Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467486
• Subject: NM_019727.2
• Aligned Length: 1566
• Identities: 1409
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGCGTCGGGTGGTGGTGGCTGTAGCGCTTCGGAGAGACTGCCTCCGCCCTTCCCCGGCCTGGAGCCGGAGTC  74
            ||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.|||.||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTCAGGAGGTGGTGGCTGTAGCGCTTCGGAGCGACTCCCTCCGCCCTTCCCTGGCATGGATCCGGAGTC  74

Query   75  CGAGGGGGCGGCCGGGGGATCAGAACCCGAGGCTGGGGACAGCGACACCGAGGGGGAGGACATTTTCACCGGCG  148
            .||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct   75  GGAAGGGGCTGCCGGGGGGTCAGAACCCGAGGCTGGGGACAGCGACACCGAGGGGGAGGATATTTTCACTGGCG  148

Query  149  CCGCGGTGGTCAGTAAACATCAGTCTCCAAAGATAACTACATCCCTTCTTCCCATCAACAATGGCTCCAAAGAA  222
            ||||||..|.||.|||.|..|||||||||||||.|||.|||||||||.||||.|||||.|||||.||||||||.
Sbjct  149  CCGCGGCAGCCACTAAGCCCCAGTCTCCAAAGAAAACCACATCCCTTTTTCCTATCAAAAATGGTTCCAAAGAG  222

Query  223  AATGGGATCCATGAAGAACAAGACCAAGAGCCACAGGATCTCTTTGCAGATGCCACAGTGGAGCTATCCTTGGA  296
            ||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct  223  AATGGGATCCATGAGGACCAAGACCAAGAGCCACAGGATCTCTTTGCAGATGCCACAGTGGAACTATCCCTGGA  296

Query  297  CAGCACACAAAATAATCAGAAGAAGGTGCTAGCCAAAACACTCATTTCTCTTCCTCCTCAGGAAGCCACAAATT  370
            |||||||||.|||||.|||||||...|||.||.||||||.||.|.|||||.||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  297  CAGCACACAGAATAACCAGAAGACAATGCCAGGCAAAACCCTTACTTCTCATCCTCCGCAAGAAGCCACAAATT  370

Query  371  CTTCGAAGCCCCAGCCAACCTATGAGGAGCTAGAGGAAGAAGAACAGGAGGATCAATTTGATTTGACAGTCGGT  444
            ||.|||||||.|||||||.||||||||||||   |||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  371  CTCCGAAGCCACAGCCAAGCTATGAGGAGCT---GGAGGAAGAACAGGAGGATCAGTTTGATTTGACAGTTGGT  441

Query  445  ATAACTGATCCTGAGAAGATAGGGGATGGTATGAATGCATATGTAGCCTACAAAGTTACAACACAGACAAGCTT  518
            ||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  442  ATCACCGATCCTGAGAAGATCGGGGATGGTATGAATGCCTATGTAGCCTACAAAGTCACCACACAGACAAGCTT  515

Query  519  ACCATTGTTCAGAAGCAAACAGTTTGCAGTAAAAAGAAGATTTAGTGACTTTCTGGGTCTTTATGAGAAGCTTT  592
            |||..||||||||||.|..|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  ACCGATGTTCAGAAGTAGGCAGTTTGCAGTGAAAAGAAGATTCAGTGACTTCCTGGGTCTTTATGAGAAGCTTT  589

Query  593  CCGAGAAGCACTCTCAGAATGGCTTCATTGTCCCTCCACCCCCGGAGAAGAGCCTCATAGGGATGACAAAAGTG  666
            |.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  590  CAGAGAAGCACTCCCAGAATGGTTTCATTGTGCCTCCTCCACCCGAGAAGAGCCTAATAGGAATGACAAAGGTG  663

Query  667  AAAGTTGGGAAGGAAGATTCTTCTTCTGCAGAATTTCTTGAAAAACGGAGGGCCGCTTTAGAAAGGTACCTTCA  740
            ||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  664  AAGGTTGGGAAGGAAGATTCTTCTTCCGCAGAGTTTCTTGAGAAACGGAGGGCTGCTTTGGAAAGGTACCTTCA  737

