Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467486
- Subject:
- XR_001751380.1
- Aligned Length:
- 2133
- Identities:
- 1565
- Gaps:
- 567
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AGGTCTCCGCCCCTCGGATCCCACGGGGTCCCTTGCGGCCCTCCCACTCCTCGCACCGTTGGATCGCTTTGCTC 74
Query 1 --------------------------------------------------------ATGGCGTCGGGTGGTGGT 18
||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACGGCGCTATCTCTCGATAAAGTTGTTGTTGCGGCTTCCGCCGCGGGTGGAAGAAGATGGCGTCGGGTGGTGGT 148
Query 19 GGCTGTAGCGCTTCGGAGAGACTGCCTCCGCCCTTCCCCGGCCTGGAGCCGGAGTCCGAGGGGGCGGCCGGGGG 92
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGCTGTAGCGCTTCGGAGAGACTGCCTCCGCCCTTCCCCGGCCTGGAGCCGGAGTCCGAGGGGGCGGCCGGGGG 222
Query 93 ATCAGAACCCGAGGCTGGGGACAGCGACACCGAGGGGGAGGACATTTTCACCGGCGCCGCGGTGGTCAGTAAAC 166
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATCAGAACCCGAGGCTGGGGACAGCGACACCGAGGGGGAGGACATTTTCACCGGCGCCGCGGTGGTCAGTAAAC 296
Query 167 ATCAGTCTCCAAAGATAACTACATCCCTTCTTCCCATCAACAATGGCTCCAAAGAAAATGGGATCCATGAAGAA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATCAGTCTCCAAAGATAACTACATCCCTTCTTCCCATCAACAATGGCTCCAAAGAAAATGGGATCCATGAAGAA 370
Query 241 CAAGACCAAGAGCCACAGGATCTCTTTGCAGATGCCACAGTGGAGCTATCCTTGGACAGCACACAAAATAATCA 314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CAAGACCAAGAGCCACAGGATCTCTTTGCAGATGCCACAGTGGAGCTATCCTTGGACAGCACACAAAATAATCA 444
Query 315 GAAGAAGGTGCTAGCCAAAACACTCATTTCTCTTCCTCCTCAGGAAGCCACAAATTCTTCGAAGCCCCAGCCAA 388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAAGAAGGTGCTAGCCAAAACACTCATTTCTCTTCCTCCTCAGGAAGCCACAAATTCTTCGAAGCCCCAGCCAA 518
Query 389 CCTATGAGGAGCTAGAGGAAGAAGAACAGGAGGATCAATTTGATTTGACAGTCGGTATAACTGATCCTGAGAAG 462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCTATGAGGAGCTAGAGGAAGAAGAACAGGAGGATCAATTTGATTTGACAGTCGGTATAACTGATCCTGAGAAG 592
Query 463 ATAGGGGATGGTATGAATGCATATGTAGCCTACAAAGTTACAACACAGACAAGCTTACCATTGTTCAGAAGCAA 536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATAGGGGATGGTATGAATGCATATGTAGCCTACAAAGTTACAACACAGACAAGCTTACCATTGTTCAGAAGCAA 666
Query 537 ACAGTTTGCAGTAAAAAGAAGATTTAGTGACTTTCTGGGTCTTTATGAGAAGCTTTCCGAGAAGCACTCTCAGA 610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACAGTTTGCAGTAAAAAGAAGATTTAGTGACTTTCTGGGTCTTTATGAGAAGCTTTCCGAGAAGCACTCTCAGA 740
Query 611 ATGGCTTCATTGTCCCTCCACCCCCGGAGAAGAGCCTCATAGGGATGACAAAAGTGAAAGTTGGGAAGGAAGAT 684
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATGGCTTCATTGTCCCTCCGCCCCCGGAGAAGAGCCTCATAGGGATGACAAAAGTGAAAGTTGGGAAGGAAGAT 814
Query 685 TCTTCTTCTGCAGAATTTCTTGAAAAACGGAGGGCCGCTTTAGAAAGGTACCTTCAGAGGATTGTAAATCATCC 758
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCTTCTTCTGCAGAATTTCTTGAAAAACGGAGGGCCGCTTTAGAAAGGTACCTTCAGAGGATTGTAAATCATCC 888
Query 759 TACCATGTTACAGGACCCTGACGTCAGAGAGTTCTTGGAAAAAGAAG--------------------------- 805
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TACCATGTTACAGGACCCTGACGTCAGAGAGTTCTTGGAAAAAGAAGAGGGGCAGCAGATAACTTGCCATCCCT 962
Query 806 ----------------AGCTGCCACGTGCCGTGGGTACCCAGACATTGAGTGGTGCTGGTCTCCTCAAGATGTT 863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCCTTCTTGGTCTTGTAGCTGCCACGTGCCGTGGGTACCCAGACATTGAGTGGTGCTGGTCTCCTCAAGATGTT 1036
