Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000468146
Subject:
XM_005263657.4
Aligned Length:
1176
Identities:
828
Gaps:
348

Alignment

Query    1  ATGTCTCGGGAACCCACCCCACCTCTACCTGGAGATATGTCTACTGGTCCCATAGCAGAAAGCTGGTGTTACAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACAGGTTAAAGTAGTAAAATTTTCCTATATGTGGACCATTAATAACTTCAGTTTTTGTCGAGAGGAAATGGGTG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AAGTGTTAAAAAGTTCAACATTTTCATCTGGCCCAAGTGACAAAATGAAATGGTGCCTGAGGGTAAACCCAAAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GGATTAGATGATGAAAGTAAAGACTACTTGTCCTTATATTTGCTTTTAGTCAGCTGCCCCAAAAGTGAAGTTCG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AGCAAAATTCAAATTTTCCCTTCTGAATGCTAAAAGGGAAGAAACAAAAGCAATGGAAAGCCAAAGAGCATATC  370
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------ATGGAAAGCCAAAGAGCATATC  22

Query  371  GATTTGTGCAAGGGAAGGACTGGGGTTTTAAAAAATTCATTAGAAGGGACTTTTTGCTTGATGAAGCTAATGGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   23  GATTTGTGCAAGGGAAGGACTGGGGTTTTAAAAAATTCATTAGAAGGGACTTTTTGCTTGATGAAGCTAATGGT  96

Query  445  CTTTTACCAGATGACAAGCTTACATTATTTTGTGAGGTGAGTGTGGTCCAAGATTCAGTAAACATATCAGGACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   97  CTTTTACCAGATGACAAGCTTACATTATTTTGTGAGGTGAGTGTGGTCCAAGATTCAGTAAACATATCAGGACA  170

Query  519  TACTAATACAAATACTTTGAAGGTGCCTGAGTGTCGTCTAGCAGAAGATTTAGGTAATCTCTGGGAAAACACAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  171  TACTAATACAAATACTTTGAAGGTGCCTGAGTGTCGTCTAGCAGAAGATTTAGGTAATCTCTGGGAAAACACAA  244

Query  593  GATTTACAGACTGCAGTTTTTTCGTGAGAGGACAAGAATTTAAAGCTCATAAATCTGTGCTTGCAGCTCGATCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  245  GATTTACAGACTGCAGTTTTTTCGTGAGAGGACAAGAATTTAAAGCTCATAAATCTGTGCTTGCAGCTCGATCT  318

Query  667  CCAGTTTTTAACGCCATGTTTGAACATGAAATGGAAGAAAGCAAAAAGAATCGAGTGGAAATAAATGATTTAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  319  CCAGTTTTTAACGCCATGTTTGAACATGAAATGGAAGAAAGCAAAAAGAATCGAGTGGAAATAAATGATTTAGA  392

Query  741  CCCTGAAGTTTTTAAAGAAATGATGAGATTCATTTACACAGGGAGAGCACCAAACCTTGACAAAATGGCTGACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  393  CCCTGAAGTTTTTAAAGAAATGATGAGATTCATTTACACAGGGAGAGCACCAAACCTTGACAAAATGGCTGACA  466

Query  815  ACTTGTTGGCAGCTGCAGACAAATATGCACTGGAACGGCTGAAGGTCATGTGCGAAGAAGCTTTGTGTAGTAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  467  ACTTGTTGGCAGCTGCAGACAAATATGCACTGGAACGGCTGAAGGTCATGTGCGAAGAAGCTTTGTGTAGTAAC  540

Query  889  CTCTCAGTAGAGAATGTTGCAGATACCCTTGTCCTTGCAGATTTGCACAGTGCAGAACAGTTGAAAGCACAAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  CTCTCAGTAGAGAATGTTGCAGATACCCTTGTCCTTGCAGATTTGCACAGTGCAGAACAGTTGAAAGCACAAGC  614

Query  963  CATAGACTTTATTAATAGGTGCAGTGTACTTCGACAACTTGGGTGTAAAGATGGGAAAAACTGGAACAGCAACC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  615  CATAGACTTTATTAATAGGTGCAGTGTACTTCGACAACTTGGGTGTAAAGATGGGAAAAACTGGAACAGCAACC  688

Query 1037  AAGCAACCGACATAATGGAAACATCAGGGTGGAAGTCCATGATTCAGTCTCACCCTCATTTAGTAGCAGAAGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  689  AAGCAACCGACATAATGGAAACATCAGGGTGGAAGTCCATGATTCAGTCTCACCCTCATTTAGTAGCAGAAGCC  762

Query 1111  TTTCGAGCACTAGCATCTGCACAGTGTCCACAGTTTGGCATTCCACGCAAACGGCTAAAACAGTCC  1176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  763  TTTCGAGCACTAGCATCTGCACAGTGTCCACAGTTTGGCATTCCACGCAAACGGCTAAAACAGTCC  828