Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467337
- Subject:
- XM_011542192.3
- Aligned Length:
- 1533
- Identities:
- 1262
- Gaps:
- 243
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTCGGTGAAATGTGTGGATGCCCGTAAGAACCATCACAAGACAAAATGGTTCGTGCCTTGGGGACCCAATCA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TTGTGACAAGATCCGAGACATTGAAGAGGCAATTCCAAGGGAAATTGAAGCCAATGACATCGTGTTTTCTGTTC 148
Query 1 -----------------ATGGAGATGAGTCCTTGGTTCCAATTCATGCTGTTTATCCTGCAGCTGGACATTGCC 57
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACATTCCCCTCCCCCACATGGAGATGAGTCCTTGGTTCCAATTCATGCTGTTTATCCTGCAGCTGGACATTGCC 222
Query 58 TTCAAGCTAAACAACCAAATCAGAGAAAATGCAGAAGTCTCCATGGACGTTTCCCTGGCTTACCGTGATGACGC 131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTCAAGCTAAACAACCAAATCAGAGAAAATGCAGAAGTCTCCATGGACGTTTCCCTGGCTTACCGTGATGACGC 296
Query 132 ATTTGCTGAGTGGACTGAAATGGCCCATGAAAGAGTACCACGGAAACTCAAATGCACCTTCACATCTCCCAAGA 205
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GTTTGCTGAGTGGACTGAAATGGCCCATGAAAGAGTACCACGGAAACTCAAATGCACCTTCACATCTCCCAAGA 370
Query 206 CTCCAGAGCATGAGGGCCGTTACTATGAATGTGATGTCCTTCCTTTCATGGAAATTGGGTCTGTGGCCCATAAG 279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTCCAGAGCATGAGGGCCGTTACTATGAATGTGATGTCCTTCCTTTCATGGAAATTGGGTCTGTGGCCCATAAG 444
Query 280 TTTTACCTTTTAAACATCCGGCTGCCTGTGAATGAGAAGAAGAAAATCAATGTGGGAATTGGGGAGATAAAGGA 353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTTACCTTTTAAACATCCGGCTGCCTGTGAATGAGAAGAAGAAAATCAATGTGGGAATTGGGGAGATAAAGGA 518
Query 354 TATCCGGTTGGTGGGGATCCACCAAAATGGAGGCTTCACCAAGGTGTGGTTTGCCATGAAGACCTTCCTTACGC 427
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TATCCGGTTGGTGGGGATCCACCAAAATGGAGGCTTCACCAAGGTGTGGTTTGCCATGAAGACCTTCCTTACGC 592
Query 428 CCAGCATCTTCATCATTATGGTGTGGTATTGGAGGAGGATCACCATGATGTCCCGACCCCCAGTGCTTCTGGAA 501
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCAGCATCTTCATCATTATGGTGTGGTATTGGAGGAGGATCACCATGATGTCCCGACCCCCAGTGCTTCTGGAA 666
Query 502 AAAGTCATCTTTGCCCTTGGGATTTCCATGACCTTTATCAATATCCCAGTGGAATGGTTTTCCATCGGGTTTGA 575
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAAGTCATCTTTGCCCTTGGGATTTCCATGACCTTTATCAATATCCCAGTGGAATGGTTTTCCATCGGGTTTGA 740
Query 576 CTGGACCTGGATGCTGCTGTTTGGTGACATCCGACAGGGCATCTTCTATGCGATGCTTCTGTCCTTCTGGATCA 649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTGGACCTGGATGCTGCTGTTTGGTGACATCCGACAGGGCATCTTCTATGCGATGCTTCTGTCCTTCTGGATCA 814
Query 650 TCTTCTGTGGCGAGCACATGATGGATCAGCACGAGCGGAACCACATCGCAGGGTATTGGAAGCAAGTCGGACCC 723
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCTTCTGTGGCGAGCACATGATGGATCAGCACGAGCGGAACCACATCGCAGGGTATTGGAAGCAAGTCGGACCC 888
Query 724 ATTGCCGTTGGCTCCTTCTGCCTCTTCATATTTGACATGTGTGAGAGAGGGGTACAACTCACGAATCCCTTCTA 797
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATTGCCGTTGGCTCCTTCTGCCTCTTCATATTTGACATGTGTGAGAGAGGGGTACAACTCACGAATCCCTTCTA 962
Query 798 CAGTATCTGGACTACAGACATTGGAACAGAGCTGGCCATGGCCTTCATCATCGTGGCTGGAATCTGCCTCTGCC 871
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAGTATCTGGACTACAGACATTGGAACAGAGCTGGCCATGGCCTTCATCATCGTGGCTGGAATCTGCCTCTGCC 1036
Query 872 TCTACTTCCTGTTTCTATGCTTCATGGTATTTCAGGTGTTTCGGAACATCAGTGGGAAGCAGTCCAGCCTGCCA 945
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCTACTTCCTGTTTCTATGCTTCATGGTATTTCAGGTGTTTCGGAACATCAGTGGGAAGCAGTCCAGCCTGCCA 1110
Query 946 GCTATGAGCAAAGTCCGGCGGCTACACTATGAGGGGCTAATTTTTAGGTTCAAGTTCCTCATGCTTATCACCTT 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCTATGAGCAAAGTCCGGCGGCTACACTATGAGGGGCTAATTTTTAGGTTCAAGTTCCTCATGCTTATCACCTT 1184
Query 1020 GGCCTGCGCTGCCATGACTGTCATCTTCTTCATCGTTAGTCAGGTAACGGAAGGCCATTGGAAATGGGGCGGCG 1093
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGCCTGCGCTGCCATGACTGTCATCTTCTTCATCGTTAGTCAGGTAACGGAAGGCCATTGGAAATGGGGCGGCG 1258
Query 1094 TCACAGTCCAAGTGAACAGTGCCTTTTTCACAGGCATCTATGGGATGTGGAATCTGTATGTCTTTGCTCTGATG 1167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCACAGTCCAAGTGAACAGTGCCTTTTTCACAGGCATCTATGGGATGTGGAATCTGTATGTCTTTGCTCTGATG 1332
Query 1168 TTCTTGTATGCACCATCCCATAAAAACTATGGAGAAGACCAGTCCAATGG----------CGATCT-------G 1224
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |.||.| |
Sbjct 1333 TTCTTGTATGCACCATCCCATAAAAACTATGGAGAAGACCAGTCCAATGGAATGCAACTCCCATGTAAATCGAG 1406
Query 1225 GG-----TGTCCATAGTGGG--------------GAAGAACTCCAGCTCACCACCACTA---------TCACCC 1270
|| |||.|.|.||..| .|||||.| |.|||.|.|..|.| |||.|.
Sbjct 1407 GGAAGATTGTGCTTTGTTTGTTTCGGAACTTTATCAAGAATT---GTTCAGCGCTTCGAAATATTCCTTCATCA 1477
Query 1271 ATGTGGACGGACCCACTGAGATCTACAAGTTGACCCGCAAGGAGGCCCAGGAG 1323
|||...|||.|.|..|||..||.
Sbjct 1478 ATGACAACGCAGCTTCTGGTATT------------------------------ 1500