Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467359
• Subject: XM_011514291.3
• Aligned Length: 2025
• Identities: 1996
• Gaps: 24

Alignment

Query    1  ATGATGGTGGAATCTGCCTCCCTGACAATCAGGTCGGCTCCATCTGGTCAGAATGGCGTGGGCAGCCTCTCTGG  74
            ||||||||||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGGTGGAATCTGCCTCGGAGACAATCAGGTCGGCTCCATCTGGTCAGAATGGCGTGGGCAGCCTCTCTGG  74

Query   75  GCAAGCCGATGGCAGCAGCGGCGGGGCCACAGGGACAACTGCAAGTGGCACGGGCAGGGAAGTGACCACGGGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAAGCCGATGGCAGCAGCGGCGGGGCCACAGGGACAACTGCAAGTGGCACGGGCAGGGAAGTGACCACGGGTG  148

Query  149  CAGACAGCAATGGTGAGATGAGTCCCGCAGAGCTGCTGCACTTCCAGCAGCAACAGGCTCTCCAAGTGGCCCGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGACAGCAATGGTGAGATGAGTCCCGCAGAGCTGCTGCACTTCCAGCAGCAACAGGCTCTCCAAGTGGCCCGG  222

Query  223  CAGTTCCTGCTGCAGCAGGCCTCAGGCCTGAGCTCCCCAGGGAACAATGACAGCAAACAGTCTGCCTCTGCTGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGTTCCTGCTGCAGCAGGCCTCAGGCCTGAGCTCCCCAGGGAACAATGACAGCAAACAGTCTGCCTCTGCTGT  296

Query  297  GCAGGTGCCTGTGTCGGTGGCCATGATGTCGCCGCAGATGCTTACCCCGCAACAGATGCAGCAGATCCTGTCGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGGTGCCTGTGTCGGTGGCCATGATGTCGCCGCAGATGCTTACCCCGCAACAGATGCAGCAGATCCTGTCGC  370

Query  371  CCCCGCAGCTGCAGGCCTTGCTCCAGCAGCAGCAAGCCCTCATGCTCCAGCAGCTACAGGAGTACTACAAGAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCCGCAGCTGCAGGCCTTGCTCCAGCAGCAGCAAGCCCTCATGCTCCAGCAGCTACAGGAGTACTACAAGAAG  444

Query  445  CAGCAGGAGCAGCTCCACCTGCAGCTCCTCACCCAGCAGCAGGCTGGGAAACCGCAGCCCAAAGAGGCACTGGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGCAGGAGCAGCTCCACCTGCAGCTCCTCACCCAGCAGCAGGCTGGGAAACCGCAGCCCAAAGAGGCACTGGG  518

Query  519  GAACAAGCAGCTGGCCTTCCAGCAGCAGCTCCTGCAAATGCAACAGTTGCAGCAGCAGCACCTGCTCAACCTGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAACAAGCAGCTGGCCTTCCAGCAGCAGCTCCTGCAAATGCAACAGTTGCAGCAGCAGCACCTGCTCAACCTGC  592

Query  593  AGAGGCAGGGGCTGGTCAGCCTGCAGCCCAACCAAGCCTCGGGGCCCCTCCAGACCCTTCCGCA----------  656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
Sbjct  593  AGAGGCAGGGGCTGGTCAGCCTGCAGCCCAACCAAGCCTCGGGGCCCCTCCAGACCCTTCCGCAAGCCTCCCCT  666

Query  657  --------------AGCTGTTTGCCCAACAGACCTGCCCCAGCTGTGGAAGGGCGAGGGTGCCCCCGGGCAGCC  716
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCTCTCCCACAGCAGCTGTTTGCCCAACAGACCTGCCCCAGCTGTGGAAGGGCGAGGGTGCCCCCGGGCAGCC  740

Query  717  TGCCGAGGACAGCGTCAAGCAGGAGGGGCTGGACCTCACTGGCACGGCCGCCACCGCTACCTCGTTTGCCGCTC  790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCCGAGGACAGCGTCAAGCAGGAGGGGCTGGACCTCACTGGCACGGCCGCCACCGCTACCTCGTTTGCCGCTC  814

Query  791  CCCCCAAGGTCTCACCCCCCCTCTCCCACCATACCCTGCCCAACGGACAGCCTACTGTGCTCACATCTCGGAGA  864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCCCAAGGTCTCACCCCCCCTCTCCCACCATACCCTGCCCAACGGACAGCCTACTGTGCTCACATCTCGGAGA  888

Query  865  GACAGCTCTTCCCACGAGGAGACCCCCGGCTCCCACCCCCTGTACGGACACGGAGAGTGCAAGTGGCCAGGCTG  938
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACAGCTCTTCCCACGAGGAGACCCCCGGCTCCCACCCCCTGTACGGACACGGAGAGTGCAAGTGGCCAGGCTG  962

Query  939  TGAGACCCTGTGTGAAGACCTGGGCCAGTTTATCAAACACCTCAACACAGAGCACGCCCTGGATGACCGGAGTA  1012
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGAGACCCTGTGTGAAGACCTGGGCCAGTTTATCAAACACCTCAACACAGAGCACGCCCTGGATGACCGGAGTA  1036

