Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000467633
Subject:
XM_006510207.3
Aligned Length:
1068
Identities:
865
Gaps:
120

Alignment

Query    1  ATGGGGGTCTGTGGGTACCTGTTCCTGCCCTGGAAGTGCCTCGTGGTCGTGTCTCTCAGGCTGCTGTTCCTTGT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGGGGTCTGTGGGTACCTGTTCCTGCCCTGGAAGTGCCTCGTGGTCGTGTCTCTCAGGCTGCTATTCCTTGT  74

Query   75  ACCCACAGGAGTGCCCGTGCGCAGCGGAGATGCCACCTTCCCCAAAGCTATGGACAACGTGACGGTCCGGCAGG  148
            |||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct   75  ACCCACAGGAGTGCCGGTGCGTAGCGGAGATGCCACCTTTCCCAAAGCTATGGACAACGTGACGGTCAGGCAGG  148

Query  149  GGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACTATTGACAACCGGGTCACCCGGGTGGCCTGGCTAAACCGCAGCACCATC  222
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  GGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACAATTGACAACCGAGTCACCCGGGTGGCCTGGCTAAACCGCAGTACCATC  222

Query  223  CTCTATGCTGGGAATGACAAGTGGTGCCTGGATCCTCGCGTGGTCCTTCTGAGCAACACCCAAACGCAGTACAG  296
            |||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct  223  CTCTATGCTGGAAATGACAAGTGGTGCCTAGATCCTCGTGTGGTCCTCCTGAGTAACACCCAGACCCAGTACAG  296

Query  297  CATCGAGATCCAGAACGTGGATGTGTATGACGAGGGCCCTTACACCTGCTCGGTGCAGACAGACAACCACCCAA  370
            |||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  297  CATTGAGATCCAGAATGTGGATGTGTACGATGAGGGCCCTTATACCTGCTCGGTACAGACAGACAACCACCCTA  370

Query  371  AGACCTCTAGGGTCCACCTCATTGTGCAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGATTTCTTCAGATATCTCCATTAAT  444
            |||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGACCTCCAGGGTCCACCTCATTGTACAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGATTTCTTCAGATATCTCCATTAAT  444

Query  445  GAAGGGAACAATATTAGCCTCACCTGCATAGCAACTGGTAGACCAGAGCCTACGGTTACTTGGAGACACATCTC  518
            |||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||
Sbjct  445  GAAGGGAACAACATCAGCCTCACTTGCATAGCCACAGGTAGACCGGAGCCTACAGTAACCTGGAGACATATTTC  518

Query  519  TCCCAAAGCGGTTGGCTTTGTGAGTGAAGACGAATACTTGGAAATTCAGGGCATCACCCGGGAGCAGTCAGGGG  592
            ||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||.||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct  519  TCCCAAGGCCGTTGGCTTTGTGAGTGAGGATGAGTACCTGGAGATCCAGGGCATCACTCGGGAACAGTCAGGCG  592

Query  593  ACTACGAGTGCAGTGCCTCCAATGACGTGGCCGCGCCCGTGGTACGGAGAGTAAAGGTCACCGTGAACTATCCA  666
            |.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGTACGAGTGCAGCGCCTCCAACGACGTGGCGGCACCAGTGGTACGAAGAGTGAAGGTCACCGTGAACTATCCA  666

Query  667  CCATACATTTCAGAAGCCAAGGGTACAGGTGTCCCCGTGGGACAAAAGGGGACACTGCAGTGTGAAGCCTCAGC  740
            ||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct  667  CCATACATCTCAGAAGCTAAGGGCACAGGTGTCCCCGTGGGGCAGAAGGGGACTCTGCAGTGTGAAGCTTCCGC  740

Query  741  AGTCCCCTCAGCAGAATTCCAGTGGTACAAGGATGACAAAAGACTGATTGAAGGAAAGAAAGGGGTGAAAGTGG  814
            ||||||.|||||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct  741  AGTCCCTTCAGCAGAATTTCAATGGTTCAAGGATGACAAAAGACTGGTCGAAGGAAAGAAGGGAGTCAAAGTGG  814

Query  815  AAAACAGACCTTTCCTCTCAAAACTCATCTTCTTCAATGTCTCTGAACATGACTATGGGAACTACACTTGCGTG  888
            ||||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  815  AAAACAGACCTTTCCTTTCAAAACTCACCTTTTTCAACGTCTCTGAACATGACTATGGGAACTACACATGTGTG  888

Query  889  GCCTCCAACAAGCTGGGCCACACCAATGCCAGCATCATGCTATTTG------GTGAGACT--GTGCTC------  948
            |||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||      .||||.||  ..||||      
Sbjct  889  GCCTCCAACAAGCTGGGTCACACCAACGCCAGCATCATGCTATTTGAACTAAATGAGCCTACAAGCTCAACTTT  962

Query  949  --------------------------------------------------------------------------  948
                                                                                      
Sbjct  963  GTTGCAAGGTCCCGGTGCTGTCAGTGAGGTCAACAATGGGACATCAAGGAGGGCAGGCTGCATTTGGCTCCTCC  1036

Query  949  --------------------------------  948
                                            
Sbjct 1037  CTCTTCTGGTCTTACACCTGCTCCTCAAATTT  1068