Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467973
- Subject:
- NM_001144030.2
- Aligned Length:
- 3075
- Identities:
- 2857
- Gaps:
- 216
Alignment
Query 1 ATGCATCGGAAAAAGGTGGATAACCGAATCCGGATTCTCATTGAGAATGGAGTAGCTGAGCGGCAAAGATCTCT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTTTGTTGTAGTTGGGGATCGAGGAAAAGATCAGGTGGTAATACTTCATCACATGTTATCCAAAGCAACTGTGA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGGCTCGGCCTTCAGTGCTGTGGTGTTATAAGAAAGAGCTGGGGTTTAGCAGTCACCGGAAGAAAAGAATGCGA 222
||||||
Sbjct 1 --------------------------------------------------------------------ATGCGA 6
Query 223 CAGCTGCAGAAGAAAATAAAGAATGGAACACTGAACATAAAGCAGGACGACCCCTTTGAACTCTTCATAGCAGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7 CAGCTGCAGAAGAAAATAAAGAATGGAACACTGAACATAAAGCAGGACGACCCCTTTGAACTCTTCATAGCAGC 80
Query 297 CACAAACATTCGCTACTGCTACTACAACGAGACCCACAAGATCCTGGGCAATACCTTCGGCATGTGTGTGCTGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 81 CACAAACATTCGCTACTGCTACTACAACGAGACCCACAAGATCCTGGGCAATACCTTCGGCATGTGTGTGCTGC 154
Query 371 AGGATTTTGAAGCCTTAACTCCAAACTTGCTGGCCAGGACTGTAGAAACAGTGGAAGGTGGTGGGCTAGTGGTC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 155 AGGATTTTGAAGCCTTAACTCCAAACTTGCTGGCCAGGACTGTAGAAACAGTGGAAGGTGGTGGGCTAGTGGTC 228
Query 445 ATCCTCCTACGGACCATGAACTCACTCAAGCAATTGTACACAGTGACTATGGATGTGCATTCCAGGTACAGAAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 229 ATCCTCCTACGGACCATGAACTCACTCAAGCAATTGTACACAGTGACTATGGATGTGCATTCCAGGTACAGAAC 302
Query 519 TGAGGCCCATCAGGATGTGGTGGGAAGATTTAATGAAAGGTTTATTCTGTCTCTGGCCTCTTGTAAGAAGTGTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 303 TGAGGCCCATCAGGATGTGGTGGGAAGATTTAATGAAAGGTTTATTCTGTCTCTGGCCTCTTGTAAGAAGTGTC 376
Query 593 TCGTCATTGATGACCAGCTCAACATCCTGCCCATCTCCTCCCACGTTGCCACCATGGAGGCCCTGCCTCCCCAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 377 TCGTCATTGATGACCAGCTCAACATCCTGCCCATCTCCTCCCACGTTGCCACCATGGAGGCCCTGCCTCCCCAG 450
Query 667 ACTCCGGATGAGAGTCTTGGTCCTTCTGATCTGGAGCTGAGGGAGTTGAAGGAGAGCTTGCAGGACACCCAGCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 451 ACTCCGGATGAGAGTCTTGGTCCTTCTGATCTGGAGCTGAGGGAGTTGAAGGAGAGCTTGCAGGACACCCAGCC 524
Query 741 TGTGGGTGTGTTGGTGGACTGCTGTAAGACTCTAGACCAGGCCAAAGCTGTCTTGAAATTTATCGAGGGCATCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 525 TGTGGGTGTGTTGGTGGACTGCTGTAAGACTCTAGACCAGGCCAAAGCTGTCTTGAAATTTATCGAGGGCATCT 598
Query 815 CTGAAAAGACCCTGAGGAGTACTGTTGCACTCACAGCTGCTCGAGGACGGGGAAAATCTGCAGCCCTGGGATTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 CTGAAAAGACCCTGAGGAGTACTGTTGCACTCACAGCTGCTCGAGGACGGGGAAAATCTGCAGCCCTGGGATTG 672
Query 889 GCGATTGCTGGGGCGGTGGCATTTGGGTACTCCAATATCTTTGTTACCTCCCCAAGCCCTGATAACCTCCATAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 673 GCGATTGCTGGGGCGGTGGCATTTGGGTACTCCAATATCTTTGTTACCTCCCCAAGCCCTGATAACCTCCATAC 746
Query 963 TCTGTTTGAATTTGTATTTAAAGGATTTGATGCTCTGCAATATCAGGAACATCTGGATTATGAGATTATCCAGT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 747 TCTGTTTGAATTTGTATTTAAAGGATTTGATGCTCTGCAATATCAGGAACATCTGGATTATGAGATTATCCAGT 820
