Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000467337
Subject:
XM_006501964.2
Aligned Length:
1623
Identities:
1196
Gaps:
300

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCTGGGGCAATTATAGAAAACATGAGTACCAAGAAGCTCTGCATTGTTGGAGGGATTCTTCTGGTTTTCCA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AATCGTTGCCTTTCTGGTGGGAGGCTTGATCGCTCCAGCACCCACAACAGCAGTACCCTACACGGCAATAAAAT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GTGTGGATGTCCGTAAGAACCACCATAAAACAAGATGGCTGGCGCCTTGGGGACCTAACAAGTGTGACAAGATC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CGTGACATCGAGGAAGCAATTCCAAGGGAAATTGAAGCAAATGACATTGTGTTTTCTGTACACATTCCCCTCCC  296

Query    1  ----ATGGAGATGAGTCCTTGGTTCCAATTCATGCTGTTTATCCTGCAGCTGGACATTGCCTTCAAGCTAAACA  70
                ||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct  297  TTCTATGGAGATGAGTCCATGGTTCCAGTTTATGCTGTTTATCTTGCAGCTAGACATTGCTTTCAAGCTGAACA  370

Query   71  ACCAAATCAGAGAAAATGCAGAAGTCTCCATGGACGTTTCCCTGGCTTACCGTGATGACGCATTTGCTGAGTGG  144
            |||||||||||||||||||||||.|.||||||||.||||||||||.||||||||||||....|||.||||.|||
Sbjct  371  ACCAAATCAGAGAAAATGCAGAAATTTCCATGGATGTTTCCCTGGGTTACCGTGATGATATGTTTTCTGAATGG  444

Query  145  ACTGAAATGGCCCATGAAAGAGTACCACGGAAACTCAAATGCACCTTCACATCTCCCAAGACTCCAGAGCATGA  218
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  445  ACTGAAATGGCCCATGAAAGAGTACCACGTAAACTCAAATGTACTTTTACATCCCCCAAGACCCCAGAGCACGA  518

Query  219  GGGCCGTTACTATGAATGTGATGTCCTTCCTTTCATGGAAATTGGGTCTGTGGCCCATAAGTTTTACCTTTTAA  292
            .||.|||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||.|||||||.|||
Sbjct  519  AGGTCGTTATTATAATTGTGATGTCCTTCCTTTCATGGAAATTGGGTCAGTGGCTCATAAGTATTACCTTCTAA  592

Query  293  ACATCCGGCTGCCTGTGAATGAGAAGAAGAAAATCAATGTGGGAATTGGGGAGATAAAGGATATCCGGTTGGTG  366
            |.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  593  ATATCCGGCTACCTGTAAATGAGAAAAAGAAAATCAATGTTGGAATTGGGGAGATAAAGGACATTCGGTTGGTG  666

Query  367  GGGATCCACCAAAATGGAGGCTTCACCAAGGTGTGGTTTGCCATGAAGACCTTCCTTACGCCCAGCATCTTCAT  440
            ||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  667  GGAATCCACCAAAACGGAGGTTTCACTAAGGTATGGTTTGCTATGAAGACCTTCCTTACACCCAGCATCTTCAT  740

Query  441  CATTATGGTGTGGTATTGGAGGAGGATCACCATGATGTCCCGACCCCCAGTGCTTCTGGAAAAAGTCATCTTTG  514
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATTATGGTGTGGTATTGGAGGAGGATCACCATGATGTCCCGACCTCCAGTGCTTCTGGAAAAAGTCATCTTTG  814

Query  515  CCCTTGGGATTTCCATGACCTTTATCAATATCCCAGTGGAATGGTTTTCCATCGGGTTTGACTGGACCTGGATG  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCTTGGGATTTCCATGACCTTTATCAATATCCCTGTGGAATGGTTTTCTATTGGATTTGACTGGACCTGGATG  888

Query  589  CTGCTGTTTGGTGACATCCGACAGGGCATCTTCTATGCGATGCTTCTGTCCTTCTGGATCATCTTCTGTGGCGA  662
            |||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGTTATTTGGTGACATCCGACAGGGCATCTTCTATGCAATGCTTCTTTCTTTCTGGATCATCTTCTGTGGCGA  962

Query  663  GCACATGATGGATCAGCACGAGCGGAACCACATCGCAGGGTATTGGAAGCAAGTCGGACCCATTGCCGTTGGCT  736
            |||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct  963  GCACATGATGGATCAACATGAACGGAATCACATTGCAGGGTACTGGAAGCAAGTTGGACCAATTGCTGTTGGCT  1036

Query  737  CCTTCTGCCTCTTCATATTTGACATGTGTGAGAGAGGGGTACAACTCACGAATCCCTTCTACAGTATCTGGACT  810
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTTCTGCCTCTTCATATTTGACATGTGTGAAAGAGGAGTACAACTCACAAATCCTTTCTACAGTATCTGGACT  1110

Query  811  ACAGACATTGGAACAGAGCTGGCCATGGCCTTCATCATCGTGGCTGGAATCTGCCTCTGCCTCTACTTCCTGTT  884
            |||||..||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111  ACAGATGTTGGAACAGAACTGGCTATGGCTTTCATCATTGTGGCAGGTATCTGCCTCTGCCTCTATTTCCTGTT  1184

Query  885  TCTATGCTTCATGGTATTTCAGGTGTTTCGGAACATCAGTGGGAAGCAGTCCAGCCTGCCAGCTATGAGCAAAG  958
            |||.||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1185  TCTGTGCTTCATGGTATTTCAGGTATTTAGAAACATCAGTGGGAAGCAGTCTAGCCTCCCAGCCATGAGCAAAG  1258

Query  959  TCCGGCGGCTACACTATGAGGGGCTAATTTTTAGGTTCAAGTTCCTCATGCTTATCACCTTGGCCTGCGCTGCC  1032
            |||||.||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1259  TCCGGAGGCTGCACTATGAGGGTCTGATCTTCAGGTTCAAGTTCCTCATGCTTATCACCTTGGCTTGTGCTGCC  1332

Query 1033  ATGACTGTCATCTTCTTCATCGTTAGTCAGGTAACGGAAGGCCATTGGAAATGGGGCGGCGTCACAGTCCAAGT  1106
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 1333  ATGACTGTTATCTTCTTCATCGTTAGTCAGGTGTCAGAAGGCCATTGGAAATGGGGTGGTGTCACAGTTCAAGT  1406

Query 1107  GAACAGTGCCTTTTTCACAGGCATCTATGGGATGTGGAATCTGTATGTCTTTGCTCTGATGTTCTTGTATGCAC  1180
            ||.||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAGCAGTGCTTTCTTCACTGGAATCTATGGGATGTGGAACCTGTATGTCTTTGCTTTGATGTTCTTGTATGCAC  1480

Query 1181  CATCCCATAAAAACTATGGAGAAGACCAGTCCAATGGCGATCTGGGTGTCCATAGTGGGGAAGAACTCCAGCTC  1254
            ||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1481  CATCCCATAAGAACTATGGGGAAGACCAGTCTAATGGTGACCTGGGTGTCCACAGCGGGGAAGAACTGCAGCTT  1554

Query 1255  ACCACCACTATCACCCATGTGGACGGACCCACTGAGATCTACAAGTTGACCCGCAAGGAGGCCCAGGAG  1323
            ||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.
Sbjct 1555  ACTACCACTATAACCCATGTAGATGGACCAACTGAGATCTACAAGTTGACCCGTAAAGAAGCACAGGAA  1623