Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467359
• Subject: XM_011514289.2
• Aligned Length: 2061
• Identities: 1996
• Gaps: 60

Alignment

Query    1  ATGATGGTGGAATCTGCCTCCCTGACAATCAGGTCGGCTCCATCTGGTCAGAATGGCGTGGGCAGCCTCTCTGG  74
            ||||||||||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGGTGGAATCTGCCTCGGAGACAATCAGGTCGGCTCCATCTGGTCAGAATGGCGTGGGCAGCCTCTCTGG  74

Query   75  GCAAGCCGATGGCAGCAGCGGCGGGGCCACAGGGACAACTGCAAGTGGCACGGGCAGGGAAGTGACCACGGGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAAGCCGATGGCAGCAGCGGCGGGGCCACAGGGACAACTGCAAGTGGCACGGGCAGGGAAGTGACCACGGGTG  148

Query  149  CAGACAGCAATGGTGAGATGAGTCCCGCAGAGCTGCTGCACTTCCAGCAGCAACAGGCTCTCCAAGTGGCCCGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGACAGCAATGGTGAGATGAGTCCCGCAGAGCTGCTGCACTTCCAGCAGCAACAGGCTCTCCAAGTGGCCCGG  222

Query  223  CAGTTCCTGCTGCAGCAGGCCTCAGGCCTGAGCTCCCCAGGGAACAATGACAGCAAACAGTCTGCCTCTGCTGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGTTCCTGCTGCAGCAGGCCTCAGGCCTGAGCTCCCCAGGGAACAATGACAGCAAACAGTCTGCCTCTGCTGT  296

Query  297  GCAGGTGCCTGTGTCGGTGGCCATGATGTCGCCGCAGATGCTTACCCCGCAACAGATGCAGCAGATCCTGTCGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGGTGCCTGTGTCGGTGGCCATGATGTCGCCGCAGATGCTTACCCCGCAACAGATGCAGCAGATCCTGTCGC  370

Query  371  CCCCGCAGCTGCAGGCCTTGCTCCAGCAGCAGCAAGCCCTCATGCTCCAGCAGCTACAGGAGTACTACAAGAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCCGCAGCTGCAGGCCTTGCTCCAGCAGCAGCAAGCCCTCATGCTCCAGCAGCTACAGGAGTACTACAAGAAG  444

Query  445  CAGCAGGAGCAGCTCCACCTGCAGCTCCTCACCCAGCAGCAGGCTGGGAAACCGCAGCCCAAAGAGGCACTGGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGCAGGAGCAGCTCCACCTGCAGCTCCTCACCCAGCAGCAGGCTGGGAAACCGCAGCCCAAAGAGGCACTGGG  518

Query  519  GAACAAGCAGCTGGCCTTCCAGCAGCAGCTCCTGCAAATGCAACAGTTGCAGCAGCAGCACCTGCTCAACCTGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAACAAGCAGCTGGCCTTCCAGCAGCAGCTCCTGCAAATGCAACAGTTGCAGCAGCAGCACCTGCTCAACCTGC  592

Query  593  AGAGGCAGGGGCTGGTCAGCCTGCAGCCCAACCAAGCCTCGGGGCCCCTCCAGACCCTTCCGCA----------  656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
Sbjct  593  AGAGGCAGGGGCTGGTCAGCCTGCAGCCCAACCAAGCCTCGGGGCCCCTCCAGACCCTTCCGCAAGCCTCCCCT  666

Query  657  --------------AGCTGTTTGCCCAACAGACCTGCCCCAGCTGTGGAAGGGCGAGGGTGCCCCCGGGCAGCC  716
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCTCTCCCACAGCAGCTGTTTGCCCAACAGACCTGCCCCAGCTGTGGAAGGGCGAGGGTGCCCCCGGGCAGCC  740

Query  717  TGCCGAGGACAGCGTCAAGCAGGAGGGGCTGGACCTCACTGGCACGGCCGCCACCGCTACCTCGTTTGCCGCTC  790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCCGAGGACAGCGTCAAGCAGGAGGGGCTGGACCTCACTGGCACGGCCGCCACCGCTACCTCGTTTGCCGCTC  814

Query  791  CCCCCAAGGTCTCACCCCCCCTCTCCCACCATACCCTGCCCAACGGACAGCCTACTGTGCTCACATCTCGGAGA  864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCCCAAGGTCTCACCCCCCCTCTCCCACCATACCCTGCCCAACGGACAGCCTACTGTGCTCACATCTCGGAGA  888

Query  865  GACAGCTCTTCCCACGAGGAGACCCCCGGCTCCCACCCCCTGTACGGACACGGAGAGTGCAAGTGGCCAGGCTG  938
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACAGCTCTTCCCACGAGGAGACCCCCGGCTCCCACCCCCTGTACGGACACGGAGAGTGCAAGTGGCCAGGCTG  962

Query  939  TGAGACCCTGTGTGAAGACCTGGGCCAGTTTATCAAACACCTCAACACAGAGCACGCCCTGGATGACCGGAGTA  1012
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGAGACCCTGTGTGAAGACCTGGGCCAGTTTATCAAACACCTCAACACAGAGCACGCCCTGGATGACCGGAGTA  1036

