Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467903
• Subject: XM_017009685.2
• Aligned Length: 2369
• Identities: 1964
• Gaps: 391

Alignment

Query    1  ATGTCGGGGGTCCGGGGCCTGTCGCGGCTGCTGAGCGCTCGGCGCCTGGCGCTGGCCAAGGCGTGGCCAACAGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGGGGGTCCGGGGCCTGTCGCGGCTGCTGAGCGCTCGGCGCCTGGCGCTGGCCAAGGCGTGGCCAACAGT  74

Query   75  GTTGCAAACAGGAACCCGAGGTTTTCACTTCACTGTTGATGGGAACAAGAGGGCATCTGCTAAAGTTTCAGATT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTTGCAAACAGGAACCCGAGGTTTTCACTTCACTGTTGATGGGAACAAGAGGGCATCTGCTAAAGTTTCAGATT  148

Query  149  CCATTTCTGCTCAGTATCCAGTAGTGGATCATGAATTTGATGCAGTGGTGGTAGGCGCTGGAGGGGCAGGCTTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATTTCTGCTCAGTATCCAGTAGTGGATCATGAATTTGATGCAGTGGTGGTAGGCGCTGGAGGGGCAGGCTTG  222

Query  223  CGAGCTGCATTTGGCCTTTCTGAGGCAGGGTTTAATACAGCATGTGTTACCAAGCTGTTTCCTACCAGGTCACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGAGCTGCATTTGGCCTTTCTGAGGCAGGGTTTAATACAGCATGTGTTACCAAGCTGTTTCCTACCAGGTCACA  296

Query  297  CACTGTTGCAGCACAGGGAGGAATCAATGCTGCTCTGGGGAACATGGAGGAGGACAACTGGAGGTGGCATTTCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACTGTTGCAGCACAGGGAGGAATCAATGCTGCTCTGGGGAACATGGAGGAGGACAACTGGAGGTGGCATTTCT  370

Query  371  ACGACACCGTGAAGGGCTCCGACTGGCTGGGGGACCAGGATGCCATCCACTACATGACGGAGCAGGCCCCCGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACGACACCGTGAAGGGCTCCGACTGGCTGGGGGACCAGGATGCCATCCACTACATGACGGAGCAGGCCCCCGCC  444

Query  445  GCCGTGGTCGAGCTAGAAAATTATGGCATGCCGTTTAGCAGAACTGAAGATGGGAAGATTTATCAGCGTGCATT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCGTGGTCGAGCTAGAAAATTATGGCATGCCGTTTAGCAGAACTGAAGATGGGAAGATTTATCAGCGTGCATT  518

Query  519  TGGTGGACAGAGCCTCAAGTTTGGAAAGGGCGGGCAGGCCCATCGGTGCTGCTGTGTGGCTGATCGGACTGGCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGTGGACAGAGCCTCAAGTTTGGAAAGGGCGGGCAGGCCCATCGGTGCTGCTGTGTGGCTGATCGGACTGGCC  592

Query  593  ACTCGCTATTGCACACCTTATATGGAAGGTCTCTGCGATATGATACCAGCTATTTTGTGGAGTATTTTGCCTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTCGCTATTGCACACCTTATATGGAAGGTCTCTGCGATATGATACCAGCTATTTTGTGGAGTATTTTGCCTTG  666

Query  667  GATCTCCTGATGGAGAATGGGGAGTGCCGTGGTGTCATCGCACTGTGCATAGAGGACGGGTCCATCCATCGCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATCTCCTGATGGAGAATGGGGAGTGCCGTGGTGTCATCGCACTGTGCATAGAGGACGGGTCCATCCATCGCAT  740

Query  741  AAGAGCAAAGAACACTGTTGTTGCCACAGGAGGCTACGGGCGCACCTACTTCAGCTGCACGTCTGCCCACACCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAGAGCAAAGAACACTGTTGTTGCCACAGGAGGCTACGGGCGCACCTACTTCAGCTGCACGTCTGCCCACACCA  814

Query  815  GCACTGGCGACGGCACGGCCATGATCACCAGGGCAGGCCTTCCTTGCCAGGACCTAGAGTTTGTTCAGTTCCAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCACTGGCGACGGCACGGCCATGATCACCAGGGCAGGCCTTCCTTGCCAGGACCTAGAGTTTGTTCAGTTCCAC  888

Query  889  CCCACAGGCATATATGGTGCTGGTTGTCTCATTACGGAAGGATGTCGTGGAGAGGGAGGCATTCTCATTAACAG  962
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTACAGGCATATATGGTGCTGGTTGTCTCATTACGGAAGGATGTCGTGGAGAGGGAGGCATTCTCATTAACAG  962

Query  963  TCAAGGCGAAAGGTTTATGGAGCGATACGCCCCTGTCGCGAAGGACCTGGCGTCTAGAGATGTGGTGTCTCGGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCAAGGCGAAAGGTTTATGGAGCGATACGCCCCTGTCGCGAAGGACCTGGCGTCTAGAGATGTGGTGTCTCGGT  1036

Query 1037  CCATGACTCTGGAGATCCGAGAAGGAAGAGGCTGTGGCCCTGAGAAAGATCACGTCTACCTGCAGCTGCACCAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCATGACTCTGGAGATCCGAGAAGGAAGAGGCTGTGGCCCTGAGAAAGATCACGTCTACCTGCAGCTGCACCAC  1110

Query 1111  CTACCTCCAGAGCAGCTGGCCACGCGCCTGCCTGGCATTTCAGAGACAGCCATGATCTTCGCTGGCGTGGACGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTACCTCCAGAGCAGCTGGCCACGCGCCTGCCTGGCATTTCAGAGACAGCCATGATCTTCGCTGGCGTGGACGT  1184

