Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467259
• Subject: NM_175362.2
• Aligned Length: 3468
• Identities: 2990
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  ---------------------ATGGATGACTGCATGGAGACGCTGGTGCATGAAGAGGACGCCTTGTGGGAGAA  53
                                 ||||||||||.|||||||||||||..|.||||||||||.|||.|.|||||.||
Sbjct    1  ATGCCAGGAGGAGGGCCAGCTATGGATGACTACATGGAGACGCTGAAGGATGAAGAGGAGGCCCTATGGGATAA  74

Query   54  TGTGGAGTGTAACCGGCACATGCTCAGCCGCTATATCAACCCTGCCAAGCTCACGCCCTACCTGCGTCAGTGTA  127
            .|||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct   75  CGTGGAATGCAACCGGCACATGCTGAGCCGTTACATCAACCCCGCCAAGCTCACCCCCTACCTGCGCCAGTGCA  148

Query  128  AGGTCATTGATGAGCAGGATGAAGATGAAGTGCTTAATGCCCCTATGCTGCCATCCAAGATCAACCGAGCAGGC  201
            |||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  AGGTCATCGATGAGCAAGATGAAGACGAGGTGCTCAATGCGCCCATGCTGCCGTCCAAGATCAACCGTGCAGGC  222

Query  202  CGGCTGTTGGACATTCTACATACCAAGGGGCAAAGGGGCTATGTGGTCTTCTTGGAGAGCCTAGAATTTTATTA  275
            ||..|||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.||.|||||.||
Sbjct  223  CGATTGTTGGACATTCTTCACACCAAGGGACAAAGGGGCTATGTGGTCTTCCTGGAGAGCCTGGAGTTTTACTA  296

Query  276  CCCAGAACTGTACAAACTGGTGACTGGGAAAGAGCCCACTCGGAGATTCTCCACCATTGTGGTGGAGGAAGGCC  349
            |||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCAGAACTTTACAAACTGGTGACTGGAAAGGAACCCACCCGGAGATTCTCCACCATTGTGGTGGAGGAAGGCC  370

Query  350  ACGAGGGCCTCACGCACTTCCTGATGAACGAGGTCATCAAGCTGCAGCAGCAGATGAAGGCCAAGGACCTGCAA  423
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||.|||||||||||.||.
Sbjct  371  ATGAGGGCCTCACACACTTCCTGATGAACGAGGTCATCAAACTGCAGCAGCAAGTGAAAGCCAAGGACCTTCAG  444

Query  424  CGCTGCGAGCTGCTGGCCAGGTTGCGGCAGCTGGAGGATGAGAAGAAGCAGATGACGCTGACGCGCGTGGAGCT  497
            |||||.|||||||||||||.||..|||||.|||||||||||||||||||||.|||..||||..||.||||||||
Sbjct  445  CGCTGTGAGCTGCTGGCCAAGTCCCGGCAACTGGAGGATGAGAAGAAGCAGCTGAGCCTGATACGGGTGGAGCT  518

Query  498  GCTAACCTTCCAGGAGCGGTACTACAAGATGAAGGAAGAGCGGGACAGCTACAATGACGAGCTGGTCAAGGTGA  571
            |||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  519  GCTGACCTTCCAGGAGCGATACTACAAGATGAAGGAGGAGCGGGACAGCTACAATGACGAGCTCGTCAAGGTCA  592

Query  572  AGGACGACAACTACAACTTAGCCATGCGCTACGCACAGCTCAGTGAGGAGAAGAACATGGCGGTCATGAGGAGC  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  593  AGGACGACAACTACAACTTAGCCATGCGCTACGCCCAGCTCAGTGAGGAGAAAAACATGGCGGTGATGAGGAGC  666

Query  646  CGAGACCTCCAACTCGAGATCGATCAGCTAAAGCACCGGTTGAATAAGATGGAGGAGGAATGTAAGCTGGAGAG  719
            ||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||..||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  CGCGACCTCCAACTCGAGATCGACCAGCTCAAACACCGACTGAACAAGATGGAGGAGGAATGCAAGCTGGAGAG  740