Query 1013  CAGCCCAGTGCCGGGTACAGATGCAGGTGGTGCAGCAGCTGGAGATCCAGCTCGCCAAGGAGAGCGAGCGGCTG  1086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGCCCAGTGCCGGGTACAGATGCAGGTGGTGCAGCAGCTGGAGATCCAGCTCGCCAAGGAGAGCGAGCGGCTG  1110

Query 1087  CAGGCCATGATGGCCCACCTGCACATGCGGCCCTCGGAGCCCAAGCCCTTCAGCCAGCCA--------------  1146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
Sbjct 1111  CAGGCCATGATGGCCCACCTGCACATGCGGCCCTCGGAGCCCAAGCCCTTCAGCCAGCCACTGAACCCGGTCCC  1184

Query 1147  ----------------------GTGACCGTCTCTGCAGCAGACTCATTCCCAGATGGTCTCGTGCACCCCCCGA  1198
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGGCTCCTCCTCATTCTCCAAGGTGACCGTCTCTGCAGCAGACTCATTCCCAGATGGTCTCGTGCACCCCCCGA  1258

Query 1199  CCTCGGCCGCAGCCCCTGTCACCCCTCTACGGCCCCCTGGCCTGGAATCTGCCTCCCTGCATGGTGGGGGCCCA  1272
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCTCGGCCGCAGCCCCTGTCACCCCTCTACGGCCCCCTGGCCTGGGCTCTGCCTCCCTGCATGGTGGGGGCCCA  1332

Query 1273  GCCCGTCGGAGAAGCAGTGACAAGTTCTGCTCCCCCATCTCCTCAGAGCTGGCCCAGAATCATGAGTTCTACAA  1346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCCGTCGGAGAAGCAGTGACAAGTTCTGCTCCCCCATCTCCTCAGAGCTGGCCCAGAATCATGAGTTCTACAA  1406

Query 1347  GAACGCCGACGTCCGGCCCCCCTTCACCTACGCCTCCCTCATCCGCCAGGCCATCCTGGAAACCCCTGACAGGC  1420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAACGCCGACGTCCGGCCCCCCTTCACCTACGCCTCCCTCATCCGCCAGGCCATCCTGGAAACCCCTGACAGGC  1480

Query 1421  AGCTGACCCTGAATGAGATCTATAACTGGTTCACCAGGATGTTCGCCTATTTCCGCAGAAACACTGCCACCTGG  1494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGCTGACCCTGAATGAGATCTATAACTGGTTCACCAGGATGTTCGCCTATTTCCGCAGAAACACTGCCACCTGG  1554

Query 1495  AAGAACGCCGTGCGCCACAACCTCAGCCTGCACAAGTGCTTCGTCCGCGTGGAGAACGTCAAGGGTGCCGTGTG  1568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGAACGCCGTGCGCCACAACCTCAGCCTGCACAAGTGCTTCGTCCGCGTGGAGAACGTCAAGGGTGCCGTGTG  1628

Query 1569  GACTGTGGACGAGCGGGAGTATCAGAAGCGGAGACCGCCAAAGATGACAGGGAGCCCCACCCTGGTGAAGAACA  1642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GACTGTGGACGAGCGGGAGTATCAGAAGCGGAGACCGCCAAAGATGACAGGGAGCCCCACCCTGGTGAAGAACA  1702

Query 1643  TGATCTCTGGCCTCAGCTATGGAGCACTTAATGCCAGCTACCAGGCCGCCCTGGCCGAGAGCAGCTTCCCCCTC  1716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGATCTCTGGCCTCAGCTATGGAGCACTTAATGCCAGCTACCAGGCCGCCCTGGCCGAGAGCAGCTTCCCCCTC  1776

Query 1717  CTCAACAGCCCTGGCATGCTGAACCCTGGCTCCGCCAGCAGCCTGCTGCCCCTCAGCCACGATGACGTGGGTGC  1790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTCAACAGCCCTGGCATGCTGAACCCTGGCTCCGCCAGCAGCCTGCTGCCCCTCAGCCACGATGACGTGGGTGC  1850

Query 1791  CCCCGTGGAGCCGCTGCCCAGCAACGGCAGCAGCAGCCCTCCTCGCCTCTCCCCGCCCCAGTACAGCCACCAGG  1864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCCCGTGGAGCCGCTGCCCAGCAACGGCAGCAGCAGCCCTCCTCGCCTCTCCCCGCCCCAGTACAGCCACCAGG  1924

Query 1865  TGCAGGTGAAGGAGGAGCCAGCAGAGGCAGAGGAAGACAGGCAGCCCGGGCCTCCCCTGGGCGCCCCTAACCCC  1938
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGCAGGTGAAGGAGGAGCCAGCAGAGGCAGAGGAAGACAGGCAGCCCGGGCCTCCCCTGGGCGCCCCTAACCCC  1998

Query 1939  AGCGCCTCGGGGCCTCCGGAAGACAGGGACCTGGAGGAGGAGCTGCCGGGAGAAGAACTGTCC  2001
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AGCGCCTCGGGGCCTCCGGAAGACAGGGACCTGGAGGAGGAGCTGCCGGGAGAAGAACTGTCC  2061