Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467359
• Subject: XM_017317688.2
• Aligned Length: 2077
• Identities: 1771
• Gaps: 80

Alignment

Query    1  ATGATGGTGGAATCTGCCTCCCTGACAATCAGGTCGGCTCCATCTGGTCAGAATGGCGTGGGCAGCCTCTCTGG  74
            |||||||||||.|||||.||...||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||.
Sbjct    1  ATGATGGTGGAGTCTGCATCGGAGACAATCAGGTCGGCTCCGTCTGGTCAGAACGGCGTGGGCAGCCTCTCTGC  74

Query   75  GCAAGCCGATGGCAGCAGCGG---CGGGGCCACAGGGA------CAACTGCAAG------TGGCACGGGCAGGG  133
            |||.||.||||||.||.|.||   ||||.||.|.||.|      |..||||..|      ||.|.|.|||||||
Sbjct   75  GCAGGCTGATGGCGGCGGTGGGGCCGGGACCGCGGGCACGGCCCCGGCTGCCGGTAGGGATGCCTCAGGCAGGG  148

Query  134  AAGTGACCA-CG--GGTGCAGACAGCAATGGTGAGATGAGTCCCGCAGAGCTGCTGCACTTCCAGCAGCAACAG  204
            |||...||| ||  ||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  AAGCAGCCAGCGGAGGAGCCGACAGCAATGGCGAGATGAGCCCCGCGGAGCTTCTGCACTTCCAACAGCAACAG  222

Query  205  GCTCTCCAAGTGGCCCGGCAGTTCCTGCTGCAGCAGGCCTCAGGCCTGAGCTCCCCAGGGAACAATGACAGCAA  278
            ||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||..||||||.||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  223  GCTCTCCAGGTGGCCCGGCAGTTCCTGTTGCAGCAAGCCTCCAGCCTGAACTCCCCGGGGAACAATGACAGTAA  296

Query  279  ACAGTCTGCCTCTGCTGTGCAGGTGCCTGTGTCGGTGGCCATGATGTCGCCGCAGATGCTTACCCCGCAACAGA  352
            ||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||.||||
Sbjct  297  ACAGTCGGCCTCTGCGGTGCAGGTGCCTGTGTCTGTGGCCATGATGTCCCAGCAGATGCTTACCCCCCAGCAGA  370

Query  353  TGCAGCAGATCCTGTCGCCCCCGCAGCTGCAGGCCTTGCTCCAGCAGCAGCAAGCCCTCATGCTCCAGCAGCTA  426
            |||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct  371  TGCAGCAGATCCTGTCGCCACCTCAGCTGCAGGCCTTGCTGCAGCAGCAACAGGCTCTCATGCTCCAGCAGCTG  444

Query  427  CAGGAGTACTACAAGAAGCAGCAGGAGCAGCTCCACCTGCAGCTCCTCACCCAGCAGCAGGCTGGGAAACCGCA  500
            ||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct  445  CAGGAGTATTACAAGAAGCAGCAAGAGCAGCTCCACCTGCAGCTCCTCACCCAGCAGCAGGCTGGAAAACAGCA  518

Query  501  GCCCAAAGAGGCACTGGGGAACAAGCAGCTGGCCTTCCAGCAGCAGCTCCTGCAAATGCAACAGTTGCAGCAGC  574
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  519  GCCCAAAGAGGCCCTGGGGAACAAGCAGCTGGCCTTCCAGCAGCAGCTCCTGCAGATGCAACAGTTGCAGCAAC  592

Query  575  AGCACCTGCTCAACCTGCAGAGGCAGGGGCTGGTCAGCCTGCAGCCCAACCAAGCCTCGGGGCCCCTCCAGACC  648
            |||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||.||
Sbjct  593  AGCACTTGCTCAACCTCCAGAGGCAGGGGCTGGTCAGCCTGCAGCCAAGCCAAGCCTCAGGGCCCCTCCAGGCC  666

