Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467337
- Subject:
- XM_006501964.2
- Aligned Length:
- 1623
- Identities:
- 1196
- Gaps:
- 300
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCTGGGGCAATTATAGAAAACATGAGTACCAAGAAGCTCTGCATTGTTGGAGGGATTCTTCTGGTTTTCCA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AATCGTTGCCTTTCTGGTGGGAGGCTTGATCGCTCCAGCACCCACAACAGCAGTACCCTACACGGCAATAAAAT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GTGTGGATGTCCGTAAGAACCACCATAAAACAAGATGGCTGGCGCCTTGGGGACCTAACAAGTGTGACAAGATC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CGTGACATCGAGGAAGCAATTCCAAGGGAAATTGAAGCAAATGACATTGTGTTTTCTGTACACATTCCCCTCCC 296
Query 1 ----ATGGAGATGAGTCCTTGGTTCCAATTCATGCTGTTTATCCTGCAGCTGGACATTGCCTTCAAGCTAAACA 70
||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct 297 TTCTATGGAGATGAGTCCATGGTTCCAGTTTATGCTGTTTATCTTGCAGCTAGACATTGCTTTCAAGCTGAACA 370
Query 71 ACCAAATCAGAGAAAATGCAGAAGTCTCCATGGACGTTTCCCTGGCTTACCGTGATGACGCATTTGCTGAGTGG 144
|||||||||||||||||||||||.|.||||||||.||||||||||.||||||||||||....|||.||||.|||
Sbjct 371 ACCAAATCAGAGAAAATGCAGAAATTTCCATGGATGTTTCCCTGGGTTACCGTGATGATATGTTTTCTGAATGG 444
Query 145 ACTGAAATGGCCCATGAAAGAGTACCACGGAAACTCAAATGCACCTTCACATCTCCCAAGACTCCAGAGCATGA 218
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 445 ACTGAAATGGCCCATGAAAGAGTACCACGTAAACTCAAATGTACTTTTACATCCCCCAAGACCCCAGAGCACGA 518
Query 219 GGGCCGTTACTATGAATGTGATGTCCTTCCTTTCATGGAAATTGGGTCTGTGGCCCATAAGTTTTACCTTTTAA 292
.||.|||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||.|||||||.|||
Sbjct 519 AGGTCGTTATTATAATTGTGATGTCCTTCCTTTCATGGAAATTGGGTCAGTGGCTCATAAGTATTACCTTCTAA 592
Query 293 ACATCCGGCTGCCTGTGAATGAGAAGAAGAAAATCAATGTGGGAATTGGGGAGATAAAGGATATCCGGTTGGTG 366
|.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 593 ATATCCGGCTACCTGTAAATGAGAAAAAGAAAATCAATGTTGGAATTGGGGAGATAAAGGACATTCGGTTGGTG 666
Query 367 GGGATCCACCAAAATGGAGGCTTCACCAAGGTGTGGTTTGCCATGAAGACCTTCCTTACGCCCAGCATCTTCAT 440
||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 667 GGAATCCACCAAAACGGAGGTTTCACTAAGGTATGGTTTGCTATGAAGACCTTCCTTACACCCAGCATCTTCAT 740
Query 441 CATTATGGTGTGGTATTGGAGGAGGATCACCATGATGTCCCGACCCCCAGTGCTTCTGGAAAAAGTCATCTTTG 514
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CATTATGGTGTGGTATTGGAGGAGGATCACCATGATGTCCCGACCTCCAGTGCTTCTGGAAAAAGTCATCTTTG 814
Query 515 CCCTTGGGATTTCCATGACCTTTATCAATATCCCAGTGGAATGGTTTTCCATCGGGTTTGACTGGACCTGGATG 588
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCCTTGGGATTTCCATGACCTTTATCAATATCCCTGTGGAATGGTTTTCTATTGGATTTGACTGGACCTGGATG 888
Query 589 CTGCTGTTTGGTGACATCCGACAGGGCATCTTCTATGCGATGCTTCTGTCCTTCTGGATCATCTTCTGTGGCGA 662
|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGTTATTTGGTGACATCCGACAGGGCATCTTCTATGCAATGCTTCTTTCTTTCTGGATCATCTTCTGTGGCGA 962
Query 663 GCACATGATGGATCAGCACGAGCGGAACCACATCGCAGGGTATTGGAAGCAAGTCGGACCCATTGCCGTTGGCT 736
|||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 963 GCACATGATGGATCAACATGAACGGAATCACATTGCAGGGTACTGGAAGCAAGTTGGACCAATTGCTGTTGGCT 1036
Query 737 CCTTCTGCCTCTTCATATTTGACATGTGTGAGAGAGGGGTACAACTCACGAATCCCTTCTACAGTATCTGGACT 810
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCTTCTGCCTCTTCATATTTGACATGTGTGAAAGAGGAGTACAACTCACAAATCCTTTCTACAGTATCTGGACT 1110
Query 811 ACAGACATTGGAACAGAGCTGGCCATGGCCTTCATCATCGTGGCTGGAATCTGCCTCTGCCTCTACTTCCTGTT 884
|||||..||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111 ACAGATGTTGGAACAGAACTGGCTATGGCTTTCATCATTGTGGCAGGTATCTGCCTCTGCCTCTATTTCCTGTT 1184
Query 885 TCTATGCTTCATGGTATTTCAGGTGTTTCGGAACATCAGTGGGAAGCAGTCCAGCCTGCCAGCTATGAGCAAAG 958
|||.||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1185 TCTGTGCTTCATGGTATTTCAGGTATTTAGAAACATCAGTGGGAAGCAGTCTAGCCTCCCAGCCATGAGCAAAG 1258
Query 959 TCCGGCGGCTACACTATGAGGGGCTAATTTTTAGGTTCAAGTTCCTCATGCTTATCACCTTGGCCTGCGCTGCC 1032
|||||.||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1259 TCCGGAGGCTGCACTATGAGGGTCTGATCTTCAGGTTCAAGTTCCTCATGCTTATCACCTTGGCTTGTGCTGCC 1332
Query 1033 ATGACTGTCATCTTCTTCATCGTTAGTCAGGTAACGGAAGGCCATTGGAAATGGGGCGGCGTCACAGTCCAAGT 1106
||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 1333 ATGACTGTTATCTTCTTCATCGTTAGTCAGGTGTCAGAAGGCCATTGGAAATGGGGTGGTGTCACAGTTCAAGT 1406
Query 1107 GAACAGTGCCTTTTTCACAGGCATCTATGGGATGTGGAATCTGTATGTCTTTGCTCTGATGTTCTTGTATGCAC 1180
||.||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAGCAGTGCTTTCTTCACTGGAATCTATGGGATGTGGAACCTGTATGTCTTTGCTTTGATGTTCTTGTATGCAC 1480
Query 1181 CATCCCATAAAAACTATGGAGAAGACCAGTCCAATGGCGATCTGGGTGTCCATAGTGGGGAAGAACTCCAGCTC 1254
||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1481 CATCCCATAAGAACTATGGGGAAGACCAGTCTAATGGTGACCTGGGTGTCCACAGCGGGGAAGAACTGCAGCTT 1554
Query 1255 ACCACCACTATCACCCATGTGGACGGACCCACTGAGATCTACAAGTTGACCCGCAAGGAGGCCCAGGAG 1323
||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.
Sbjct 1555 ACTACCACTATAACCCATGTAGATGGACCAACTGAGATCTACAAGTTGACCCGTAAAGAAGCACAGGAA 1623