Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467359
• Subject: NM_001110825.1
• Aligned Length: 2023
• Identities: 1771
• Gaps: 26

Alignment

Query    1  ATGATGGTGGAATCTGCCTCCCTGACAATCAGGTCGGCTCCATCTGGTCAGAATGGCGTGGGCAGCCTCTCTGG  74
            |||||||||||.|||||.||...||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||.
Sbjct    1  ATGATGGTGGAGTCTGCATCGGAGACAATCAGGTCGGCTCCGTCTGGTCAGAACGGCGTGGGCAGCCTCTCTGC  74

Query   75  GCAAGCCGATGGCAGCAGCGG---CGGGGCCACAGGGA------CAACTGCAAG------TGGCACGGGCAGGG  133
            |||.||.||||||.||.|.||   ||||.||.|.||.|      |..||||..|      ||.|.|.|||||||
Sbjct   75  GCAGGCTGATGGCGGCGGTGGGGCCGGGACCGCGGGCACGGCCCCGGCTGCCGGTAGGGATGCCTCAGGCAGGG  148

Query  134  AAGTGACCA-CG--GGTGCAGACAGCAATGGTGAGATGAGTCCCGCAGAGCTGCTGCACTTCCAGCAGCAACAG  204
            |||...||| ||  ||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  AAGCAGCCAGCGGAGGAGCCGACAGCAATGGCGAGATGAGCCCCGCGGAGCTTCTGCACTTCCAACAGCAACAG  222

Query  205  GCTCTCCAAGTGGCCCGGCAGTTCCTGCTGCAGCAGGCCTCAGGCCTGAGCTCCCCAGGGAACAATGACAGCAA  278
            ||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||..||||||.||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  223  GCTCTCCAGGTGGCCCGGCAGTTCCTGTTGCAGCAAGCCTCCAGCCTGAACTCCCCGGGGAACAATGACAGTAA  296

Query  279  ACAGTCTGCCTCTGCTGTGCAGGTGCCTGTGTCGGTGGCCATGATGTCGCCGCAGATGCTTACCCCGCAACAGA  352
            ||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||.||||
Sbjct  297  ACAGTCGGCCTCTGCGGTGCAGGTGCCTGTGTCTGTGGCCATGATGTCCCAGCAGATGCTTACCCCCCAGCAGA  370

Query  353  TGCAGCAGATCCTGTCGCCCCCGCAGCTGCAGGCCTTGCTCCAGCAGCAGCAAGCCCTCATGCTCCAGCAGCTA  426
            |||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct  371  TGCAGCAGATCCTGTCGCCACCTCAGCTGCAGGCCTTGCTGCAGCAGCAACAGGCTCTCATGCTCCAGCAGCTG  444

Query  427  CAGGAGTACTACAAGAAGCAGCAGGAGCAGCTCCACCTGCAGCTCCTCACCCAGCAGCAGGCTGGGAAACCGCA  500
            ||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct  445  CAGGAGTATTACAAGAAGCAGCAAGAGCAGCTCCACCTGCAGCTCCTCACCCAGCAGCAGGCTGGAAAACAGCA  518

Query  501  GCCCAAAGAGGCACTGGGGAACAAGCAGCTGGCCTTCCAGCAGCAGCTCCTGCAAATGCAACAGTTGCAGCAGC  574
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  519  GCCCAAAGAGGCCCTGGGGAACAAGCAGCTGGCCTTCCAGCAGCAGCTCCTGCAGATGCAACAGTTGCAGCAAC  592

Query  575  AGCACCTGCTCAACCTGCAGAGGCAGGGGCTGGTCAGCCTGCAGCCCAACCAAGCCTCGGGGCCCCTCCAGACC  648
            |||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||.||
Sbjct  593  AGCACTTGCTCAACCTCCAGAGGCAGGGGCTGGTCAGCCTGCAGCCAAGCCAAGCCTCAGGGCCCCTCCAGGCC  666

