Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467565
- Subject:
- XR_001752484.1
- Aligned Length:
- 3355
- Identities:
- 2248
- Gaps:
- 1102
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GCTACTCTTCGGCAGTCAGTGGAGGAAGTGAAAAAAAACACGGGGTCACAGGTATTTCTGGAAAACTCAAACTG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TTTTTCCTCTACTCTGATACCACAAGAATCATCAGCACAGAGGAAGACTTCTGTGATCAAATGTGGTGGGAGAG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GGAGGTTTTCACCAGCACATGAGCAGTCAGTTCTGCCGCAGACTCGGCGGGTGTCCTTCGGTTCAGTTCCAACA 222
Query 1 ---------------------------------------ATGCTGCCACTGGGCTCAGAGCCCGCCCTGAATGA 35
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCGCCTGCCTGGAGAGAGGTCAGACCACAGGCGGCCACCATGCTGCCACTGGGCTCAGAGCCCGCCCTGAATGA 296
Query 36 GCTGCTGCTTCGCAAGGAGGAGGAGTGGAGGGCGCTGCAGGCACACCGCACCCAGCTGCAGGAGGCGGCTCTGC 109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCTGCTGCTTCGCAAGGAGGAGGAGTGGAGGGCGCTGCAGGCACACCGCACCCAGCTGCAGGAGGCGGCTCTGC 370
Query 110 AGGACACACGGAGCCAGCTGGAGGAGGCGCAGGGGAAACTGCGGTGCCTGCAGGAGGACTTTGTCTACAACCTT 183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGGACACACGGAGCCAGCTGGAGGAGGCGCAGGGGAAACTGCGGTGCCTGCAGGAGGACTTTGTCTACAACCTT 444
Query 184 CAGGTGCTGGAGGAGCGGGACCTCGAGCTGGAGCGCTATGACGCCGCCTTCGCCCAGGCCAGGGAGTGGGAGGA 257
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 445 CAGGTGCTGGAGGAGCGGGACCTCGAGCTGGAGCGCTATGACGCCGCCTTCGCCCAGGCCAGGGAGTGGGAAGA 518
Query 258 GGCCAGGCGGGCAGAGGTGAGCGAGCTCAAGATAGAGGCAGCTAAGCTGAGGCAGGCGCTAGCCAGAGAGGCCA 331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGCCAGGCGGGCAGAGGTGAGCGAGCTCAAGATAGAGGCAGCTAAGCTGAGGCAGGCGCTAGCCAGAGAGGCCA 592
Query 332 GGAAGGTGGAGGAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGCATTCCAGGAGCATCGCCTGGAGCTGGAGCGCGTCCAC 405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGAAGGTGGAGGAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGCATTCCAGGAGCATCGCCTGGAGCTGGAGCGCGTCCAC 666
Query 406 AGTGACAAGAATGGTGAGATTGACCACCACCGGGAACAGTATGAAAATCTAAAATGGACACTGGAGAGAAAACT 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGTGACAAGAATGGTGAGATTGACCACCACCGGGAACAGTATGAAAATCTAAAATGGACACTGGAGAGAAAACT 740
Query 480 TGAGGAGCTCGACGGTGAGCTTGCTCTGCAGAGACAGGAACTGCTGCTGGAGTTTGAATCGAAAATGCGGAAGA 553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGAGGAGCTCGACGGTGAGCTTGCTCTGCAGAGACAGGAACTGCTGCTGGAGTTTGAATCGAAAATGCGGAAGA 814
Query 554 GGGAGCACGAATTCCGTCTGCAGGCTGACAACATGAGCAACACAGCCTTGTCCCGGGAGCTTAAGGTTAAACTA 627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGGAGCACGAATTCCGTCTGCAGGCTGACAACATGAGCAACACAGCCTTGTCCCGGGAGCTTAAGGTTAAACTA 888
Query 628 CTGCACAAAGAGCTGGAGGCTCTGAAGGAAGCCGGGGCAAAGGCTGCAGAGAGTCTGCAGAGGGCAGAGGCCAC 701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGCACAAAGAGCTGGAGGCTCTGAAGGAAGCCGGGGCAAAGGCTGCAGAGAGTCTGCAGAGGGCAGAGGCCAC 962
Query 702 CAACGCCGAGCTGGAGAGGAAGCTCCAGAGCCGAGCCGGGGAGCTCCAGGATCTGGAGGCCATGAGCCGCGCCC 775
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAACGCCGAGCTGGAGAGGAAGCTCCAGAGCCGAGCCGGGGAGCTCCAGGACCTGGAGGCCATGAGCCGCGCCC 1036
