Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468048
- Subject:
- NM_001144937.3
- Aligned Length:
- 2199
- Identities:
- 1499
- Gaps:
- 699
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCTGGTGGACGAGAGACATGTTTGCCTTTGATTGGATTCATTCTTATCTGTCTTAAAATGGTTGCTTCAGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AAAATCAGCTCCTGAAATACCCACTATTGATCAGGCATATTCAAAACTCAGCAACAGTATCACTGTAGAATGGG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CTACAGTGCCGGGTGCCACCAGTTACCTCCTCACGGCTGAAGACGGGGACACAGTCATTGAAACCACGGTGGCC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 AATTCCCCAGGCACTGTGACGGGACTAAAGGCTGCAACCTGGTATGAAATCACCATCAGATCCATCAGCGCTGC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 TGGGAGAAGCCAGGCGTCACCTCCAAAGCAGGCAAAGACAGTGTTGGCTGCACCAATTCTAGAAGTAAGCTCTC 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 CAAGTTCAGACTCCATTCTTGTGCAGTGGGAAGCTGTATATATGGCAATTGCATTCTCCGTGTCCATTATGCGA 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 GCCAATGGCTTGGGGAGTATATGGAAAGAGAATACTACAAACACCTCCTTGACATTCACCAGTTTAGAAGCCGG 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 AACTCTCTACACCATAAAGGCCTATGCATGGAATGCCAACAGAATCCCTGGGGATGACTCCACCTGCAATCAGA 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 GAACAAGTCCTCGGGCCCCTGCCAACATTCAAGTCTCTTTCGATAGTGGAGCTCTGAAGGCATCTTTTTCCTGG 666
Query 1 ---------------------------------ATGGCTTTGAGCGACTCTTCAGAGCTGACCTGCAGTACAAC 41
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCACGGGCAGAAGGAGCTTTCAATTATACTGTGATGGCTTTGAGCGACTCTTCAGAGCTGACCTGCAGTACAAC 740
Query 42 TTTCAGTTCCTGCACCATCTCTTCCCTCCAGTGTGGAACTGAATACTTGATTTCAGTTTTAGCAAGTAATGATG 115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTCAGTTCCTGCACCATCTCTTCCCTCCAGTGTGGAACTGAATACTTGATTTCAGTTTTAGCAAGTAATGATG 814
Query 116 CTGGATCTAGCAAATCATCTTCAGCAATGACCCTGAAAACTGTTGCTTGTGCACCCGGAAGAGTGACGATCCAA 189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTGGATCTAGCAAATCATCTTCAGCAATGACCCTGAAAACTGTTGCTTGTGCACCCGGAAGAGTGACGATCCAA 888
Query 190 GAAGATCCCCCTGGCCACCTGTCTGTGGCTTGGTCCAGTGTAGATCTGGGTGACTACTATGTGGTCTTTGTGAA 263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAAGATCCCCCTGGCCACCTGTCTGTGGCTTGGTCCAGTGTAGATCTGGGTGACTACTATGTGGTCTTTGTGAA 962
Query 264 GAGTGATGATGGCTTGGAAGTACACTGCAACACATCTCTCACTCAGTGCAACTTCTTATCTGAGTGTGGCTTCA 337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GAGTGATGATGGCTTGGAAGTACACTGCAACACATCTCTCACTCAGTGCAACTTCTTATCTGAGTGTGGCTTCA 1036
Query 338 CTTATTTTATTAGTGTTTTTGTCTATAACAAGGCAGGGCAAAGTCCTTTGGGTGACATATTCAATTATACCACA 411
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTTATTTTATTAGTGTTTTTGTCTATAACAAGGCAGGGCAAAGTCCTTTGGGTGACATATTCAATTATACCACA 1110
Query 412 GCTCCCTGTTGTCCTAGTGACATTAACCCCGTGTTGGTGTCCAGTGACAGAGTTGAGATTGTCTGGTCTCCTGT 485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCTCCCTGTTGTCCTAGTGACATTAACCCCGTGTTGGTGTCCAGTGACAGAGTTGAGATTGTCTGGTCTCCTGT 1184
Query 486 CCGTGGTGCCGAACTGTATGAAACCAAGGCTGTAGATGGGTACAACATGGTTGAGTGCAATGACACTACTCCTG 559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCGTGGTGCCGAACTGTATGAAACCAAGGCTGTAGATGGGTACAACATGGTTGAGTGCAATGACACTACTCCTG 1258
