Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467477
- Subject:
- NM_011361.3
- Aligned Length:
- 1295
- Identities:
- 1149
- Gaps:
- 4
Alignment
Query 1 ATGACGGTGAAAACTGAGGCTGCT--AAGGGCACCCTCACTTACTCCAGGATGAGGGGCATGGTGGCAATTCTC 72
|||||.||.|||.|.||||||||| || |||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1 ATGACCGTCAAAGCCGAGGCTGCTCGAA--GCACCCTTACCTACTCCAGAATGAGGGGAATGGTAGCGATTCTC 72
Query 73 ATCGCTTTCATGAAGCAGAGGAGGATGGGTCTGAACGACTTTATTCAGAAGATTGCCAATAACTCCTATGCATG 146
||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||..|||.||||||||||
Sbjct 73 ATCGCTTTTATGAAACAGAGAAGGATGGGCCTGAACGATTTTATTCAGAAGATTGCCAGCAACACCTATGCATG 146
Query 147 CAAACACCCTGAAGTTCAGTCCATCTTGAAGATCTCCCAACCTCAGGAGCCTGAGCTTATGAATGCCAACCCTT 220
|||||||.||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 147 CAAACACGCTGAAGTTCAGTCCATTTTGAAAATGTCCCATCCTCAGGAGCCGGAGCTTATGAACGCTAACCCCT 220
Query 221 CTCCTCCACCAAGTCCTTCTCAGCAAATCAACCTTGGCCCGTCGTCCAATCCTCATGCTAAACCATCTGACTTT 294
|||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||
Sbjct 221 CTCCTCCGCCAAGTCCCTCTCAACAAATCAACCTGGGTCCGTCCTCCAACCCTCACGCCAAACCCTCCGACTTT 294
Query 295 CACTTCTTGAAAGTGATCGGAAAGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTAGCAAGACACAAGGCAGAAGAAGTGTT 368
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 295 CACTTCTTGAAAGTGATCGGAAAGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTGGCTAGGCACAAGGCAGAAGAAGTATT 368
Query 369 CTATGCAGTCAAAGTTTTACAGAAGAAAGCAATCCTGAAAAAGAAAGAGGAGAAGCATATTATGTCGGAGCGGA 442
||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 369 CTATGCAGTCAAAGTTTTACAGAAGAAAGCCATCCTGAAGAAGAAAGAGGAGAAGCATATTATGTCAGAGCGGA 442
Query 443 ATGTTCTGTTGAAGAATGTGAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCTTTCCAGACTGCTGACAAATTG 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||..|.
Sbjct 443 ATGTTCTGTTGAAGAATGTGAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCATTCCAGACCGCTGACAAGCTC 516
Query 517 TACTTTGTCCTAGACTACATTAATGGTGGAGAGTTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAACGCTGCTTCCTGGAACC 590
|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 517 TACTTTGTCCTGGACTACATTAATGGTGGAGAGCTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAGCGCTGCTTCCTGGAACC 590
Query 591 ACGGGCTCGTTTCTATGCTGCTGAAATAGCCAGTGCCTTGGGCTACCTGCATTCACTGAACATCGTTTATAGAG 664
|||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 591 ACGGGCTCGATTCTACGCAGCTGAAATAGCCAGTGCCCTGGGCTATCTGCACTCCCTAAACATCGTTTATAGAG 664
Query 665 ACTTAAAACCAGAGAATATTTTGCTAGATTCACAGGGACACATTGTCCTTACTGACTTCGGACTCTGCAAGGAG 738
||||||||||.|||||||||.|.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct 665 ACTTAAAACCTGAGAATATTCTCCTAGACTCCCAGGGGCACATCGTCCTCACTGACTTTGGGCTCTGCAAAGAG 738
Query 739 AACATTGAACACAACAGCACAACATCCACCTTCTGTGGCACGCCGGAGTATCTCGCACCTGAGGTGCTTCATAA 812
||.|||||.||.|||.|.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct 739 AATATTGAGCATAACGGGACAACATCTACCTTCTGTGGCACGCCTGAGTATCTGGCTCCTGAGGTCCTCCATAA 812
Query 813 GCAGCCTTATGACAGGACTGTGGACTGGTGGTGCCTGGGAGCTGTCTTGTATGAGATGCTGTATGGCCTGCCGC 886
||||||.||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||||||.|||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 813 GCAGCCGTATGACCGGACGGTGGACTGGTGGTGTCTTGGGGCTGTCCTGTATGAGATGCTCTACGGCCTGCCCC 886
Query 887 CTTTTTATAGCCGAAACACAGCTGAAATGTACGACAACATTCTGAACAAGCCTCTCCAGCTGAAACCAAATATT 960
|.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 887 CGTTTTATAGCCGGAACACGGCTGAGATGTACGACAATATTCTGAACAAGCCTCTCCAGTTGAAACCAAATATT 960
Query 961 ACAAATTCCGCAAGACACCTCCTGGAGGGCCTCCTGCAGAAGGACAGGACAAAGCGGCTCGGGGCCAAGGATGA 1034
|||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||.||||.||.|||||||||||
Sbjct 961 ACAAACTCGGCAAGGCACCTCCTGGAAGGCCTCCTGCAGAAGGACCGGACCAAGAGGCTGGGTGCCAAGGATGA 1034
Query 1035 CTTCATGGAGATTAAGAGTCATGTCTTCTTCTCCTTAATTAACTGGGATGATCTCATTAATAAGAAGATTACTC 1108
|||.||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1035 CTTTATGGAGATTAAGAGTCATATTTTCTTCTCTTTAATTAACTGGGATGATCTCATCAATAAGAAGATTACAC 1108
Query 1109 CCCCTTTTAACCCAAATGTGAGTGGGCCCAACGACCTACGGCACTTTGACCCCGAGTTTACCGAAGAGCCTGTC 1182
||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1109 CCCCATTTAACCCAAATGTGAGTGGGCCCAGTGACCTTCGGCACTTCGATCCCGAGTTTACCGAGGAGCCGGTC 1182
Query 1183 CCCAACTCCATTGGCAAGTCCCCTGACAGCGTCCTCGTCACAGCCAGCGTCAAGGAAGCTGCCGAGGCTTTCCT 1256
||||.||||||.||||.|||||||||||||.||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct 1183 CCCAGCTCCATCGGCAGGTCCCCTGACAGCATCCTTGTCACGGCCAGTGTGAAGGAAGCAGCAGAAGCCTTCCT 1256
Query 1257 AGGCTTTTCCTATGCGCCTCCCACGGACTCTTTCCTC 1293
.|||||.||||||||.|||||...|||.||.||||||
Sbjct 1257 CGGCTTCTCCTATGCACCTCCTGTGGATTCCTTCCTC 1293