Query 776 GGGTAAAGGATTTAGAGGATAAACTTCACTCTGTGCAGCTAACCAGGAAGAAGGAAGAGGAAACATTTAAGAGG 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGGTAAAGGATTTAGAGGATAAACTTCACTCTGTGCAGCTAACCAGGAAGAAGGAAGAGGAAACATTTAAGAGG 1110
Query 850 AAGCATGAGGAGCTCGACCGTCTGGCCAGGGAGAAGGATGCAGTGCTGGTGGCGGTGAAGGGAGCCCACGTGGA 923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGCATGAGGAGCTCGACCGTCTGGCCAGGGAGAAGGATGCAGTGCTGGTGGCGGTGAAGGGAGCCCACGTGGA 1184
Query 924 GCAGCTGCAGGAGCTGCAGACCAGGGTTCTGGAGCTGCAGGCCCACTGCGAGACCCTCGAGGCGCAGCTCCGCA 997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCAGCTGCAGGAGCTGCAGACCAGGGTTCTGGAGCTGCAGGCCCACTGCGAGACCCTCGAGGCGCAGCTCCGCA 1258
Query 998 GGGCAGAGTGGAGACAGGCTGACACCGCCAAGGAGAAGGACGCTGCCATTGACCAACTTCGTGAAGATGCATCA 1071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGGCAGAGTGGAGACAGGCTGACACCGCCAAGGAGAAGGACGCTGCCATTGACCAACTTCGTGAAGATGCATCA 1332
Query 1072 ACTGTAAAATCTGCCTGGGATGCTCAAATTGCTCAACTATCTAAGGAGATGGTCTCCAGAGACCTTCAGATTCA 1145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACTGTAAAATCTGCCTGGGATGCTCAAATTGCTCAACTATCTAAGGAGATGGTCTCCAGAGACCTTCAGATTCA 1406
Query 1146 GACGCTGCAGGAAGAAGAGGTGAAGCTCAAGGCACAGGTGGCCCGATCCCAGCAGGACATTGAAAGGTACAAGC 1219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GACGCTGCAGGAAGAAGAGGTGAAGCTCAAGGCACAGGTGGCCCGATCCCAGCAGGACATTGAAAGGTACAAGC 1480
Query 1220 AACAGCTGTCCCTGGCAGTGGAAAGGGAGCGGAGCCTGGAGCGTGATCAGGTGCAGCTGGGCCTGGACTGGCAG 1293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AACAGCTGTCCCTGGCAGTGGAAAGGGAGCGGAGCCTGGAGCGTGATCAGGTGCAGCTGGGCCTGGACTGGCAG 1554
Query 1294 CGCCGCTGTGATGACATTGAAAGGGACCAGATCCAAAAGTCAGAGGCCCTGATTCAGGGTCTGAGCATGGCAAA 1367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CGCCGCTGTGATGACATTGAAAGGGACCAGATCCAAAAGTCAGAGGCCCTGATTCAGGGTCTGAGCATGGCAAA 1628
Query 1368 AAGTCAGGTTGCTGCCAAGCTGCAGGAGACAGAGCAGGCGCTACAGGAGCAGGAGGTGGTGCTGAAGGCCATGA 1441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1629 AAGTCAGGTTGCTGCCAAGCTGCAGGAGACAGAGCAGGCGCTACAGGAGCAGGAGGTGGTGCTGAAGGCCGTGA 1702
Query 1442 CCCTGGAACGAGACCAGGCCGTGCAGGCCCTGAGGATGCATGGGCTCCCCAGACCAGGGGCACAGATGCTTCTC 1515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CCCTGGAACGAGACCAGGCCGTGCAGGCCCTGAGGATGCATGGGCTCCCCAGACCAGGGGCACAGATGCTTCTC 1776
Query 1516 AGGCAGCATGAAGAAGAAATAAGTAAAGACTTTCCATCCAGTGAGATCCAGCGGCTCCGAGAGCAGAACACGAG 1589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AGGCAGCATGAAGAAGAAATAAGTAAAGACTTTCCATCCAGTGAGATCCAGCGGCTCCGAGAGCAGAACACGAG 1850
Query 1590 CTTGCGAAACGCGATTGCCCAGATGAGGAAAGAAATGGAGGCTCTAAGCCATCAGATTCCTCCTCCCATCCAGA 1663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CTTGCGAAACGCGATTGCCCAGATGAGGAAAGAAATGGAGGCTCTAAGCCATCAGATTCCTCCTCCCATCCAGA 1924
Query 1664 CAGCGGCAGAGAGCACAGATGCAAACCAGCCTGACCCAGAGGCTGGGGGAGATGCCGCCACTCCTGATTATGTT 1737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CAGCGGCAGAGAGCACAGATGCAAACCAGCCTGACCCAGAGGCTGGGGGAGATGCCGCCACTCCTGATTATGTT 1998
Query 1738 CTGGCCCTTGAAGCAGAAATACGAACTCTAAAGCATAAGTTTAAAACTCTGGAAAAGCATCTAGAAGATGTGTT 1811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTGGCCCTTGAAGCAGAAATACGAACTCTAAAGCATAAGTTTAAAACTCTGGAAAAGCATCTAGAAGATGTGTT 2072