Query 560 CGTGCACCCTTTCGGCTCTAGAGTGTGACACCAAGTACAACATCACAGTGTATTCATTCAATGAAGTCCGAGGC 633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CGTGCACCCTTTCGGCTCTAGAGTGTGACACCAAGTACAACATCACAGTGTATTCATTCAATGAAGTCCGAGGC 1332
Query 634 AGCAATATGTCATGTACTCCCCAGTTCATAACCACAGCTCCTTGCAGTCCTGAAATAAAAAATGTTTCAAGGGA 707
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGCAATATGTCATGTACTCCCCAGTTCATAACCACAGCTCCTTGCAGTCCTGAAATAAAAAATGTTTCAAGGGA 1406
Query 708 TGCATTCTCCATGATTAATGTGCACTGGCGATCCACTAATGATGATGCTACTTACACGGTGACTGCCCAAGGGG 781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGCATTCTCCATGATTAATGTGCACTGGCGATCCACTAATGATGATGCTACTTACACGGTGACTGCCCAAGGGG 1480
Query 782 AGAAAGGACTGTATCAGTGCAGCAGCACAGGAGAGTCCTGCACCATGCGGGGCTTGCCCTGTGGCTCAGTGTTC 855
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGAAAGGACTGTATCAGTGCAGCAGCACAGGAGAGTCCTGCACCATGCGGGGCTTGCCCTGTGGCTCAGTGTTC 1554
Query 856 TCTGTCACTGCTGTGGCCGAAACACAGGCAGGACGGAGCCTGCCCAGCTACAGTGTGCCCCTGGAAACAGTGCC 929
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TCTGTCACTGCTGTGGCCGAAACACAGGCAGGACGGAGCCTGCCCAGCTACAGTGTGCCCCTGGAAACAGTGCC 1628
Query 930 ATGCTGTCCAACCGGTCTGACAGTAACTCAAATCACCCAGTCAGTAATCAACGTGAGCTGGACTATTGGGAGAG 1003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ATGCTGTCCAACCGGTCTGACAGTAACTCAAATCACCCAGTCAGTAATCAACGTGAGCTGGACTATTGGGAGAG 1702
Query 1004 TGGCTCAAACCCATGTTGCAGTTCTGGAGTCACACACTGGACAGTCTAAGTGTCACACTCATCAAAACCACTGC 1077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGGCTCAAACCCATGTTGCAGTTCTGGAGTCACACACTGGACAGTCTAAGTGTCACACTCATCAAAACCACTGC 1776
Query 1078 CTCCTAGGGTGCATCACATGTGGCATCAATTACACAGTGACATTAAAAGCAATTAGTGCCACCGGGTTGACTGC 1151
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CTCCTAGGATGCATCACATGTGGCATCAATTACACAGTGACATTAAAAGCAATTAGTGCCACCGGGTTGACTGC 1850
Query 1152 AGATTGCTCCTACCAAAGTTATTTCTCTGGTGCCTGCTGCCCTTTGGGGGTGAAATTATATAGGCTGGGCCCTA 1225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AGATTGCTCCTACCAAAGTTATTTCTCTGGTGCCTGCTGCCCTTTGGGGGTGAAATTATATAGGCTGGGCCCTA 1924
Query 1226 ATGGCATCCGGATCTACTGGCAAGCCTCCAGGGGCTCTGCCAATTACAGCACTGACCTCTATGGCTCCAAAGGC 1299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ATGGCATCCGGATCTACTGGCAAGCCTCCAGGGGCTCTGCCAATTACAGCACTGACCTCTATGGCTCCAAAGGC 1998
Query 1300 ATTTTCACGTGCACCCCGAGTGCTGGCCTCAGTTTCTGTGATGTCACTGAGATACCCTGTGGGGATGTATACAC 1373
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ATTTTCACGTGCACCCCGAGTGCTGGCCTCAGTTTCTGTGATGTCACTGAGATACCCTGTGGGGATGTATACAC 2072
Query 1374 TGTGATGGTCTCACCAGTTGCTAAAACAGGATTGAAGCTTACTTTCTGTCCAAAAAAAATATATTCAGTAACTT 1447
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TGTGATGGTCTCACCAGTTGCTAAAACAGGATTGAAGCTTACTTTCTGTCCAAAAAAAATATATTCAGTAACTT 2146
Query 1448 GCTCTGGAAGTACACTTGGAATGGTGATTTATAGAGGGAAGAGAAATGAAGAA 1500
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GCTCTGGAAGTACACTTGGAATGGTGATTTATAGAGGGAAGAGAAATGAAGAA 2199