Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467337
- Subject:
- NM_001002292.3
- Aligned Length:
- 1662
- Identities:
- 1262
- Gaps:
- 372
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCTGGGGCAATTATAGAAAACATGAGCACCAAGAAGCTGTGCATTGTTGGTGGGATTCTGCTCGTGTTCCA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AATCATCGCCTTTCTGGTGGGAGGCTTGATTGGGCCCACAACGGCAGTGTCCTACATGTCGGTGAAATGTGTGG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ATGCCCGTAAGAACCATCACAAGACAAAATGGTTCGTGCCTTGGGGACCCAATCATTGTGACAAGATCCGAGAC 222
Query 1 ------------------------------------------------------------------------AT 2
||
Sbjct 223 ATTGAAGAGGCAATTCCAAGGGAAATTGAAGCCAATGACATCGTGTTTTCTGTTCACATTCCCCTCCCCCACAT 296
Query 3 GGAGATGAGTCCTTGGTTCCAATTCATGCTGTTTATCCTGCAGCTGGACATTGCCTTCAAGCTAAACAACCAAA 76
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAGATGAGTCCTTGGTTCCAATTCATGCTGTTTATCCTGCAGCTGGACATTGCCTTCAAGCTAAACAACCAAA 370
Query 77 TCAGAGAAAATGCAGAAGTCTCCATGGACGTTTCCCTGGCTTACCGTGATGACGCATTTGCTGAGTGGACTGAA 150
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCAGAGAAAATGCAGAAGTCTCCATGGACGTTTCCCTGGCTTACCGTGATGACGCGTTTGCTGAGTGGACTGAA 444
Query 151 ATGGCCCATGAAAGAGTACCACGGAAACTCAAATGCACCTTCACATCTCCCAAGACTCCAGAGCATGAGGGCCG 224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATGGCCCATGAAAGAGTACCACGGAAACTCAAATGCACCTTCACATCTCCCAAGACTCCAGAGCATGAGGGCCG 518
Query 225 TTACTATGAATGTGATGTCCTTCCTTTCATGGAAATTGGGTCTGTGGCCCATAAGTTTTACCTTTTAAACATCC 298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TTACTATGAATGTGATGTCCTTCCTTTCATGGAAATTGGGTCTGTGGCCCATAAGTTTTACCTTTTAAACATCC 592
Query 299 GGCTGCCTGTGAATGAGAAGAAGAAAATCAATGTGGGAATTGGGGAGATAAAGGATATCCGGTTGGTGGGGATC 372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGCTGCCTGTGAATGAGAAGAAGAAAATCAATGTGGGAATTGGGGAGATAAAGGATATCCGGTTGGTGGGGATC 666
Query 373 CACCAAAATGGAGGCTTCACCAAGGTGTGGTTTGCCATGAAGACCTTCCTTACGCCCAGCATCTTCATCATTAT 446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CACCAAAATGGAGGCTTCACCAAGGTGTGGTTTGCCATGAAGACCTTCCTTACGCCCAGCATCTTCATCATTAT 740
Query 447 GGTGTGGTATTGGAGGAGGATCACCATGATGTCCCGACCCCCAGTGCTTCTGGAAAAAGTCATCTTTGCCCTTG 520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGTGTGGTATTGGAGGAGGATCACCATGATGTCCCGACCCCCAGTGCTTCTGGAAAAAGTCATCTTTGCCCTTG 814
Query 521 GGATTTCCATGACCTTTATCAATATCCCAGTGGAATGGTTTTCCATCGGGTTTGACTGGACCTGGATGCTGCTG 594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGATTTCCATGACCTTTATCAATATCCCAGTGGAATGGTTTTCCATCGGGTTTGACTGGACCTGGATGCTGCTG 888
Query 595 TTTGGTGACATCCGACAGGGCATCTTCTATGCGATGCTTCTGTCCTTCTGGATCATCTTCTGTGGCGAGCACAT 668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTTGGTGACATCCGACAGGGCATCTTCTATGCGATGCTTCTGTCCTTCTGGATCATCTTCTGTGGCGAGCACAT 962
Query 669 GATGGATCAGCACGAGCGGAACCACATCGCAGGGTATTGGAAGCAAGTCGGACCCATTGCCGTTGGCTCCTTCT 742
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GATGGATCAGCACGAGCGGAACCACATCGCAGGGTATTGGAAGCAAGTCGGACCCATTGCCGTTGGCTCCTTCT 1036
Query 743 GCCTCTTCATATTTGACATGTGTGAGAGAGGGGTACAACTCACGAATCCCTTCTACAGTATCTGGACTACAGAC 816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCCTCTTCATATTTGACATGTGTGAGAGAGGGGTACAACTCACGAATCCCTTCTACAGTATCTGGACTACAGAC 1110
Query 817 ATTGGAACAGAGCTGGCCATGGCCTTCATCATCGTGGCTGGAATCTGCCTCTGCCTCTACTTCCTGTTTCTATG 890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATTGGAACAGAGCTGGCCATGGCCTTCATCATCGTGGCTGGAATCTGCCTCTGCCTCTACTTCCTGTTTCTATG 1184
Query 891 CTTCATGGTATTTCAGGTGTTTCGGAACATCAGTGGGAAGCAGTCCAGCCTGCCAGCTATGAGCAAAGTCCGGC 964
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTTCATGGTATTTCAGGTGTTTCGGAACATCAGTGGGAAGCAGTCCAGCCTGCCAGCTATGAGCAAAGTCCGGC 1258
Query 965 GGCTACACTATGAGGGGCTAATTTTTAGGTTCAAGTTCCTCATGCTTATCACCTTGGCCTGCGCTGCCATGACT 1038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGCTACACTATGAGGGGCTAATTTTTAGGTTCAAGTTCCTCATGCTTATCACCTTGGCCTGCGCTGCCATGACT 1332
Query 1039 GTCATCTTCTTCATCGTTAGTCAGGTAACGGAAGGCCATTGGAAATGGGGCGGCGTCACAGTCCAAGTGAACAG 1112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTCATCTTCTTCATCGTTAGTCAGGTAACGGAAGGCCATTGGAAATGGGGCGGCGTCACAGTCCAAGTGAACAG 1406
Query 1113 TGCCTTTTTCACAGGCATCTATGGGATGTGGAATCTGTATGTCTTTGCTCTGATGTTCTTGTATGCACCATCCC 1186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGCCTTTTTCACAGGCATCTATGGGATGTGGAATCTGTATGTCTTTGCTCTGATGTTCTTGTATGCACCATCCC 1480
Query 1187 ATAAAAACTATGGAGAAGACCAGTCCAATGG----------CGATCT-------GGG-----TGTCCATAGTGG 1238
||||||||||||||||||||||||||||||| |.||.| ||| |||.|.|.||..
Sbjct 1481 ATAAAAACTATGGAGAAGACCAGTCCAATGGAATGCAACTCCCATGTAAATCGAGGGAAGATTGTGCTTTGTTT 1554
Query 1239 G--------------GAAGAACTCCAGCTCACCACCACTA---------TCACCCATGTGGACGGACCCACTGA 1289
| .|||||.| |.|||.|.|..|.| |||.|.|||...|||.|.|..|||.
Sbjct 1555 GTTTCGGAACTTTATCAAGAATT---GTTCAGCGCTTCGAAATATTCCTTCATCAATGACAACGCAGCTTCTGG 1625
Query 1290 GATCTACAAGTTGACCCGCAAGGAGGCCCAGGAG 1323
.||.
Sbjct 1626 TATT------------------------------ 1629