCGTGGATTTTAC 296
Query 76 --AAAG-----GGTCCCCAGCTGCTGAGCAGCTCCAGGACATCCTGGGGGAGGAAGATGAGGCTCCCAACCCCA 142
|||| ||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAAAAGGACTCGGTCTCCAGCTGCTGAGCAGCTGCAGGACATCCTGGGGGAGGAAGATGAGGCTCCCAACCCCA 370
Query 143 CCCTCTTTACAGAGATGGATACTCTGCAGCATGACGGAGACCAGATGGAGTGGAAGGAGTCAGCCAGGTGGATA 216
|||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCCTCTTCACAGAGATGGACACTCTACAGCATGATGGGGACCAGATGGAGTGGAAGGAGTCAGCCAGGTGGATA 444
Query 217 AAGTTTGAAGAAAAGGTAGAGGAAGGCGGCGAACGCTGGAGCAAGCCCCACGTGTCCACACTATCCCTGCACAG 290
||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 445 AAATTTGAAGAAAAGGTAGAGGAAGGAGGAGAACGATGGAGCAAGCCCCATGTGTCCACGCTGTCCCTGCACAG 518
Query 291 CCTCTTCGAGCTCCGTACCTGCCTGCAGACGGGGACGGTGCTGCTGGATTTGGACAGTGGCTCCTTACCACAGA 364
.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||.|||||||..|||||.|||||||||
Sbjct 519 TCTCTTTGAGCTCCGCACCTGCCTGCAGACAGGGACAGTGCTACTGGATCTGGACAGCTGCTCCCTACCACAGA 592
Query 365 TCATAGATGATGTCATTGAGAAGCAGATTGAGGATGGTCTCCTGCGGCCAGAGCTCCGGGAGAGGGTCAGTTAC 438
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 593 TCATAGATGATGTCATTGAGAAGCAGATAGAGGATGGACTTCTGCGACCTGAGCTCCGGGAGAGGGTCAGCTAC 666
Query 439 GTCCTCCTGAGGAGGCACCGCCACCAAACCAAGAAGCCCATCCACCGCTCCTTAGCTGACATTGGGAAGTCAGT 512
||.||||||||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||.|||||.||||||||.||
Sbjct 667 GTGCTCCTGAGGAAGCATCGTCACCAAACCAAGAAGCCCATCCACCGTTCCCTTGCAGACATCGGGAAGTCGGT 740
Query 513 CTCCACCACAAATCGCAGTCCTGCCCGGAGC-CCTGGTGCTGGCCCGAGTCTACACCACTCCACGGAAGACCTG 585
.|||||.||.||.||.||..||||||||||| ||| ..||.|||||.|.|||.||||.||||||.||.||||||
Sbjct 741 TTCCACGACGAACCGAAGCTCTGCCCGGAGCTCCT-CAGCAGGCCCAACTCTGCACCGCTCCACTGAGGACCTG 813
Query 586 CGGATGCGGCAGAGTGCAAATTACGGACGTCTGTGTCATGCCCAGAGCAGAAGCATGAATGACATTTCTCTCAC 659
.||||.||.||.||..|.|..||.||.|.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||..||
Sbjct 814 AGGATTCGACAAAGCACCAGCTATGGTCATCTGTGTCATGCCCAGAGTAGAAGCATGAATGACATCTCTCATAC 887
Query 660 CCCAAACACAGACCAGCGGAAAAACAAATTCATGAAGAAGATCCCCAAGGACTCAGAAGCGTCCAACGTGCTCG 733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 888 CCCAAACACAGACCAGCGGAAAAACAAATTCATGAAGAAGATTCCCAAGGACTCAGAAGCTTCCAACGTGCTCG 961
Query 734 TGGGCGAGGTGGACTTCCTAGACCAGCCATTCATCGCGTTCGTGCGCCTCATCCAGTCGGCCATGCTGGGAGGA 807
|||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||..|||||||.||||||||||||||.
