Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467712
• Subject: XM_017012839.1
• Aligned Length: 2181
• Identities: 2180
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCCGCCACCCGCGGACATCGTCAAGGTGGCCATAGAATGGCCGGGCGCCTACCCCAAACTCATGGAAATTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGCCACCCGCGGACATCGTCAAGGTGGCCATAGAATGGCCGGGCGCCTACCCCAAACTCATGGAAATTGA  74

Query   75  TCAGAAAAAACCACTGTCTGCAATAATAAAGGAAGTCTGTGATGGGTGGTCTCTTGCCAACCATGAATATTTTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCAGAAAAAACCACTGTCTGCAATAATAAAGGAAGTCTGTGATGGGTGGTCTCTTGCCAACCATGAATATTTTG  148

Query  149  CACTCCAGCATGCCGATAGTTCAAACTTCTATATCACAGAAAAGAACCGCAATGAGATAAAAAATGGCACTATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CACTCCAGCATGCCGATAGTTCAAACTTCTATATCACAGAAAAGAACCGCAATGAGATAAAAAATGGCACTATC  222

Query  223  CTTCGATTAACCACATCTCCAGCTCAGAACGCCCAGCAGCTCCATGAACGAATCCAGTCCTCGAGTATGGATGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTCGATTAACCACATCTCCAGCTCAGAACGCCCAGCAGCTCCATGAACGAATCCAGTCCTCGAGTATGGATGC  296

Query  297  CAAGCTGGAAGCCCTGAAGGACTTGGCCAGCCTCTCCCGGGATGTCACGTTTGCCCAGGAGTTTATAAACCTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAAGCTGGAAGCCCTGAAGGACTTGGCCAGCCTCTCCCGGGATGTCACGTTTGCCCAGGAGTTTATAAACCTGG  370

Query  371  ACGGTATCTCTCTCCTCACGCAGATGGTAGAGAGCGGCACTGAGCGATACCAGAAATTGCAGAAGATCATGAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACGGTATCTCTCTCCTCACGCAGATGGTGGAGAGCGGCACTGAGCGATACCAGAAATTGCAGAAGATCATGAAG  444

Query  445  CCTTGCTTTGGAGACATGCTGTCCTTCACCCTGACGGCCTTCGTTGAGCTGATGGACCATGGCATAGTGTCCTG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTTGCTTTGGAGACATGCTGTCCTTCACCCTGACGGCCTTCGTTGAGCTGATGGACCATGGCATAGTGTCCTG  518

Query  519  GGATACATTTTCGGTGGCGTTCATTAAGAAGATAGCAAGTTTTGTGAACAAGTCAGCCATAGACATCTCGATCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGATACATTTTCGGTGGCGTTCATTAAGAAGATAGCAAGTTTTGTGAACAAGTCAGCCATAGACATCTCGATCC  592

Query  593  TGCAGCGGTCCTTGGCCATTTTGGAGTCGATGGTGCTCAATAGCCATGACCTCTACCAGAAAGTGGCGCAGGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCAGCGGTCCTTGGCCATTTTGGAGTCGATGGTGCTCAATAGCCATGACCTCTACCAGAAAGTGGCGCAGGAG  666

Query  667  ATCACCATCGGCCAGCTCATTCCACACCTGCAAGGGTCAGATCAAGAAATCCAAACCTATACTATTGCAGTGAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCACCATCGGCCAGCTCATTCCACACCTGCAAGGGTCAGATCAAGAAATCCAAACCTATACTATTGCAGTGAT  740

Query  741  TAATGCGCTTTTCCTGAAGGCTCCTGATGAGAGGAGGCAGGAGATGGCGAATATTTTGGCTCAGAAGCAACTGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAATGCGCTTTTCCTGAAGGCTCCTGATGAGAGGAGGCAGGAGATGGCGAATATTTTGGCTCAGAAGCAACTGC  814

Query  815  GTTCCATCATTTTAACACATGTCATCCGAGCCCAGCGGGCCATCAACAATGAGATGGCGCACCAGCTGTATGTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTTCCATCATTTTAACACATGTCATCCGAGCCCAGCGGGCCATCAACAATGAGATGGCGCACCAGCTGTATGTT  888

Query  889  CTACAAGTGCTCACCTTTAACCTCCTGGAAGACAGGATGATGACCAAAATGGACCCCCAGGACCAGGCTCAGAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTACAAGTGCTCACCTTTAACCTCCTGGAAGACAGGATGATGACCAAAATGGACCCCCAGGACCAGGCTCAGAG  962

Query  963  GGACATCATATTTGAACTTCGAAGAATTGCTTTTGATGCTGAGTCTGAACCTAACAACAGCAGTGGCAGCATGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGACATCATATTTGAACTTCGAAGAATTGCTTTTGATGCTGAGTCTGAACCTAACAACAGCAGTGGCAGCATGG  1036

Query 1037  AGAAACGCAAGTCCATGTACACGCGAGATTATAAGAAGCTTGGGTTCATTAATCATGTCAACCCTGCCATGGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAAACGCAAGTCCATGTACACGCGAGATTATAAGAAGCTTGGGTTCATTAATCATGTCAACCCTGCCATGGAC  1110

