Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467565
• Subject: XM_011523546.3
• Aligned Length: 3379
• Identities: 2246
• Gaps: 1127

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------ATGCTGCCACTGGG  14
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCCAGGAACTGTGCAAGAAAACCATGATGTGTCATTGTACCACAACAGCGGCCACCATGCTGCCACTGGG  74

Query   15  CTCAGAGCCCGCCCTGAATGAGCTGCTGCTTCGCAAGGAGGAGGAGTGGAGGGCGCTGCAGGCACACCGCACCC  88
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCAGAGCCCGCCCTGAATGAGCTGCTGCTTCGCAAGGAGGAGGAGTGGAGGGCGCTGCAGGCACACCGCACCC  148

Query   89  AGCTGCAGGAGGCGGCTCTGCAGGACACACGGAGCCAGCTGGAGGAGGCGCAGGGGAAACTGCGGTGCCTGCAG  162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCTGCAGGAGGCGGCTCTGCAGGACACACGGAGCCAGCTGGAGGAGGCGCAGGGGAAACTGCGGTGCCTGCAG  222

Query  163  GAGGACTTTGTCTACAACCTTCAGGTGCTGGAGGAGCGGGACCTCGAGCTGGAGCGCTATGACGCCGCCTTCGC  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGGACTTTGTCTACAACCTTCAGGTGCTGGAGGAGCGGGACCTCGAGCTGGAGCGCTATGACGCCGCCTTCGC  296

Query  237  CCAGGCCAGGGAGTGGGAGGAGGCCAGGCGGGCAGAGGTGAGCGAGCTCAAGATAGAGGCAGCTAAGCTGAGGC  310
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGGCCAGGGAGTGGGAAGAGGCCAGGCGGGCAGAGGTGAGCGAGCTCAAGATAGAGGCAGCTAAGCTGAGGC  370

Query  311  AGGCGCTAGCCAGAGAGGCCAGGAAGGTGGAGGAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGCATTCCAGGAGCATCGC  384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGCGCTAGCCAGAGAGGCCAGGAAGGTGGAGGAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGCATTCCAGGAGCATCGC  444

Query  385  CTGGAGCTGGAGCGCGTCCACAGTGACAAGAATGGTGAGATTGACCACCACCGGGAACAGTATGAAAATCTAAA  458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGAGCTGGAGCGCGTCCACAGTGACAAGAATGGTGAGATTGACCACCACCGGGAACAGTATGAAAATCTAAA  518

Query  459  ATGGACACTGGAGAGAAAACTTGAGGAGCTCGACGGTGAGCTTGCTCTGCAGAGACAGGAACTGCTGCTGGAGT  532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATGGACACTGGAGAGAAAACTTGAGGAGCTCGACGGTGAGCTTGCTCTGCAGAGACAGGAACTGCTGCTGGAGT  592

Query  533  TTGAATCGAAAATGCGGAAGAGGGAGCACGAATTCCGTCTGCAGGCTGACAACATGAGCAACACAGCCTTGTCC  606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGAATCGAAAATGCGGAAGAGGGAGCACGAATTCCGTCTGCAGGCTGACAACATGAGCAACACAGCCTTGTCC  666

Query  607  CGGGAGCTTAAGGTTAAACTACTGCACAAAGAGCTGGAGGCTCTGAAGGAAGCCGGGGCAAAGGCTGCAGAGAG  680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGGGAGCTTAAGGTTAAACTACTGCACAAAGAGCTGGAGGCTCTGAAGGAAGCCGGGGCAAAGGCTGCAGAGAG  740

Query  681  TCTGCAGAGGGCAGAGGCCACCAACGCCGAGCTGGAGAGGAAGCTCCAGAGCCGAGCCGGGGAGCTCCAGGATC  754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  741  TCTGCAGAGGGCAGAGGCCACCAACGCCGAGCTGGAGAGGAAGCTCCAGAGCCGAGCCGGGGAGCTCCAGGACC  814

Query  755  TGGAGGCCATGAGCCGCGCCCGGGTAAAGGATTTAGAGGATAAACTTCACTCTGTGCAGCTAACCAGGAAGAAG  828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGAGGCCATGAGCCGCGCCCGGGTAAAGGATTTAGAGGATAAACTTCACTCTGTGCAGCTAACCAGGAAGAAG  888

Query  829  GAAGAGGAAACATTTAAGAGGAAGCATGAGGAGCTCGACCGTCTGGCCAGGGAGAAGGATGCAGTGCTGGTGGC  902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAAGAGGAAACATTTAAGAGGAAGCATGAGGAGCTCGACCGTCTGGCCAGGGAGAAGGATGCAGTGCTGGTGGC  962