Query  649  CTTCCGCAAGCTGTTTGCCCAACAGACCTGCCCCAGCTGTGGAAGGGCGAGGGTGCCCCCGGGCAGCCTGCCGA  722
            ||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  667  CTCCCGCAAGCCGTGTGCCCGACAGACCTGCCCCAGCTGTGGAAAGGCGAGGGTGCCCCGGGGCAGCCCGCTGA  740

Query  723  GGACAGCGTCAAGCAGGAGGGGCTGGACCTCACTGGCACGGCCGCCACCGCTACCTCGTTTGCC-GCTCCCCCC  795
            ||||||||.||.|||||||||||||||||||.|..||||.||.|..||.||||||||||||||| || ||.|||
Sbjct  741  GGACAGCGGCAGGCAGGAGGGGCTGGACCTCGCCAGCACAGCTGTTACTGCTACCTCGTTTGCCAGC-CCTCCC  813

Query  796  AAGGTCTCACCCCCCCTCTCCCACCATACCCTGCCCAACGGACAGCCTACTGTGCTCACATCTCGGAGAGACAG  869
            ||||||||.||.||||||||||||||..||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  AAGGTCTCCCCGCCCCTCTCCCACCACCCCTTACCCAACGGACAACCCACTGTGCTCACATCTCGGAGAGACAG  887

Query  870  CTCTTCCCACGAGGAGACCCCCGGCTCCCACCCCCTGTACGGACACGGAGAGTGCAAGTGGCCAGGCTGTGAGA  943
            |||.|||||.||||||||||||.|.||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  CTCCTCCCATGAGGAGACCCCCAGTTCCCACCCTCTTTATGGACATGGGGAGTGCAAGTGGCCAGGCTGTGAGA  961

Query  944  CCCTGTGTGAAGACCTGGGCCAGTTTATCAAACACCTCAACACAGAGCACGCCCTGGATGACCGGAGTACAGCC  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||.||.|||
Sbjct  962  CCCTGTGTGAAGACCTGGGCCAGTTTATCAAACACCTCAACACAGAACACGCTTTGGATGACCGGAGCACGGCC  1035

Query 1018  CAGTGCCGGGTACAGATGCAGGTGGTGCAGCAGCTGGAGATCCAGCTCGCCAAGGAGAGCGAGCGGCTGCAGGC  1091
            ||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1036  CAATGCCGCGTGCAGATGCAGGTGGTCCAACAGCTGGAGATCCAGCTGGCCAAGGAGAGTGAGCGGCTGCAGGC  1109

Query 1092  CATGATGGCCCACCTGCACATGCGGCCCTCGGAGCCCAAGCCCTTCAGCCAGCCA-------------------  1146
            |||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct 1110  CATGATGGCACATCTGCACATGCGGCCTTCAGAGCCCAAGCCCTTCAGCCAGCCACACCTACCCCATTGCTCAC  1183

Query 1147  --------------------------------------GTGACCGTCTCTGCAGCAGACTCATTCCCAGATGGT  1182
                                                  ||||||||||   |.||||||.|.|||||.|||||.
Sbjct 1184  AGCTGAACCCAGTCCCTGGCTCCTCCTCATTCTCCAAGGTGACCGTCT---CCGCAGACCCGTTCCCGGATGGC  1254

Query 1183  CTCGTGCACCCCCCGACCTCGGCCGCAGCCCCTGTCACCCCTCTACGGCCCCCTGGCCTGGAATCTGCCTCCCT  1256
            ||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||..||||||||..|
Sbjct 1255  CTCGTGCACCCCCCAACTTCAGCCGCTGCCCCCGTCACACCCCTGCGTCCCCCTGGCCTGGGCTCTGCCTCTTT  1328

Query 1257  GCATGGTGGGGGCCCAGCCCGTCGGAGAAGCAGTGACAAGTTCTGCTCCCCCATCTCCTCAGAGCTGGCCCAGA  1330
            |||..||||||||||.|||||..|||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1329  GCACAGTGGGGGCCCTGCCCGCAGGAGAAGTAATGACAAATTCTGCTCCCCCATCTCCTCAGAGCTTGCCCAGA  1402

