Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467625
- Subject:
- XM_011541069.2
- Aligned Length:
- 4199
- Identities:
- 2559
- Gaps:
- 1628
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAAGCGGAGCCGCTGCCGCGACCGACCGCAGCCGCCGCCGCCCGACCGCCGGGAGGATGGAGTTCAGCGGGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AGCGGAGCTGTCTCAGTCTTTGCCGCCGCGCCGGCGAGCGCCGCCCGGGAGGCAGCGGCTGGAGGAGCGGACGG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GCCCCGCGGGGCCCGAGGGCAAGGAGCAGGATGTAGTAACTGGAGTTAGTCCCCTGCTCTTCAGGAAACTCAGT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 AATCCTGACATATTTTCATCCACTGGAAAAGTTAAACTTCAGCGACAACTGAGTCAGGATGATTGTAAGTTATG 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GAGAGGAAACCTGGCCAGCTCTCTATCGGGTAAGCAGCTGCTCCCTTTGTCCAGCAGTGTACATAGCAGTGTGG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 GACAGGTGACTTGGCAGTCGTCAGGAGAAGCATCAAACCTGGTTCGAATGAGAAACCAGTCCCTTGGACAGTCT 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 GCACCTTCTCTTACTGCTGGCCTGAAGGAGTTGAGCCTTCCAAGAAGAGGCAGCTTAATCTCTACCCTTTGCCG 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 AGGAGCTGAAGTAAACCAGCACATGTTTTCACCCACATCTGCTCCAGCCCTCTTCCTCACTAAAGTCCCATTTA 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 GTGCTGATTGTGCTTTGGCTACTTCTCCTCTTGCCATTTTCCTGAACCCACGAGCCCACAGCAGTCCTGGCACT 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 CCTTGTTCCAGCCGCCCACTGCCGTGGAGTTGTCGGACAAGTAACCGCAAGAGCTTGATTGTGACCTCTAGCAC 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 ATCACCTACACTACCACGGCCACACTCACCACTCCATGGCCACACAGGTAACAGTCCTTTGGACAGCCCCCGGA 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 ATTTCTCTCCAAATGCACCTGCTCACTTTTCTTTTGTTCCTGCCCGTAGCCATAGCCACAGAGCTGACAGGACT 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 GATGGGCGGCGCTGGTCTTTGGCCTCTTTGCCCTCTTCAGGATATGGAACTAACACTCCTAGCTCCACTGTCTC 962
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 963 ATCATCATGCTCCTCACAGGAAAAGCTGCATCAGTTGCCTTTCCAGCCTACAGCTGATGAGCTGCACTTTTTGA 1036
Query 1 --------------------------------------------------------ATGCGGCCTCGCTCCCGG 18
||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CGAAGCATTTCAGCACAGAGAGCGTACCAGATGAGGAAGGACGGCAGTCCCCAGCCATGCGGCCTCGCTCCCGG 1110
Query 19 AGCCTCAGTCCCGGACGATCCCCAGTATCCTTTGACAGTGAAATAATAATGATGAATCATGTTTACAAAGAAAG 92
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGCCTCAGTCCCGGACGATCCCCAGTATCCTTTGACAGTGAAATAATAATGATGAATCATGTTTACAAAGAAAG 1184
Query 93 ATTCCCAAAGGCCACCGCACAAATGGAAGAGCGACTAGCAGAGTTTATTTCCTCCAACACTCCAGACAGCGTGC 166
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ATTCCCAAAGGCCACCGCACAAATGGAAGAGCGACTAGCAGAGTTTATTTCCTCCAACACTCCAGACAGCGTGC 1258
Query 167 TGCCCTTGGCAGATGGAGCCCTGAGCTTTATTCATCATCAGGTGATTGAGATGGCCCGAGACTGCCTGGATAAA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGCCCTTGGCAGATGGAGCCCTGAGCTTTATTCATCATCAGGTGATTGAGATGGCCCGAGACTGCCTGGATAAA 1332
