Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468049
• Subject: XM_024449012.1
• Aligned Length: 1767
• Identities: 1479
• Gaps: 288

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGGAACTCTGCCAAAAGGAAAGTTGCTTGGATTTGCCATCTCAGGAATGGAAGAAGGGGGCGGAGACCCT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TTGGGGCTTTTGTGCCCAGTGGGCCGGCCCGAAAAGCTCGCACTTTACAGAGGCGGCAAGACTAGGGTGGAGGA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AAGCTCAAGGGCCATCGCTGGGTGCTTCGGTGGCGGGCAGAAACGGGACTGGCAGTGCCCACACGTGTGCGTTC  222

Query    1  ------------------------------------------------------------------ATGGCTGA  8
                                                                              ||||||||
Sbjct  223  TCCCCGTCCGCCCGAAGGAGCTACCTGTGCACCCTGCCTCCGGCTCTCCTGAGCAGAGAGATCCTGATGGCTGA  296

Query    9  CTCAGAAGCACTCCCCTCCCTTGCTGGGGACCCAGTGGCTGTGGAAGCCTTGCTCCGGGCCGTGTTTGGGGTTG  82
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCAGAAGCACTCCCCTCCCTTGCTGGGGACCCAGTGGCTGTGGAAGCCTTGCTCCGGGCCGTGTTTGGGGTTG  370

Query   83  TTGTGGATGAGGCCATTCAGAAAGGAACCAGTGTCTCCCAGAAGGTCTGTGAGTGGAAGGAGCCTGAGGAGCTG  156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGTGGATGAGGCCATTCAGAAAGGAACCAGTGTCTCCCAGAAGGTCTGTGAGTGGAAGGAGCCTGAGGAGCTG  444

Query  157  AAGCAGCTGCTGGATTTGGAGCTGCGGAGCCAGGGCGAGTCACAGAAGCAGATCCTGGAGCGGTGTCGGGCTGT  230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGCAGCTGCTGGATTTGGAGCTGCGGAGCCAGGGCGAGTCACAGAAGCAGATCCTGGAGCGGTGTCGGGCTGT  518

Query  231  GATTCGCTACAGTGTCAAGACTGGTCACCCTCGGTTCTTCAACCAGCTCTTCTCTGGGTTGGATCCCCATGCTC  304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATTCGCTACAGTGTCAAGACTGGTCACCCTCGGTTCTTCAACCAGCTCTTCTCTGGGTTGGATCCCCATGCTC  592

Query  305  TGGCCGGGCGCATTATCACTGAGAGCCTCAACACCAGCCAGTACACATATGAAATCGCCCCCGTGTTTGTGCTC  378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGCCGGGCGCATTATCACTGAGAGCCTCAACACCAGCCAGTACACATATGAAATCGCCCCCGTGTTTGTGCTC  666

Query  379  ATGGAAGAGGAGGTGCTGAGGAAACTGCGGGCCCTGGTGGGCTGGAGCTCTGGGGACGGAATCTTCTGCCCTGG  452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGGAAGAGGAGGTGCTGAGGAAACTGCGGGCCCTGGTGGGCTGGAGCTCTGGGGACGGAATCTTCTGCCCTGG  740

Query  453  TGGCTCCATCTCCAACATGTATGCTGTAAATCTGGCCCGCTATCAGCGCTACCCGGATTGCAAGCAGAGGGGCC  526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGCTCCATCTCCAACATGTATGCTGTAAATCTGGCCCGCTATCAGCGCTACCCGGATTGCAAGCAGAGGGGCC  814

Query  527  TCCGCACACTGCCGCCCCTGGCCCTATTCACATCGAAGGAGTGTCACTACTCCATCCAGAAGGGAGCTGCGTTT  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCGCACACTGCCGCCCCTGGCCCTATTCACATCGAAGGAGTGTCACTACTCCATCCAGAAGGGAGCTGCGTTT  888

Query  601  CTGGGACTTGGCACCGACAGTGTCCGAGTGGTCAAGGCTGATGAGAGAGGGAAAATGGTCCCCGAGGATCTGGA  674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGGGACTTGGCACCGACAGTGTCCGAGTGGTCAAGGCTGATGAGAGAGGGAAAATGGTCCCCGAGGATCTGGA  962

