Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467633
- Subject:
- NM_172290.3
- Aligned Length:
- 1057
- Identities:
- 829
- Gaps:
- 134
Alignment
Query 1 ATGGGGGTCTGTGGGTACC-TGTTCCTGCCCTGG---AAGTGC----------CTCGTGGTCGTGTCTCTCA-- 58
.||...||| | ||.|| ||.||| |||||||.| ..||| |||
Sbjct 1 ----------ATGAAAACCAT--------CCAGGCAAAAATGCACAATTCTATCTCGTGGGC-AATCT-TCACG 54
Query 59 -GGCTG------CTGTTCCTTGTACCCACAGGAGTGCCCGTGCGCAGCGGAGATGCCACCTTCCCCAAAGCTAT 125
||||| ||||.|||..| ||| |||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 55 GGGCTGGCGGCTCTGTGCCTCTT--CCA-AGGAGTGCCGGTGCGTAGCGGAGATGCCACCTTTCCCAAAGCTAT 125
Query 126 GGACAACGTGACGGTCCGGCAGGGGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACTATTGACAACCGGGTCACCCGGGTGG 199
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 126 GGACAACGTGACGGTCAGGCAGGGGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACAATTGACAACCGAGTCACCCGGGTGG 199
Query 200 CCTGGCTAAACCGCAGCACCATCCTCTATGCTGGGAATGACAAGTGGTGCCTGGATCCTCGCGTGGTCCTTCTG 273
||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 200 CCTGGCTAAACCGCAGTACCATCCTCTATGCTGGAAATGACAAGTGGTGCCTAGATCCTCGTGTGGTCCTCCTG 273
Query 274 AGCAACACCCAAACGCAGTACAGCATCGAGATCCAGAACGTGGATGTGTATGACGAGGGCCCTTACACCTGCTC 347
||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 274 AGTAACACCCAGACCCAGTACAGCATTGAGATCCAGAATGTGGATGTGTACGATGAGGGCCCTTATACCTGCTC 347
Query 348 GGTGCAGACAGACAACCACCCAAAGACCTCTAGGGTCCACCTCATTGTGCAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGA 421
|||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 348 GGTACAGACAGACAACCACCCTAAGACCTCCAGGGTCCACCTCATTGTACAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGA 421
Query 422 TTTCTTCAGATATCTCCATTAATGAAGGGAACAATATTAGCCTCACCTGCATAGCAACTGGTAGACCAGAGCCT 495
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 422 TTTCTTCAGATATCTCCATTAATGAAGGGAACAACATCAGCCTCACTTGCATAGCCACAGGTAGACCGGAGCCT 495
Query 496 ACGGTTACTTGGAGACACATCTCTCCCAAAGCGGTTGGCTTTGTGAGTGAAGACGAATACTTGGAAATTCAGGG 569
||.||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||.||||.||.|||||
Sbjct 496 ACAGTAACCTGGAGACATATTTCTCCCAAGGCCGTTGGCTTTGTGAGTGAGGATGAGTACCTGGAGATCCAGGG 569
Query 570 CATCACCCGGGAGCAGTCAGGGGACTACGAGTGCAGTGCCTCCAATGACGTGGCCGCGCCCGTGGTACGGAGAG 643
||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct 570 CATCACTCGGGAACAGTCAGGCGAGTACGAGTGCAGCGCCTCCAACGACGTGGCGGCACCAGTGGTACGAAGAG 643
Query 644 TAAAGGTCACCGTGAACTATCCACCATACATTTCAGAAGCCAAGGGTACAGGTGTCCCCGTGGGACAAAAGGGG 717
|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 644 TGAAGGTCACCGTGAACTATCCACCATACATCTCAGAAGCTAAGGGCACAGGTGTCCCCGTGGGGCAGAAGGGG 717
Query 718 ACACTGCAGTGTGAAGCCTCAGCAGTCCCCTCAGCAGAATTCCAGTGGTACAAGGATGACAAAAGACTGATTGA 791
||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 718 ACTCTGCAGTGTGAAGCTTCCGCAGTCCCTTCAGCAGAATTTCAATGGTTCAAGGATGACAAAAGACTGGTCGA 791
Query 792 AGGAAAGAAAGGGGTGAAAGTGGAAAACAGACCTTTCCTCTCAAAACTCATCTTCTTCAATGTCTCTGAACATG 865
|||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 792 AGGAAAGAAGGGAGTCAAAGTGGAAAACAGACCTTTCCTTTCAAAACTCACCTTTTTCAACGTCTCTGAACATG 865
Query 866 ACTATGGGAACTACACTTGCGTGGCCTCCAACAAGCTGGGCCACACCAATGCCAGCATCATGCTATTTGGTGAG 939
||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||| .
Sbjct 866 ACTATGGGAACTACACATGTGTGGCCTCCAACAAGCTGGGTCACACCAACGCCAGCATCATGCTATTTGGT--C 937
Query 940 ACTGTGCTC----------------------------------------------------------------- 948
.|.|||||.
Sbjct 938 CCGGTGCTGTCAGTGAGGTCAACAATGGGACATCAAGGAGGGCAGGCTGCATTTGGCTCCTCCCTCTTCTGGTC 1011
Query 949 --------------------- 948
Sbjct 1012 TTACACCTGCTCCTCAAATTT 1032