Query  720  AAATCAGTCTCTAAAACTGAAGAATGACATTGAAAATCGGCCCAAGAAGGAGCAGGTTCTGGAACTGGAGCGGG  793
            |||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||||.||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  741  AAATCAGTCCCTCAAGCTCAAGAATGACATCGAGAACCGGCCCAGGAAGGAGCAGGTCCTGGAGCTGGAGCGGG  814

Query  794  AGAATGAAATGCTGAAGACCAAAAACCAGGAGCTGCAGTCCATCATCCAGGCCGGGAAGCGCAGCCTGCCAGAC  867
            |||||||.|||||||||||.||||..||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  815  AGAATGAGATGCTGAAGACGAAAATTCAGGAGCTGCAGTCCATCATCCAGGCTGGCAAGCGCAGCCTCCCTGAC  888

Query  868  TCAGACAAGGCCATCCTGGACATCTTGGAACACGACCGCAAGGAGGCCCTGGAGGACAGGCAGGAGCTGGTCAA  941
            |||||||||||||||.||||||||.|||||||.|||||.||||||||.||.||||||.|||||||.||||||||
Sbjct  889  TCAGACAAGGCCATCTTGGACATCCTGGAACATGACCGGAAGGAGGCGCTAGAGGACCGGCAGGAACTGGTCAA  962

Query  942  CAGGATCTACAACCTGCAGGAGGAGGCCCGCCAGGCAGAGGAGCTGCGAGACAAGTACCTGGAGGAGAAGGAGG  1015
            ||..||.||||||||.||.|||||.|.|||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  963  CAAAATTTACAACCTACAAGAGGAAGTCCGCCAGGCGGAGGAGCTGCGGGATAAGTACCTGGAGGAGAAGGAAG  1036

Query 1016  ACCTGGAGCTCAAGTGCTCGACCCTGGGAAAGGACTGTGAAATGTACAAGCACCGCATGAACACGGTCATGCTG  1089
            |||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1037  ACCTGGAACTCAAGTGTTCAACCCTGGGGAAGGACTGTGAAATGTACAAGCACCGCATGAACACAGTTATGCTG  1110

Query 1090  CAGCTGGAGGAGGTGGAGCGGGAGCGGGACCAGGCCTTCCACTCCCGAGATGAAGCTCAGACACAGTACTCGCA  1163
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 1111  CAGCTGGAGGAGGTGGAGCGGGAGCGGGACCAGGCCTTCCACTCCCGAGATGAGGCACAGACACAGTACTCACA  1184

Query 1164  GTGCTTAATCGAAAAGGACAAGTACAGGAAGCAGATCCGCGAGCTGGAGGAGAAGAACGATGAGATGAGGATCG  1237
            ||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||.|
Sbjct 1185  GTGCTTAATCGAGAAGGACAAGTACCGGAAGCAGATCCGGGAGCTGGAGGAGAAGAACGATGAGATGCGTATTG  1258

Query 1238  AGATGGTGCGGCGGGAGGCCTGCATCGTCAACCTGGAGAGCAAGCTGCGGCGCCTCTCCAAGGACAGCAACAAC  1311
            ||||||||.||.||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||.|..||.|
Sbjct 1259  AGATGGTGAGGAGGGAGGCCTGTATTGTCAACCTGGAAAGCAAGCTCCGGCGCCTGTCCAAGGACAACGGCAGC  1332

Query 1312  CTGGACCAGAGTCTGCCCAGGAACCTGCCAGTAACCATCATCTCTCAGGACTTTGGGGATGCCAGCCCCAGGAC  1385
            ||.||||||||||||||.||..||||.||||..|||||||||||.|||.||.||||.||..|||||||||||||
Sbjct 1333  CTCGACCAGAGTCTGCCTAGACACCTTCCAGCCACCATCATCTCACAGAACCTTGGAGACACCAGCCCCAGGAC  1406

Query 1386  CAATGGTCAAGAAGCTGACGATTCTTCCACCTCGGAGGAGTCACCTGAAGACAGCAAGTACTTCCTGCCCTACC  1459
            ||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1407  CAATGGCCAGGAAGCTGATGATTCTTCAACCTCAGAAGAGTCTCCCGAAGACAGCAAGTACTTTCTGCCTTACC  1480

