Protein Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000467358
Subject:
XM_006517342.3
Aligned Length:
1228
Identities:
976
Gaps:
159

Alignment

Query    1  MSKLKVIPEKSLTNNSRIVGLLAQLEKINAEPSESDTARYVTSKILHLAQSQEKTRREMTAKGSTGMEILLSTL  74
                                                                      ||.|||||||.|||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------MTTKGSTGMEVLLSTL  16

Query   75  ENTKDLQTTLNILSILVELVSAGGGRRVSFLVTKGGSQILLQLLMNASKESPPHEDLMVQIHSILAKIGPKDKK  148
            ||||||||.|||||||.||||.                                                 |||
Sbjct   17  ENTKDLQTVLNILSILIELVSS-------------------------------------------------DKK  41

Query  149  FGVKARINGALNITLNLVKQNLQNHRLVLPCLQLLRVYSANSVNSVSLGKNGVVELMFKIIGPFSKKNSSLIKV  222
            ||||||.||||..|||||||..||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct   42  FGVKARVNGALTVTLNLVKQHFQNYRLVLPCLQLLRVYSTNSVNSVSLGKNGVVELMFKIIGPFSKKNSGLMKV  115

Query  223  ALDTLAALLKSKTNARRAVDRGYVQVLLTIYVDWHRHDNRHRNMLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMK  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  116  ALDTLAALLKSKTNARRAVDRGYVQVLLTIYVDWHRHDNRHRNMLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMK  189

Query  297  ILYNTS----------------------------------------QLPVIPVTGPVAQLYSLPPEVDDVVDES  330
            ||||||                                        |||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  190  ILYNTSQECLAVRTLDPLVNTSSLIMRKCFPKNRLPLPTIKSSFHFQLPIIPVTGPVAQLYSLPPEVDDVVDES  263

Query  331  DDNDDIDVEAENETENEDDLDQNFKNDDIETDINKLKPQQEPGRTIEDLKMYEHLFPELVDDFQDYDLISKEPK  404
            |||||||.|.|||.||||||||.|||||||||||||.|||.||||||.||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  264  DDNDDIDLEVENELENEDDLDQSFKNDDIETDINKLRPQQVPGRTIEELKMYEHLFPELVDDFQDYELISKEPK  337

Query  405  PFVFEGKVRGPIVVPTAGEETSGNSGNLRK-VVMKENISSKGDEGEKKSTFMDLAKEDIKDNDRTLQQQPGDQN  477
            |||||||.||||||||||||..||||...| |||||..|.||.|          ||||.|..||||.||.|.|.
Sbjct  338  PFVFEGKARGPIVVPTAGEEVPGNSGSVKKGVVMKERASPKGEE----------AKEDPKGHDRTLPQQLGGQS  401

Query  478  RTISSVHGLNNDIVKALDRITLQNIPSQTAPGFTAEMKKDCSLPLTVLTCAKACPHMATCGNVLFEGRTVQLGK  551
            |...|.|..|||.|||||||||||.|||.|.|..|.|.||..||||||.|.|||||.|.||..|||||||.|||
Sbjct  402  RVAPSAHSFNNDLVKALDRITLQNVPSQVASGLNAGMRKDFGLPLTVLSCTKACPHVAKCGSTLFEGRTVHLGK  475

Query  552  LCCTGVETEDDEDTESNSSVEQA-SVEVPDGPTLHDPDLYIEIVKNTKSVPEYSEVAYPDYFGHIPPPFKEPIL  624
            ||||||||||||||||.||.||| |||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  476  LCCTGVETEDDEDTESHSSTEQAPSVEASDGPTLHDPDLYIEIVKNTKSVPEYSEVAYPDYFGHIPPPFKEPIL  549

Query  625  ERPYGVQRTKIAQDIERLIHQSDIIDRVVYDLDNPNYTIPEEGDILKFNSKFESGNLRKVIQIRKNEYDLILNS  698
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  550  ERPYGVQRTKIAQDIERLIHQNDIIDRVVYDLDNPTYTTPEEGDTLKFNSKFESGNLRKVIQIRKSEYDLILNS  623

Query  699  DINSNHYHQWFYFEVSGMRPGVAYRFNIINCEKSNSQFNYGMQPLMYSVQEALNARPWWIRMGTDICYYKNHFS  772
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  624  DINSNHYHQWFYFEVSGMRPGVAYRFNIINCEKSNSQFNYGMQPLMYSVQEALNARPWWIRMGTDICYYKNHFS  697

Query  773  RSSVAAGGQKGKSYYTITFTVNFPHKDDVCYFAYHYPYTYSTLQMHLQKLESAHNPQQIYFRKDVLCETLSGNS  846
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  698  RSSVAAGGQKGKSYYTITFTVNFPHKDDVCYFAYHYPYTYSTLQMHLQKLESAHNPQQIYFRKDVLCETLSGNI  771

Query  847  CPLVTITAMPESNYYEHICHFRNRPYVFLSARVHPGETNASWVMKGTLEYLMSNNPTAQSLRESYIFKIVPMLN  920
            |||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  772  CPLVTITAMPESNYYEHICQFRTRPYIFLSARVHPGETNASWVMKGTLEYLMSNSPTAQSLRESYIFKIVPMLN  845

Query  921  PDGVINGNHRCSLSGEDLNRQWQSPSPDLHPTIYHAKGLLQYLAAVKRLPLVYCDYHGHSRKKNVFMYGCSIKE  994
            |||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  846  PDGVINGNHRCSLSGEDLNRQWQSPNPELHPTIYHAKGLLQYLAAVKRLPLVYCDYHGHSRKKNVFMYGCSIKE  919

Query  995  TVWHTNDNATSCDVVEDTGYRTLPKILSHIAPAFCMSSCSFVVEKSKESTARVVVWREIGVQRSYTMESTLCGC  1068
            |||||.||..|||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  920  TVWHTHDNSASCDIVEDMGYRTLPKILSHIAPAFCMSSCSFVVEKSKESTARVVVWREIGVQRSYTMESTLCGC  993

Query 1069  DQGKYKGLQIGTRELEEMGAKFCVGLLRLKRLTSPLEYNLPSSLLDFENDLIESSCKVTSPTTYVLDEDEPRFL  1142
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  994  DQGRYKGLQIGTRELEEMGAKFCVGLLRLKRLTSSLEYNLPSNLLDFENDLIESSCKVTSPTTYVLDEDEPRFL  1067

Query 1143  EEVDYSAESNDELDIELAENVGDYEPSAQEEVLSDSELSRTYLP  1186
            ||||||||||||||.|||||.||||||||||.|||||.|||.|.
Sbjct 1068  EEVDYSAESNDELDVELAENTGDYEPSAQEEALSDSEVSRTHLI  1111