Query 1812 GGATCCTTTAAAGATGTCCTCACCTCATGCTGAGTCTCAGCCCAGCGTCCGCACCTCGACAGAGACGACTGGAG 1885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GGATCCTTTAAAGATGTCCTCACCTCATGCTGAGTCTCAGCCCAGCGTCCGCACCTCGACAGAGACGACTGGAG 2146
Query 1886 GGTCTGCCCAAGCTGGTCAAGCCGGAGGGTCTGTCCAAGCTGGTCAAGCAGGAGGATCTGTCCAAGCTGGCCCA 1959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GGTCTGCCCAAGCTGGTCAAGCCGGAGGGTCTGTCCAAGCTGGTCAAGCAGGAGGATCTGTCCAAGCTGGCCCA 2220
Query 1960 GTATCCTCTGGACTGGCACTCAGGAAGCTCGGGGACAGAGTGCAGCTCCTAAACCTGCTGGTGACACGACTCAG 2033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GTATCCTCTGGACTGGCACTCAGGAAGCTCGGGGACAGAGTGCAGCTCCTAAACCTGCTGGTGACACGACTCAG 2294
Query 2034 ACAGAAGGTGCTGCGGGAACCCCTGGAGCCGGCCGCTCTCCAGCGTGAGCTTCCCCGTGAGGTGGACCAGGTAC 2107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 ACAGAAGGTGCTGCGGGAACCCCTGGAGCCGGCCGCTCTCCAGCGTGAGCTTCCCCGTGAGGTGGACCAGGTAC 2368
Query 2108 ACCTGGAGGTTTTGGAGCTGCGGAAGCAGGTGGCTGAGCTGGGGAAGCATCTCAGGATAGCCCAGCACGGGGGA 2181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 ACCTGGAGGTTTTGGAGCTGCGGAAGCAGGTGGCTGAGCTGGGGAAGCATCTCAGGATAGCCCAGCACGGGGGA 2442
Query 2182 GCGGAGCCTTCAGGCAGGAAGCAGCCCCCAGCCTCGGACGCCGTGGCCCTTGGGAGAGA-GGTGGGTG----AC 2250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||.|| ||
Sbjct 2443 GCGGAGCCTTCAGGCAGGAAGCAGCCCCCAGCCTCGGACGCCGTGGCCCTTGGGAGAGAGGGTGGCTGTTGCAC 2516
Query 2251 CGC----------------------------------------------------------------------- 2253
|.|
Sbjct 2517 CACGCCCTCCCTCCTGCCCCTGAGGCCCGGAAGCCAGGCGAGGAGCCCAGGAGGCCTTTGGATCGCAGCCCACC 2590
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2591 TTTGGGACAGGTGCAGCCCCATTTTACATCTCAGGACGCCAAGAGTGCCGAGGATGAGGCTCCTTCCAGACACT 2664
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2665 TGGGAAAGCACCAGCCCCGCTCAGCACAGGTGGGCAGCAGACTTGACGCCCTGCAAGGCCCGAAGACACAACAC 2738
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2739 AGCATCCACACGGTGACCTGTAAATCACCTCGGCAGAAAGAAGACAGGTCCCCAAAGCCACCCCAGGCTCCCCA 2812
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2813 GCACCCTGAGGAGCATGGTCGCCAATCCCACAGCTCCTCCTCCTTTGCCAGTGGCACCCTCCAGGACATGTGGA 2886
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2887 GGTTGCTAGACCTGGGATCCAGCCCTTCTGGTGTCACCTCCCAGGGTGACTCAACTCCAGAGCTCCCAGCTCCT 2960
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 2961 CCAGCAGCCGACAGGAGGCCCGTCAAGATGCAGGCAGGCATTGCCACCCCAGGGATGAAGACAGCAGCCCAGGC 3034
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 3035 AAAGGCCAAGACCACAGGAGCCTCCCGGTCTCATCCTGCAAAAGCTAAAGGCTGCCAGAGGCCCCCCAAGATCC 3108
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 3109 GTAACTACAACATTATGGACTGACTTCCTCCCCCCACCCCGCCCCACTAAGGGGTGCTCGGGGCCTCCGCATGG 3182
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 3183 TGCCTGTGCTTTCACCTACGTGTTGTGGGGGGGTGTGGGCACAGCGTGCAGGGTGGAGGCAGGGAGCTGCAGGG 3256
Query 2254 -------------------------------------------------------------------------- 2253
Sbjct 3257 CAGGCTCCCAAATGCTGCTGAGGCGACCCTGCTGACTGAAGGCCTCCCTGAGCACAGGGCCCATTAAAACCAGG 3330
Query 2254 ------------------------- 2253
Sbjct 3331 TTCCTCCCTGGGGCGTCTGCTTGGC 3355