Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467859
• Subject: XM_005269059.5
• Aligned Length: 1349
• Identities: 1215
• Gaps: 133

Alignment

Query    1  ATGCTGCTATCCGTGACTTCCAGGCCCGGGATTTCGACTTTTGGCTACAATAGAAACAACAAGAAGCCATATGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGCTATCCGTGACTTCCAGGCCCGGGATTTCGACTTTTGGCTACAATAGAAACAACAAGAAGCCATATGT  74

Query   75  GTCACTGGCTCAGCAGATGGCACCACCTAGCCCAAGCAACAGTACACCTAACAGCAGTAGTGGAAGCAATGGAA  148
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTCATTGGCTCAGCAGATGGCACCACCTAGCCCAAGCAACAGTACACCTAACAGCAGTAGTGGAAGCAATGGAA  148

Query  149  ATGACCAGCTGAGCAAAACCAACCTATACATCCGAGGATTGCAACCAGGCACTACTGACCAAGATCTTGTCAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGACCAGCTGAGCAAAACCAACCTATACATCCGAGGATTGCAACCAGGCACTACTGACCAAGATCTTGTCAAG  222

Query  223  CTGTGTCAGCCATATGGCAAGATTGTTTCCACTAAGGCCATACTGGACAAGACCACAAACAAATGTAAAGGCTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGTGTCAGCCATATGGCAAGATTGTTTCCACTAAGGCCATACTGGACAAGACCACAAACAAATGTAAAGGCTA  296

Query  297  TGGCTTTGTAGATTTTGACAGCCCTTCAGCAGCACAGAAAGCTGTAACAGCACTGAAGGCCAGCGGTGTACAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGCTTTGTAGATTTTGACAGCCCTTCAGCAGCACAGAAAGCTGTAACAGCACTGAAGGCCAGCGGTGTACAGG  370

Query  371  CACAGATGGCAAAGCAACAGGAACAGGACCCCACAAATTTATACATCTCAAACCTCCCACTGTCAATGGATGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CACAGATGGCAAAGCAACAGGAACAGGACCCCACAAATTTATACATCTCAAACCTCCCACTGTCAATGGATGAG  444

Query  445  CAGGAACTGGAGGGGATGCTGAAGCCCTTTGGCCAGGTTATCTCCACCCGTATCCTTCGAGATACCAGTGGGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGGAACTGGAGGGGATGCTGAAGCCCTTTGGCCAGGTTATCTCCACCCGTATCCTTCGAGATACCAGTGGGAC  518

Query  519  CAGCAGAGGTGTTGGCTTTGCAAGGATGGAGTCCACAGAGAAGTGTGAAGCCATCATCACCCACTTTAATGGAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGCAGAGGTGTTGGCTTTGCAAGGATGGAGTCCACAGAGAAGTGTGAAGCCATCATCACCCACTTTAATGGAA  592

Query  593  AATATATTAAGACACCCCCTGGAGTACCAGCCCCATCCGATCCCTTGCTTTGCAAATTTGCTGATGGCGGGCCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AATATATTAAGACACCCCCTGGAGTACCAGCCCCATCCGATCCCTTGCTTTGCAAATTTGCTGATGGCGGGCCA  666

Query  667  AAGAAACGACAGAACCAAGGAAAATTTGTGCAAAATGGACGGGCTTGGCCAAGGAATGCAGACATGGGCGTCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGAAACGACAGAACCAAGGAAAATTTGTGCAAAATGGACGGGCTTGGCCAAGGAATGCAGACATGGGCGTCAT  740

Query  741  GGCCTTGACCTATGACCCCACCACAGCTCTTCAGAATGGGTTTTACCCAGCCCCCTATAACATCACCCCCAACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCCTTGACCTATGACCCCACCACAGCTCTTCAGAATGGGTTTTACCCAGCCCCCTATAACATCACCCCCAACA  814

Query  815  GGATGCTTGCTCAGTCTGCACTCTCCCCATACCTTTCCTCTCCTGTGTCTTCGTATCAGAGAGTGACTCAGACA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGATGCTTGCTCAGTCTGCACTCTCCCCATACCTTTCCTCTCCTGTGTCTTCGTATCAGAGAGTGACTCAGACA  888

Query  889  TCTCCTCTACAAGTACCTAACCCATCCTGGATGCACCACCATTCATACCTCATGCAGCCTTCAGGTTCAGTTCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCTCCTCTACAAGTACCTAACCCATCCTGGATGCACCACCATTCATACCTCATGCAGCCTTCAGGTTCAGTTCT  962

Query  963  GACACCAGGGATGGACCATCCCATTTCTCTCCAGCCTGCCTCCATGATGGGACCCCTTACCCAGCAACTGGGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GACACCAGGGATGGACCATCCCATTTCTCTCCAGCCTGCCTCCATGATGGGACCCCTTACCCAGCAACTGGGCC  1036

Query 1037  ATCTCTCCCTCAGCAGCACAGGCACGTATATGCCGACGGCTGCAGCTATGCAAGGAGCTTACATCTCCCAGTAC  1110
            ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATCTCTCCCTCAGCAGCACA-----GTATATGCCGACGGCTGCAGCTATGCAAGGAGCTTACATCTCCCAGTAC  1105

Query 1111  ACCCCTGTGCCTTCTTCCAGTGTTTCAGTCGAGGAGAGCAGCGGCCAACAGAACCAAGTGGCAGTGGACGCACC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106  ACCCCTGTGCCTTCTTCCAGTGTTTCAGTCGAGGAGAGCAGCGGCCAACAGAACCAAGTGGCAGTGGACGCACC  1179

Query 1185  CTCAGAGCATGGGGTCTATTCTTTCCAGTTCAACAAG-------------------------------------  1221
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                     
Sbjct 1180  CTCAGAGCATGGGGTCTATTCTTTCCAGTTCAACAAGTAACAGTGGGATTCCCCTCCCCATCTTTACTGAATAG  1253

Query 1222  --------------------------------------------------------------------------  1221
                                                                                      
Sbjct 1254  AAATGAATTCTTGGAGATACTCATGCTCCCAGATTCCAGAGGGTTAACCAGGAATGGAGACCATCCGTCGGCCC  1327

Query 1222  -----------------  1221
                             
Sbjct 1328  TGCTAAGGACTAACACT  1344