Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468049
• Subject: XM_011538442.2
• Aligned Length: 1653
• Identities: 1479
• Gaps: 174

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCAATTCCACTGAAGTCCTCATTTCTGCTGAGCTACCTGTGCACCCTGCCTCCGGCTCTCCTGAGCAGAGA  74

Query    1  -------ATGGCTGACTCAGAAGCACTCCCCTCCCTTGCTGGGGACCCAGTGGCTGTGGAAGCCTTGCTCCGGG  67
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GATCCTGATGGCTGACTCAGAAGCACTCCCCTCCCTTGCTGGGGACCCAGTGGCTGTGGAAGCCTTGCTCCGGG  148

Query   68  CCGTGTTTGGGGTTGTTGTGGATGAGGCCATTCAGAAAGGAACCAGTGTCTCCCAGAAGGTCTGTGAGTGGAAG  141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGTGTTTGGGGTTGTTGTGGATGAGGCCATTCAGAAAGGAACCAGTGTCTCCCAGAAGGTCTGTGAGTGGAAG  222

Query  142  GAGCCTGAGGAGCTGAAGCAGCTGCTGGATTTGGAGCTGCGGAGCCAGGGCGAGTCACAGAAGCAGATCCTGGA  215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGCCTGAGGAGCTGAAGCAGCTGCTGGATTTGGAGCTGCGGAGCCAGGGCGAGTCACAGAAGCAGATCCTGGA  296

Query  216  GCGGTGTCGGGCTGTGATTCGCTACAGTGTCAAGACTGGTCACCCTCGGTTCTTCAACCAGCTCTTCTCTGGGT  289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCGGTGTCGGGCTGTGATTCGCTACAGTGTCAAGACTGGTCACCCTCGGTTCTTCAACCAGCTCTTCTCTGGGT  370

Query  290  TGGATCCCCATGCTCTGGCCGGGCGCATTATCACTGAGAGCCTCAACACCAGCCAGTACACATATGAAATCGCC  363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGATCCCCATGCTCTGGCCGGGCGCATTATCACTGAGAGCCTCAACACCAGCCAGTACACATATGAAATCGCC  444

Query  364  CCCGTGTTTGTGCTCATGGAAGAGGAGGTGCTGAGGAAACTGCGGGCCCTGGTGGGCTGGAGCTCTGGGGACGG  437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCGTGTTTGTGCTCATGGAAGAGGAGGTGCTGAGGAAACTGCGGGCCCTGGTGGGCTGGAGCTCTGGGGACGG  518

Query  438  AATCTTCTGCCCTGGTGGCTCCATCTCCAACATGTATGCTGTAAATCTGGCCCGCTATCAGCGCTACCCGGATT  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATCTTCTGCCCTGGTGGCTCCATCTCCAACATGTATGCTGTAAATCTGGCCCGCTATCAGCGCTACCCGGATT  592

Query  512  GCAAGCAGAGGGGCCTCCGCACACTGCCGCCCCTGGCCCTATTCACATCGAAGGAG------------------  567
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct  593  GCAAGCAGAGGGGCCTCCGCACACTGCCGCCCCTGGCCCTATTCACATCGAAGGAGGTGGGGAAGAGGCACAGG  666

Query  568  -----------------------------------TGTCACTACTCCATCCAGAAGGGAGCTGCGTTTCTGGGA  606
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCAACCCTGGGCTCCTGATTCTAATCTCCAGCCATGTCACTACTCCATCCAGAAGGGAGCTGCGTTTCTGGGA  740

Query  607  CTTGGCACCGACAGTGTCCGAGTGGTCAAGGCTGATGAGAGAGGGAAAATGGTCCCCGAGGATCTGGAGAGGCA  680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTGGCACCGACAGTGTCCGAGTGGTCAAGGCTGATGAGAGAGGGAAAATGGTCCCCGAGGATCTGGAGAGGCA  814

Query  681  GATTGGTATGGCCGAGGCTGAG----------------------------------------GGTGCTGTGCCG  714
            ||||||||||||||||||||||                                        ||||||||||||
Sbjct  815  GATTGGTATGGCCGAGGCTGAGGTTGACTTTTCACTTTTTTGAAACTTTTATTTTGGATTCAGGTGCTGTGCCG  888

