Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467617
• Subject: NM_181280.1
• Aligned Length: 1172
• Identities: 986
• Gaps: 73

Alignment

Query    1  ATGTCCCCAGAAGTGGCCT----TGAACCGAATATCTCCAATGCTCTCCCCTTTCATATCTAGCGTGGTCCGGA  70
            ||||        || ||||    ||||         |...|||.|.|.|     ||.||||||.|         
Sbjct    1  ATGT--------GT-GCCTGTAATGAA---------TGGTATGGTGTGC-----CAGATCTAGAG---------  42

Query   71  ATGGAAAAG--TGGGAC---TGGATGCTACAAACTGTTTGAGGATAA----CTG--ACT--TAAAATCTGG---  128
                 ||||  |.|.||   |||| |..|.|||         ||.||    |||  |||  .||||   ||   
Sbjct   43  -----AAAGCATCGTACCTTTGGA-GAAAGAAA---------GAAAACCATCTGCCACTAGAAAAA---GGCCA  98

Query  129  ---CTGCACATCATTGACTCCTGGGCCCAACTGTGACCGATTTAAACTGCACATACCATATGCTGGAGAGACAT  199
               |||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.|
Sbjct   99  AAACTGTACATCATTGACTCCTGGACCCAACTGTGACCGCTTCAAACTGCACATCCCGTACGCTGGGGAGACGT  172

Query  200  TAAAGTGGGATATCATTTTCAATGCCCAATACCCAGAACTGCCTCCCGATTTTATCTTTGGAGAAGATGCTGAA  273
            ||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct  173  TAAAATGGGACATAATTTTCAATGCTCAGTACCCAGAGCTGCCTCCTGATTTCATCTTTGGAGAGGATGCTGAG  246

Query  274  TTCCTGCCAGACCCCTCAGCTTTGCAGAATCTTGCCTCCTGGAATCCTTCAAATCCTGAATGTCTCTTACTTGT  347
            ||.||||||||||||||.||..||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.||.||
Sbjct  247  TTTCTGCCAGACCCCTCTGCGCTGCACAACCTTGCCTCCTGGAACCCTTCAAACCCTGAGTGCCTGTTGCTCGT  320

Query  348  GGTGAAGGAACTTGTGCAACAATATCACCAATTCCAATGTAGCCGCCTCCGGGAGAGCTCCCGCCTCATGTTTG  421
            |||||||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||.||..||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  321  GGTGAAGGAGCTGGTGCAGCAGTACCACCAGTTCCAGTGCGGCCGCCTCCGTGAGAGCTCGCGCCTCATGTTTG  394

Query  422  AATACCAGACATTACTGGAGGAGCCACAGTATGGAGAGAACATGGAAATTTATGCTGGGAAAAAAAACAACTGG  495
            |.||||||||..|.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  395  AGTACCAGACGCTCCTGGAAGAGCCTCAGTATGGAGAGAACATGGAAATTTATGCTGGAAAGAAAAACAACTGG  468

Query  496  ACTGGTGAATTTTCAGCTCGTTTCCTTTTGAAGCTGCCCGTAGATTTCAGCAATATCCCCACATACCTTCTCAA  569
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||.|.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  469  ACTGGTGAATTTTCAGCTCGTTTTCTATTGAAGTTACCAGTAGATTTCAGCAACATTCCCACATACCTTCTCAA  542

Query  570  GGATGTAAATGAAGACCCTGGAGAAGATGTGGCCCTCCTCTCTGTTAGTTTTGAGGACACTGAAGCCACCCAGG  643
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  543  GGATGTAAATGAAGACCCTGGAGAAGATGTGGCCCTTCTTTCTGTCAGTTTTGAGGATACTGAAGCTACCCAGG  616

Query  644  TGTACCCCAAGCTGTACTTGTCACCTCGAATTGAGCATGCACTTGGAGGCTCCTCAGCTCTTCATATCCCAGCT  717
            |||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct  617  TGTACCCCAAGTTGTACTTGTCACCCCGAATTGAGCATGCACTCGGAGGCTCCTCTGCTCTTCACATCCCTGCT  690

Query  718  TTTCCAGGAGGAGGATGTCTCATTGATTACGTTCCTCAAGTATGCCACCTGCTCACCAACAAGGTGCAGTACGT  791
            ||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  691  TTCCCCGGAGGAGGATGTCTCATTGATTATGTGCCTCAAGTGTGCCACCTGCTCACCAACAAGGTACAGTATGT  764

Query  792  GATTCAAGGGTATCACAAAAGAAGAGAGTATATTGCTGCTTTTCTCAGTCACTTTGGCACAGGTGTCGTGGAAT  865
            |||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  765  GATTCAAGGCTATCACAAAAGAAGAGAGTACATCGCAGCTTTCCTCAGTCACTTTGGCACAGGTGTCGTGGAAT  838

Query  866  ATGATGCAGAAGGCTTTACAAAACTCACTCTGCTGCTGATGTGGAAAGATTTTTGTTTTCTTGTACACATTGAC  939
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  839  ATGATGCAGAAGGCTTCACAAAACTTACTCTGCTGCTGATGTGGAAAGACTTTTGTTTTCTTGTCCACATTGAC  912

Query  940  CTGCCTCTGTTTTTCCCTCGAGACCAGCCAACTCTCACATTTCAGTCCGTTTATCACTTTACCAACAGTGGACA  1013
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  913  CTGCCCCTGTTTTTCCCTCGAGATCAGCCTACGCTCACATTTCAGTCAGTCTATCACTTTACCAACAGTGGACA  986

Query 1014  GCTTTACTCCCAGGCCCAAAAAAATTATCCGTACAGCCCCAGATGGGATGGAAATGAAATGGCCAAAAGAGCAA  1087
            ||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  987  GCTTTACTCCCAAGCACAAAAAAACTACCCATACAGCCCCAGATGGGATGGAAATGAAATGGCCAAGAGAGCAA  1060

Query 1088  AGGCTTATTTCAAAACCTTTGTCCCTCAGTTCCAGGAGGCAGCATTTGCCAATGGAAAGCTC  1149
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1061  AGGCTTATTTCAAAACCTTTGTCCCTCAGTTCCAGGAGGCCGCATTTGCCAATGGAAAGCTC  1122