Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467287
- Subject:
- XM_011526403.1
- Aligned Length:
- 2636
- Identities:
- 2435
- Gaps:
- 180
Alignment
Query 1 ATGGACGTCGTGGACCCTGACATTTTCAATAGAGACCCCCGGGACCACTATGACCTGCTACAGCGGCTGGGTGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGACGTCGTGGACCCTGACATTTTCAATAGAGACCCCCGGGACCACTATGACCTGCTACAGCGGCTGGGTGG 74
Query 75 CGGCACGTATGGGGAAGTCTTTAAGGCTCGAGACAAGGTGTCAGGGGACCTGGTGGCACTGAAGATGGTGAAGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGGCACGTATGGGGAAGTCTTTAAGGCTCGAGACAAGGTGTCAGGGGACCTGGTGGCACTGAAGATGGTGAAGA 148
Query 149 TGGAGCCTGATGATGATGTCTCCACCCTTCAGAAGGAAATCCTCATATTGAAAACTTGCCGGCACGCCAACATC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGAGCCTGATGATGATGTCTCCACCCTTCAGAAGGAAATCCTCATATTGAAAACTTGCCGGCACGCCAACATC 222
Query 223 GTGGCCTACCATGGGAGTTATCTCTGGTTGCAGAAACTCTGGATCTGCATGGAATTCTGTGGGGCTGGTTCTCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTGGCCTACCATGGGAGTTATCTCTGGTTGCAGAAACTCTGGATCTGCATGGAATTCTGTGGGGCTGGTTCTCT 296
Query 297 CCAGGACATCTACCAAGTGACAGGCTCCCTGTCAGAGCTCCAGATTAGCTATGTCTGCCGGGAAGTGCTCCAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCAGGACATCTACCAAGTGACAGGCTCCCTGTCAGAGCTCCAGATTAGCTATGTCTGCCGGGAAGTGCTCCAGG 370
Query 371 GACTGGCCTATTTGCACTCACAGAAGAAGATACACAGGGACATCAAGGGAGCTAACATCCTCATCAATGATGCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GACTGGCCTATTTGCACTCACAGAAGAAGATACACAGGGACATCAAGGGAGCTAACATCCTCATCAATGATGCT 444
Query 445 GGGGAGGTCAGATTGGCTGACTTTGGCATCTCGGCCCAGATTGGGGCTACACTGGCCAGACGCCTCTCTTTCAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGGGAGGTCAGATTGGCTGACTTTGGCATCTCGGCCCAGATTGGGGCTACACTGGCCAGACGCCTCTCTTTCAT 518
Query 519 TGGGACACCCTACTGGATGGCTCCGGAAGTGGCAGCTGTGGCCCTGAAGGGAGGATACAATGAGCTGTGTGACA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGGGACACCCTACTGGATGGCTCCGGAAGTGGCAGCTGTGGCCCTGAAGGGAGGATACAATGAGCTGTGTGACA 592
Query 593 TCTGGTCCCTGGGCATCACGGCCATCGAACTGGCCGAGCTACAGCCACCGCTCTTTGATGTGCACCCTCTCAGA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCTGGTCCCTGGGCATCACGGCCATCGAACTGGCCGAGCTACAGCCACCGCTCTTTGATGTGCACCCTCTCAGA 666
Query 667 GTTCTCTTCCTCATGACCAAGAGTGGCTACCAGCCTCCCCGACTGAAGGAAAAAGGCAAATGGTCGGCTGCCTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTTCTCTTCCTCATGACCAAGAGTGGCTACCAGCCTCCCCGACTGAAGGAAAAAGGCAAATGGTCGGCTGCCTT 740
Query 741 CCACAACTTCATCAAAGTCACTTCTGACTAAGAGTCCCAAGAAACGACCCAGCGCCACCAAGATGCTCAGTCAT 814
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCACAACTTCATCAAAGTCAC-TCTGACTAAGAGTCCCAAGAAACGACCCAGCGCCACCAAGATGCTCAGTCAT 813
Query 815 CAACTGGTATCCCAGCCTGGGCTGAATCGAGGCCTGATCCTGGATCTTCTTGACAAACTGAAGAATCCCGGGAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 CAACTGGTATCCCAGCCTGGGCTGAATCGAGGCCTGATCCTGGATCTTCTTGACAAACTGAAGAATCCCGGGAA 887
