Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467321
• Subject: XM_011525178.2
• Aligned Length: 1134
• Identities: 916
• Gaps: 192

Alignment

Query    1  ATGCGCCCCCCGCCCGCGCTGGCCCT----GGCCGGGC----TCT-----GCCTGCTGGCGCTGCC--CGCC--  57
                                    .|    ||.|||||    |||     .||| ||||| .||||  .|||  
Sbjct    1  ------------------------ATGAAAGGACGGGCAGTTTCTTTTGATCCT-CTGGC-ATGCCAAGGCCTG  48

Query   58  ---GCC-------GCCGCCT-------CCTACTTCG-----------GCCTGACCGGGCGGGAAGTCCTGACGC  103
               |||       |..||||       ||| ||..|           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   49  AATGCCAGTCCTGGGAGCCTTACCAGCCCT-CTAAGAAGAATCAGAAGCCTGACCGGGCGGGAAGTCCTGACGC  121

Query  104  CCTTCCCAGGATTGGGCACTGCGGCAGCCCCGGCACAGGGCGGGGCCCACCTGAAGCAGTGTGACCTGCTGAAG  177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  122  CCTTCCCAGGATTGGGCACTGCGGCAGCCCCGGCACAGGGCGGGGCCCACCTGAAGCAGTGTGACCTGCTGAAG  195

Query  178  CTGTCCCGGCGGCAGAAGCAGCTCTGCCGGAGGGAGCCCGGCCTGGCTGAGACCCTGAGGGATGCTGCGCACCT  251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  196  CTGTCCCGGCGGCAGAAGCAGCTCTGCCGGAGGGAGCCCGGCCTGGCTGAGACCCTGAGGGATGCTGCGCACCT  269

Query  252  CGGCCTGCTTGAGTGCCAGTTTCAGTTCCGGCATGAGCGCTGGAACTGTAGCCTGGAGGGCAGGACGGGCCTGC  325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  270  CGGCCTGCTTGAGTGCCAGTTTCAGTTCCGGCATGAGCGCTGGAACTGTAGCCTGGAGGGCAGGATGGGCCTGC  343

Query  326  TCAAGAGAGGCTTCAAAGAGACAGCTTTCCTGTACGCGGTGTCCTCTGCCGCCCTCACCCACACCCTGGCCCGG  399
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  344  TCAAGAGAGGCTTCAAAGAGACAGCTTTCCTGTACGCGGTGTCCTCTGCCGCCCTCACCCACACCCTGGCCCGG  417

Query  400  GCCTGCAGCGCTGGGCGCATGGAGCGCTGCACCTGTGATGACTCTCCGGGGCTGGAGAGCCGGCAGGCCTGGCA  473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  418  GCCTGCAGCGCTGGGCGCATGGAGCGCTGCACCTGTGATGACTCTCCGGGGCTGGAGAGCCGGCAGGCCTGGCA  491

Query  474  GTGGGGCGTGTGCGGTGACAACCTCAAGTACAGCACCAAGTTTCTGAGCAACTTCCTGGGGTCCAAGAGAGGAA  547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  GTGGGGCGTGTGCGGTGACAACCTCAAGTACAGCACCAAGTTTCTGAGCAACTTCCTGGGGTCCAAGAGAGGAA  565

Query  548  ACAAGGACCTGCGGGCACGGGCAGACGCCCACAATACCCACGTGGGCATCAAGGCTGTGAAGAGTGGCCTCAGG  621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  566  ACAAGGACCTGCGGGCACGGGCAGACGCCCACAATACCCACGTGGGCATCAAGGCTGTGAAGAGTGGCCTCAGG  639

Query  622  ACCACGTGTAAGTGCCATGGCGTATCAGGCTCCTGTGCCGTGCGCACCTGCTGGAAGCAGCTCTCCCCGTTCCG  695
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  640  ACCACGTGTAAGTGCCATGGCGTATCAGGCTCCTGTGCCGTGCGCACCTGCTGGAAGCAGCTCTCCCCGTTCCG  713

Query  696  TGAGACGGGCCAGGTGCTGAAACTGCGCTATGACTCGGCTGTCAAGGTGTCCAGTGCCACCAATGAGGCCTTGG  769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714  TGAGACGGGCCAGGTGCTGAAACTGCGCTATGACTCGGCTGTCAAGGTGTCCAGTGCCACCAATGAGGCCTTGG  787

Query  770  GCCGCCTAGAGCTGTGGGCCCCTGCCAGGCAGGGCAGCCTCACCAAAGGCCTGGCCCCAAGGTCTGGGGACCTG  843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  788  GCCGCCTAGAGCTGTGGGCCCCTGCCAGGCAGGGCAGCCTCACCAAAGGCCTGGCCCCAAGGTCTGGGGACCTG  861

Query  844  GTGTACATGGAGGACTCACCCAGCTTCTGCCGGCCCAGCAAGTACTCACCTGGCACAGCAGGT-TGGAGTGC--  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| .||.||||  
Sbjct  862  GTGTACATGGAGGACTCACCCAGCTTCTGCCGGCCCAGCAAGTACTCACCTGGCACAGCAGGTAGGGTGTGCTC  935

Query  915  ---AGTGGCAAGAT--------CTCAGCT-----------CATCACAACC---TCCACCT-----CCCGGATTC  958
               .|.|||.||.|        ||..|||           .||.|||.||   .||.|||     ||       
Sbjct  936  CCGGGAGGCCAGCTGCAGCAGCCTGTGCTGCGGGCGGGGCTATGACACCCAGAGCCGCCTGGTGGCC-------  1002

Query  959  AAGCGATTCTCCCGTCTCAGCTGCCTGAG---------------------------------------------  987
                  ||||||.|   |..|||||  ||                                             
Sbjct 1003  ------TTCTCCTG---CCACTGCC--AGGTGCAGTGGTGCTGCTACGTGGAGTGCCAGCAATGTGTGCAGGAG  1065

Query  988  ------------------------  987
                                    
Sbjct 1066  GAGCTTGTGTACACCTGCAAGCAC  1089