Query 1460  ATCCGCCCCAGCGCAGGATGAACCTGAAGGGCATCCAGCTGCAGAGAGCCAAATCCCCCATCAGCCTGAAGCGA  1533
            |.||.||||.||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|
Sbjct 1481  ACCCACCCCGGCGCCGGATGAACCTAAAGGGCATCCAGCTGCAGAGAGCCAAATCCCCCATCAGCATGAAGCAA  1554

Query 1534  ACATCAGATTTTCAAGCCAAGGGGCACGAGGAAGAAGGCACGGATGCCAGCCCTAGCTCCTGCGGATCTCTGCC  1607
            .||||.||.|||||||.||||||||||||.||.||...|||.||.|.||||||.||.||||.|.|.||.|||||
Sbjct 1555  GCATCTGAGTTTCAAGTCAAGGGGCACGAAGAGGATTTCACAGACGGCAGCCCCAGTTCCTCCCGCTCGCTGCC  1628

Query 1608  CATCACCAACTCCTTCACCAAGATGCAGCCCCCCCGGAGCCGCAGCAGCATCATGTCAATCACCGCCGAGCCCC  1681
            ..||||||.|||.|||.||||||||||.||||..|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1629  TGTCACCAGCTCTTTCTCCAAGATGCAACCCCATCGGAGCCGCAGCAGCATCATGTCAATCACGGCAGAGCCCC  1702

Query 1682  CGGGAAACGACTCCATCGTCAGACGCTACAAGGAGGACGCGCCCCATCGCAGCACAGTCGAAGAAGACAATGAC  1755
            |||||||.||||||||.||||||||||..|||||.||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.
Sbjct 1703  CGGGAAATGACTCCATAGTCAGACGCTGTAAGGAAGATGCGCCACACCGGAGCACGGTGGAAGAAGACAACGAT  1776

Query 1756  AGCGGCGGGTTTGACGCCTTAGATCTGGATGATGACAGTCACGAACGCTACTCCTTCGGACCCTCCTCCATCCA  1829
            |||.|.||||||||.||||||||.||.||.|||||.|.|||||||||.||.|||||.|||||..||||||||||
Sbjct 1777  AGCTGTGGGTTTGATGCCTTAGACCTTGACGATGAAAATCACGAACGTTATTCCTTTGGACCTCCCTCCATCCA  1850

Query 1830  CTCCTCCTCCTCCTCCCACCAATCCGAGGGCCTGGATGCCTACGACCTGGAGCAGGTCAACCTCATGTTCAGGA  1903
            ||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|
Sbjct 1851  CTCCTCCTCCTCTTCACACCAGTCAGAGGGACTGGATGCCTACGACCTGGAGCAGGTCAACCTCATGTTACGAA  1924

Query 1904  AGTTCTCTCTGGAAAGACCCTTCCGGCCTTCGGTCACCTCTGTGGGGCACGTGCGGGGCCCAGGGCCCTCGGTG  1977
            ||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||.||||.|||.||||||||||||.|.|||||||.|||.
Sbjct 1925  AGTTCTCTTTGGAAAGGCCCTTCCGGCCATCGGTCACATCTGGGGGTCACGTGCGGGGCACCGGGCCCTTGGTC  1998

Query 1978  CAGCACACGACGCTGAATGGCGACAGCCTCACCTCCCAGCTCACCCTGCTGGGGGGCAACGCGCGAGGGAGCTT  2051
            ||||||||.||.|||||||||||..|.||||.|.|.|||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct 1999  CAGCACACAACTCTGAATGGCGATGGGCTCATCACGCAGCTCACCCTTCTGGGCGGCAATGCACGCGGGAGCTT  2072

Query 2052  CGTGCACTCGGTCAAGCCTGGCTCTCTGGCCGAGAAAGCCGGCCTCCGTGAGGGCCACCAGCTGCTGCTGCTAG  2125
            |.|.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||..|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 2073  CATTCACTCTGTCAAGCCAGGCTCACTGGCTGAGAGGGCCGGACTGCGTGAGGGCCACCAACTCCTGCTGCTGG  2146