Query 864 CAACAAAGCCACAGATGCCGTCAGCAAAATGACCATCAAGATGAATGAATCAGACATTTGGTTTGAGGAGAAGC 937
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAACAAAGCCACAGATGCCGTCAGCAAAATGACCATCAAGATGAATGAATCAGACATTTGGTTTGAGGAGAAGC 1110
Query 938 TCCAGGAGGTAGAGTGTGAGGAGCAGCGCTTACGGAAACTGCATGCTGTTGTAGAAACTCTAGTCAACCATAGG 1011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCCAGGAGGTAGAGTGTGAGGAGCAGCGCTTACGGAAACTGCATGCTGTTGTAGAAACTCTAGTCAACCATAGG 1184
Query 1012 AAAGAGCTAGCGCTGAACACAGCCCAGTTTGCAAAGAGTCTAGCCATGCTTGGGAGCTCTGAGGACAACACGGC 1085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAAGAGCTAGCGCTGAACACAGCCCAGTTTGCAAAGAGTCTAGCCATGCTTGGGAGCTCTGAGGACAACACGGC 1258
Query 1086 ATTGTCACGGGCACTCTCCCAGCTGGCTGAGGTGGAAGAAAAAATTGAGCAGCTCCACCAGGAACAGGCCAACA 1159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATTGTCACGGGCACTCTCCCAGCTGGCTGAGGTGGAAGAAAAAATTGAGCAGCTCCACCAGGAACAGGCCAACA 1332
Query 1160 ATGACTTCTTCCTCCTTGCTGAGCTCCTGAGTGACTACATTCGCCTCCTGGCCATAGTCCGCGCTGCCTTCGAC 1233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATGACTTCTTCCTCCTTGCTGAGCTCCTGAGTGACTACATTCGCCTCCTGGCCATAGTCCGCGCTGCCTTCGAC 1406
Query 1234 CAGCGCATGAAGACATGGCAGCGCTGGCAGGATGCCCAAGCCACACTGCAGAAGAAGCGGGAGGCCGAGGCTCG 1307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CAGCGCATGAAGACATGGCAGCGCTGGCAGGATGCCCAAGCCACACTGCAGAAGAAGCGGGAGGCCGAGGCTCG 1480
Query 1308 GCTGCTGTGGGCCAACAAGCCTGATAAGCTGCAGCAGGCCAAGGACGAGATCCTCGAGTGGGAGTCTCGGGTGA 1381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GCTGCTGTGGGCCAACAAGCCTGATAAGCTGCAGCAGGCCAAGGACGAGATCCTCGAGTGGGAGTCTCGGGTGA 1554
Query 1382 CTCAATATGAAAGGGACTTCGAGAGGATTTCAACAGTGGTCCGAAAAGAAGTGATACGGTTTGAGAAAGAGAAA 1455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTCAATATGAAAGGGACTTCGAGAGGATTTCAACAGTGGTCCGAAAAGAAGTGATACGGTTTGAGAAAGAGAAA 1628
Query 1456 TCCAAGGACTTCAAGAACCACGTGATCAAGTACCTTGAGACACTCCTTTACTCACAGCAGCAGCTGGCAAAGTA 1529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TCCAAGGACTTCAAGAACCACGTGATCAAGTACCTTGAGACACTCCTTTACTCACAGCAGCAGCTGGCAAAGTA 1702
Query 1530 CTGGGAAGCCTTCCTTCCTGAGGCAAAGGCCATCTCC------------------------------------- 1566
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CTGGGAAGCCTTCCTTCCTGAGGCAAAGGCCATCTCCTAATGGACCAAGGACCCCAGAGCCCACCTGTGTGACG 1776
Query 1567 -------------------------------------------------------------------------- 1566
Sbjct 1777 CTGCCTTTTTATACACTGTCCTCCTCCACCTTGATGGACCCCTAGTGATGCATCCTGCCTAGGCTGGACTTAAC 1850
Query 1567 -------------------------------------------------------------------------- 1566
Sbjct 1851 CCCTTCCTCCCTGTCCCCACGACCAACTGTCCCCAGTTACTCTAACCGTTATTTCATTTAGCTTCCATATATAT 1924
Query 1567 -------------------------------------------------------------------------- 1566
Sbjct 1925 TTTCTTACCTAAGAGAATAGTTTCCTGCTTTAAGCAAAAGACCTACAATAGGTGGTGGAATTATGGGATGGGGT 1998
Query 1567 -------------------------------------------------------------------------- 1566
Sbjct 1999 GGAGTATTGATATAAATATATAAATACAAATGTATATTTTTCAGGATGTGGTTTAGGAACTGGGAATAACGTTT 2072
Query 1567 ------------------------------------------------------------- 1566
Sbjct 2073 TCTGTTACTCCTGATGGTGCCATGAAAAGGTTATGTAATAAAATATTTTAAAATCAGGTCA 2133