Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467565
• Subject: XR_001752489.2
• Aligned Length: 2627
• Identities: 2246
• Gaps: 375

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  TGGCTACTCTTCGGCAGTCAGTGGAGGAAGTGAAAAAAAACACGGGGTCACAGGTATTTCTGGAAAACTCAAAC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGTTTTTCCTCTACTCTGATACCACAAGAATCATCAGCACAGAGGAAGACTTCTGTGATCAAATGTGGTGGGAG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AGGGAGGTTTTCACCAGCACATGAGCAGTCAGTTCTGCCGCAGACTCGGCGGGTGTCCTTCGGTTCAGTTCCAA  222

Query    1  -----------------------------------------ATGCTGCCACTGGGCTCAGAGCCCGCCCTGAAT  33
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CACCGCCTGCCTGGAGAGAGGTCAGACCACAGGCGGCCACCATGCTGCCACTGGGCTCAGAGCCCGCCCTGAAT  296

Query   34  GAGCTGCTGCTTCGCAAGGAGGAGGAGTGGAGGGCGCTGCAGGCACACCGCACCCAGCTGCAGGAGGCGGCTCT  107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAGCTGCTGCTTCGCAAGGAGGAGGAGTGGAGGGCGCTGCAGGCACACCGCACCCAGCTGCAGGAGGCGGCTCT  370

Query  108  GCAGGACACACGGAGCCAGCTGGAGGAGGCGCAGGGGAAACTGCGGTGCCTGCAGGAGGACTTTGTCTACAACC  181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCAGGACACACGGAGCCAGCTGGAGGAGGCGCAGGGGAAACTGCGGTGCCTGCAGGAGGACTTTGTCTACAACC  444

Query  182  TTCAGGTGCTGGAGGAGCGGGACCTCGAGCTGGAGCGCTATGACGCCGCCTTCGCCCAGGCCAGGGAGTGGGAG  255
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  445  TTCAGGTGCTGGAGGAGCGGGACCTCGAGCTGGAGCGCTATGACGCCGCCTTCGCCCAGGCCAGGGAGTGGGAA  518

Query  256  GAGGCCAGGCGGGCAGAGGTGAGCGAGCTCAAGATAGAGGCAGCTAAGCTGAGGCAGGCGCTAGCCAGAGAGGC  329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAGGCCAGGCGGGCAGAGGTGAGCGAGCTCAAGATAGAGGCAGCTAAGCTGAGGCAGGCGCTAGCCAGAGAGGC  592

Query  330  CAGGAAGGTGGAGGAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGCATTCCAGGAGCATCGCCTGGAGCTGGAGCGCGTCC  403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGGAAGGTGGAGGAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGCATTCCAGGAGCATCGCCTGGAGCTGGAGCGCGTCC  666

Query  404  ACAGTGACAAGAATGGTGAGATTGACCACCACCGGGAACAGTATGAAAATCTAAAATGGACACTGGAGAGAAAA  477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACAGTGACAAGAATGGTGAGATTGACCACCACCGGGAACAGTATGAAAATCTAAAATGGACACTGGAGAGAAAA  740

Query  478  CTTGAGGAGCTCGACGGTGAGCTTGCTCTGCAGAGACAGGAACTGCTGCTGGAGTTTGAATCGAAAATGCGGAA  551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTGAGGAGCTCGACGGTGAGCTTGCTCTGCAGAGACAGGAACTGCTGCTGGAGTTTGAATCGAAAATGCGGAA  814

Query  552  GAGGGAGCACGAATTCCGTCTGCAGGCTGACAACATGAGCAACACAGCCTTGTCCCGGGAGCTTAAGGTTAAAC  625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGGGAGCACGAATTCCGTCTGCAGGCTGACAACATGAGCAACACAGCCTTGTCCCGGGAGCTTAAGGTTAAAC  888

Query  626  TACTGCACAAAGAGCTGGAGGCTCTGAAGGAAGCCGGGGCAAAGGCTGCAGAGAGTCTGCAGAGGGCAGAGGCC  699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACTGCACAAAGAGCTGGAGGCTCTGAAGGAAGCCGGGGCAAAGGCTGCAGAGAGTCTGCAGAGGGCAGAGGCC  962

