Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468018
• Subject: XM_006500123.3
• Aligned Length: 860
• Identities: 731
• Gaps: 4

Alignment

Query   1  ATGGAGGAAAAAAGACGGCGAGCCCGAGTTCAGGGAGCCTGGGCTGCCCCTGTTAAAAGCCAGGCCATTGCTCA  74
           ||||||||.||.||||.||||||||||||.|||||||.|||||||.|.|||...||.||||||.|...|.||||
Sbjct   1  ATGGAGGACAAGAGACAGCGAGCCCGAGTGCAGGGAGGCTGGGCTACACCTACCAAGAGCCAGTCTGCTACTCA  74

Query  75  GCCAGCTACCACTGCTAAGAGCCATCTCCACCAGA-AGCCTGGCCAGACCTGGAAGAACAAAGAGCATCATCTC  147
           |||||||.||.||||||.|||||.|||...||||| .||..|||||| ||||||.||.|||.||.||.||.|..
Sbjct  75  GCCAGCTTCCCCTGCTAGGAGCCGTCTTTCCCAGACCGCGGGGCCAG-CCTGGAGGAGCAAGGAACAGCAGCAA  147

Query 148  TCTGACAGAGAGTTTGTGTTCAAAGAACCTCAGCAGGTAGTACGTAGAGCTCCTGAGCCACGAGTGATTGACAG  221
           |.||||.||.|.||||||||||||||||||||||.|||.||.|||..|||.||.||.||..|||||||||||||
Sbjct 148  TGTGACCGACAATTTGTGTTCAAAGAACCTCAGCTGGTTGTCCGTGCAGCCCCAGAACCCAGAGTGATTGACAG  221

Query 222  AGAGGGTGTGTATGAAATCAGCCTGTCACCCACAGGTGTATCTAGGGTCTGTTTGTATCCTGGCTTTGTTGACG  295
           .|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||.
Sbjct 222  GGAGGGTGTGTATGAAATCAGCCTGTCACCTACTGGTGTGTCTAGGGTGTGCTTATATCCTGGCTTTGTGGACT  295

Query 296  TGAAAGAAGCTGACTGGATATTGGAACAGCTTTGTCAAGATGTTCCCTGGAAACAGAGGACCGGCATCAGAGAG  369
           ||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.|.|||||.||||||||||||||||..||||||||||||
Sbjct 296  TGAAGGAAGCTGACTGGATCTTGGAGCAGCTTTGTAAGGATGTCCCCTGGAAACAGAGGATGGGCATCAGAGAG  369

Query 370  GATATAACTTATCAGCAACCAAGACTTACAGCATGGTATGGAGAACTTCCTTACACTTATTCAAGAATCACTAT  443
           |||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 370  GATGTAACTTATCCGCAACCAAGACTTACAGCATGGTATGGAGAGCTTCCTTACACTTACTCGAGAATCACTAT  443

Query 444  GGAACCAAATCCTCACTGGCACCCTGTGCTGCGCACACTAAAGAACCGCATTGAAGAGAACACTGGCCACACCT  517
           ||||||||||||||||||||..|||||||||.|.||.||.||||.||||||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 444  GGAACCAAATCCTCACTGGCTTCCTGTGCTGTGGACTCTGAAGAGCCGCATTGAAGAGAACACCAGCCACACCT  517

Query 518  TCAACTCCTTACTCTGCAATCTTTATCGCAATGAGAAGGACAGCGTGGACTGGCACAGTGATGATGAACCCTCA  591
           ||||||||||.||.||.|||.||||.||..|||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.
Sbjct 518  TCAACTCCTTGCTGTGTAATTTTTACCGGGATGAGAAGGACAGTGTGGACTGGCACAGCGACGATGAACCATCC  591

Query 592  CTAGGGAGGTGCCCCATTATTGCTTCACTAAGTTTTGGTGCCACACGCACATTTGAGATGAGAAAGAAGCCACC  665
           ||.|||||.||||||.|.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 592  CTGGGGAGCTGCCCCGTCATTGCTTCCCTCAGTTTTGGTGCCACTCGGACTTTTGAGATGAGGAAGAAGCCCCC  665

Query 666  ACCAGAAGAGAATGGAGAGTACACATATGTGGAAAGAGTGAAGATACCCTTGGATCATGGGACCTTGTTAATCA  739
           |||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 666  ACCTGAAGAAAATGGAGACTATACATATGTGGAGAGAGTGAAGATACCATTGGATCACGGGACCTTGCTAATCA  739

Query 740  TGGAAGGAGCGACACAAGCTGACTGGCAGCATCGAGTGCCCAAAGAATACCACTCTAGAGAACCGAGAGTGAAC  813
           ||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||.||||||||||.|||
Sbjct 740  TGGAAGGAGCCACACAAGCCGACTGGCAGCACCGAGTGCCCAAGGAATACCACTCCAGACAACCGAGAGTAAAC  813

Query 814  CTGACCTTTCGGACAGTCTATCCAGACCCTCGAGGGGCACCCTGG-  858
           .|.|||||||||||.||.|||||||||||..||||.|| ||||.| 
Sbjct 814  TTAACCTTTCGGACCGTTTATCCAGACCCAAGAGGAGC-CCCTCGG  858