Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467641
• Subject: NM_030678.3
• Aligned Length: 2216
• Identities: 1765
• Gaps: 199

Alignment

Query    1  ATGCCTTTAAACCGCACTTTGTCCATGTCCTCACTGCCAGGACTGGAGGACTGGGAGGATGAATTCGACCTGGA  74
            ||||||.|.|.|||||.|.|.||..|||||||.||.||||||.||||.||||||||||||||||||||||..||
Sbjct    1  ATGCCTCTCAGCCGCAGTCTCTCTGTGTCCTCGCTTCCAGGATTGGAAGACTGGGAGGATGAATTCGACCCCGA  74

Query   75  GAACGCAGTGCTCTTCGAAGTGGCCTGGGAGGTGGCTAACAAGGTGGGTGGCATCTACACGGTGCTGCAGACGA  148
            ||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  GAACGCAGTGCTTTTCGAGGTGGCCTGGGAGGTGGCCAACAAGGTGGGTGGCATCTACACTGTGCTGCAGACGA  148

Query  149  AGGCGAAGGTGACAGGGGACGAATGGGGCGACAACTACTTCCTGGTGGGGCCGTACACGGAGCAGGGCGTGAGG  222
            |||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||..||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  AGGCGAAGGTGACAGGGGATGAATGGGGTGACAACTACTATCTGGTGGGACCATACACGGAGCAGGGTGTGAGG  222

Query  223  ACCCAGGTGGAACTGCTGGAGGCCCCCACCCCGGCCCTGAAGAGGACACTGGATTCCATGAACAGCAAGGG---  293
            ||.|||||.||.||.||||||.||||.||.||||..|||||||||||..||||||||||||||||||||||   
Sbjct  223  ACGCAGGTAGAGCTCCTGGAGCCCCCAACTCCGGAACTGAAGAGGACTTTGGATTCCATGAACAGCAAGGGTTG  296

Query  294  --------------------------------------------------------------------------  293
                                                                                      
Sbjct  297  TAAGGTGTATTTTGGGCGTTGGCTGATCGAGGGGGGACCCCTAGTGGTGCTCCTGGATGTAGGAGCCTCAGCTT  370

Query  294  -------------------------------------CTGCA--------------------------------  298
                                                 |||||                                
Sbjct  371  GGGCCCTGGAGCGCTGGAAGGGTGAGCTTTGGGACACCTGCAACATCGGGGTACCCTGGTACGACCGCGAGGCC  444

Query  299  ----------------------------------------------AGTTCCTGGCACAGAGTGAGGAGAAGCC  326
                                                          ||||||||||.||||..||.||||||||
Sbjct  445  AATGACGCTGTCCTGTTCGGCTTCCTCACCACCTGGTTCCTGGGTGAGTTCCTGGCCCAGAACGAAGAGAAGCC  518

Query  327  ACATGTGGTTGCTCACTTCCATGAGTGGTTGGCAGGCGTTGGACTCTGCCTGTGTCGTGCCCGGCGACTGCCTG  400
            ..||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||..||||.|
Sbjct  519  GTATGTGGTTGCCCACTTCCACGAATGGTTGGCTGGCGTTGGTCTGTGTCTGTGCCGTGCCCGGCGCTTGCCGG  592

Query  401  TAGCAACCATCTTCACCACCCATGCCACGCTGCTGGGGCGCTACCTGTGTGCCGGTGCCGTGGACTTCTACAAC  474
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct  593  TGGCAACCATCTTCACCACTCATGCCACGCTGCTGGGGCGCTACCTGTGTGCTGGCGCTGTGGACTTCTACAAC  666

Query  475  AACCTGGAGAACTTCAACGTGGACAAGGAAGCAGGGGAGAGGCAGATCTACCACCGATACTGCATGGAAAGGGC  548
            |||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||..|.||
Sbjct  667  AACCTGGAGAATTTCAATGTAGACAAGGAAGCAGGAGAGAGGCAGATCTATCACCGGTACTGCATGGAGCGTGC  740