Query 889 AGGACCCTCCATTGGGGACATTGAGGATGAGGAGCCCGAGCTACCCCCTGCTATCCCTCGGCGGATCAGATCCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 AGGACCCTCCATTGGGGACATTGAGGATGAGGAGCCCGAGCTACCCCCTGCTATCCCTCGGCGGATCAGATCCA 961
Query 963 CCCACCGCTCCAGCTCTCTGGGGATCCCAGATGCAGACTGCTGTCGGCGGCACATGGAGTTCAGGAAGCTCCGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 CCCACCGCTCCAGCTCTCTGGGGATCCCAGATGCAGACTGCTGTCGGCGGCACATGGAGTTCAGGAAGCTCCGA 1035
Query 1037 GGAATGGAGACCAGACCCCCAGCCAACACCGCTCGCCTACAGCCTCCTCGAGACCTCAGGAGCAGCAGCCCCAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 GGAATGGAGACCAGACCCCCAGCCAACACCGCTCGCCTACAGCCTCCTCGAGACCTCAGGAGCAGCAGCCCCAG 1109
Query 1111 GAAGCAACTGTCAGAGTCGTCTGACGATGACTATGACGACGTGGACAT-------------------------- 1158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 GAAGCAACTGTCAGAGTCGTCTGACGATGACTATGACGACGTGGACATGCTGAACCTTGGCACCTGGAAATCTC 1183
Query 1159 -------------------------------------------------------------------------- 1158
Sbjct 1184 CCAAAGACCAGATACTGAGCCCCAGATCCAGACCCAACAGTCAGCCCAGGCCCCCATACTCCCCAGCCCACAGG 1257
Query 1159 --------------------CCCCACCCCTGCAGAGGACACACCTCCTCCACTTCCCCCCAAGCCCAAGTTCCG 1212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 CCGAGTCAGGCTCCATCCAGCCCCACCCCTGCAGAGGACACACCTCCTCCACTTCCCCCCAAGCCCAAGTTCCG 1331
Query 1213 TTCTCCATCAGACGAGGGTCCTGGGAGCATGGGGGATGATGGGCAGCTGAGCCCGGGGGTGCTGGTCCGGTGTG 1286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 TTCTCCATCAGACGAGGGTCCTGGGAGCATGGGGGATGATGGGCAGCTGAGCCCGGGGGTGCTGGTCCGGTGTG 1405
Query 1287 CCAGTGGGCCCCCACCAAACAGCCCCCGTCCTGGGCCTCCCCCATCCACCAGCAGCCCCCACCTCACCGCCCAT 1360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 CCAGTGGGCCCCCACCAAACAGCCCCCGTCCTGGGCCTCCCCCATCCACCAGCAGCCCCCACCTCACCGCCCAT 1479
Query 1361 TCAGAACCCTCACTCTGGAACCCACCCTCCCGGGAGCTTGACAAGCCCCCACTTCTGCCCCCCAAGAAGGAAAA 1434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 TCAGAACCCTCACTCTGGAACCCACCCTCCCGGGAGCTTGACAAGCCCCCACTTCTGCCCCCCAAGAAGGAAAA 1553
Query 1435 GATGAAGAGAAAGGGATGTGCCCTTCTCGTAAAGTTGTTCAATGGCTGCCCCCTCCGGATCCACAGCACGGCCG 1508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 GATGAAGAGAAAGGGATGTGCCCTTCTCGTAAAGTTGTTCAATGGCTGCCCCCTCCGGATCCACAGCACGGCCG 1627
Query 1509 CCTGGACACATCCCTCCACCAAGGACCAGCACCTGCTCCTGGGGGCAGAGGAAGGCATCTTCATCCTGAACCGG 1582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 CCTGGACACATCCCTCCACCAAGGACCAGCACCTGCTCCTGGGGGCAGAGGAAGGCATCTTCATCCTGAACCGG 1701
Query 1583 AATGACCAGGAGGCCACGCTGGAAATGCTCTTTCCTAGCCGGACTACGTGGGTGTACTCCATCAACAACGTTCT 1656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702 AATGACCAGGAGGCCACGCTGGAAATGCTCTTTCCTAGCCGGACTACGTGGGTGTACTCCATCAACAACGTTCT 1775
Query 1657 CATGTCTCTCTCAGGAAAGACCCCCCCCTTTTATTCTCATAGCATCCCTTGCCCTGCTGGAACGGGAAAGAGAC 1730