Sbjct 962 TGGGCGAGGTGGACTTCCTGGACCAGCCATTCATTGCATTTGTTCGTCTTGTCCAGTCTGCCATGCTGGGAGGG 1035
Query 808 GTGACCGAGGTGCCTGTCCCCACCAGATTTCTGTTTATACTACTGGGACCTTCTGGGAGAGCAAAATCCTACAA 881
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1036 GTGACAGAGGTGCCTGTCCCCACCAGATTTCTGTTCATACTATTAGGACCTTCCGGGAGAGCAAAGTCCTATAA 1109
Query 882 TGAAATTGGCCGTGCCATTGCAACCCTCATGGTAGATGATCTCTTCAGTGACGTGGCCTACAAAGCCCGCAATC 955
|||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||.|
Sbjct 1110 TGAGATTGGCCGAGCCATCGCAACCCTCATGGTGGATGATCTATTCAGCGATGTGGCTTATAAAGCTCGGAACC 1183
Query 956 GGGAAGATCTGATCGCAGGAATTGATGAATTTCTGGATGAGGTCATCGTCCTTCCTCCTGGAGAATGGGACCCA 1029
|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1184 GAGAAGATCTGATCGCAGGGATTGATGAATTTCTAGACGAGGTCATTGTCCTTCCCCCTGGAGAGTGGGACCCA 1257
Query 1030 AATATCCGGATTGAGCCCCCCAAGAAGGTGCCCTCTGCTGACAAGAGGAAATCTGTGTTCTCCCTAGCAGAGCT 1103
||.|||.|.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||.
Sbjct 1258 AACATCAGAATTGAGCCACCCAAGAAAGTTCCCTCAGCTGACAAGAGGAAATCTGTGTTCTCTCTGGCAGAGCC 1331
Query 1104 GGGCCAGATGAATGGCTCTGTGGGAGGAGGCGGCGGAG-CTC--CTGGAGGAGGCAATGGAGGTGGTGGTGGTG 1174
||||||||||||||||||||||||.||| ||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 1332 GGGCCAGATGAATGGCTCTGTGGGCGGA---GGCGGAGCCTCGGCTGGAGGAGGC------------------- 1383
Query 1175 GTGGCAGTGGCGGCGGGGCTGGCAGTGGCGGGGCCGGCGGAACAAGCAGCGGGGATGATGGAGAGATGCCAGCC 1248
|||||||||||.||||||||..|..|||||||.||||||....||||.||.||.||.|..|||||||||||.
Sbjct 1384 --GGCAGTGGCGGAGGGGCTGGAGGCAGCGGGGCTGGCGGAGTGGGCAGTGGCGACGAAGCTGAGATGCCAGCT 1455
Query 1249 ATGCATGAAATCGGGGAGGAACTTATCTGGACAGGAAGGTTCTTCGGTGGCCTGTGTCTGGATATCAAGAGGAA 1322
|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1456 ATGCACGAAATCGGGGAGGAGCTGATCTGGACCGGAAGGTTCTTTGGAGGACTGTGTCTGGATGTCAAGAGGAA 1529
Query 1323 GTTGCCCTGGTTCCCAAGTGACTTCTATGATGGCTTCCACATTCAGTCCATCTCTGCCATCCTATTCATCTACC 1396
|.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||..|.||.||||||||||
Sbjct 1530 GCTGCCCTGGTTCCCAAGCGACTTCTATGATGGCTTCCACCTCCAGTCCATCTCTGCTGTTCTGTTCATCTACC 1603
Query 1397 TCGGCTGTATCACCAACGCGATCACCTTTGGTGGGCTTCTGGGGGATGCCACCGACAATTATCAGGGAGTGATG 1470
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||
Sbjct 1604 TCGGCTGTATTACCAACGCGATCACCTTTGGTGGGCTTCTGGGGGATGCCACAGACAACTACCAGGGAGTAATG 1677
Query 1471 GAGAGCTTCCTGGGCACTGCCATGGCTGGCTCCTTGTTCTGCCTCTTCTCGGGACAGCCTCTCATCATTCTCAG 1544
||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1678 GAGAGCTTCCTGGGCACTGCCATGGCTGGCAGCTTGTTCTGCCTCTTCTCGGGGCAGCCTCTTATCATCCTCAG 1751
Query 1545 CAGCACGGGGCCCATCCTCATCTTTGAGAAGCTCCTCTTCGACTTCAGCAAAGGCAATGGCCTGGACTACATGG 1618
||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||||||||||||||||||||