Query  649  CTTCCGCA---AGCTGTTTGCCCAACAGACCTGCCCCAGCTGTGGAAGGGCGAGGGTGCCCCCGGGCAGCCTGC  719
            ||.|||||   |||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  667  CTCCCGCAAGCAGCCGTGTGCCCGACAGACCTGCCCCAGCTGTGGAAAGGCGAGGGTGCCCCGGGGCAGCCCGC  740

Query  720  CGAGGACAGCGTCAAGCAGGAGGGGCTGGACCTCACTGGCACGGCCGCCACCGCTACCTCGTTTGCC-GCTCCC  792
            .||||||||||.||.|||||||||||||||||||.|..||||.||.|..||.||||||||||||||| || ||.
Sbjct  741  TGAGGACAGCGGCAGGCAGGAGGGGCTGGACCTCGCCAGCACAGCTGTTACTGCTACCTCGTTTGCCAGC-CCT  813

Query  793  CCCAAGGTCTCACCCCCCCTCTCCCACCATACCCTGCCCAACGGACAGCCTACTGTGCTCACATCTCGGAGAGA  866
            |||||||||||.||.||||||||||||||..||.|.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  CCCAAGGTCTCCCCGCCCCTCTCCCACCACCCCTTACCCAACGGACAACCCACTGTGCTCACATCTCGGAGAGA  887

Query  867  CAGCTCTTCCCACGAGGAGACCCCCGGCTCCCACCCCCTGTACGGACACGGAGAGTGCAAGTGGCCAGGCTGTG  940
            ||||||.|||||.||||||||||||.|.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  CAGCTCCTCCCATGAGGAGACCCCCAGTTCCCACCCTCTTTATGGACATGGGGAGTGCAAGTGGCCAGGCTGTG  961

Query  941  AGACCCTGTGTGAAGACCTGGGCCAGTTTATCAAACACCTCAACACAGAGCACGCCCTGGATGACCGGAGTACA  1014
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||.||.
Sbjct  962  AGACCCTGTGTGAAGACCTGGGCCAGTTTATCAAACACCTCAACACAGAACACGCTTTGGATGACCGGAGCACG  1035

Query 1015  GCCCAGTGCCGGGTACAGATGCAGGTGGTGCAGCAGCTGGAGATCCAGCTCGCCAAGGAGAGCGAGCGGCTGCA  1088
            |||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1036  GCCCAATGCCGCGTGCAGATGCAGGTGGTCCAACAGCTGGAGATCCAGCTGGCCAAGGAGAGTGAGCGGCTGCA  1109

Query 1089  GGCCATGATGGCCCACCTGCACATGCGGCCCTCGGAGCCCAAGCCCTTCAGCCAGCCAGTGACCGTCTCTGCAG  1162
            ||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||   |.|
Sbjct 1110  GGCCATGATGGCACATCTGCACATGCGGCCTTCAGAGCCCAAGCCCTTCAGCCAGCCAGTGACCGTCT---CCG  1180

Query 1163  CAGACTCATTCCCAGATGGTCTCGTGCACCCCCCGACCTCGGCCGCAGCCCCTGTCACCCCTCTACGGCCCCCT  1236
            |||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.||||||
Sbjct 1181  CAGACCCGTTCCCGGATGGCCTCGTGCACCCCCCAACTTCAGCCGCTGCCCCCGTCACACCCCTGCGTCCCCCT  1254

Query 1237  GGCCTGGAATCTGCCTCCCTGCATGGTGGGGGCCCAGCCCGTCGGAGAAGCAGTGACAAGTTCTGCTCCCCCAT  1310
            |||||||..||||||||..||||..||||||||||.|||||..|||||||.|.||||||.||||||||||||||
Sbjct 1255  GGCCTGGGCTCTGCCTCTTTGCACAGTGGGGGCCCTGCCCGCAGGAGAAGTAATGACAAATTCTGCTCCCCCAT  1328