Query 2126  AAGGCTGCATCCGAGGCGAGAGGCAGAGTGTCCCGTTGGACACATGCACCAAAGAGGAAGCCCACTGGACCATC  2199
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||.||..||||..|.|||||.|||||.||.||||..|||||||||
Sbjct 2147  AAGGTTGCATCCGAGGCGAAAGGCAGAGCGTTCCACTGGATGCGTGCACAAAAGAAGAGGCCCGTTGGACCATC  2220

Query 2200  CAGAGGTGCAGCGGCCCCGTCACGCTGCACTACAAGGTCAACCACGAAGGGTACCGGAAGCTGGTGAAGGACAT  2273
            |||||||||||.||||.|.||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.||
Sbjct 2221  CAGAGGTGCAGTGGCCTCATCACTCTGCATTACAAGGTCAACCATGAAGGATACCGGAAGCTGCTGAAGGAGAT  2294

Query 2274  GGAGGACGGCCTGATCACATCGGGGGACTCGTTCTACATCCGGCTGAACCTGAACATCTCCAGCCAGCTGGACG  2347
            ||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2295  GGAGGATGGTCTGATCACATCAGGGGACTCGTTCTATATCCGCCTGAACCTGAACATCTCCAGCCAGCTGGATG  2368

Query 2348  CCTGCACCATGTCCCTGAAGTGTGACGATGTTGTGCACGTCCGTGACACCATGTACCAGGACAGGCACGAGTGG  2421
            |||||.||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||..||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CCTGCTCCATGTCCCTCAAGTGTGACGACGTGGTGCATGTCCTAGACACCATGTACCAGGACAGGCACGAGTGG  2442

Query 2422  CTGTGCGCGCGGGTCGACCCTTTCACAGACCATGACCTGGATATGGGCACCATACCCAGCTACAGCCGAGCCCA  2495
            |||||.||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 2443  CTGTGTGCACGAGTCGACCCCTTCACTGACCAAGACCTGGACACGGGCACCATCCCCAGCTACAGCCGGGCTCA  2516

Query 2496  GCAGCTCCTCCTGGTGAAACTGCAGCGCCTGATGCACCGAGGCAGCCGGGAGGAGGTAGACGGCACCCACCACA  2569
            .|||||.|||||||||||.||.|||||..||.|.|||.||||||.||||||.||||.||||.||.|.|||||||
Sbjct 2517  ACAGCTTCTCCTGGTGAAGCTCCAGCGGTTGGTTCACAGAGGCAACCGGGAAGAGGCAGACAGCGCTCACCACA  2590

Query 2570  CCCTGCGGGCA--CTCCGGAACACCCTGCAGCCAGAAGAAGCGCTTTCAACAAGCGACCCCCGGGTCAGCCCCC  2641
            ||||||  |||  ||||||||||||||||||||.|||||...||||||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 2591  CCCTGC--GCAGCCTCCGGAACACCCTGCAGCCCGAAGAGATGCTTTCGACGAGCGACCCCCGAGTCAGCCCCC  2662

Query 2642  GTCTCTCGCGAGCAAGCTTCCTTTTTGGCCAGCTCCTTCAGTTCGTCAGCAGGTCCGAGAACAAGTATAAGCGG  2715
            |.|||||..||||.||.|||.|.||||||||||||||.|||||.||||||.||||.||.||||||||.||..|.
Sbjct 2663  GCCTCTCCAGAGCGAGTTTCTTCTTTGGCCAGCTCCTGCAGTTTGTCAGCCGGTCAGAAAACAAGTACAAAAGA  2736

Query 2716  ATGAACAGCAACGAGCGGGTCCGCATCATCTCGGGGAGTCCGCTAGGGAGCCTGGCCCGGTCCTCGCTGGACGC  2789
            |||||||||||.|||||.||..|.||||||||.||||||||.||.||||||||..||||||||||||||||.||
Sbjct 2737  ATGAACAGCAATGAGCGCGTGAGAATCATCTCTGGGAGTCCCCTGGGGAGCCTCTCCCGGTCCTCGCTGGATGC  2810