Query  741  GAGGATTGTAAATCATCCTACCATGTTACAGGACCCTGACGTCAGAGAGTTCTTGGAAAAAGAAGAGCTGCCAC  814
            .||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||..|||||||||||||||||||.|
Sbjct  738  AAGAATTGTGAATCATCCCACCATGTTACAGGACCCAGATGTCAGGGAGTTTCTGGAAAAAGAAGAGCTGCCTC  811

Query  815  GTGCCGTGGGTACCCAGACATTGAGTGGTGCTGGTCTCCTCAAGATGTTCAACAAAGCCACAGATGCCGTCAGC  888
            |.||.|||||.||.|||.|.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  812  GAGCTGTGGGCACGCAGGCTTTGAGTGGCGCTGGTCTCCTTAAGATGTTCAACAAAGCTACAGATGCAGTCAGC  885

Query  889  AAAATGACCATCAAGATGAATGAATCAGACATTTGGTTTGAGGAGAAGCTCCAGGAGGTAGAGTGTGAGGAGCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  AAAATGACCATCAAGATGAATGAATCAGACATTTGGTTCGAGGAGAAACTCCAGGAGGTAGAGTGTGAGGAGCA  959

Query  963  GCGCTTACGGAAACTGCATGCTGTTGTAGAAACTCTAGTCAACCATAGGAAAGAGCTAGCGCTGAACACAGCCC  1036
            ||||.|||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  960  GCGCCTACGGAAGCTGCATGCTGTGGTGGAGACTCTAGTCAACCATAGGAAAGAACTAGCGCTGAACACAGCCC  1033

Query 1037  AGTTTGCAAAGAGTCTAGCCATGCTTGGGAGCTCTGAGGACAACACGGCATTGTCACGGGCACTCTCCCAGCTG  1110
            .||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.||.||.||.||||||||.|||
Sbjct 1034  TGTTTGCCAAGAGTCTAGCCATGCTTGGGAGCTCCGAGGACAACACAGCACTTTCTCGAGCGCTCTCCCAACTG  1107

Query 1111  GCTGAGGTGGAAGAAAAAATTGAGCAGCTCCACCAGGAACAGGCCAACAATGACTTCTTCCTCCTTGCTGAGCT  1184
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1108  GCTGAGGTGGAAGAAAAGATTGAGCAGCTCCACCAGGAACAGGCCAACAATGACTTCTTCCTCCTTGCTGAACT  1181

Query 1185  CCTGAGTGACTACATTCGCCTCCTGGCCATAGTCCGCGCTGCCTTCGACCAGCGCATGAAGACATGGCAGCGCT  1258
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  CCTGAGTGACTATATTCGCCTCCTGGCCATTGTCCGAGCTGCCTTCGACCAGCGCATGAAGACATGGCAGCGCT  1255

Query 1259  GGCAGGATGCCCAAGCCACACTGCAGAAGAAGCGGGAGGCCGAGGCTCGGCTGCTGTGGGCCAACAAGCCTGAT  1332
            ||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1256  GGCAGGATGCTCAAGCCACGCTGCAGAAGAAGCGGGAGTCTGAGGCACGGCTGCTGTGGGCCAACAAGCCTGAC  1329

Query 1333  AAGCTGCAGCAGGCCAAGGACGAGATCCTCGAGTGGGAGTCTCGGGTGACTCAATATGAAAGGGACTTCGAGAG  1406
            ||.|||||||||||.|||||.||||||...||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1330  AAACTGCAGCAGGCTAAGGATGAGATCACAGAGTGGGAATCTCGGGTGACTCAGTATGAAAGGGACTTTGAAAG  1403

Query 1407  GATTTCAACAGTGGTCCGAAAAGAAGTGATACGGTTTGAGAAAGAGAAATCCAAGGACTTCAAGAACCACGTGA  1480
            ||||||.|||||.||||||||.|||||||.|||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1404  GATTTCCACAGTTGTCCGAAAGGAAGTGACACGATTTGAGAAAGAGAAGTCCAAGGATTTCAAAAACCACGTGA  1477

Query 1481  TCAAGTACCTTGAGACACTCCTTTACTCACAGCAGCAGCTGGCAAAGTACTGGGAAGCCTTCCTTCCTGAGGCA  1554
            |.||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  TGAAGTACCTGGAGACACTCCTACATTCCCAGCAGCAGCTGGCAAAATACTGGGAAGCCTTCCTTCCTGAGGCA  1551

Query 1555  AAGGCCATCTCC  1566
            ||||||||||||
Sbjct 1552  AAGGCCATCTCC  1563