Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467633
• Subject: XM_017313305.1
• Aligned Length: 1091
• Identities: 831
• Gaps: 166

Alignment

Query    1  ATGGGGGTCTGTGGGTACC-TGTTCCTGCCCTGG---AAGTGC----------CTCGTGGTCGTGTCTCTCA--  58
                      .||...||| |        ||.||   ||.|||          |||||||.| ..||| |||  
Sbjct    1  ----------ATGAAAACCAT--------CCAGGCAAAAATGCACAATTCTATCTCGTGGGC-AATCT-TCACG  54

Query   59  -GGCTG------CTGTTCCTTGTACCCACAGGAGTGCCCGTGCGCAGCGGAGATGCCACCTTCCCCAAAGCTAT  125
             |||||      ||||.|||..|  ||| |||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct   55  GGGCTGGCGGCTCTGTGCCTCTT--CCA-AGGAGTGCCGGTGCGTAGCGGAGATGCCACCTTTCCCAAAGCTAT  125

Query  126  GGACAACGTGACGGTCCGGCAGGGGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACTATTGACAACCGGGTCACCCGGGTGG  199
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  126  GGACAACGTGACGGTCAGGCAGGGGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACAATTGACAACCGAGTCACCCGGGTGG  199

Query  200  CCTGGCTAAACCGCAGCACCATCCTCTATGCTGGGAATGACAAGTGGTGCCTGGATCCTCGCGTGGTCCTTCTG  273
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct  200  CCTGGCTAAACCGCAGTACCATCCTCTATGCTGGAAATGACAAGTGGTGCCTAGATCCTCGTGTGGTCCTCCTG  273

Query  274  AGCAACACCCAAACGCAGTACAGCATCGAGATCCAGAACGTGGATGTGTATGACGAGGGCCCTTACACCTGCTC  347
            ||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  274  AGTAACACCCAGACCCAGTACAGCATTGAGATCCAGAATGTGGATGTGTACGATGAGGGCCCTTATACCTGCTC  347

Query  348  GGTGCAGACAGACAACCACCCAAAGACCTCTAGGGTCCACCTCATTGTGCAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGA  421
            |||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  348  GGTACAGACAGACAACCACCCTAAGACCTCCAGGGTCCACCTCATTGTACAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGA  421

Query  422  TTTCTTCAGATATCTCCATTAATGAAGGGAACAATATTAGCCTCACCTGCATAGCAACTGGTAGACCAGAGCCT  495
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct  422  TTTCTTCAGATATCTCCATTAATGAAGGGAACAACATCAGCCTCACTTGCATAGCCACAGGTAGACCGGAGCCT  495

Query  496  ACGGTTACTTGGAGACACATCTCTCCCAAAGCGGTTGGCTTTGTGAGTGAAGACGAATACTTGGAAATTCAGGG  569
            ||.||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||.||||.||.|||||
Sbjct  496  ACAGTAACCTGGAGACATATTTCTCCCAAGGCCGTTGGCTTTGTGAGTGAGGATGAGTACCTGGAGATCCAGGG  569

Query  570  CATCACCCGGGAGCAGTCAGGGGACTACGAGTGCAGTGCCTCCAATGACGTGGCCGCGCCCGTGGTACGGAGAG  643
            ||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct  570  CATCACTCGGGAACAGTCAGGCGAGTACGAGTGCAGCGCCTCCAACGACGTGGCGGCACCAGTGGTACGAAGAG  643

Query  644  TAAAGGTCACCGTGAACTATCCACCATACATTTCAGAAGCCAAGGGTACAGGTGTCCCCGTGGGACAAAAGGGG  717
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  644  TGAAGGTCACCGTGAACTATCCACCATACATCTCAGAAGCTAAGGGCACAGGTGTCCCCGTGGGGCAGAAGGGG  717

Query  718  ACACTGCAGTGTGAAGCCTCAGCAGTCCCCTCAGCAGAATTCCAGTGGTACAAGGATGACAAAAGACTGATTGA  791
            ||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||.|.||
Sbjct  718  ACTCTGCAGTGTGAAGCTTCCGCAGTCCCTTCAGCAGAATTTCAATGGTTCAAGGATGACAAAAGACTGGTCGA  791

Query  792  AGGAAAGAAAGGGGTGAAAGTGGAAAACAGACCTTTCCTCTCAAAACTCATCTTCTTCAATGTCTCTGAACATG  865
            |||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  792  AGGAAAGAAGGGAGTCAAAGTGGAAAACAGACCTTTCCTTTCAAAACTCACCTTTTTCAACGTCTCTGAACATG  865

Query  866  ACTATGGGAACTACACTTGCGTGGCCTCCAACAAGCTGGGCCACACCAATGCCAGCATCATGCTATTTG-----  934
            ||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||     
Sbjct  866  ACTATGGGAACTACACATGTGTGGCCTCCAACAAGCTGGGTCACACCAACGCCAGCATCATGCTATTTGAACTA  939

Query  935  -GTGAGACT--GTGCTC---------------------------------------------------------  948
             .||||.||  ..||||                                                         
Sbjct  940  AATGAGCCTACAAGCTCAACTTTGTTGCAAGGTCCCGGTGCTGTCAGTGAGGTCAACAATGGGACATCAAGGAG  1013

Query  949  -------------------------------------------------------  948
                                                                   
Sbjct 1014  GGCAGGCTGCATTTGGCTCCTCCCTCTTCTGGTCTTACACCTGCTCCTCAAATTT  1068