Query 2790  CACCAAGCTCTTGACTGAGAAGCAGGAAGAGCTGGACCCTGAGAGCGAGCTGGGCAAGAACCTCAGCCTCATCC  2863
            ||||||.|||.||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||..|||||..||..||||||||.|||.||||
Sbjct 2811  CACCAAACTCCTGACCGAGAAGCATGAAGAACTGGATCCTGAGAATGAGCTCAGCCGGAACCTCACCCTGATCC  2884

Query 2864  CCTACAGCCTGGTACGCGCCTTCTACTGCGAGCGCCGCCGGCCCGTGCTCTTCACACCCACCGTGCTGGCGGAG  2937
            |.|||||||||||.|||||.|||.||||.|||||||||.||||.|||||||||||.||||||.|||||||..||
Sbjct 2885  CTTACAGCCTGGTGCGCGCTTTCCACTGTGAGCGCCGCAGGCCTGTGCTCTTCACGCCCACCATGCTGGCCAAG  2958

Query 2938  ACGCTGGTGCAGAGGCTGCTCAACTCGGGAGGTGCCATGGAGTTCACCATCTGCAAGTCAGATATCGTCACAAG  3011
            ||..|||||||||.||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2959  ACATTGGTGCAGAAGCTGCTCAACTCAGGGGGTGCCATGGAGTTCACCATCTGCAAGTCAGATATTGTCACAAG  3032

Query 3012  AGATGAGTTCCTCAGAAGGCAGAAGACGGAGACCATCATCTACTCCCGAGAGAAGAACCCCAACGCGTTCGAAT  3085
            |||||||||||||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.|.||.||||
Sbjct 3033  AGATGAGTTCCTCCGAAAGCAGAAGACAGAGACCATCATCTACTCCCGGGAAAAGAACCCCAACACCTTTGAAT  3106

Query 3086  GCATCGCCCCTGCCAACATTGAAGCTGTGGCCGCCAAGAACAAGCACTGCCTGCTGGAGGCTGGGATCGGC---  3156
            ||||||.|||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 3107  GCATCGTCCCTGCCAACATTGAGGCTGTGGCAGCCAAGAACAAACACTGCCTGCTGGAGGCTGGGATCGGCTGT  3180

Query 3157  -TGCACAAGAGACTTGATCAAGTCCAACATCTACCCCATCGTGCTCTTCATCCGGGTGTGTGAGAAGAACATCA  3229
             |||    |.|||.|||||||||.|||..|.||||||||.|||||..|||||||||||.|.|||||||||||||
Sbjct 3181  GTGC----GCGACCTGATCAAGTGCAAGGTGTACCCCATAGTGCTGCTCATCCGGGTGAGCGAGAAGAACATCA  3250

Query 3230  AGAGGTTCAGAAAGCTGCTGCCCCGACCTGAGACGGAGGAGGAGTTCCTGCGCGTGTGCCGGCTGAAGGAGAAG  3303
            |..|||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||.||||.||.||||||
Sbjct 3251  AACGGTTCAGGAAGCTGCTGCCGCGGCCAGAGACGGAAGAGGAATTCCTGCGAGTGTGCAGGCTCAAAGAGAAG  3324

Query 3304  GAGCTGGAGGCCCTGCCGTGCCTGTACGCCACGGTGGAACCTGACATGTGGGGCAGCGTAGAGGAGCTGCTCCG  3377
            |||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||.||||.||||||.|||||||.|||||||||||.||
Sbjct 3325  GAGCTGGAGGCGCTGCCCTGCCTCTACGCCACCGTGGAAGCTGAGATGTGGAGCAGCGTGGAGGAGCTGCTGCG  3398

Query 3378  CGTTGTCAAGGACAAGATCGGCGAGGAGCAGCGCAAGACCATCTGGGTGGACGAGGACCAGCTG  3441
            .||..||||.||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3399  AGTCCTCAAAGACAAGATTGTAGAGGAGCAGCGCAAGACCATCTGGGTGGACGAGGACCAGCTG  3462