Query 1111  TTCACGCAGACTCCACCTGGGATGTTGGCTCTGGACAACATGCTGTACTTTGCCAAGCACCACCAAGATGCCTA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCACGCAGACTCCACCTGGGATGTTGGCTCTGGACAACATGCTGTACTTTGCCAAGCACCACCAAGATGCCTA  1184

Query 1185  CATCCGGATTGTGCTTGAGAACAGTAGTCGAGAAGACAAGCATGAATGTCCCTTTGGCCGCAGTAGTATAGAGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATCCGGATTGTGCTTGAGAACAGTAGTCGAGAAGACAAGCATGAATGTCCCTTTGGCCGCAGTAGTATAGAGC  1258

Query 1259  TGACCAAGATGCTATGTGAGATCTTGAAAGTGGGCGAGTTGCCTAGTGAGACCTGCAACGACTTCCACCCGATG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGACCAAGATGCTATGTGAGATCTTGAAAGTGGGCGAGTTGCCTAGTGAGACCTGCAACGACTTCCACCCGATG  1332

Query 1333  TTCTTCACCCACGACAGATCCTTTGAGGAGTTTTTCTGCATCTGTATCCAGCTCCTGAACAAGACATGGAAGGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTCTTCACCCACGACAGATCCTTTGAGGAGTTTTTCTGCATCTGTATCCAGCTCCTGAACAAGACATGGAAGGA  1406

Query 1407  AATGAGGGCAACTTCTGAAGACTTCAACAAGGTAATGCAGGTGGTGAAGGAGCAGGTTATGAGAGCACTTACAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AATGAGGGCAACTTCTGAAGACTTCAACAAGGTAATGCAGGTGGTGAAGGAGCAGGTTATGAGAGCACTTACAA  1480

Query 1481  CCAAGCCTAGCTCCCTGGACCAGTTCAAGAGCAAACTGCAGAACCTGAGCTACACTGAGATCCTGAAAATCCGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCAAGCCTAGCTCCCTGGACCAGTTCAAGAGCAAACTGCAGAACCTGAGCTACACTGAGATCCTGAAAATCCGC  1554

Query 1555  CAGTCCGAGAGGATGAACCAGGAAGATTTCCAGTCCCGCCCGATTTTGGAACTAAAGGAGAAGATTCAGCCAGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGTCCGAGAGGATGAACCAGGAAGATTTCCAGTCCCGCCCGATTTTGGAACTAAAGGAGAAGATTCAGCCAGA  1628

Query 1629  AATCTTAGAGCTGATCAAACAGCAACGCCTGAACCGCCTTGTGGAAGGGACCTGCTTTAGGAAACTCAATGCCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AATCTTAGAGCTGATCAAACAGCAACGCCTGAACCGCCTTGTGGAAGGGACCTGCTTTAGGAAACTCAATGCCC  1702

Query 1703  GGCGGAGGCAAGACAAGTTTTGGTATTGTCGGCTTTCGCCAAATCACAAAGTCCTGCATTACGGAGACTTAGAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GGCGGAGGCAAGACAAGTTTTGGTATTGTCGGCTTTCGCCAAATCACAAAGTCCTGCATTACGGAGACTTAGAA  1776

Query 1777  GAGAGTCCTCAGGGAGAAGTGCCCCACGATTCCTTGCAGGACAAACTGCCGGTGGCAGATATCAAAGCCGTGGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GAGAGTCCTCAGGGAGAAGTGCCCCACGATTCCTTGCAGGACAAACTGCCGGTGGCAGATATCAAAGCCGTGGT  1850

Query 1851  GACGGGAAAGGACTGCCCTCATATGAAAGAGAAAGGTGCCCTTAAACAAAACAAGGAGGTGCTTGAACTCGCTT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GACGGGAAAGGACTGCCCTCATATGAAAGAGAAAGGTGCCCTTAAACAAAACAAGGAGGTGCTTGAACTCGCTT  1924

Query 1925  TCTCCATCTTGTATGACTCAAACTGCCAACTGAACTTCATCGCTCCTGACAAGCATGAGTACTGTATCTGGACG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TCTCCATCTTGTATGACTCAAACTGCCAACTGAACTTCATCGCTCCTGACAAGCATGAGTACTGTATCTGGACG  1998

Query 1999  GATGGACTGAATGCGCTACTCGGGAAGGACATGATGAGCGACCTGACGCGGAATGACCTGGACACCCTGCTCAG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GATGGACTGAATGCGCTACTCGGGAAGGACATGATGAGCGACCTGACGCGGAATGACCTGGACACCCTGCTCAG  2072

Query 2073  CATGGAAATCAAGCTCCGCCTCCTGGACCTGGAAAACATCCAGATCCCTGACGCACCTCCGCCGATTCCCAAGG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CATGGAAATCAAGCTCCGCCTCCTGGACCTGGAAAACATCCAGATCCCTGACGCACCTCCGCCGATTCCCAAGG  2146

Query 2147  AGCCCAGCAACTATGACTTCGTCTATGACTGTAAC  2181
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGCCCAGCAACTATGACTTCGTCTATGACTGTAAC  2181