Query  903  GGTGAAGGGAGCCCACGTGGAGCAGCTGCAGGAGCTGCAGACCAGGGTTCTGGAGCTGCAGGCCCACTGCGAGA  976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGTGAAGGGAGCCCACGTGGAGCAGCTGCAGGAGCTGCAGACCAGGGTTCTGGAGCTGCAGGCCCACTGCGAGA  1036

Query  977  CCCTCGAGGCGCAGCTCCGCAGGGCAGAGTGGAGACAGGCTGACACCGCCAAGGAGAAGGACGCTGCCATTGAC  1050
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCCTCGAGGCGCAGCTCCGCAGGGCAGAGTGGAGACAGGCTGACACCGCCAAGGAGAAGGACGCTGCCATTGAC  1110

Query 1051  CAACTTCGTGAAGATGCATCAACTGTAAAATCTGCCTGGGATGCTCAAATTGCTCAACTATCTAAGGAGATGGT  1124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAACTTCGTGAAGATGCATCAACTGTAAAATCTGCCTGGGATGCTCAAATTGCTCAACTATCTAAGGAGATGGT  1184

Query 1125  CTCCAGAGACCTTCAGATTCAGACGCTGCAGGAAGAAGAGGTGAAGCTCAAGGCACAGGTGGCCCGATCCCAGC  1198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTCCAGAGACCTTCAGATTCAGACGCTGCAGGAAGAAGAGGTGAAGCTCAAGGCACAGGTGGCCCGATCCCAGC  1258

Query 1199  AGGACATTGAAAGGTACAAGCAACAGCTGTCCCTGGCAGTGGAAAGGGAGCGGAGCCTGGAGCGTGATCAGGTG  1272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGACATTGAAAGGTACAAGCAACAGCTGTCCCTGGCAGTGGAAAGGGAGCGGAGCCTGGAGCGTGATCAGGTG  1332

Query 1273  CAGCTGGGCCTGGACTGGCAGCGCCGCTGTGATGACATTGAAAGGGACCAGATCCAAAAGTCAGAGGCCCTGAT  1346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGCTGGGCCTGGACTGGCAGCGCCGCTGTGATGACATTGAAAGGGACCAGATCCAAAAGTCAGAGGCCCTGAT  1406

Query 1347  TCAGGGTCTGAGCATGGCAAAAAGTCAGGTTGCTGCCAAGCTGCAGGAGACAGAGCAGGCGCTACAGGAGCAGG  1420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCAGGGTCTGAGCATGGCAAAAAGTCAGGTTGCTGCCAAGCTGCAGGAGACAGAGCAGGCGCTACAGGAGCAGG  1480

Query 1421  AGGTGGTGCTGAAGGCCATGACCCTGGAACGAGACCAGGCCGTGCAGGCCCTGAGGATGCATGGGCTCCCCAGA  1494
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGTGGTGCTGAAGGCCGTGACCCTGGAACGAGACCAGGCCGTGCAGGCCCTGAGGATGCATGGGCTCCCCAGA  1554

Query 1495  CCAGGGGCACAGATGCTTCTCAGGCAGCATGAAGAAGAAATAAGTAAAGACTTTCCATCCAGTGAGATCCAGCG  1568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCAGGGGCACAGATGCTTCTCAGGCAGCATGAAGAAGAAATAAGTAAAGACTTTCCATCCAGTGAGATCCAGCG  1628

Query 1569  GCTCCGAGAGCAGAACACGAGCTTGCGAAACGCGATTGCCCAGATGAGGAAAGAAATGGAGGCTCTAAGCCATC  1642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCTCCGAGAGCAGAACACGAGCTTGCGAAACGCGATTGCCCAGATGAGGAAAGAAATGGAGGCTCTAAGCCATC  1702

Query 1643  AGATTCCTCCTCCCATCCAGACAGCGGCAGAGAGCACAGATGCAAACCAGCCTGACCCAGAGGCTGGGGGAGAT  1716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGATTCCTCCTCCCATCCAGACAGCGGCAGAGAGCACAGATGCAAACCAGCCTGACCCAGAGGCTGGGGGAGAT  1776

Query 1717  GCCGCCACTCCTGATTATGTTCTGGCCCTTGAAGCAGAAATACGAACTCTAAAGCATAAGTTTAAAACTCTGGA  1790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCCGCCACTCCTGATTATGTTCTGGCCCTTGAAGCAGAAATACGAACTCTAAAGCATAAGTTTAAAACTCTGGA  1850

Query 1791  AAAGCATCTAGAAGATGTGTTGGATCCTTTAAAGATGTCCTCACCTCATGCTGAGTCTCAGCCCAGCGTCCGCA  1864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AAAGCATCTAGAAGATGTGTTGGATCCTTTAAAGATGTCCTCACCTCATGCTGAGTCTCAGCCCAGCGTCCGCA  1924