Query  549  GGCAGCCCACTGCGCTCACGTCTTCACTACTGTGTCCCAGATCACCGCCATCGAGGCACAGCACTTGCTCAAGA  622
            .|||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||.|.||.||||
Sbjct  741  AGCAGCTCACTGTGCCCATGTCTTCACTACCGTATCCCAGATCACCGCAATCGAGGCTCAACACCTCCTTAAGA  814

Query  623  GGAAACCAGATATTGTGACCCCCAATGGGCTGAATGTGAAGAAGTTTTCTGCCATGCATGAGTTCCAGAACCTC  696
            |.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.
Sbjct  815  GAAAACCAGATATTGTGACCCCCAACGGGCTGAATGTGAAGAAGTTCTCTGCTATGCACGAATTCCAGAACCTT  888

Query  697  CATGCTCAGAGCAAGGCTCGAATCCAGGAGTTTGTGCGGGGCCATTTTTATGGGCATCTGGACTTCAACTTGGA  770
            ||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|.||
Sbjct  889  CATGCTCAGAGCAAAGCACGAATCCAGGAATTTGTGCGTGGCCATTTTTATGGGCACCTGGACTTCAACCTAGA  962

Query  771  CAAGACCTTATACTTCTTTATCGCCGGCCGCTATGAGTTCTCCAACAAGGGTGCTGACGTCTTCCTGGAGGCAT  844
            ||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct  963  CAAGACTTTGTATTTCTTTATCGCTGGCCGCTATGAGTTTTCCAACAAGGGAGCTGATGTGTTCCTGGAGGCAT  1036

Query  845  TGGCTCGGCTCAACTATCTGCTCAGAGTGAACGGCAGCGAGCAGACAGTGGTTGCCTTCTTCATCATGCCAGCG  918
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1037  TGGCCCGGCTCAACTATCTGCTCAGAGTGAATGGCAGTGAGCAAACAGTTGTCGCATTCTTCATCATGCCGGCC  1110

Query  919  CGGACCAACAATTTCAACGTGGAAACCCTCAAAGGCCAAGCTGTGCGCAAACAGCTTTGGGACACGGCCAACAC  992
            ||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1111  CGGACCAATAATTTCAACGTGGAAACCCTGAAGGGCCAAGCCGTGCGCAAACAACTATGGGACACAGCCAATAC  1184

Query  993  GGTGAAGGAAAAGTTCGGGAGGAAGCTTTATGAATCCTTACTGGTTGGGAGCCTTCCCGACATGAACAAGATGC  1066
            .||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||||||.|..|.||.||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGTCAAGGAGAAATTTGGGAGGAAGCTCTACGAATCCCTTTTAGTGGGGAGCCTCCCGGACATGAACAAGATGC  1258

Query 1067  TGGATAAGGAAGACTTCACTATGATGAAGAGAGCCATCTTTGCAACGCAGCGGCAGTCTTTCCCCCCTGTGTGC  1140
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1259  TGGACAAGGAGGACTTCACTATGATGAAGAGAGCCATCTTTGCCACTCAGCGGCAGTCTTTCCCACCAGTGTGC  1332

Query 1141  ACCCACAATATGCTGGATGACTCCTCAGACCCCATCCTGACCACCATCCGCCGAATCGGCCTCTTCAATAGCAG  1214
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 1333  ACCCACAACATGCTGGACGACTCCTCAGACCCCATCTTGACCACCATCCGCCGAATTGGCCTTTTCAACAGCAG  1406

Query 1215  TGCCGACAGGGTGAAGGTGATTTTCCACCCGGAGTTCCTCTCCTCCACAAGCCCCCTGCTCCCTGTGGACTATG  1288
            |||||||.|.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct 1407  TGCCGACCGTGTGAAGGTGATTTTTCACCCAGAATTCCTTTCTTCCACAAGCCCTCTCCTCCCCGTGGATTATG  1480