Query 1037 CTCTAAATCCTGAATTTAACAAAGCAGTGATCAGAGTGAATGTATTTCGAGAACACAGGCAGACTATTCAGTAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 CTCTAAATCCTGAATTTAACAAAGCAGTGATCAGAGTGAATGTATTTCGAGAACACAGGCAGACTATTCAGTAT 894
Query 1111 ATACATCCTGCAGATGCTGTGAAGCTGGGCCAGGCTGAACTAGTTGTGATTGATGAAGCTGCCGCCATCCCCCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 ATACATCCTGCAGATGCTGTGAAGCTGGGCCAGGCTGAACTAGTTGTGATTGATGAAGCTGCCGCCATCCCCCT 968
Query 1185 CCCCTTGGTGAAGAGCCTACTTGGCCCCTACCTTGTTTTCATGGCATCCACCATCAATGGCTATGAGGGCACTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 969 CCCCTTGGTGAAGAGCCTACTTGGCCCCTACCTTGTTTTCATGGCATCCACCATCAATGGCTATGAGGGCACTG 1042
Query 1259 GCCGGTCACTGTCCCTCAAGCTAATTCAGCAGCTCCGTCAACAGAGCGCCCAGAGCCAGGTCAGCACCACTGCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1043 GCCGGTCACTGTCCCTCAAGCTAATTCAGCAGCTCCGTCAACAGAGCGCCCAGAGCCAGGTCAGCACCACTGCT 1116
Query 1333 GAGAATAAGACCACGACGACAGCCAGATTGGCATCAGCGCGGACACTGCATGAGGTTTCCCTCCAGGAGTCAAT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1117 GAGAATAAGACCACGACGACAGCCAGATTGGCATCAGCGCGGACACTGTATGAGGTTTCCCTCCAGGAGTCAAT 1190
Query 1407 CCGATACGCCCCTGGGGATGCAGTGGAGAAGTGGCTGAATGACTTGCTGTGCCTGGATTGCCTCAACATCACTC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191 CCGATACGCCCCTGGGGATGCAGTGGAGAAGTGGCTGAATGACTTGCTGTGCCTGGATTGCCTCAACATCACTC 1264
Query 1481 GGATAGTCTCAGGCTGCCCCTTGCCTGAAGCTTGTGAACTGTACTATGTTAATAGAGATACCCTCTTTTGCTAC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1265 GGATAGTCTCAGGCTGCCCCTTGCCTGAAGCTTGTGAACTGTACTATGTTAATAGAGATACCCTCTTTTGCTAC 1338
Query 1555 CACAAGGCCTCTGAAGTTTTCCTCCAACGGCTTATGGCCCTCTACGTGGCTTCTCACTACAAGAACTCTCCCAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1339 CACAAGGCCTCTGAAGTTTTCCTCCAACGGCTTATGGCCCTCTACGTGGCTTCTCACTACAAGAACTCTCCCAA 1412
Query 1629 TGATCTCCAGATGCTCTCCGATGCACCTGCTCACCATCTCTTCTGCCTTCTGCCTCCTGTGCCCCCCACCCAGA 1702
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1413 TGATCTCCAGATGCTCTCCGATGCACCTGCTCACCATCTCTTCTGCCTTCTGCCTCCCGTGCCCCCCACCCAGA 1486
Query 1703 ATGCCCTTCCAGAAGTGCTTGCTGTTATCCAGGTGTGCCTTGAAGGGGAGATTTCTCGCCAGTCCATCTTGAAC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1487 ATGCCCTTCCAGAAGTGCTTGCTGTTATCCAGGTGTGCCTTGAAGGGGAGATTTCTCGCCAGTCCATCTTGAAC 1560
Query 1777 AGTCTGTCTCGAGGCAAGAAGGCTTCAGGGGACCTGATTCCATGGACAGTGTCAGAACAGTTCCAAGATCCAGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 AGTCTGTCTCGAGGCAAGAAGGCTTCAGGGGACCTGATTCCATGGACAGTGTCAGAACAGTTCCAAGATCCAGA 1634
Query 1851 CTTTGGTGGTCTGTCTGGTGGAAGGGTCGTTCGCATTGCTGTTCACCCAGATTATCAAGGGATGGGCTATGGCA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1635 CTTTGGTGGTCTGTCTGGTGGAAGGGTCGTTCGCATTGCTGTTCACCCAGATTATCAAGGGATGGGCTATGGCA 1708
Query 1925 GCCGTGCTCTGCAGCTGCTGCAGATGTACTATGAAGGCAGGTTTCCTTGTCTGGAGGAAAAGGTCCTTGAGACA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1709 GCCGTGCTCTGCAGCTGCTGCAGATGTACTATGAAGGCAGGTTTCCTTGTCTGGAGGAAAAGGTCCTTGAGACA 1782
Query 1999 CCACAGGAAATTCACACCGTAAGCAGCGAGGCTGTCAGCTTGTTGGAAGAGGTCATCACTCCCCGGAAGGACCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1783 CCACAGGAAATTCACACCGTAAGCAGCGAGGCTGTCAGCTTGTTGGAAGAGGTCATCACTCCCCGGAAGGACCT 1856