Query  715  TTCCTGGTCAGTGCCACCTCTGGCACCACTGTGCTAGGGGCCTTTGACCCCCTGGAGGCAATTGCTGATGTGTG  788
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTCCTGGTCAGTGCCACCTCTGGCACCACTGTGCTAGGGGCCTTTGACCCCCTGGAGGCAATTGCTGATGTGTG  962

Query  789  CCAGCGTCATGGGCTATGGCTGCATGTGGATGCTGCCTGGGGTGGGAGCGTCCTGCTGTCACAGACACACAGGC  862
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCAGCGTCATGGGCTATGGCTGCATGTGGATGCTGCCTGGGGTGGGAGCGTCCTGCTGTCACAGACACACAGGC  1036

Query  863  ATCTCCTGGATGGGATCCAGAGGGCTGACTCTGTGGCCTGGAATCCCCACAAGCTCCTCGCAGCAGGCCTGCAA  936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATCTCCTGGATGGGATCCAGAGGGCTGACTCTGTGGCCTGGAATCCCCACAAGCTCCTCGCAGCAGGCCTGCAA  1110

Query  937  TGCTCTGCACTTCTTCTCCAGGATACCTCGAACCTGCTCAAGCGCTGCCATGGGTCCCAGGCCAGCTACCTTTT  1010
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGCTCTGCACTTCTTCTCCAGGATACCTCGAACCTGCTCAAGCGCTGCCATGGGTCCCAGGCCAGCTACCTTTT  1184

Query 1011  CCAGCAGGACAAGTTCTACGATGTGGCTCTGGACACGGGAGACAAGGTGGTGCAGTGTGGCCGCCGTGTGGACT  1084
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCAGCAGGACAAGTTCTACGATGTGGCTCTGGACACGGGAGACAAGGTGGTGCAGTGTGGCCGCCGTGTGGACT  1258

Query 1085  GTCTGAAGCTGTGGCTCATGTGGAAGGCACAGGGCGATCAAGGGCTGGAGCGGCGCATCGACCAGGCCTTTGTC  1158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTCTGAAGCTGTGGCTCATGTGGAAGGCACAGGGCGATCAAGGGCTGGAGCGGCGCATCGACCAGGCCTTTGTC  1332

Query 1159  CTTGCCCGGTACCTGGTGGAGGAAATGAAGAAGCGGGAAGGGTTTGAGCTAGTCATGGAGCCTGAGTTTGTCAA  1232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTTGCCCGGTACCTGGTGGAGGAAATGAAGAAGCGGGAAGGGTTTGAGCTAGTCATGGAGCCTGAGTTTGTCAA  1406

Query 1233  TGTGTGTTTCTGGTTCGTACCCCCCAGCCTGCGAGGGAAGCAGGAGAGTCCAGATTACCACGAAAGGCTGTCAA  1306
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGTGTGTTTCTGGTTCGTACCCCCCAGCCTGCGAGGGAAGCAGGAGAGTCCAGATTACCACGAAAGGCTGTCAA  1480

Query 1307  AGGTGGCCCCCGTGCTCAAGGAGCGCATGGTGAAGGAGGGCTCCATGATGATTGGCTACCAGCCCCACGGGACC  1380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGTGGCCCCCGTGCTCAAGGAGCGCATGGTGAAGGAGGGCTCCATGATGATTGGCTACCAGCCCCACGGGACC  1554

Query 1381  CGGGGCAACTTCTTCCGTGTGGTTGTGGCCAACTCTGCACTGACCTGTGCTGATATGGACTTCCTCCTCAACGA  1454
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CGGGGCAACTTCTTCCGTGTGGTTGTGGCCAACTCTGCACTGACCTGTGCTGATATGGACTTCCTCCTCAACGA  1628

Query 1455  GCTGGAGCGGCTAGGCCAGGACCTG  1479
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCTGGAGCGGCTAGGCCAGGACCTG  1653