Sbjct 1752 CAGCACAGGACCCATCCTCATCTTTGAGAAGCTCCTCTTTGACTTCAGCAAGGCCAATGGCCTGGACTACATGG 1825
Query 1619 AGTTCCGCCTCTGGATTGGCCTACACTCAGCTGTCCAGTGCCTTATCCTAGTGGCCACAGATGCCAGCTTTATC 1692
|||||||||||||||||||.||.||||||||..|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1826 AGTTCCGCCTCTGGATTGGTCTTCACTCAGCCATCCAGTGCCTTATTCTGGTGGCCACAGATGCCAGCTTTATC 1899
Query 1693 ATCAAATATATCACCCGCTTCACCGAGGAGGGCTTCTCCACCCTTATCAGCTTCATCTTCATCTACGATGCCAT 1766
|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1900 ATCAAGTATATCACCCGCTTCACCGAAGAGGGCTTCTCCACCCTCATCAGCTTCATCTTCATCTACGACGCCAT 1973
Query 1767 CAAGAAGATGATCGGTGCCTTCAAGTACTACCCTATCAATATGGACTTCAAGCCAAACTTCATCACTACCTACA 1840
|||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|.||||||||||||..||||||||||.|||||||
Sbjct 1974 CAAAAAGATGATTGGTGCCTTCAAATACTATCCCATTAACACGGACTTCAAGCCTGACTTCATCACCACCTACA 2047
Query 1841 AGTGCGAGTGTGTCGCCCCTGACACAGTGAATACAACCGTGTTCAATGCTTCAGCCCCATTGGCACCAGACACC 1914
|.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||..|.|||||||.|||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 2048 AATGCGAGTGCGTCGCTCCTGACACAGTGAACACAACCACGGTCAATGCCTCAGCCCCACTGGCACCAAACACC 2121
Query 1915 AACGCTTCTCTGTACAACCTCCTTAACCTCACAGCGTTGGACTGGTCCCTGCTGAGCAAGAAGGAGTGTCTGAG 1988
|||.|.||||||||||.||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2122 AACACGTCTCTGTACACCCCCCTTAACCTCACAGCGCTGGACTGGTCCCTGCTGAGCAAGAAGGAGTGCCTGAG 2195
Query 1989 CTACGGCGGGCGCCTGCTTGGGAATTCCTGCAAGTTTATCCCAGACCTGGCGCTCATGTCCTTCATCCTTTTCT 2062
||||||||||||||||||.||||..||||||.||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2196 CTACGGCGGGCGCCTGCTCGGGAGCTCCTGCCAGTTCGTCCCAGACCTGGCGCTCATGTCCTTCATCCTTTTCT 2269
Query 2063 TTGGGACATACTCCATGACCCTGACCCTGAAGAAGTTCAAATTCAGCCGCTATTTTCCTACCAAG--------- 2127
|||||||.||||||||||||.||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2270 TTGGGACTTACTCCATGACCTTGACTCTGAAGAAATTCAAGTTCAGCCGCTATTTTCCCACCAAGGTCCGGACC 2343
Query 2128 -------------------------------------------------------------------------- 2127
Sbjct 2344 CTGGTGGCTGACTTCTCCATTGTATTCTCCATCCTGCTTTTCTGTGGAATCGATGCCTGTTTTGGCCTGCAGAC 2417
Query 2128 -CCAACGC------------------------------GGCCTGACCGAGGCTGGTTCGTGGCCCCCTTTGGGA 2170
||||.|| ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2418 CCCAAAGCTGCACGTGCCTAGTGTCATTAAGCCCACAAGGCCCGACCGAGGCTGGTTCGTTGCCCCCTTTGGGA 2491
Query 2171 AGAACCCGTGGTGGGTATACCCAGCAAGCATCCTGCCCGCCCTGCTGGTGACCATCCTGATCTTCATGGACCAG 2244
|||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2492 AGAACCCTTGGTGGGTGTACCCTGCCAGCATCCTGCCGGCCCTGCTGGTGACCATCCTGATCTTCATGGACCAG 2565
Query 2245 CAGATCACTGCCGTCATTGTCAACCGGAAGGAGAACAAACTGAAGAAGGCTGCCGGCTACCATCTGGACCTGTT 2318
