Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467869
• Subject: NM_002069.6
• Aligned Length: 1063
• Identities: 861
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGGGCTGCACGTTGAGCGCCGAAGACAAGGCGGCAGTGGAGCGAAGCAAGATGATCGACCGCAACTTACGGGA  74
            ||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.|.||.||
Sbjct    1  ATGGGCTGCACGCTGAGCGCCGAGGACAAGGCGGCGGTGGAGCGGAGTAAGATGATCGACCGCAACCTCCGTGA  74

Query   75  GGACGGGGAAAAAGCGGCCAAAGAAGTGAAGCTGCTGCTACTCGGTGCTGGAGAATCTGGTAAAAGCACCATTG  148
            ||||||.||.||.|||||....||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct   75  GGACGGCGAGAAGGCGGCGCGCGAGGTCAAGCTGCTGCTGCTCGGTGCTGGTGAATCTGGTAAAAGTACAATTG  148

Query  149  TGAAACAGATGAAAATCATTCATGAGGATGGCTATTCAGAGGATGAATGTAAACAATATAAAGTAGTTGTCTAC  222
            ||||.|||||||||||.||.|||||.|.|||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||.|||.||||||
Sbjct  149  TGAAGCAGATGAAAATTATCCATGAAGCTGGTTATTCAGAAGAGGAGTGTAAACAATACAAAGCAGTGGTCTAC  222

Query  223  AGCAATACTATACAGTCCATCATTGCAATCATAAGAGCCATGGGACGGCTAAAGATTGACTTTGGGGAAGCTGC  296
            ||.||.||.||.|||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||..||.|.|||||.||||||||.||..|.||
Sbjct  223  AGTAACACCATCCAGTCAATTATTGCTATCATTAGGGCTATGGGGAGGTTGAAGATAGACTTTGGTGACTCAGC  296

Query  297  CAGGGCAGATGATGCCCGGCAATTATTTGTTTTAGCTGGCAG-TGCTGAAGAAGGAGTCATGACTCCAGAACTA  369
            |.||||.||||||||.||.|||.|.|||||..||||||| || ||||||||||||..|.||||||.|||||||.
Sbjct  297  CCGGGCGGATGATGCACGCCAACTCTTTGTGCTAGCTGG-AGCTGCTGAAGAAGGCTTTATGACTGCAGAACTT  369

Query  370  GCAGGAGTGATTAAACGGTTATGGCGAGATGGTGGGGTACAAGCTTGCTTCAGCAGATCCAGGGAATATCAGCT  443
            ||.|||||.||.||..|.||.|||..||||.||||.||||||||.||.||||.|||||||.|.||.||.|||||
Sbjct  370  GCTGGAGTTATAAAGAGATTGTGGAAAGATAGTGGTGTACAAGCCTGTTTCAACAGATCCCGAGAGTACCAGCT  443

Query  444  CAATGATTCTGCTTCATATTATCTAAATGATCTGGATAGAATATCCCAGTCTAACTACATTCCAACTCAGCAAG  517
            .|||||||||||..||||.|||.|.|||||..||||.||||||.|.||..|.||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct  444  TAATGATTCTGCAGCATACTATTTGAATGACTTGGACAGAATAGCTCAACCAAATTACATCCCGACTCAACAAG  517

Query  518  ATGTTCTTCGGACGAGAGTGAAGACCACAGGCATTGTAGAAACACATTTCACCTTCAAAGACCTATACTTCAAG  591
            |||||||..|.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.||..|.||.||.
Sbjct  518  ATGTTCTCAGAACTAGAGTGAAAACTACAGGAATTGTTGAAACCCATTTTACTTTCAAAGATCTTCATTTTAAA  591

Query  592  ATGTTTGATGTAGGTGGCCAAAGATCAGAACGAAAAAAGTGGATTCACTGTTTTGAGGGAGTGACAGCAATTAT  665
            |||||||||||.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||.||
Sbjct  592  ATGTTTGATGTGGGAGGTCAGAGATCTGAGCGGAAGAAGTGGATTCATTGCTTCGAAGGAGTGACGGCGATCAT  665

Query  666  CTTCTGTGTGGCCCTCAGTGATTATGACCTTGTTCTGGCTGAGGACGAGGAGATGAACCGAATGCATGAAAGCA  739
            |||||||||.||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  CTTCTGTGTAGCACTGAGTGACTACGACCTGGTTCTAGCTGAAGATGAAGAAATGAACCGAATGCATGAAAGCA  739

Query  740  TGAAACTGTTTGACAGCATTTGTAATAACAAATGGTTTACAGAAACTTCAATCATTCTCTTCCTTAACAAGAAA  813
            |||||.|||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||.||.||||||||.
Sbjct  740  TGAAATTGTTTGACAGCATATGTAACAACAAGTGGTTTACAGATACATCCATTATACTTTTTCTAAACAAGAAG  813

Query  814  GACCTTTTTGAGGAAAAAATAAAGAGGAGTCCGTTAACTATCTGTTATCCAGAATACACAGGTTCCAATACATA  887
            ||.||.|||||.||||||||.||.|.|||.||..|.|||||.||.|||||||||||..||||.||.||.|||||
Sbjct  814  GATCTCTTTGAAGAAAAAATCAAAAAGAGCCCTCTCACTATATGCTATCCAGAATATGCAGGATCAAACACATA  887

Query  888  TGAAGAGGCAGCTGCCTATATTCAATGCCAGTTTGAAGATCTGAACAGAAGAAAAGATACCAAGGAGATCTATA  961
            |||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|.||||||.||.||.|||||.||.||.|
Sbjct  888  TGAAGAGGCAGCTGCATATATTCAATGTCAGTTTGAAGACCTCAATAAAAGAAAGGACACAAAGGAAATATACA  961

Query  962  CTCACTTCACCTGTGCCACAGACACGAAGAATGTGCAGTTTGTTTTTGATGCTGTTACAGATGTCATCATTAAA  1035
            |.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  962  CCCACTTCACATGTGCCACAGATACTAAGAATGTGCAGTTTGTTTTTGATGCTGTAACAGATGTCATCATAAAA  1035

Query 1036  AACAACTTAAAGGAATGTGGACTTTAT  1062
            ||.||..||||.||.|||||.||.|.|
Sbjct 1036  AATAATCTAAAAGATTGTGGTCTCTTT  1062