Query 1311  CTCCTCAGAGCTGGCCCAGAATCATGAGTTCTACAAGAACGCCGACGTCCGGCCCCCCTTCACCTACGCCTCCC  1384
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1329  CTCCTCAGAGCTTGCCCAGAATCATGAGTTCTACAAGAACGCTGACGTCAGGCCCCCCTTCACCTACGCTTCCC  1402

Query 1385  TCATCCGCCAGGCCATCCTGGAAACCCCTGACAGGCAGCTGACCCTGAATGAGATCTATAACTGGTTCACCAGG  1458
            |.||||||||||||||.||||||||.||.||..||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1403  TTATCCGCCAGGCCATTCTGGAAACTCCAGATCGGCAGCTGACGCTAAATGAGATTTATAACTGGTTCACCAGG  1476

Query 1459  ATGTTCGCCTATTTCCGCAGAAACACTGCCACCTGGAAGAACGCCGTGCGCCACAACCTCAGCCTGCACAAGTG  1532
            |||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477  ATGTTCGCCTACTTCCGAAGAAACACGGCCACCTGGAAGAATGCCGTGCGCCACAACCTCAGCCTGCACAAGTG  1550

Query 1533  CTTCGTCCGCGTGGAGAACGTCAAGGGTGCCGTGTGGACTGTGGACGAGCGGGAGTATCAGAAGCGGAGACCGC  1606
            .||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1551  TTTCGTCCGTGTGGAGAACGTCAAGGGGGCCGTGTGGACTGTGGATGAGCGGGAATATCAGAAACGGAGACCGC  1624

Query 1607  CAAAGATGACAGGGAGCCCCACCCTGGTGAAGAACATGATCTCTGGCCTCAGCTATGGAGCACTTAATGCCAGC  1680
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1625  CAAAGATGACAGGGAGTCCCACTCTGGTGAAGAACATGATCTCGGGCCTCAGTTACGGGGCACTTAACGCCAGC  1698

Query 1681  TACCAGGCCGCCCTGGCCGAGAGCAGCTTCCCCCTCCTCAACAGCCCTGGCATGCTGAACCCTGGCTCCGCCAG  1754
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||.||.|||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1699  TACCAGGCTGCCCTGGCAGAGAGCAGCTTCCCTCTTCTCAGCAACCCCGGCATGCTGAACCCTGGCTCAGCCAG  1772

Query 1755  CAGCCTGCTGCCCCTCAGCCACGATGACGTGGGTGCCCCCGTGGAGCCGCTGCCCAGCAACGGCAGCAGCAGCC  1828
            ||||||.||||||||||||||.||.|||.||||||.|||.|.|||.||.||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1773  CAGCCTTCTGCCCCTCAGCCAGGAGGACCTGGGTGTCCCTGGGGAACCACTACCCAGCAATGGGAGCAGCAGCC  1846

Query 1829  CTCCTCGCCTCTCCCCGCCCCAGTACAGCCACCAGGTGCAGGTGAAGGAGGAGCCAGCAGAGGCAGAGGAAGAC  1902
            |.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||.|.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1847  CGCCTCGTCTTTCCCCTCCTCAGTACAGCCACCAGATACAAGTCAAAGAGGAGCCTGCAGAGGCAGAGGAAGAC  1920

Query 1903  AGGCAGCCCGGGCCTCCCCTGGGCGCCCCTAACCCCAGCGCCTCGGGGCCTCCGGAAGACAGGGACCTGGAGGA  1976
            .|.|.|||.|||||||||.||||||||||.|||||||||.|...|||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1921  CGACGGCCGGGGCCTCCCTTGGGCGCCCCCAACCCCAGCACTGTGGGGCCTCCAGAAGACAGGGACCTGGAGGA  1994

Query 1977  GGAGCTGCCGGGAGAAGAACTGTCC  2001
            |||.|||...|||||.||..|||||
Sbjct 1995  GGACCTGGGAGGAGAGGACATGTCC  2019