Query 1185  CACGAAGGAGCCGATCCCTGTCCTCCCCACCGTGCATTATAACATGGGCGGCATTCCCACCAACTACAAGGGGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CACGAAGGAGCCGATCCCTGTCCTCCCCACCGTGCATTATAACATGGGCGGCATTCCCACCAACTACAAGGGGC  1258

Query 1259  AGGTCCTGAGGCACGTGAATGGCCAGGATCAGATTGTGCCCGGCCTGTACGCCTGTGGGGAGGCCGCCTGTGCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGTCCTGAGGCACGTGAATGGCCAGGATCAGATTGTGCCCGGCCTGTACGCCTGTGGGGAGGCCGCCTGTGCC  1332

Query 1333  TCGGTACATGGTGCCAACCGCCTCGGGGCAAACTCGCTCTTGGACCTGGTTGTCTTTGGTCGGGCATGTGCCCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCGGTACATGGTGCCAACCGCCTCGGGGCAAACTCGCTCTTGGACCTGGTTGTCTTTGGTCGGGCATGTGCCCT  1406

Query 1407  GAGCATCGAAGAGTCATGCAGGCCTGGAGATAAAGTCCCTCCAATTAAACCAAACGCTGGGGAAGAATCTGTCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAGCATCGAAGAGTCATGCAGGCCTGGAGATAAAGTCCCTCCAATTAAACCAAACGCTGGGGAAGAATCTGTCA  1480

Query 1481  TGAATCTTGACAAATTGAGATTTGCTGATGGAAGCATAAGAACATCGGAACTGCGACTCAGCATGCAGAAGTCA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGAATCTTGACAAATTGAGATTTGCTGATGGAAGCATAAGAACATCGGAACTGCGACTCAGCATGCAGAAGTCA  1554

Query 1555  ATGCAAAATCATGCTGCCGTGTTCCGTGTGGGAAGCGTGTTGCAAGAAGGTTGTGGGAAAATCAGCAAGCTCTA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATGCAAAATCATGCTGCCGTGTTCCGTGTGGGAAGCGTGTTGCAAGAAGGTTGTGGGAAAATCAGCAAGCTCTA  1628

Query 1629  TGGAGACCTAAAGCACCTGAAGACGTTCGACCGGGGAATGGTCTGGAACACGGACCTGGTGGAGACCCTGGAGC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGGAGACCTAAAGCACCTGAAGACGTTCGACCGGGGAATGGTCTGGAACACGGACCTGGTGGAGACCCTGGAGC  1702

Query 1703  TGCAGAACCTGATGCTGTGTGCGCTGCAGACCATCTACGGAGCAGAGGCACGGAAGGAGTCACGGGGCGCGCAT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGCAGAACCTGATGCTGTGTGCGCTGCAGACCATCTACGGAGCAGAGGCACGGAAGGAGTCACGGGGCGCGCAT  1776

Query 1777  GCCAGGGAAGACTACAAGGTGCGGATTGATGAGTACGATTACTCCAAGCCCATCCAGGGGCAACAGAAGAAGCC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCCAGGGAAGACTACAAGGTGCGGATTGATGAGTACGATTACTCCAAGCCCATCCAGGGGCAACAGAAGAAGCC  1850

Query 1851  CTTTGAGGAGCACTGGAGGAAGCACACCCTGTCCTATGTGGACGTTGGCACTGGGAAGGTCACTCTGGA-----  1919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||     
Sbjct 1851  CTTTGAGGAGCACTGGAGGAAGCACACCCTGTCCTATGTGGACGTTGGCACTGGGAAGGTCAGTGTGGAGCTCG  1924

Query 1920  ----------------------ATATAGACCCG------------------------TGATCGACAAAACTTTG  1947
                                  |.|..|.||||                        ||||.|         ||
Sbjct 1925  TTCTCACCACAGCCCAGCACCCACACGGCCCCGCCCAGGCCTGCGGGCTGGCCTTGCTGATGG---------TG  1989

Query 1948  AACGAGGCTGA-CTGTGCCACCG------------TCCCGCCAGCCATTCG--------------------CTC  1988
            ||||.||..|| |.| ||||  |            |||||.|||  |||||                    |||
Sbjct 1990  AACGGGGAAGAGCAG-GCCA--GATTTAAATCAACTCCCGACAG--ATTCGAGGCACCGCTGAAAAAGGCACTC  2058

Query 1989  CTAC----------------------------------------------------------------------  1992
            |.||                                                                      
Sbjct 2059  CGACAGCAGTCGGGCTTCGGGCTGGAAACAGAATCCAGTTCCTGCAGGTGGTTCAGAGGAGCCTTAAGGAAGGG  2132

Query 1993  --------------------------------------------------------------------------  1992
                                                                                      
Sbjct 2133  TTGCTCCGTGGTGTGCGCCAGATGGACGTCACTGGGCAGGAGCAAGTGTCCAAGGCCTGGTGGTAGGGGAGGAG  2206

Query 1993  --------------------------------------------------------------------------  1992
                                                                                      
Sbjct 2207  ATGATGATTGTGGACCTAGCGAGAAAGCATCTGTGGGGTGGGGACACACAGCCATTACCAGAAACCAGTCCCAC  2280

Query 1993  --------------------------------------------------------------------------  1992
                                                                                      
Sbjct 2281  GTTAAGGGAGCCCAGAAGAGACACCTCCCCTCTCCTCCCACGGGCTGGGCCAACTGGAAGCGTCTGCAGGGGAG  2354

Query 1993  -  1992
             
Sbjct 2355  C  2355