Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468031
- Subject:
- XM_006514469.2
- Aligned Length:
- 1881
- Identities:
- 1335
- Gaps:
- 430
Alignment
Query 1 ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT 74
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGTTTCACCGACGAGTACCAGCTATACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT 74
Query 75 CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 75 CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGTACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATTAATACCAAGAAGC 148
Query 149 TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG 222
||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 149 TGTCGGCCAGAGATCACCAGAAACTGGAGAGAGAAGCTCGGATCTGCCGCCTGCTGAAGCATTCCAACATTGTA 222
Query 223 CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT 296
||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CGCCTCCATGACAGCATCTCTGAAGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT 296
Query 297 TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG 370
|||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 297 TGAAGACATCGTGGCAAGAGAGTACTACAGTGAAGCTGATGCCAGTCACTGCATCCAGCAGATCCTGGAAGCTG 370
Query 371 TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 371 TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCTGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAATGC 444
Query 445 AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG 518
|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAAGGCGCCGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTGGCCATCGAGGTTCAGGGAGACCAGCAGGCATGGTTTGG 518
Query 519 TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT 592
.||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 519 ATTTGCGGGAACGCCAGGCTACCTGTCTCCCGAGGTCCTTCGGAAGGAGGCCTACGGCAAACCTGTGGACATCT 592
Query 593 GGGCATGTGGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTACCCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTG 666
||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 593 GGGCATGTGGGGTGATCCTGTATATCCTGCTGGTGGGCTACCCACCTTTCTGGGATGAGGACCAACACAAGCTG 666
Query 667 TACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCCTGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAA 740
||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 667 TACCAGCAGATCAAGGCTGGGGCGTATGATTTCCCATCCCCTGAGTGGGACACCGTTACTCCTGAAGCCAAAAA 740
Query 741 CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGG 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 741 CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACGGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCATGGG 814
Query 815 TCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCC 888
||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 815 TCTGCCAACGTTCCACCGTGGCCTCTATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAATGTCTGAAGAAGTTCAATGCA 888
Query 889 AGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAGCAGCCAAGAGTTTACT 962
|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGGAGGAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACTATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAGCAGCCAAGAGTTTACT 962
Query 963 CAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCACCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAAG 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..|.|||..||||||||||||||
Sbjct 963 CAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACAAACAGCACCAAAAACAGCTCGGCCATCACCAGCCCCAAAG 1036
Query 1037 GGACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAGTCTTCTGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAAAG-- 1108
|..|.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||..||||.||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1037 GATCTCTCCCTCCTGCTGCCCTGGAATCTTCCGACAGCACCAACACAACCATAGAGGATGAAGATGCCAAAGCC 1110
Query 1109 -------------------------------------------------------------------------- 1108
Sbjct 1111 CCCAGGGTCCCTGATGTCCTGAGCTTGGTGAGGAGGGCCTCAGGAGCCCCCGAAGCCGAGGGCCCCCTCTCCTG 1184
Query 1109 -------------------------------------------------------------------------- 1108
Sbjct 1185 CCAATCTCCAGTTCCCATTAGCCCCCTTCCAACCCCGTCCCCCAGGATCTCTGACATCCTGAACTCAGTGAGAA 1258
Query 1109 -------------------------------------------------------------------------- 1108
Sbjct 1259 GGGGCTGTGGAACCCCAGAAGCCGAGGGACCCCTATCAGTGGGGCCCCCACCCTGCTTGTCTCCGGGTCTCCTA 1332
Query 1109 -------------------------------------------------------------------------- 1108
Sbjct 1333 GGCCCCCTGCCCACCCCGTCCCCCAGGATCTCTGACATCCTCAACTCAGTGAGGCGGGGCTCAGGGACCCCAGA 1406
Query 1109 -------------------------------------------------------------------------- 1108
Sbjct 1407 AGCTGAGGGCCTCCCACCAGTGGGCCCCCCACCCTGCCCATCTCCGACTCTCCCTGGCCCCTTGCCCACCCCAT 1480
Query 1109 CCCGGAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGGAGCAGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGGTGACTTTGAGGCCTAC 1182
|||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1481 CCCGGAAGCAGGAAATCATCAAGACCACAGAGCAGCTCATTGAGGCCGTCAACAATGGGGACTTTGAGGCCTAT 1554
Query 1183 GCGAAAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCGTTTGAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGGTTGAAGGGATGGACTT 1256
||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1555 GCGAAAATCTGTGACCCAGGCCTGACCTCATTTGAGCCTGAAGCTCTGGGCAACCTGGTCGAAGGGATGGATTT 1628
Query 1257 CCACAGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACGACCATCCTGAACCCACACG 1330
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1629 CCACAGATTCTACTTTGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACCACCATCCTGAACCCGCACG 1702
Query 1331 TGCACGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCATCGCTTACATCCGGCTCACGCAGTACATTGACGGGCAGGGCCGG 1404
|||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||.|.
Sbjct 1703 TGCACGTCATTGGCGAGGATGCGGCATGCATCGCCTACATCCGCCTCACACAGTACATCGATGGCCAGGGCAGA 1776
Query 1405 CCCCGCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGCGTGTGGCCCCGCTGC-------AG-------------------- 1451
|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||.||||.|| ||
Sbjct 1777 CCCCGTACCAGCCAGTCCGAAGAGACCCGTGTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAATGTACATTTCCA 1850
Query 1452 ------------------------------- 1451
Sbjct 1851 CTGCTCGGGCGCTCCAGTGGCCCCGCTGCAG 1881