Query  675  GAGGCAGATTGGTATGGCCGAGGCTGAGGGTGCTGTGCCGTTCCTGGTCAGTGCCACCTCTGGCACCACTGTGC  748
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAGGCAGATTGGTATGGCCGAGGCTGAGGGTGCTGTGCCGTTCCTGGTCAGTGCCACCTCTGGCACCACTGTGC  1036

Query  749  TAGGGGCCTTTGACCCCCTGGAGGCAATTGCTGATGTGTGCCAGCGTCATGGGCTATGGCTGCATGTGGATGCT  822
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TAGGGGCCTTTGACCCCCTGGAGGCAATTGCTGATGTGTGCCAGCGTCATGGGCTATGGCTGCATGTGGATGCT  1110

Query  823  GCCTGGGGTGGGAGCGTCCTGCTGTCACAGACACACAGGCATCTCCTGGATGGGATCCAGAGGGCTGACTCTGT  896
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCTGGGGTGGGAGCGTCCTGCTGTCACAGACACACAGGCATCTCCTGGATGGGATCCAGAGGGCTGACTCTGT  1184

Query  897  GGCCTGGAATCCCCACAAGCTCCTCGCAGCAGGCCTGCAATGCTCTGCACTTCTTCTCCAGGATACCTCGAACC  970
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCCTGGAATCCCCACAAGCTCCTCGCAGCAGGCCTGCAATGCTCTGCACTTCTTCTCCAGGATACCTCGAACC  1258

Query  971  TGCTCAAGCGCTGCCATGGGTCCCAGGCCAGCTACCTTTTCCAGCAGGACAAGTTCTACGATGTGGCTCTGGAC  1044
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCTCAAGCGCTGCCATGGGTCCCAGGCCAGCTACCTTTTCCAGCAGGACAAGTTCTACGATGTGGCTCTGGAC  1332

Query 1045  ACGGGAGACAAGGTGGTGCAGTGTGGCCGCCGTGTGGACTGTCTGAAGCTGTGGCTCATGTGGAAGGCACAGGG  1118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACGGGAGACAAGGTGGTGCAGTGTGGCCGCCGTGTGGACTGTCTGAAGCTGTGGCTCATGTGGAAGGCACAGGG  1406

Query 1119  CGATCAAGGGCTGGAGCGGCGCATCGACCAGGCCTTTGTCCTTGCCCGGTACCTGGTGGAGGAAATGAAGAAGC  1192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGATCAAGGGCTGGAGCGGCGCATCGACCAGGCCTTTGTCCTTGCCCGGTACCTGGTGGAGGAAATGAAGAAGC  1480

Query 1193  GGGAAGGGTTTGAGCTAGTCATGGAGCCTGAGTTTGTCAATGTGTGTTTCTGGTTCGTACCCCCCAGCCTGCGA  1266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGGAAGGGTTTGAGCTAGTCATGGAGCCTGAGTTTGTCAATGTGTGTTTCTGGTTCGTACCCCCCAGCCTGCGA  1554

Query 1267  GGGAAGCAGGAGAGTCCAGATTACCACGAAAGGCTGTCAAAGGTGGCCCCCGTGCTCAAGGAGCGCATGGTGAA  1340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGGAAGCAGGAGAGTCCAGATTACCACGAAAGGCTGTCAAAGGTGGCCCCCGTGCTCAAGGAGCGCATGGTGAA  1628

Query 1341  GGAGGGCTCCATGATGATTGGCTACCAGCCCCACGGGACCCGGGGCAACTTCTTCCGTGTGGTTGTGGCCAACT  1414
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGAGGGCTCCATGATGATTGGCTACCAGCCCCACGGGACCCGGGGCAACTTCTTCCGTGTGGTTGTGGCCAACT  1702

Query 1415  CTGCACTGACCTGTGCTGATATGGACTTCCTCCTCAACGAGCTGGAGCGGCTAGGCCAGGACCTG  1479
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTGCACTGACCTGTGCTGATATGGACTTCCTCCTCAACGAGCTGGAGCGGCTAGGCCAGGACCTG  1767