Query 1865  CCTCGACAGAGACGACTGGAGGGTCTGCCCAAGCTGGTCAAGCCGGAGGGTCTGTCCAAGCTGGTCAAGCAGGA  1938
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCTCGACAGAGACGACTGGAGGGTCTGCCCAAGCTGGTCAAGCCGGAGGGTCTGTCCAAGCTGGTCAAGCAGGA  1998

Query 1939  GGATCTGTCCAAGCTGGCCCAGTATCCTCTGGACTGGCACTCAGGAAGCTCGGGGACAGAGTGCAGCTCCTAAA  2012
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGATCTGTCCAAGCTGGCCCAGTATCCTCTGGACTGGCACTCAGGAAGCTCGGGGACAGAGTGCAGCTCCTAAA  2072

Query 2013  CCTGCTGGTGACACGACTCAGACAGAAGGTGCTGCGGGAACCCCTGGAGCCGGCCGCTCTCCAGCGTGAGCTTC  2086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCTGCTGGTGACACGACTCAGACAGAAGGTGCTGCGGGAACCCCTGGAGCCGGCCGCTCTCCAGCGTGAGCTTC  2146

Query 2087  CCCGTGAGGTGGACCAGGTACACCTGGAGGTTTTGGAGCTGCGGAAGCAGGTGGCTGAGCTGGGGAAGCATCTC  2160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CCCGTGAGGTGGACCAGGTACACCTGGAGGTTTTGGAGCTGCGGAAGCAGGTGGCTGAGCTGGGGAAGCATCTC  2220

Query 2161  AGGATAGCCCAGCACGGGGGAGCGGAGCCTTCAGGCAGGAAGCAGCCCCCAGCCTCGGACGCCGTGGCCCTTGG  2234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AGGATAGCCCAGCACGGGGGAGCGGAGCCTTCAGGCAGGAAGCAGCCCCCAGCCTCGGACGCCGTGGCCCTTGG  2294

Query 2235  GAGAGAGGTGGGTGACC--------GC-----------------------------------------------  2253
            |||||||| |..|.|||        ||                                               
Sbjct 2295  GAGAGAGG-GCCTCACCAAGAGAGGGCCTATGGAGGCCGAGGACCAGGGGGAGCTTTTCCTGCACCTCCGGTCA  2367

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2368  GTGGCACGTGCCCCCCAGACCTTATCTATGCACCGACTCCAGAGAAAGCTGAAGGAGGCAGCCAGAAAAATCAT  2441

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2442  CAGCCTCCGCCTGGAGAAAGAGCAGCTCATCGAGATGGGGAACAGGCTCCGTGCAGAGCTGGGCCGACCCGAAA  2515

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2516  GGTGGCTGTTGCACCACGCCCTCCCTCCTGCCCCTGAGGCCCGGAAGCCAGGCGAGGAGCCCAGGAGGCCTTTG  2589

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2590  GATCGCAGCCCACCTTTGGGACAGGTGCAGCCCCATTTTACATCTCAGGACGCCAAGAGTGCCGAGGATGAGGC  2663

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2664  TCCTTCCAGACACTTGGGAAAGCACCAGCCCCGCTCAGCACAGGTGGGCAGCAGACTTGACGCCCTGCAAGGCC  2737

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2738  CGAAGACACAACACAGCATCCACACGGTGACCTGTAAATCACCTCGGCAGAAAGAAGACAGGTCCCCAAAGCCA  2811

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2812  CCCCAGGCTCCCCAGCACCCTGAGGAGCATGGTCGCCAATCCCACAGCTCCTCCTCCTTTGCCAGTGGCACCCT  2885

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2886  CCAGGACATGTGGAGGTTGCTAGACCTGGGATCCAGCCCTTCTGGTGTCACCTCCCAGGGTGACTCAACTCCAG  2959

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 2960  AAATGGGGTCTCACTATGTCACCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGGCTCAAGCAGTCCTGCCGCCTTGGCCTCC  3033

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 3034  CAAAGTGCTGAGATGACAGGTGTGGGCCCCACGCCCAGCCTGGCGTGGAGTGGAGCCCTTCACCCAAACATGAA  3107

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 3108  CCAGGAGGCGAGCTTGGTAAGGAGCACGTGGGCTCCAGGAATGCGAGGGGGAATGAATGGAGGCAGCTCCTCAG  3181

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 3182  TGTGCAAAAACATGCAGCGCGGGCCTCACTGGTCACCATCACAGCAGCCTTGCAGTGGGATCAGGACAGTCCTG  3255

Query 2254  --------------------------------------------------------------------------  2253
                                                                                      
Sbjct 3256  CTGTCCAGGAAGGAGAGGACCCTGCTCTCTTGTTTCTCACTACCTGCTCCTGTCGTTCTAGTCCCATTGCTGCT  3329

Query 2254  -------------------------------------------------  2253
                                                             
Sbjct 3330  CTCAGGACAAGCTGTGACTGAGAGAGCAGGTCACGCTGGTGACATTTTA  3378