||||||||||||||||||||||||||.|.|.|||||||||||||| |||||.||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1776 CATGTCTCTCTCAGGAAAGACCCCCCACCTGTATTCTCATAGCAT-CCTTGGCCTGCTGGAAC-GGAAAGAGAC 1847
Query 1731 CAGAAGCAGGAAACCCCCATCGGTTCACATTAGCCCCCCACCGCCTACTGCNAANGGAGAAACATGGTTTCCAC 1804
||| ||||||||| ||||||| |.||||||||| ||||||||||||||||..||.|.|| ||||||||||||||
Sbjct 1848 CAG-AGCAGGAAA-CCCCATC-GCTCACATTAG-CCCCCACCGCCTACTGGCAAGGAAG-AACATGGTTTCCAC 1916
Query 1805 CAANGATCCAGGACACCAAAGGGCTGCCGGGCGTGCTGTGTGGCGGAGGGTGCGAGCTCTGGGGGCCCGTTCCT 1878
||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1917 CAA-GATCCAGGACACCAAA-GGCTGCCGGGCGTGCTGTGTGGCGGAGGGTGCGAGCTCTGGGGGCCCGTTCCT 1988
Query 1879 GTGCGGTGCATTGGAGACGTCCGTTGTCCTGCTTCAGTGGTACCAGCCCATGAACAAATTCCTGCTTGTCCGGC 1952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989 GTGCGGTGCATTGGAGACGTCCGTTGTCCTGCTTCAGTGGTACCAGCCCATGAACAAATTCCTGCTTGTCCGGC 2062
Query 1953 AGGTGCTGTTCCCACTGCCGACGCCTCTGTCCGTGTTCGCGCTGCTGACCGGGCCAGGCTCTGAGCTGCCCGCT 2026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2063 AGGTGCTGTTCCCACTGCCGACGCCTCTGTCCGTGTTCGCGCTGCTGACCGGGCCAGGCTCTGAGCTGCCCGCT 2136
Query 2027 GTGTGCATCGGCGTGAGCCCCGGGCGGCCGGGGAAGTCGGTGCTCTTCCACACGGTGCGCTTTGGCGCGCTCTC 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2137 GTGTGCATCGGCGTGAGCCCCGGGCGGCCGGGGAAGTCGGTGCTCTTCCACACGGTGCGCTTTGGCGCGCTCTC 2210
Query 2101 TTGCTGGCTGGGCGAGATGAGCACCGAGCACAGGGGACCCGTGCAGGTGACCCAGGTAGAGGAAGATATGGTGA 2174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2211 TTGCTGGCTGGGCGAGATGAGCACCGAGCACAGGGGACCCGTGCAGGTGACCCAGGTAGAGGAAGATATGGTGA 2284
Query 2175 TGGTGTTGATGGATGGCTCTGTGAAGCTGGTGACCCCGGAGGGGTCCCCAGTCCGGGGACTTCGCACACCTGAG 2248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2285 TGGTGTTGATGGATGGCTCTGTGAAGCTGGTGACCCCGGAGGGGTCCCCAGTCCGGGGACTTCGCACACCTGAG 2358
Query 2249 ATCCCCATGACCGAAGCGGTGGAGGCCGTGGCTATGGTTGGAGGTCAGCTTCAGGCCTTCTGGAAGCATGGAGT 2322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2359 ATCCCCATGACCGAAGCGGTGGAGGCCGTGGCTATGGTTGGAGGTCAGCTTCAGGCCTTCTGGAAGCATGGAGT 2432
Query 2323 GCAGGTGTGGGCTCTAGGCTCGGATCAGCTGCTACAGGAGCTGAGAGACCCTACCCTCACTTTCCGTCTGCTTG 2396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2433 GCAGGTGTGGGCTCTAGGCTCGGATCAGCTGCTACAGGAGCTGAGAGACCCTACCCTCACTTTCCGTCTGCTTG 2506
Query 2397 GCTCCCCCAGGCCTGTAGTG--GTGGAGACACG-------CCCAGTGGATGATCCTACTGCTCCCAG---CAA- 2457
||||||||||| |||.|||| |||| |||| |.||.|| .|.|||.||.||||||| |||
Sbjct 2507 GCTCCCCCAGG-CTGGAGTGCAGTGG---CACGATCTCGCCTCACTG---CAACCTCCTCCTCCCAGGTTCAAG 2573
Query 2458 -----------CCTCTACATCCAG-GAA------------------ 2473
||||..|.|||.| |.|
Sbjct 2574 CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCCTG 2619