Query 241 TCTCGGAGTGGCCTCATTACATCACAATACTTCTACGAACTTCAAGATAATTTGGAGAAACTTTTACAAGATGC 314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCTCGGAGTGGCCTCATTACATCACAATACTTCTACGAACTTCAAGATAATTTGGAGAAACTTTTACAAGATGC 1406
Query 315 TCATGAGCGCTCAGAGAGCTCAGAAGTGGCTTTTGTGATGCAGCTGGTGAAAAAGCTGATGATTATCATTGCCC 388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCATGAGCGCTCAGAGAGCTCAGAAGTGGCTTTTGTGATGCAGCTGGTGAAAAAGCTGATGATTATCATTGCCC 1480
Query 389 GCCCAGCACGTCTCCTGGAATGCCTGGAGTTTGACCCTGAAGAGTTCTACCACCTTTTAGAAGCAGCTGAGGGC 462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GCCCAGCACGTCTCCTGGAATGCCTGGAGTTTGACCCTGAAGAGTTCTACCACCTTTTAGAAGCAGCTGAGGGC 1554
Query 463 CACGCCAAAGAGGGACAAGGGATTAAATGTGACATTCCCCGCTACATCGTTAGCCAGCTGGGCCTCACCCGGGA 536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CACGCCAAAGAGGGACAAGGGATTAAATGTGACATTCCCCGCTACATCGTTAGCCAGCTGGGCCTCACCCGGGA 1628
Query 537 TCCCCTAGAAGAAATGGCCCAGTTGAGCAGCTGTGACAGTCCTGACACTCCAGAGACAGATGATTCTATTGAGG 610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TCCCCTAGAAGAAATGGCCCAGTTGAGCAGCTGTGACAGTCCTGACACTCCAGAGACAGATGATTCTATTGAGG 1702
Query 611 GCCATGGGGCATCTCTGCCATCTAAAAAGACACCCTCTGAAGAGGACTTCGAGACCATTAAGCTCATCAGCAAT 684
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GCCATGGGGCATCTCTGCCATCTAAAAAGACACCCTCTGAAGAGGACTTCGAGACCATTAAGCTCATCAGCAAT 1776
Query 685 GGCG-CTATGGGGCTGTATTTCTGGTGCGGCACAAGTCCACCCGGCAGCGC-TTGCCATGA--GAGATC-ACAA 753
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| .||||| ||||
Sbjct 1777 GGCGCCTATGGGGCTGTATTTCTGGTGCGGCACAAGTCCACCCGGCAGCGCTTTGCCATGAAGAAGATCAACAA 1850
Query 754 GCAG-ACTTGAT-CTACGGA--CAGAT-CAGCAGGCTTTCGT-GAGCGTGACATACTGAC-TTCGCTGAGAACC 820
|||| ||.|||| ||||||| ||||| ||||||||.||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1851 GCAGAACCTGATCCTACGGAACCAGATCCAGCAGGCCTTCGTGGAGCGTGACATACTGACTTTCGCTGAGAACC 1924
Query 821 CCTTGGTGGTCAGCATGTTCTGCTCCTTTGATACCAAGCGCCACTTGTGCATGGTGATGGAGTACGTTGAAGGG 894
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CCTTTGTGGTCAGCATGTTCTGCTCCTTTGATACCAAGCGCCACTTGTGCATGGTGATGGAGTACGTTGAAGGG 1998
Query 895 GGAGACTGTGCCACTCTGCTGAAGAATATTGGGGCCCTGCCTGTGGACATGGTGCGTCTATACTTTGCGGAAAC 968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GGAGACTGTGCCACTCTGCTGAAGAATATTGGGGCCCTGCCTGTGGACATGGTGCGTCTATACTTTGCGGAAAC 2072
Query 969 TGTGCTGGCCCTGGAGTACTTACACAACTATGGCATCGTGCACCGTGACCTCAAGCCTGACAACCTCCTAATTA 1042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TGTGCTGGCCCTGGAGTACTTACACAACTATGGCATCGTGCACCGTGACCTCAAGCCTGACAACCTCCTAATTA 2146
Query 1043 CATCCATGGGGCACATCAAGCTCACGGACTTTGGACTGTCCAAAATGGGCCTCATGAGTCTGACAACGAACTTG 1116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CATCCATGGGGCACATCAAGCTCACGGACTTTGGACTGTCCAAAATTGGCCTCATGAGTCTGACAACGAACTTG 2220
Query 1117 TATGAGGGTCATATTGAAAAGGATGCCCGGGAATTCCTGGACAAGCAGGTATGCGGGACCCCAGAATACATTGC 1190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TATGAGGGTCATATTGAAAAGGATGCCCGGGAATTCCTGGACAAGCAGGTATGCGGGACCCCAGAATACATTGC 2294