Query 1331  ATCATGAGTTCTACAAGAACGCCGACGTCCGGCCCCCCTTCACCTACGCCTCCCTCATCCGCCAGGCCATCCTG  1404
            ||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1403  ATCATGAGTTCTACAAGAACGCTGACGTCAGGCCCCCCTTCACCTACGCTTCCCTTATCCGCCAGGCCATTCTG  1476

Query 1405  GAAACCCCTGACAGGCAGCTGACCCTGAATGAGATCTATAACTGGTTCACCAGGATGTTCGCCTATTTCCGCAG  1478
            |||||.||.||..||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1477  GAAACTCCAGATCGGCAGCTGACGCTAAATGAGATTTATAACTGGTTCACCAGGATGTTCGCCTACTTCCGAAG  1550

Query 1479  AAACACTGCCACCTGGAAGAACGCCGTGCGCCACAACCTCAGCCTGCACAAGTGCTTCGTCCGCGTGGAGAACG  1552
            ||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1551  AAACACGGCCACCTGGAAGAATGCCGTGCGCCACAACCTCAGCCTGCACAAGTGTTTCGTCCGTGTGGAGAACG  1624

Query 1553  TCAAGGGTGCCGTGTGGACTGTGGACGAGCGGGAGTATCAGAAGCGGAGACCGCCAAAGATGACAGGGAGCCCC  1626
            |||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1625  TCAAGGGGGCCGTGTGGACTGTGGATGAGCGGGAATATCAGAAACGGAGACCGCCAAAGATGACAGGGAGTCCC  1698

Query 1627  ACCCTGGTGAAGAACATGATCTCTGGCCTCAGCTATGGAGCACTTAATGCCAGCTACCAGGCCGCCCTGGCCGA  1700
            ||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1699  ACTCTGGTGAAGAACATGATCTCGGGCCTCAGTTACGGGGCACTTAACGCCAGCTACCAGGCTGCCCTGGCAGA  1772

Query 1701  GAGCAGCTTCCCCCTCCTCAACAGCCCTGGCATGCTGAACCCTGGCTCCGCCAGCAGCCTGCTGCCCCTCAGCC  1774
            ||||||||||||.||.||||.||.|||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1773  GAGCAGCTTCCCTCTTCTCAGCAACCCCGGCATGCTGAACCCTGGCTCAGCCAGCAGCCTTCTGCCCCTCAGCC  1846

Query 1775  ACGATGACGTGGGTGCCCCCGTGGAGCCGCTGCCCAGCAACGGCAGCAGCAGCCCTCCTCGCCTCTCCCCGCCC  1848
            |.||.|||.||||||.|||.|.|||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.
Sbjct 1847  AGGAGGACCTGGGTGTCCCTGGGGAACCACTACCCAGCAATGGGAGCAGCAGCCCGCCTCGTCTTTCCCCTCCT  1920

Query 1849  CAGTACAGCCACCAGGTGCAGGTGAAGGAGGAGCCAGCAGAGGCAGAGGAAGACAGGCAGCCCGGGCCTCCCCT  1922
            |||||||||||||||.|.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||.|.|.|||.|||||||||.|
Sbjct 1921  CAGTACAGCCACCAGATACAAGTCAAAGAGGAGCCTGCAGAGGCAGAGGAAGACCGACGGCCGGGGCCTCCCTT  1994

Query 1923  GGGCGCCCCTAACCCCAGCGCCTCGGGGCCTCCGGAAGACAGGGACCTGGAGGAGGAGCTGCCGGGAGAAGAAC  1996
            |||||||||.|||||||||.|...|||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||...|||||.||..
Sbjct 1995  GGGCGCCCCCAACCCCAGCACTGTGGGGCCTCCAGAAGACAGGGACCTGGAGGAGGACCTGGGAGGAGAGGACA  2068

Query 1997  TGTCC  2001
            |||||
Sbjct 2069  TGTCC  2073