Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467477
- Subject:
- NM_001143677.2
- Aligned Length:
- 1384
- Identities:
- 1263
- Gaps:
- 98
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------ATGACGGTGAAAACTGAGGCTGCTA 25
||..|.|..|.||||| |||| |||
Sbjct 1 ATGTCATCTCAGAGTTCCAGCTTATCAGAGGCATGTAGCAGGGAGGCTTATTCCAGCCATAACTG-GGCT-CTA 72
Query 26 AGGGCACCCTC---ACTTACTCC----------------------------AGGATGAGGGGCATG--GTGGCA 66
....||.|||| |..||.||| ||.|||| |.| |..||.
Sbjct 73 CCTCCAGCCTCCAGAAGTAATCCCCAACCTGCATATCCTTGGGCAACCCGAAGAATGA-----AAGAAGAAGCT 141
Query 67 AT---------TCTCATCGCTTTCATGAAGCAGAGGAGGATGGGTCTGAACGACTTTATTCAGAAGATTGCCAA 131
|| |.|.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 142 ATAAAACCCCCTTTGAAAGCTTTCATGAAGCAGAGGAGGATGGGTCTGAACGACTTTATTCAGAAGATTGCCAA 215
Query 132 TAACTCCTATGCATGCAAACACCCTGAAGTTCAGTCCATCTTGAAGATCTCCCAACCTCAGGAGCCTGAGCTTA 205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 216 TAACTCCTATGCATGCAAACACCCTGAAGTTCAGTCCATCTTGAAGATCTCCCAACCTCAGGAGCCTGAGCTTA 289
Query 206 TGAATGCCAACCCTTCTCCTCCACCAAGTCCTTCTCAGCAAATCAACCTTGGCCCGTCGTCCAATCCTCATGCT 279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 290 TGAATGCCAACCCTTCTCCTCCACCAAGTCCTTCTCAGCAAATCAACCTTGGCCCGTCGTCCAATCCTCATGCT 363
Query 280 AAACCATCTGACTTTCACTTCTTGAAAGTGATCGGAAAGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTAGCAAGACACAA 353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 AAACCATCTGACTTTCACTTCTTGAAAGTGATCGGAAAGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTAGCAAGACACAA 437
Query 354 GGCAGAAGAAGTGTTCTATGCAGTCAAAGTTTTACAGAAGAAAGCAATCCTGAAAAAGAAAGAGGAGAAGCATA 427
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 438 GGCAGAAGAAGTGTTCTATGCAGTCAAAGTTTTACAGAAGAAAGCAATCCTGAAAAAGAAAGAGGAGAAGCATA 511
Query 428 TTATGTCGGAGCGGAATGTTCTGTTGAAGAATGTGAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCTTTCCAG 501
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 512 TTATGTCGGAGCGGAATGTTCTGTTGAAGAATGTGAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCTTTCCAG 585
Query 502 ACTGCTGACAAATTGTACTTTGTCCTAGACTACATTAATGGTGGAGAGTTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAACG 575
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 586 ACTGCTGACAAATTGTACTTTGTCCTAGACTACATTAATGGTGGAGAGTTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAACG 659
Query 576 CTGCTTCCTGGAACCACGGGCTCGTTTCTATGCTGCTGAAATAGCCAGTGCCTTGGGCTACCTGCATTCACTGA 649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 CTGCTTCCTGGAACCACGGGCTCGTTTCTATGCTGCTGAAATAGCCAGTGCCTTGGGCTACCTGCATTCACTGA 733
Query 650 ACATCGTTTATAGAGACTTAAAACCAGAGAATATTTTGCTAGATTCACAGGGACACATTGTCCTTACTGACTTC 723
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734 ACATCGTTTATAGAGACTTAAAACCAGAGAATATTTTGCTAGATTCACAGGGACACATTGTCCTTACTGACTTC 807
Query 724 GGACTCTGCAAGGAGAACATTGAACACAACAGCACAACATCCACCTTCTGTGGCACGCCGGAGTATCTCGCACC 797
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 GGACTCTGCAAGGAGAACATTGAACACAACAGCACAACATCCACCTTCTGTGGCACGCCGGAGTATCTCGCACC 881
Query 798 TGAGGTGCTTCATAAGCAGCCTTATGACAGGACTGTGGACTGGTGGTGCCTGGGAGCTGTCTTGTATGAGATGC 871
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 TGAGGTGCTTCATAAGCAGCCTTATGACAGGACTGTGGACTGGTGGTGCCTGGGAGCTGTCTTGTATGAGATGC 955
Query 872 TGTATGGCCTGCCGCCTTTTTATAGCCGAAACACAGCTGAAATGTACGACAACATTCTGAACAAGCCTCTCCAG 945
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 956 TGTATGGCCTGCCGCCTTTTTATAGCCGAAACACAGCTGAAATGTACGACAACATTCTGAACAAGCCTCTCCAG 1029
Query 946 CTGAAACCAAATATTACAAATTCCGCAAGACACCTCCTGGAGGGCCTCCTGCAGAAGGACAGGACAAAGCGGCT 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 CTGAAACCAAATATTACAAATTCCGCAAGACACCTCCTGGAGGGCCTCCTGCAGAAGGACAGGACAAAGCGGCT 1103
Query 1020 CGGGGCCAAGGATGACTTCATGGAGATTAAGAGTCATGTCTTCTTCTCCTTAATTAACTGGGATGATCTCATTA 1093
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104 CGGGGCCAAGGATGACTTCATGGAGATTAAGAGTCATGTCTTCTTCTCCTTAATTAACTGGGATGATCTCATTA 1177
Query 1094 ATAAGAAGATTACTCCCCCTTTTAACCCAAATGTGAGTGGGCCCAACGACCTACGGCACTTTGACCCCGAGTTT 1167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 ATAAGAAGATTACTCCCCCTTTTAACCCAAATGTGAGTGGGCCCAACGACCTACGGCACTTTGACCCCGAGTTT 1251
Query 1168 ACCGAAGAGCCTGTCCCCAACTCCATTGGCAAGTCCCCTGACAGCGTCCTCGTCACAGCCAGCGTCAAGGAAGC 1241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 ACCGAAGAGCCTGTCCCCAACTCCATTGGCAAGTCCCCTGACAGCGTCCTCGTCACAGCCAGCGTCAAGGAAGC 1325
Query 1242 TGCCGAGGCTTTCCTAGGCTTTTCCTATGCGCCTCCCACGGACTCTTTCCTC 1293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1326 TGCCGAGGCTTTCCTAGGCTTTTCCTATGCGCCTCCCACGGACTCTTTCCTC 1377