Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467405
• Subject: XM_011532817.2
• Aligned Length: 1033
• Identities: 815
• Gaps: 213

Alignment

Query    1  ATGGAAAAGTATGAAAAATTAGCTAAGACTGGAGAAGGGTCTTATGGGGTTGTATTCAAATGCAGAAACAAAAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAAAGTATGAAAAATTAGCTAAGACTGGAGAAGGGTCTTATGGGGTTGTATTCAAATGCAGAAACAAAAC  74

Query   75  CTCTGGACAAGTAGTAGCTGTTAAAAAATTTGTGGAATCTGAAGATGATCCTGTTGTTAAGAAAATAGCACTAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCTGGACAAGTAGTAGCTGTTAAAAAATTTGTGGAATCTGAAGATGATCCTGTTGTTAAGAAAATAGCACTAA  148

Query  149  GAGAAATACGTATGTTGAAGCAAATTAAAACAATNCCAAATCTTGTGAACCTCATCGAAGGTGTTCAGGAGAAA  222
            ||||||||||||||||||||| ||||||||||  .|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct  149  GAGAAATACGTATGTTGAAGC-AATTAAAACA--TCCAAATCTTGTGAACCTCATCG-AGGTGTTCAGGAG-AA  217

Query  223  AAAGGAAAATGCATTTAGTTTTTGAATACTGTGATCATACACTTTTAAATGAGCTGGAAAGAAACCCAAATGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  218  AAAGGAAAATGCATTTAGTTTTTGAATACTGTGATCATACACTTTTAAATGAGCTGGAAAGAAACCCAAATGGA  291

Query  297  GTTGCTGATGGAGTGATCAAAAGCGTATTATGGCAAACACTTCAAGCTCTTAATTTCTGTCATATACATAACTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  292  GTTGCTGATGGAGTGATCAAAAGCGTATTATGGCAAACACTTCAAGCTCTTAATTTCTGTCATATACATAACTG  365

Query  371  TATTCACAGAGATATAAAACCTGAAAATATTCTAATAACTAAGCAAGGAATAATCAAGATTTGTGACTTCGGGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  366  TATTCACAGAGATATAAAACCTGAAAATATTCTAATAACTAAGCAAGGAATAATCAAGATTTGTGACTTCGGGT  439

Query  445  TTGCACAAATTCTGATTCCAGGAGATGCCTACACCGATTATGTAGCTACGAGATGGTACCGAGCTCCTGAACTT  518
            |||||||||||||||                                                           
Sbjct  440  TTGCACAAATTCTGA-----------------------------------------------------------  454

Query  519  CTTGTGGGAGATACTCAGTATGGTTCTTCAGTCGATATATGGGCTATTGGTTGTGTTTTTGCAGAGCTCCTGAC  592
                                                                            ||||||||||
Sbjct  455  ----------------------------------------------------------------AGCTCCTGAC  464

Query  593  AGGCCAGCCACTGTGGCCTGGAAAATCAGATGTGGACCAACTTTATCTGATAATCAGAACACTAGGAAAATTAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  465  AGGCCAGCCACTGTGGCCTGGAAAATCAGATGTGGACCAACTTTATCTGATAATCAGAACACTAGGAAAATTAA  538

Query  667  TCCCAAGACATCAATCAATCTTTAAAAGTAACGGGTTTTTCCATGGCATCAGTATACCTGAGCCAGAAGACATG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  539  TCCCAAGACATCAATCAATCTTTAAAAGTAACGGGTTTTTCCATGGCATCAGTATACCTGAGCCAGAAGACATG  612

Query  741  GAAACTCTTGAGGAAAAGTTCTCAGATGTTCATCCTGTGGCTCTGAACTTCATGAAGGGGTGTCTGAAGATGAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  613  GAAACTCTTGAGGAAAAGTTCTCAGATGTTCATCCTGTGGCTCTGAACTTCATGAAGGGGTGTCTGAAGATGAA  686

Query  815  TCCAGATGACAGATTAACCTGTTCCCAACTCCTGGAGAGCTCCTACTTTGATTCTTTTCAAGAGGCCCAAATTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  687  TCCAGATGACAGATTAACCTGTTCCCAACTCCTGGAGAGCTCCTACTTTGATTCTTTTCAAGAGGCCCAAATTA  760

Query  889  AAAGAAAAGCACGTAATGAAGGAAGAAACAGAAGACGCCAACAG--------GTACTTCCGCTCAAA--AGT--  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||  |.||.||||.|  ||.  
Sbjct  761  AAAGAAAAGCACGTAATGAAGGAAGAAACAGAAGACGCCAACAGAATCAACTGT--TGCCTCTCATACCAGGAA  832

Query  951  -----------------------------------------------------------------------  950
                                                                                   
Sbjct  833  GCCACATCTCCCCCACACCTGATGGAAGAAAACAAGTCCTCCAGTTAAAATTTGATCACCTTCCAAACATT  903