Query 2073 GCCTCCTTTACTCCTCAAATTGAATGAGAGGCCTGCCGAACGCCTGGATTACCTGGGTGTTTCCTATGGCTTGA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1857 GCCTCCTTTACTCCTCAAATTGAATGAGAGGCCTGCCGAACGCCTGGATTACCTGGGTGTTTCCTATGGCTTGA 1930
Query 2147 CCCCCAGGCTCCTCAAGTTCTGGAAACGAGCTGGATTTGTTCCTGTTTATCTGAGACAGACCCCGAATGACCTG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1931 CCCCCAGGCTCCTCAAGTTCTGGAAACGAGCTGGATTTGTTCCTGTTTATCTGAGACAGACCCCGAATGACCTG 2004
Query 2221 ACCGGAGAGCACTCGTGCATCATGCTGAAGACGCTCACTGATGAGGATGAGGCTGACCAGGGAGGCTGGCTTGC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2005 ACCGGAGAGCACTCGTGCATCATGCTGAAGACGCTCACTGATGAGGATGAGGCTGACCAGGGAGGCTGGCTTGC 2078
Query 2295 AGCCTTCTGGAAAGATTTCCGACGGCGGTTCCTAGCCTTGCTCTCCTACCAGTTCAGTACCTTCTCTCCTTCCC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2079 AGCCTTCTGGAAAGATTTCCGACGGCGGTTCCTAGCCTTGCTCTCCTACCAGTTCAGTACCTTCTCTCCTTCCC 2152
Query 2369 TGGCTCTGAACATCATTCAGAACAGGAACATGGGGAAGCCAGCCCAGCCTGCCCTGAGCCGGGAGGAGCTGGAA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2153 TGGCTCTGAACATCATTCAGAACAGGAACATGGGGAAGCCAGCCCAGCCTGCCCTGAGCCGGGAGGAGCTGGAA 2226
Query 2443 GCACTCTTCCTCCCCTATGACCTGAAGCGGCTGGAGATGTATTCACGGAATATGGTGGACTATCACCTCATCAT 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2227 GCACTCTTCCTCCCCTATGACCTGAAGCGGCTGGAGATGTATTCACGGAATATGGTGGACTATCACCTCATCAT 2300
Query 2517 GGACATGATCCCGGCCATCTCTCGCATCTATTTCCTGAACCAGCTGGGGGACCTGGCCCTGTCTGCGGCTCAGT 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2301 GGACATGATCCCGGCCATCTCTCGCATCTATTTCCTGAACCAGCTGGGGGACCTGGCCCTGTCTGCGGCTCAGT 2374
Query 2591 CGGCTCTTCTCTTGGGGATTGGCCTGCAGCATAAGTCTGTGGACCAGCTGGAAAAGGAGATTGAGCTGCCCTCG 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2375 CGGCTCTTCTCTTGGGGATTGGCCTGCAGCATAAGTCTGTGGACCAGCTGGAAAAGGAGATTGAGCTGCCCTCG 2448
Query 2665 GGCCAGTTGATGGGACTTTTCAACCGGATCATCCGCAAAGTTGTGAAGCTATTTAATGAAGTTCAGGAAAAGGC 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2449 GGCCAGTTGATGGGACTTTTCAACCGGATCATCCGCAAAGTTGTGAAGCTATTTAATGAAGTTCAGGAAAAGGC 2522
Query 2739 CATTGAGGAGCAGATGGTGGCAGCGAAGGATGTGGTCATGGAGCCCACGATGAAGACCCTCAGTGACGACCTAG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2523 CATTGAGGAGCAGATGGTGGCAGCGAAGGATGTGGTCATGGAGCCCACGATGAAGACCCTCAGTGACGACCTAG 2596
Query 2813 ATGAAGCAGCAAAGGAATTTCAGGAGAAACACAAGAAGGAAGTAGGGAAGCTGAAGAGCATGGACCTCTCTGAA 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2597 ATGAAGCAGCAAAGGAATTTCAGGAGAAACACAAGAAGGAAGTAGGGAAGCTGAAGAGCATGGACCTCTCTGAA 2670
Query 2887 TACATAATCCGTGGGGACGATGAAGAGTGGAATGAAGTTTTGAACAAAGCTGGGCCGAACGCCTCGATCATCAG 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2671 TACATAATCCGTGGGGACGATGAAGAGTGGAATGAAGTTTTGAACAAAGCTGGGCCGAACGCCTCGATCATCAG 2744
Query 2961 CCTGAAAAGTGACAAGAAAAGGAAGTTAGAGGCCAAACAAGAACCCAAACAGAGCAAGAAGTTGAAGAACAGAG 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2745 CCTGAAAAGTGACAAGAAAAGGAAGTTAGAGGCCAAACAAGAACCCAAACAGAGCAAGAAGTTGAAGAACAGAG 2818
Query 3035 AGACAAAGAACAAAAAAGATATGAAACTGAAGCGGAAGAAA 3075
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2819 AGACAAAGAACAAAAAAGATATGAAACTGAAGCGGAAGAAA 2859