Query 1191 GCCTGAGGTGATCCTGCGCCAGGGCTATGGGAAGCCAGTGGACTGGTGGGCCATGGGCATTATCCTGTATGAGT 1264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GCCTGAGGTGATCCTGCGCCAGGGCTATGGGAAGCCAGTGGACTGGTGGGCCATGGGCATTATCCTGTATGAGT 2368
Query 1265 TCCTGGTGGGCTGCGTCCCTTTTTTTGGAGATACTCCGGAGGAGCTCTTTGGGCAGGTGATCAGTGATGAGATT 1338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TCCTGGTGGGCTGCGTCCCTTTTTTTGGAGATACTCCGGAGGAGCTCTTTGGGCAGGTGATCAGTGATGAGATT 2442
Query 1339 GTGTGGCCTGAGGGTGATGAGGCACTGCCCCCAGACGCCCAGGACCTCACCTCCAAACTGCTCCACCAGAACCC 1412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GTGTGGCCTGAGGGTGATGAGGCACTGCCCCCAGACGCCCAGGACCTCACCTCCAAACTGCTCCACCAGAACCC 2516
Query 1413 TCTGGAGAGACTTGGCACAGGCAGTGCCTATGAGGTGAAGCAGCACCCATTCTTTACTGGTCTGGACTGGACAG 1486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TCTGGAGAGACTTGGCACAGGCAGTGCCTATGAGGTGAAGCAGCACCCATTCTTTACTGGTCTGGACTGGACAG 2590
Query 1487 GACTTCTCCGCCAGAAGGCTGAATTTATTCCTCAGTTGGAGTCAGAGGATGATACTAGCTATTTTGACACCCGC 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 GACTTCTCCGCCAGAAGGCTGAATTTATTCCTCAGTTGGAGTCAGAGGATGATACTAGCTATTTTGACACCCGC 2664
Query 1561 TCAGAGCGATACCACCACATGGACTCGGAGGATGAGGAAGAAGTGAGTGAGGATGGCTGCCTTGAGATCCGCCA 1634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 TCAGAGCGATACCACCACATGGACTCGGAGGATGAGGAAGAAGTGAGTGAGGATGGCTGCCTTGAGATCCGCCA 2738
Query 1635 GTTCTCTTCCTGCTCTCCAAGGTTCAACAAGGTGTACAGCAGCATGGAGCGGCTCTCACTGCTCGAGGAGCGCC 1708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GTTCTCTTCCTGCTCTCCAAGGTTCAACAAGGTGTACAGCAGCATGGAGCGGCTCTCACTGCTCGAGGAGCGCC 2812
Query 1709 GGACACCACCCCCGACCAAGCGCAGCCTGAGTGAGGAGAAGGAGGACCATTCGGATGGCCTGGCAGGGCTCAAA 1782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 GGACACCACCCCCGACCAAGCGCAGCCTGAGTGAGGAGAAGGAGGACCATTCAGATGGCCTGGCAGGGCTCAAA 2886
Query 1783 GGCCGAGA-CGGAGGCTGGGTGATTGGCTCCCCTGAGATTATTACGGAAGCGGCTGTCGGTGTCTGAGTCGTCC 1855
|||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2887 GGCCGAGACCGGA-GCTGGGTGATTGGCTCCCCTGAGA-TATTACGGAAGCGGCTGTCGGTGTCTGAGTCATCC 2958
Query 1856 CANCACAGAGAGTGACTCAAGCCCTCCAATGAACA-TGCGACGCCGCTGCTCAGGCTTCCTGGATGCGCCTCGG 1928
|| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2959 CA-CACAGAGAGTGACTCAAGCCCTCCAATG-ACAGTGCGACGCCGCTGCTCAGGCCTCCTGGATGCGCCTCGG 3030
Query 1929 TTCCCGGAGGGCCNTGAGGAGCCCAGCAGCACCCNTCAGGAGGCAACCACAGGAGGGTATATGGGTCCTGACAC 2002
|||||||||||||.|||||||.|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3031 TTCCCGGAGGGCCCTGAGGAGGCCAGCAGCACCC-TCAGGAGGCAACCACAGGAGGGTATATGGGTCCTGACAC 3103
Query 2003 CCCCCATTCT-GAGAGGGGGTATCTGGGCCTGTCACTGAACACTCNAGGGGAGCAGCGGCCAAAGCTGGATGAG 2075
|||| .||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3104 CCCC--ATCTGGAGAGGGGGTATCTGGGCCTGTCACTGAACACTC-AGGGGAGCAGCGGCCAAAGCTGGATGAG 3174
