Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467690
• Subject: NM_001322186.2
• Aligned Length: 1565
• Identities: 1337
• Gaps: 205

Alignment

Query    1  ATGAGCCCCCTTTGGTGGGGGTTTCTGCTCAGTTGCTTGGGCTGCAAAATCCTGCCAGGAGCCCAGGGTCAGTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCCCCGAGTCTGCATGACGGTGGACAGCCTAGTGAACAAGGAGTGCTGCCCACGCCTGGG--TGCAGAGTCGGC  146
                                                      .|||||       |||||  |.||.|   |.|
Sbjct    1  ------------------------------------------ATGCTG-------CTGGGGATACAAA---GAC  22

Query  147  CAATGTCTGTGGCTCTCAGCAAG-GCCGGGGGCAGT----GCACAGAGGTGCGAGCCGACACAAGGCCCTGGAG  215
            .||||               ||| |||       ||    |..|.||.||       |||| |||...||.|||
Sbjct   23  AAATG---------------AAGTGCC-------GTCTCCGTTCTGATGT-------GACA-AAGAGACTAGAG  66

Query  216  TGGTCCCTACATCCTACGAAACCAGGATGACCGTGAGCTGTGGCCAAGAAAATTCTTCCACCGGACCTGCAA-G  288
                             |||     |||||.|.||.|        ||.|.|       |||.|    |.||| |
Sbjct   67  -----------------GAA-----GATGAACATGTG--------AACACA-------CACAG----TCCAATG  99

Query  289  TGCACAGGAAACTTTGCCGGCTATAATTGTGGAGACTGCAAGTTTGGCTGGACCGGTCCCAACTGCGAGCGGAA  362
            .|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  100  AGAAGAGGAAACTTTGCCGGCTATAATTGTGGAGACTGCAAGTTTGGCTGGACCGGTCCCAACTGCGAGCGGAA  173

Query  363  GAAACCACCAGTGATTCGGCAGAACATCCATTCCTTGAGTCCTCAGGAAAGAGAGCAGTTCTTGGGCGCCTTAG  436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  174  GAAACCACCAGTGATTCGGCAGAACATCCATTCCTTGAGTCCTCAGGAAAGAGAGCAGTTCTTGGGCGCCTTAG  247

Query  437  ATCTCGCGAAGAAGAGAGTACACCCCGACTACGTGATCACCACACAACACTGGCTGGGCCTGCTTGGGCCCAAT  510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  248  ATCTCGCGAAGAAGAGAGTACACCCCGACTACGTGATCACCACACAACACTGGCTGGGCCTGCTTGGGCCCAAT  321

Query  511  GGAACCCAGCCGCAGTTTGCCAACTGCAGTGTTTATGATTTTTTTGTGTGGCTCCATTATTATTCTGTTAGAGA  584
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  322  GGAACCCAGCCGCAGTTTGCCAACTGCAGTGTTTATGATTTTTTTGTGTGGCTCCATTATTATTCTGTTAGAGA  395

Query  585  TACATTATTAGGACCAGGACGCCCCTACAGGGCCATAGATTTCTCACATCAAGGACCTGCATTTGTTACCTGGC  658
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  396  TACATTATTAGGACCAGGACGCCCCTACAGGGCCATAGATTTCTCACATCAAGGACCTGCATTTGTTACCTGGC  469

Query  659  ACCGGTACCATTTGTTGTGTCTGGAAAGAGATCTCCAGCGACTCATTGGCAATGAGTCTTTTGCTTTGCCCTAC  732
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  470  ACCGGTACCATTTGTTGTGTCTGGAAAGAGATCTCCAGCGACTCATTGGCAATGAGTCTTTTGCTTTGCCCTAC  543

Query  733  TGGAACTTTGCCACTGGGAGGAACGAGTGTGATGTGTGTACAGACCAGCTGTTTGGGGCAGCGAGACCAGACGA  806
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  544  TGGAACTTTGCCACTGGGAGGAACGAGTGTGATGTGTGTACAGACCAGCTGTTTGGGGCAGCGAGACCAGACGA  617