Query  700  ACCAACGCCGAGCTGGAGAGGAAGCTCCAGAGCCGAGCCGGGGAGCTCCAGGATCTGGAGGCCATGAGCCGCGC  773
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACCAACGCCGAGCTGGAGAGGAAGCTCCAGAGCCGAGCCGGGGAGCTCCAGGACCTGGAGGCCATGAGCCGCGC  1036

Query  774  CCGGGTAAAGGATTTAGAGGATAAACTTCACTCTGTGCAGCTAACCAGGAAGAAGGAAGAGGAAACATTTAAGA  847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCGGGTAAAGGATTTAGAGGATAAACTTCACTCTGTGCAGCTAACCAGGAAGAAGGAAGAGGAAACATTTAAGA  1110

Query  848  GGAAGCATGAGGAGCTCGACCGTCTGGCCAGGGAGAAGGATGCAGTGCTGGTGGCGGTGAAGGGAGCCCACGTG  921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGAAGCATGAGGAGCTCGACCGTCTGGCCAGGGAGAAGGATGCAGTGCTGGTGGCGGTGAAGGGAGCCCACGTG  1184

Query  922  GAGCAGCTGCAGGAGCTGCAGACCAGGGTTCTGGAGCTGCAGGCCCACTGCGAGACCCTCGAGGCGCAGCTCCG  995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAGCAGCTGCAGGAGCTGCAGACCAGGGTTCTGGAGCTGCAGGCCCACTGCGAGACCCTCGAGGCGCAGCTCCG  1258

Query  996  CAGGGCAGAGTGGAGACAGGCTGACACCGCCAAGGAGAAGGACGCTGCCATTGACCAACTTCGTGAAGATGCAT  1069
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGGGCAGAGTGGAGACAGGCTGACACCGCCAAGGAGAAGGACGCTGCCATTGACCAACTTCGTGAAGATGCAT  1332

Query 1070  CAACTGTAAAATCTGCCTGGGATGCTCAAATTGCTCAACTATCTAAGGAGATGGTCTCCAGAGACCTTCAGATT  1143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAACTGTAAAATCTGCCTGGGATGCTCAAATTGCTCAACTATCTAAGGAGATGGTCTCCAGAGACCTTCAGATT  1406

Query 1144  CAGACGCTGCAGGAAGAAGAGGTGAAGCTCAAGGCACAGGTGGCCCGATCCCAGCAGGACATTGAAAGGTACAA  1217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAGACGCTGCAGGAAGAAGAGGTGAAGCTCAAGGCACAGGTGGCCCGATCCCAGCAGGACATTGAAAGGTACAA  1480

Query 1218  GCAACAGCTGTCCCTGGCAGTGGAAAGGGAGCGGAGCCTGGAGCGTGATCAGGTGCAGCTGGGCCTGGACTGGC  1291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCAACAGCTGTCCCTGGCAGTGGAAAGGGAGCGGAGCCTGGAGCGTGATCAGGTGCAGCTGGGCCTGGACTGGC  1554

Query 1292  AGCGCCGCTGTGATGACATTGAAAGGGACCAGATCCAAAAGTCAGAGGCCCTGATTCAGGGTCTGAGCATGGCA  1365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGCGCCGCTGTGATGACATTGAAAGGGACCAGATCCAAAAGTCAGAGGCCCTGATTCAGGGTCTGAGCATGGCA  1628

Query 1366  AAAAGTCAGGTTGCTGCCAAGCTGCAGGAGACAGAGCAGGCGCTACAGGAGCAGGAGGTGGTGCTGAAGGCCAT  1439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1629  AAAAGTCAGGTTGCTGCCAAGCTGCAGGAGACAGAGCAGGCGCTACAGGAGCAGGAGGTGGTGCTGAAGGCCGT  1702

Query 1440  GACCCTGGAACGAGACCAGGCCGTGCAGGCCCTGAGGATGCATGGGCTCCCCAGACCAGGGGCACAGATGCTTC  1513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GACCCTGGAACGAGACCAGGCCGTGCAGGCCCTGAGGATGCATGGGCTCCCCAGACCAGGGGCACAGATGCTTC  1776

