Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467405
• Subject: NM_001346911.1
• Aligned Length: 1142
• Identities: 942
• Gaps: 197

Alignment

Query    1  ATGGAAAAGTATGAAAAATTAGCTAAGACTGGAGAAGGGTCTTATGGGGTTGTATTCAAATGCAGAAACAAAAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAAAGTATGAAAAATTAGCTAAGACTGGAGAAGGGTCTTATGGGGTTGTATTCAAATGCAGAAACAAAAC  74

Query   75  CTCTGGACAAGTAGTAGCTGTTAAAAAATTTGTGGAATCTGAAGATGATCCTGTTGTTAAGAAAATAGCACTAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCTGGACAAGTAGTAGCTGTTAAAAAATTTGTGGAATCTGAAGATGATCCTGTTGTTAAGAAAATAGCACTAA  148

Query  149  GAGAAATACGTATGTTGAAGCAAATTAAAACAATNCCAAATCTTGTGAACCTCATCGAAGGTGTTCAGGAGAAA  222
            ||||||||||||||||||||| ||||||||||  .|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct  149  GAGAAATACGTATGTTGAAGC-AATTAAAACA--TCCAAATCTTGTGAACCTCATCG-AGGTGTTCAGGAG-AA  217

Query  223  AAAGGAAAATGCATTTAGTTTTTGAATACTGTGATCATACACTTTTAAATGAGCTGGAAAGAAACCCAAATGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  218  AAAGGAAAATGCATTTAGTTTTTGAATACTGTGATCATACACTTTTAAATGAGCTGGAAAGAAACCCAAATGGA  291

Query  297  GTTGCTGATGGAGTGATCAAAAGCGTATTATGGCAAACACTTCAAGCTCTTAATTTCTGTCATATACATAACTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  292  GTTGCTGATGGAGTGATCAAAAGCGTATTATGGCAAACACTTCAAGCTCTTAATTTCTGTCATATACATAACTG  365

Query  371  TATTCACAGAGATATAAAACCTGAAAATATTCTAATAACTAAGCAAGGAATAATCAAGATTTGTGACTTCGGGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  366  TATTCACAGAGATATAAAACCTGAAAATATTCTAATAACTAAGCAAGGAATAATCAAGATTTGTGACTTCGGGT  439

Query  445  TTGCACAAATTCTGATTCCAGGAGATGCCTACACCGATTATGTAGCTACGAGATGGTACCGAGCTCCTGAACTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  TTGCACAAATTCTGATTCCAGGAGATGCCTACACCGATTATGTAGCTACGAGATGGTACCGAGCTCCTGAACTT  513

Query  519  CTTGTGGGAGATACTCAGTATGGTTCTTCAGTCGATATATGGGCTATTGGTTGTGTTTTTGCAGAGCTCCTGAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  514  CTTGTGGGAGATACTCAGTATGGTTCTTCAGTCGATATATGGGCTATTGGTTGTGTTTTTGCAGAGCTCCTGAC  587

Query  593  AGGCCAGCCACTGTGGCCTGGAAAATCAGATGTGGACCAACTTTATCTGATAATCAGAACACTAGGAAAATTAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  588  AGGCCAGCCACTGTGGCCTGGAAAATCAGATGTGGACCAACTTTATCTGATAATCAGAACACTAGGAAAATTAA  661

Query  667  TCCCAAGACATCAATCAATCTTTAAAAGTAACGGGTTTTTCCATGGCATCAGTATACCTGAGCCAGAAGACATG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  662  TCCCAAGACATCAATCAATCTTTAAAAGTAACGGGTTTTTCCATGGCATCAGTATACCTGAGCCAGAAGACATG  735

Query  741  GAAACTCTTGAGGAAAAGTTCTCAGATGTTCATCCTGTGGCTCTGAACTTCATGAAGGGGTGTCTGAAGATGAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  736  GAAACTCTTGAGGAAAAGTTCTCAGATGTTCATCCTGTGGCTCTGAACTTCATGAAGGGGTGTCTGAAGATGAA  809

Query  815  TCCAGATGACAGATTAACCTGTTCCCAACTCCTGGAGAGCTCCTACTTTGATTCTTTTCAAGAGGCCCAAATTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  810  TCCAGATGACAGATTAACCTGTTCCCAACTCCTGGAGAGCTCCTACTTTGATTCTTTTCAAGAGGCCCAAATTA  883

Query  889  AAAGAAAAGCACGTAATGAAGGAAGAAACAGAAGACGCCAA---CAGGTAC------------TTCC-------  940
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||.||            ||||       
Sbjct  884  AAAGAAAAGCACGTAATGAAGGAAGAAACAGAAGACGCCAACAGCAGGCACCTAAGTCTGCCTTTCCTAGGCTT  957

Query  941  --GCTCAAAA--------------GT------------------------------------------------  950
              .|||||||              ||                                                
Sbjct  958  TTTCTCAAAACCAAGATCTGCCAGGTACAAAGGAATGAAACCCAGACATCTGGGAACCAAATTCTACCCAATGG  1031

Query  951  --------------------------------------------------------------------------  950
                                                                                      
Sbjct 1032  GCCAATATTGCAGAACAGTATGGTGACTGTTATGACAAACATTAATTCTGCAGTTTATCAGGTGACTGTCCTTC  1105

Query  951  --------------------------------  950
                                            
Sbjct 1106  ACTTGCTTTCAGAAAACTTTGAAGTTAAATCG  1137