Query  807  TCCGACTCTGATTAGTCGGAACTCAAGATTCTCCAGCTGGGAAACTGTCTGTGATAGCTTGGATGACTACAACC  880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  618  TCCGACTCTGATTAGTCGGAACTCAAGATTCTCCAGCTGGGAAACTGTCTGTGATAGCTTGGATGACTACAACC  691

Query  881  ACCTGGTCACCTTGTGCAATGGAACCTATGAAGGTTTGCTGAGAAGAAATCAAATGGGAAGAAACAGCATGAAA  954
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  692  ACCTGGTCACCTTGTGCAATGGAACCTATGAAGGTTTGCTGAGAAGAAATCAAATGGGAAGAAACAGCATGAAA  765

Query  955  TTGCCAACCTTAAAAGACATACGAGATTGCCTGTCTCTCCAGAAGTTTGACAATCCTCCCTTCTTCCAGAACTC  1028
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  766  TTGCCAACCTTAAAAGACATACGAGATTGCCTGTCTCTCCAGAAGTTTGACAATCCTCCCTTCTTCCAGAACTC  839

Query 1029  TACCTTCAGTTTCAGGAATGCTTTGGAAGGGTTTGATAAAGCAGATGGGACTCTGGATTCTCAAGTGATGAGCC  1102
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840  TACCTTCAGTTTCAGGAATGCTTTGGAAGGGTTTGATAAAGCAGATGGGACTCTGGATTCTCAAGTGATGAGCC  913

Query 1103  TTCATAATTTGGTTCATTCCTTCCTGAACGGGACAAACGCTTTGCCACATTCAGCCGCCAATGATCCCATTTTT  1176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  914  TTCATAATTTGGTTCATTCCTTCCTGAACGGGACAAACGCTTTGCCACATTCAGCCGCCAATGATCCCATTTTT  987

Query 1177  GTGGTTCTTCATTCCTTTACTGATGCCATCTTTGATGAGTGGATGAAAAGATTTAATCCTCCTGCAGATGCCTG  1250
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  988  GTGGTTCTTCATTCCTTTACTGATGCCATCTTTGATGAGTGGATGAAAAGATTTAATCCTCCTGCAGATGCCTG  1061

Query 1251  GCCTCAGGAGCTGGCCCCTATTGGTCACAATCGGATGTACAACATGGTTCCTTTCTTCCCTCCAGTGACTAATG  1324
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062  GCCTCAGGAGCTGGCCCCTATTGGTCACAATCGGATGTACAACATGGTTCCTTTCTTCCCTCCAGTGACTAATG  1135

Query 1325  AAGAACTCTTTTTAACCTCAGACCAACTTGGCTACAGCTATGCCATCGATCTGCCAGTTTCAGTTGAAGAAACT  1398
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136  AAGAACTCTTTTTAACCTCAGACCAACTTGGCTACAGCTATGCCATCGATCTGCCAGTTTCAGTTGAAGAAACT  1209

Query 1399  CCAGGTTGGCCCACAACTCTCTTAGTAGTCATGGGAACACTGGTGGCTTTGGTTGGTCTTTTTGTGCTGTTGGC  1472
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210  CCAGGTTGGCCCACAACTCTCTTAGTAGTCATGGGAACACTGGTGGCTTTGGTTGGTCTTTTTGTGCTGTTGGC  1283

Query 1473  TTTTCTTCAATATAGAAGACTTCGAAAAGGATATACACCCCTAATGGAGACACATTTAAGCAGCAAGAGATACA  1546
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284  TTTTCTTCAATATAGAAGACTTCGAAAAGGATATACACCCCTAATGGAGACACATTTAAGCAGCAAGAGATACA  1357

Query 1547  CAGAAGAAGCC  1557
            |||||||||||
Sbjct 1358  CAGAAGAAGCC  1368