Query 1289  AGGAGTTTGTCCGTGGCTGTCACCTTGGAGTCTTCCCCTCCTACTATGAGCCTTGGGGCTACACACCGGCTGAG  1362
            ||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1481  AGGAATTTGTCCGCGGCTGTCACCTTGGGGTCTTCCCCTCCTACTATGAGCCCTGGGGCTACACACCAGCGGAG  1554

Query 1363  TGCACGGTTATGGGAATCCCCAGTATCTCCACCAATCTCTCCGGCTTCGGCTGCTTCATGGAGGAACACATCGC  1436
            |||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGCACTGTCATGGGCATCCCCAGCATCTCCACCAACCTCTCCGGCTTTGGCTGCTTTATGGAGGAACACATCGC  1628

Query 1437  AGACCCCTCAGCTTACGGTATCTACATTCTTGACCGGCGGTTCCGCAGCCTGGATGATTCCTGCTCGCAGCTCA  1510
            |||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1629  AGATCCCTCAGCTTACGGCATTTACATTCTGGATCGGAGGTTCCGCAGCCTGGATGATTCATGCTCACAGCTCA  1702

Query 1511  CCTCCTTCCTCTACAGTTTCTGTCAGCAGAGCCGGCGGCAGCGTATCATCCAGCGGAACCGCACGGAGCGCCTC  1584
            ||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||..|.
Sbjct 1703  CCTCCTTCCTGTACAGCTTCTGCCAGCAGAGCCGGCGACAGCGCATCATCCAGCGGAACCGCACAGAACGGTTG  1776

Query 1585  TCCGACCTTCTGGACTGGAAATACCTAGGCCGGTACTATATGTCTGCGCGCCACATGGCGCTGTCCAAGGCCTT  1658
            ||.|||.|.||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.||||||||||
Sbjct 1777  TCGGACTTGCTAGATTGGAAGTACCTGGGCCGGTACTACATGTCTGCGCGCCACATGGCTCTGGCCAAGGCCTT  1850

Query 1659  TCCAGAGCACTTCACCTACGAGCCCAACGAGGCGGATGCGGCCCAGGGGTACCGCTACCCACGGCCAGCCTCGG  1732
            ||||||.|||||||||||.||.|||.|.||||..||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1851  TCCAGACCACTTCACCTATGAACCCCATGAGGTAGATGCGACCCAGGGGTACCGGTACCCACGACCAGCCTCCG  1924

Query 1733  TGCCACCGTCGCCCTCGCTGTCACGACACTCCAGCCCGCACCAGAGTGAGGACGAGGAGGATCCCCGGAACGGG  1806
            |.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||.|.||.
Sbjct 1925  TCCCGCCGTCGCCCTCACTGTCTCGACACTCCAGCCCACACCAGAGTGAGGATGAGGAAGAGCCACGGGATGGA  1998

Query 1807  CCGCTGGAGGAAGACGGCGAGCGCTACGATGAGGACGAGGAGGCCGCCAAGGACCGGCGCAACATCCGTGCACC  1880
            ||.||||.|||||||.|.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1999  CCCCTGGGGGAAGACAGTGAGCGTTATGATGAGGAAGAGGAGGCTGCCAAGGACCGCCGCAACATCCGGGCACC  2072

Query 1881  AGAGTGGCCGCGCCGAGCGTCCTGCACCTCCTCCACCAGCGGCAGCAAG---CGCAACTCTGTGGACAC--GGC  1949
            .||||||||.|||.|.||.|||||..||||||||||..|.|||||||||   .|||||||.||||||||  |||
Sbjct 2073  TGAGTGGCCACGCAGGGCCTCCTGTTCCTCCTCCACAGGTGGCAGCAAGAGAAGCAACTCGGTGGACACTGGGC  2146

Query 1950  CACCTCCAGCTCACTCAGCACCCCGAGCGAGCCCCTCAGCCCCACCAGCTCCCTGGGCGAGGAGCGTAAC  2019
              |||||||||||||||||||.||.|..||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 2147  --CCTCCAGCTCACTCAGCACACCCACTGAGCCCCTGAGTCCTACCAGTTCCCTGGGTGAGGAGCGCAAC  2214