Query 2076 GAAGCTGTTGGCCGGAGCAGTGGTTCCAGTCCAGCTATGGAGACCCGAGGCCGTGGGACCTCACAGCTGGCTGA 2149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3175 GAAGCTGTTGGCCGGAGCAGTGGTTCCAGTCCAGCTATGGAGACCCGAGGCCGTGGGACCTCACAGCTGGCTGA 3248
Query 2150 GGGAGCCACAGCCAAGGCCATCAGTGACCTGGCTGTGCGTAGGGCCCGCCACCGGCTGCTCTCTGGGGACTCAA 2223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3249 GGGAGCCACAGCCAAGGCCATCAGTGACCTGGCTGTGCGTAGGGCCCGCCACCGGCTGCTCTCTGGGGACTCAA 3322
Query 2224 CAGAGAAGCGCACTGCTCGCCCTGTCAACAAAGTGATCAAGTCCGCCTCAGCCACAGCCCTCTCACTCCTCATT 2297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3323 CAGAGAAGCGCACTGCTCGCCCTGTCAACAAAGTGATCAAGTCCGCCTCAGCCACAGCCCTCTCACTCCTCATT 3396
Query 2298 CCTTCGGAACACCACACCTGCTCCCCGTTGGCCAGCCCCATGTCCCCACATTCTCAGTCGTCCAACCCATCATC 2371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3397 CCTTCGGAACACCACACCTGCTCCCCGTTGGCCAGCCCCATGTCCCCACATTCTCAGTCGTCCAACCCATCATC 3470
Query 2372 CCGGGACTCTTCTC------------------------------------------------------------ 2385
||||||||||||||
Sbjct 3471 CCGGGACTCTTCTCCAAGCAGGGACTTCTTGCCAGCCCTTGGCAGCATGAGGCCTCCCATCATCATCCACCGAG 3544
Query 2386 ----CAAGAAGTATGGCTTCACCCTGCGGGCCATTCGCGTCTACATGGGTGACTCCGATGTCTACACCGTGCAC 2455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3545 CTGGCAAGAAGTATGGCTTCACCCTGCGGGCCATTCGCGTCTACATGGGTGACTCCGATGTCTACACCGTGCAC 3618
Query 2456 CATATGGTGTGGCACGTGGAGGATGGAGGTCCGGCCAGTGAGGCAGGGCTTCGTCAAGGTGACCTCATCACCCA 2529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3619 CATATGGTGTGGCACGTGGAGGATGGAGGTCCGGCCAGTGAGGCAGGGCTTCGTCAAGGTGACCTCATCACCCA 3692
Query 2530 TGTCAATGGGGAACCTGTGCATGGCCTGGTGCACACGGAGGTGGTGGAGC------------------------ 2579
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 3693 TGTCAATGGGGAACCTGTGCATGGCCTGGTGCACACGGAGGTGGTAGAGCTGATCCTGAAGAGTGGAAACAAGG 3766
Query 2580 -------------------------------------------------------------------------- 2579
Sbjct 3767 TGGCCATTTCAACAACTCCCCTGGAGAACACATCCATTAAAGTGGGGCCAGCTCGGAAGGGCAGCTACAAGGCC 3840
Query 2580 -------------------------------------------------------------------------- 2579
Sbjct 3841 AAGATGGCCCGAAGGAGCAAGAGGAGCCGCGGCAAGGATGGGCAAGAAAGCAGAAAAAGGAGCTCCCTGTTCCG 3914
Query 2580 -------------------------------------------------------------------------- 2579
Sbjct 3915 CAAGATCACCAAGCAAGCATCCCTGCTCCACACCAGCCGCAGCCTTTCTTCCCTTAACCGCTCCTTGTCATCAG 3988
Query 2580 -------------------------------------------------------------------------- 2579
Sbjct 3989 GGGAGAGTGGGCCAGGCTCTCCCACACACAGCCACAGCCTTTCCCCCCGATCTCCCACTCAAGGCTACCGGGTG 4062
Query 2580 -------------------------------------------------------------------------- 2579
Sbjct 4063 ACCCCCGATGCTGTGCATTCAGGCAACTCTCACGGCCCAAGAGTGCGGAGCCACCCCGTTCACCACTACTCAAG 4136
Query 2580 ------------------------------------------------------- 2579
Sbjct 4137 AGGGTGCAGTCGGCTGAGAAACTGGCAGCAGCACTTGCCGCCTCTGAGAAGAAGC 4191
