Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468031
- Subject:
- XM_017314240.1
- Aligned Length:
- 1584
- Identities:
- 1335
- Gaps:
- 133
Alignment
Query 1 ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT 74
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGTTTCACCGACGAGTACCAGCTATACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT 74
Query 75 CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 75 CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGTACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATTAATACCAAGAAGC 148
Query 149 TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG 222
||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 149 TGTCGGCCAGAGATCACCAGAAACTGGAGAGAGAAGCTCGGATCTGCCGCCTGCTGAAGCATTCCAACATTGTA 222
Query 223 CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT 296
||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CGCCTCCATGACAGCATCTCTGAAGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT 296
Query 297 TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG 370
|||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 297 TGAAGACATCGTGGCAAGAGAGTACTACAGTGAAGCTGATGCCAGTCACTGCATCCAGCAGATCCTGGAAGCTG 370
Query 371 TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 371 TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCTGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAATGC 444
Query 445 AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG 518
|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAAGGCGCCGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTGGCCATCGAGGTTCAGGGAGACCAGCAGGCATGGTTTGG 518
Query 519 TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT 592
.||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 519 ATTTGCGGGAACGCCAGGCTACCTGTCTCCCGAGGTCCTTCGGAAGGAGGCCTACGGCAAACCTGTGGACATCT 592
Query 593 GGGCATGTGGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTACCCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTG 666
||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 593 GGGCATGTGGGGTGATCCTGTATATCCTGCTGGTGGGCTACCCACCTTTCTGGGATGAGGACCAACACAAGCTG 666
Query 667 TACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCCTGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAA 740
||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 667 TACCAGCAGATCAAGGCTGGGGCGTATGATTTCCCATCCCCTGAGTGGGACACCGTTACTCCTGAAGCCAAAAA 740
Query 741 CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGG 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 741 CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACGGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCATGGG 814
Query 815 TCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCC 888
||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 815 TCTGCCAACGTTCCACCGTGGCCTCTATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAATGTCTGAAGAAGTTCAATGCA 888
Query 889 AGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGCCACACGGAATTTCTC------------------ 944
|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGGAGGAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACTATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAGTGGGCAGACAGACCAC 962
Query 945 ---------------------------------------------------------AGCAGCCAAGAGTTTAC 961
|||||||||||||||||
Sbjct 963 CGCTCCGGCCACAATGTCCACCGCGGCCTCCGGCACCACCATGGGGCTGGTGGAACAAGCAGCCAAGAGTTTAC 1036
Query 962 TCAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCACCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAA 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..|.|||..|||||||||||||
Sbjct 1037 TCAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACAAACAGCACCAAAAACAGCTCGGCCATCACCAGCCCCAAA 1110
Query 1036 GGGACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAGTCTTCTGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAAAGC 1109
||..|.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||..||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1111 GGATCTCTCCCTCCTGCTGCCCTGGAATCTTCCGACAGCACCAACACAACCATAGAGGATGAAGATGCCAAAGC 1184
Query 1110 CCGGAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGGAGCAGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGGTGACTTTGAGGCCTACG 1183
||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 1185 CCGGAAGCAGGAAATCATCAAGACCACAGAGCAGCTCATTGAGGCCGTCAACAATGGGGACTTTGAGGCCTATG 1258
Query 1184 CGAAAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCGTTTGAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGGTTGAAGGGATGGACTTC 1257
|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1259 CGAAAATCTGTGACCCAGGCCTGACCTCATTTGAGCCTGAAGCTCTGGGCAACCTGGTCGAAGGGATGGATTTC 1332
Query 1258 CACAGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACGACCATCCTGAACCCACACGT 1331
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1333 CACAGATTCTACTTTGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACCACCATCCTGAACCCGCACGT 1406
Query 1332 GCACGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCATCGCTTACATCCGGCTCACGCAGTACATTGACGGGCAGGGCCGGC 1405
||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||.|.|
Sbjct 1407 GCACGTCATTGGCGAGGATGCGGCATGCATCGCCTACATCCGCCTCACACAGTACATCGATGGCCAGGGCAGAC 1480
Query 1406 CCCGCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGCGTGTGGCCCCGCTGC-------AG--------------------- 1451
||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||.||||.|| ||
Sbjct 1481 CCCGTACCAGCCAGTCCGAAGAGACCCGTGTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAATGTACATTTCCAC 1554
Query 1452 ------------------------------ 1451
Sbjct 1555 TGCTCGGGCGCTCCAGTGGCCCCGCTGCAG 1584