Query 1013  CAGCCCAGTGCCGGGTACAGATGCAGGTGGTGCAGCAGCTGGAGATCCAGCTCGCCAAGGAGAGCGAGCGGCTG  1086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGCCCAGTGCCGGGTACAGATGCAGGTGGTGCAGCAGCTGGAGATCCAGCTCGCCAAGGAGAGCGAGCGGCTG  1110

Query 1087  CAGGCCATGATGGCCCACCTGCACATGCGGCCCTCGGAGCCCAAGCCCTTCAGCCAGCCAGTGACCGTCTCTGC  1160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGGCCATGATGGCCCACCTGCACATGCGGCCCTCGGAGCCCAAGCCCTTCAGCCAGCCAGTGACCGTCTCTGC  1184

Query 1161  AGCAGACTCATTCCCAGATGGTCTCGTGCACCCCCCGACCTCGGCCGCAGCCCCTGTCACCCCTCTACGGCCCC  1234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGCAGACTCATTCCCAGATGGTCTCGTGCACCCCCCGACCTCGGCCGCAGCCCCTGTCACCCCTCTACGGCCCC  1258

Query 1235  CTGGCCTGGAATCTGCCTCCCTGCATGGTGGGGGCCCAGCCCGTCGGAGAAGCAGTGACAAGTTCTGCTCCCCC  1308
            |||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGGCCTGGGCTCTGCCTCCCTGCATGGTGGGGGCCCAGCCCGTCGGAGAAGCAGTGACAAGTTCTGCTCCCCC  1332

Query 1309  ATCTCCTCAGAGCTGGCCCAGAATCATGAGTTCTACAAGAACGCCGACGTCCGGCCCCCCTTCACCTACGCCTC  1382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCTCCTCAGAGCTGGCCCAGAATCATGAGTTCTACAAGAACGCCGACGTCCGGCCCCCCTTCACCTACGCCTC  1406

Query 1383  CCTCATCCGCCAGGCCATCCTGGAAACCCCTGACAGGCAGCTGACCCTGAATGAGATCTATAACTGGTTCACCA  1456
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCTCATCCGCCAGGCCATCCTGGAAACCCCTGACAGGCAGCTGACCCTGAATGAGATCTATAACTGGTTCACCA  1480

Query 1457  GGATGTTCGCCTATTTCCGCAGAAACACTGCCACCTGGAAGAACGCCGTGCGCCACAACCTCAGCCTGCACAAG  1530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGATGTTCGCCTATTTCCGCAGAAACACTGCCACCTGGAAGAACGCCGTGCGCCACAACCTCAGCCTGCACAAG  1554

Query 1531  TGCTTCGTCCGCGTGGAGAACGTCAAGGGTGCCGTGTGGACTGTGGACGAGCGGGAGTATCAGAAGCGGAGACC  1604
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGCTTCGTCCGCGTGGAGAACGTCAAGGGTGCCGTGTGGACTGTGGACGAGCGGGAGTATCAGAAGCGGAGACC  1628

Query 1605  GCCAAAGATGACAGGGAGCCCCACCCTGGTGAAGAACATGATCTCTGGCCTCAGCTATGGAGCACTTAATGCCA  1678
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCCAAAGATGACAGGGAGCCCCACCCTGGTGAAGAACATGATCTCTGGCCTCAGCTATGGAGCACTTAATGCCA  1702

Query 1679  GCTACCAGGCCGCCCTGGCCGAGAGCAGCTTCCCCCTCCTCAACAGCCCTGGCATGCTGAACCCTGGCTCCGCC  1752
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCTACCAGGCCGCCCTGGCCGAGAGCAGCTTCCCCCTCCTCAACAGCCCTGGCATGCTGAACCCTGGCTCCGCC  1776

Query 1753  AGCAGCCTGCTGCCCCTCAGCCACGATGACGTGGGTGCCCCCGTGGAGCCGCTGCCCAGCAACGGCAGCAGCAG  1826
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGCAGCCTGCTGCCCCTCAGCCACGATGACGTGGGTGCCCCCGTGGAGCCGCTGCCCAGCAACGGCAGCAGCAG  1850

Query 1827  CCCTCCTCGCCTCTCCCCGCCCCAGTACAGCCACCAGGTGCAGGTGAAGGAGGAGCCAGCAGAGGCAGAGGAAG  1900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCCTCCTCGCCTCTCCCCGCCCCAGTACAGCCACCAGGTGCAGGTGAAGGAGGAGCCAGCAGAGGCAGAGGAAG  1924

Query 1901  ACAGGCAGCCCGGGCCTCCCCTGGGCGCCCCTAACCCCAGCGCCTCGGGGCCTCCGGAAGACAGGGACCTGGAG  1974
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACAGGCAGCCCGGGCCTCCCCTGGGCGCCCCTAACCCCAGCGCCTCGGGGCCTCCGGAAGACAGGGACCTGGAG  1998

Query 1975  GAGGAGCTGCCGGGAGAAGAACTGTCC  2001
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAGGAGCTGCCGGGAGAAGAACTGTCC  2025