||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2566 CAGATCACCGCAGTCATTGTCAACCGGAAGGAGAACAAGCTGAGGAAGGCCGCTGGCTACCATCTGGACCTGTT 2639
Query 2319 CTGGGTGGGCATCCTCATGGCTTTGTGCTCCTTTATGGGGCTCCCCTGGTACGTGGCTGCCACGGTCATCTCCA 2392
||||||.|||||||||||||||.||||||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2640 CTGGGTAGGCATCCTCATGGCTCTGTGCTCCTTCACCGGGCTCCCCTGGTACGTGGCTGCCACGGTCATCTCCA 2713
Query 2393 TCGCCCACATCGACAGCCTCAAGATGGAGACAGAGACCAGTGCCCCTGGGGAGCAGCCCCAGTTTCTGGGAGTC 2466
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 2714 TCGCCCACATCGACAGCCTCAAGATGGAGACGGAGACCAGTGCCCCGGGGGAACAGCCCCAGTTCCTGGGGGTC 2787
Query 2467 AGGGAACAGAGAGTAACCGGCATCATCGTCTTCATCCTGACGGGAATCTCTGTCTTCCTGGCTCCCATCCTAAA 2540
|||||.||||||||.||.||..||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 2788 AGGGAGCAGAGAGTTACTGGAGTCATGGTCTTCATCCTGACAGGCATCTCCGTCTTCCTGGCTCCTATCCTGAA 2861
Query 2541 GTGTATCCCCCTGCCGGTGCTGTACGGAGTCTTCCTCTACATGGGCGTGGCCTCCCTGAATGGCATCCAGTTCT 2614
||..||||||.||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2862 GTACATCCCCATGCCAGTGCTCTATGGAGTCTTCCTCTACATGGGTGTGGCCTCCCTGAATGGCATCCAGTTCT 2935
Query 2615 GGGAACGCTGCAAGCTCTTCCTGATGCCAGCCAAGCACCAGCCGGACCATGCCTTCCTGCGGCACGTGCCGCTG 2688
||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.
Sbjct 2936 GGGAACGCTGTAAGCTTTTCCTCATGCCAGCCAAGCACCAGCCGGACCACGCTTTCCTGCGCCACGTGCCCCTT 3009
Query 2689 CGCCGGATCCACCTCTTCACCCTGGTGCAGATCCTCTGCCTGGCGGTGCTCTGGATCCTCAAATCCACGGTGGC 2762
|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.||.||..||||
Sbjct 3010 CGCCGCATTCACCTGTTCACCCTGGTGCAGATCCTCTGCCTGGCCCTGCTCTGGATCCTTAAGTCAACCATGGC 3083
Query 2763 TGCCATCATCTTCCCGGTCATGATCCTGGGCCTCATCATCGTTCGAAGGCTTCTGGATTTCATCTTTTCCCAGC 2836
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||
Sbjct 3084 TGCCATCATCTTCCCGGTCATGATCCTGGGCCTTATCATTGTTCGAAGGCTCCTGGACTTGATTTTCTCCCAGC 3157
Query 2837 ACGACCTGGCCTGGATTGACAACATCCTCCCAGAGAAGGAAAAAAAGGAGACAGACAAGAAGAGGAAGAGAAAA 2910
|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||..
Sbjct 3158 ATGACCTGGCCTGGATTGACAATATCCTCCCAGAGAAGGACAAAAAGGAGACAGACAAGAAGAAGAAGAGAAGG 3231
Query 2911 AAAGGGGCCCACGAG--GACTGTGATGAGGA---------GCCCCAGTTCCCTCCTCCCTCGGTTATAAAGATT 2973
||||.||.|||.||| |.|.|.|| |||| |||||||||||.|||||||||.|||.|||||||.
Sbjct 3232 AAAGAGGTCCATGAGACGGCAGAGA--AGGAGGTGGCAATGCCCCAGTTCCTTCCTCCCTCAGTTGTAAAGATC 3303
Query 2974 CCCATGGAAAGTGTCCAATCAGATCCCCAAAACGGTATCCACTGCATTGCCAGAAAAAGATCTTCCAGTTGGAG 3047
|||||||||.||.|||.|||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3304 CCCATGGAAGGTATCCCATCTGATCCCCAAAACGGTATCCACTGTGTTGCCAGAAAAAGATCTTCCAGTTGGAG 3377
Query 3048 TTACTCACTC 3057
||||||.|||
Sbjct 3378 TTACTCTCTC 3387