Query 1514  TCAGGCAGCATGAAGAAGAAATAAGTAAAGACTTTCCATCCAGTGAGATCCAGCGGCTCCGAGAGCAGAACACG  1587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCAGGCAGCATGAAGAAGAAATAAGTAAAGACTTTCCATCCAGTGAGATCCAGCGGCTCCGAGAGCAGAACACG  1850

Query 1588  AGCTTGCGAAACGCGATTGCCCAGATGAGGAAAGAAATGGAGGCTCTAAGCCATCAGATTCCTCCTCCCATCCA  1661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGCTTGCGAAACGCGATTGCCCAGATGAGGAAAGAAATGGAGGCTCTAAGCCATCAGATTCCTCCTCCCATCCA  1924

Query 1662  GACAGCGGCAGAGAGCACAGATGCAAACCAGCCTGACCCAGAGGCTGGGGGAGATGCCGCCACTCCTGATTATG  1735
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GACAGCGGCAGAGAGCACAGATGCAAACCAGCCTGACCCAGAGGCTGGGGGAGATGCCGCCACTCCTGATTATG  1998

Query 1736  TTCTGGCCCTTGAAGCAGAAATACGAACTCTAAAGCATAAGTTTAAAACTCTGGAAAAGCATCTAGAAGATGTG  1809
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TTCTGGCCCTTGAAGCAGAAATACGAACTCTAAAGCATAAGTTTAAAACTCTGGAAAAGCATCTAGAAGATGTG  2072

Query 1810  TTGGATCCTTTAAAGATGTCCTCACCTCATGCTGAGTCTCAGCCCAGCGTCCGCACCTCGACAGAGACGACT--  1881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 2073  TTGGATCCTTTAAAGATGTCCTCACCTCATGCTGAGTCTCAGCCCAGCGTCCGCACCTCGACAGAGACGACTGG  2146

Query 1882  -------------------------------GGAGGGTCTGCCCAAGCTGGTCAAGCCGGAGGGTCTGTCCAAG  1924
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TATGAGCTGACAGAAGCCACTCTTCTCTGCAGGAGGGTCTGCCCAAGCTGGTCAAGCCGGAGGGTCTGTCCAAG  2220

Query 1925  CTGGTCAAGCAGGAGGATCTGTCCAAGCTGGCCCAGTATCCTCTGGACTGGCACTCAGGAAGCTCGGGGACAGA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTGGTCAAGCAGGAGGATCTGTCCAAGCTGGCCCAGTATCCTCTGGACTGGCACTCAGGAAGCTCGGGGACAGA  2294

Query 1999  GTGCAGCTCCTAAACCTGCTGGTGACACGACTCAGACAGAAGGTGCTGCGGGAACCCCTGGAGCCGGCCGCTCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GTGCAGCTCCTAAACCTGCTGGTGACACGACTCAGACAGAAGGTGCTGCGGGAACCCCTGGAGCCGGCCGCTCT  2368

Query 2073  CCAGCGTGAGCTTCCCCGTGAGGTGGACCAGGTACACCTGGAGGTTTTGGAGCTGCGGAAGCAGGTGGCTGAGC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CCAGCGTGAGCTTCCCCGTGAGGTGGACCAGGTACACCTGGAGGTTTTGGAGCTGCGGAAGCAGGTGGCTGAGC  2442

Query 2147  TGGGGAAGCATCTCAGGATAGCCCAGCACGGGGGAGCGGAGCCTTCAGGCAGGAAGCAGCCCCCAGCCTCGGAC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  TGGGGAAGCATCTCAGGATAGCCCAGCACGGGGGAGCGGAGCCTTCAGGCAGGAAGCAGCCCCCAGCCTCGGAC  2516

Query 2221  GCCGTGGCCCTTGGGAGAGAGGTGGGTGACC--------GC---------------------------------  2253
            |||||||||||||||||||||| |..|.|||        ||                                 
Sbjct 2517  GCCGTGGCCCTTGGGAGAGAGG-GCCTCACCAAGAGAGGGCCTATGGAGGCCGAGGACCAGGGGGAGCTTTTCC  2589

Query 2254  -------------------------------------  2253
                                                 
Sbjct 2590  TGCACCTCCGGTCAGTGGCACGTGCCCCCCAGACCTT  2626