Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468031
- Subject:
- NM_001174054.1
- Aligned Length:
- 1587
- Identities:
- 1336
- Gaps:
- 136
Alignment
Query 1 ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT 74
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGTTTCACCGACGAGTACCAGCTATACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT 74
Query 75 CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 75 CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGTACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATTAATACCAAGAAGC 148
Query 149 TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG 222
||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 149 TGTCGGCCAGAGATCACCAGAAACTGGAGAGAGAAGCTCGGATCTGCCGCCTGCTGAAGCATTCCAACATTGTA 222
Query 223 CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT 296
||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CGCCTCCATGACAGCATCTCTGAAGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT 296
Query 297 TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG 370
|||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 297 TGAAGACATCGTGGCAAGAGAGTACTACAGTGAAGCTGATGCCAGTCACTGCATCCAGCAGATCCTGGAAGCTG 370
Query 371 TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 371 TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCTGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAATGC 444
Query 445 AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG 518
|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAAGGCGCCGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTGGCCATCGAGGTTCAGGGAGACCAGCAGGCATGGTTTGG 518
Query 519 TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT 592
.||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 519 ATTTGCGGGAACGCCAGGCTACCTGTCTCCCGAGGTCCTTCGGAAGGAGGCCTACGGCAAACCTGTGGACATCT 592
Query 593 GGGCATGT---------------------------------GGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTAC 633
|||||||| ||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 593 GGGCATGTGGCCATTATGTTTGTCTGCCTGTGCTCATTATAGGGGTGATCCTGTATATCCTGCTGGTGGGCTAC 666
Query 634 CCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTGTACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCC 707
|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 667 CCACCTTTCTGGGATGAGGACCAACACAAGCTGTACCAGCAGATCAAGGCTGGGGCGTATGATTTCCCATCCCC 740
Query 708 TGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAACCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCA 781
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGAGTGGGACACCGTTACTCCTGAAGCCAAAAACCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCA 814
Query 782 TCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGGTCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAG 855
||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 815 TCACGGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCATGGGTCTGCCAACGTTCCACCGTGGCCTCTATGATGCACAGACAG 888
Query 856 GAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCCAGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGC 929
|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 889 GAGACTGTGGAATGTCTGAAGAAGTTCAATGCAAGGAGGAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACTATGCTGGC 962
Query 930 CACACGGAATTTCTCAGCAGCCAAGAGTTTACTCAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCA 1003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 963 CACACGGAATTTCTCAGCAGCCAAGAGTTTACTCAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACAAACAGCA 1036
Query 1004 CCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAAGGGACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAG--------------- 1062
||||||||||..|.|||..|||||||||||||||..|.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1037 CCAAAAACAGCTCGGCCATCACCAGCCCCAAAGGATCTCTCCCTCCTGCTGCCCTGGAGCCTCAAACCACCGTT 1110
Query 1063 ------------------------------TCTTCTGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAA 1106
|||||.|||||..||||.||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1111 ATCCATAACCCAGTGGACGGGATTAAGGAATCTTCCGACAGCACCAACACAACCATAGAGGATGAAGATGCCAA 1184
Query 1107 AGCCCGGAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGGAGCAGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGGTGACTTTGAGGCCT 1180
|||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1185 AGCCCGGAAGCAGGAAATCATCAAGACCACAGAGCAGCTCATTGAGGCCGTCAACAATGGGGACTTTGAGGCCT 1258
Query 1181 ACGCGAAAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCGTTTGAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGGTTGAAGGGATGGAC 1254
|.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1259 ATGCGAAAATCTGTGACCCAGGCCTGACCTCATTTGAGCCTGAAGCTCTGGGCAACCTGGTCGAAGGGATGGAT 1332
Query 1255 TTCCACAGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACGACCATCCTGAACCCACA 1328
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1333 TTCCACAGATTCTACTTTGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACCACCATCCTGAACCCGCA 1406
Query 1329 CGTGCACGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCATCGCTTACATCCGGCTCACGCAGTACATTGACGGGCAGGGCC 1402
|||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||.
Sbjct 1407 CGTGCACGTCATTGGCGAGGATGCGGCATGCATCGCCTACATCCGCCTCACACAGTACATCGATGGCCAGGGCA 1480
Query 1403 GGCCCCGCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGCGTGTGGCCCCGCTGC-------AG------------------ 1451
|.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||.||||.|| ||
Sbjct 1481 GACCCCGTACCAGCCAGTCCGAAGAGACCCGTGTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAATGTACATTTC 1554
Query 1452 --------------------------------- 1451
Sbjct 1555 CACTGCTCGGGCGCTCCAGTGGCCCCGCTGCAG 1587