Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468166
- Subject:
- NM_001347077.1
- Aligned Length:
- 1734
- Identities:
- 1445
- Gaps:
- 171
Alignment
Query 1 ATGGCGGCCAGCGCGAAGCGGAAGCAGGAGGAGAAGCACCTGAAGATGCTGCGGGACATGACCGGCCTCCCGCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1 ATGGCGGCCAGCGCGAAGCGGAAGCAGGAGGAGAAGCACCTGAAGATGCTGCGGGACATGACGGGGCTGCCGCA 74
Query 75 CAACCGAAAGTGCTTCGACTGCGGCCAGCGCGGCCCCACCTACGTTAACATGACGGTCGGCTCCTTCGTGTGTA 148
||||||.|||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 75 CAACCGCAAGTGTTTCGACTGCGACCAGCGCGGCCCCACCTACGTGAACATGACGGTCGGCTCGTTCGTGTGCA 148
Query 149 CCTCCTGCTCCGGCAGCCTGCGAGGATTAAATCCACCACACAGGGTGAAATCTATCTCCATGACAACATTCACA 222
||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 149 CCTCCTGCTCCGGCAGCCTGAGAGGGTTAAATCCACCTCACAGGGTGAAATCTATCTCCATGACAACATTTACA 222
Query 223 CAACAGGAAATTGAATTCTTACAAAAACATGGAAATGAAGTCTGTAAACAGATTTGGCTAGGATTATTTGATGA 296
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAACAGGAAATTGAATTCCTACAAAAACATGGAAATGAAGTCTGCAAACAGATATGGCTAGGATTATTTGATGA 296
Query 297 TAGATCTTCAGCAATTCCAGACTTCAGGGATCCACAAAAAGTGAAAGAGTTTCTACAAGAAAAGTATGAAAAGA 370
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 297 CAGATCTTCAGCAATTCCAGACTTCAGGGATCCACAAAAAGTGAAAGAGTTTCTACAAGAGAAATATGAAAAGA 370
Query 371 AAAGATGGTATGTCCCGCCAGAACAAGCCAAAGTCGTGGCATCAGTTCATGCATCTATTTCAGGGTCCTCTGCC 444
|||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 371 AAAGATGGTATGTTCCGCCAGAGCAAGCCAAAGTGGTGGCCTCGGTTCATGCGTCTATTTCAGGGTCTTCTGCC 444
Query 445 AGTAGCACAAGCAGCACACCTGAGGTCAAACCACTGAAATCTCTTTTAGGGGATTCTGCACCAACACTGCACTT 518
||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.||||||||..||||||||.|
Sbjct 445 AGCAGCACAAGCAGCACCCCGGAGGTCAAGCCCCTGAAATCCCTGTTGGGAGAGTCTGCACCCGCACTGCACCT 518
Query 519 AAATAAGGGCACACCTAGTCAGTCCCCAGTTGTAGGTCGTTCTCAAGGGCAGCAGCAGGAGAAGAAGCAATTTG 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 519 AAATAAGGGCACACCTAGTCAGTCCCCAGTTGTAGGTCGCTCTCAAGGGCAGCAGCAGGAGAAGAAGCAGTTTG 592
Query 593 ACCTTTTAAGTGATCTCGGCTCAGACATCTTTGCTGCTCCAGCTCCTCAGTCAACAGCTACAGCCAATTTTGCT 666
|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACCTTTTGAGTGATCTTGGCTCAGACATCTTTGCTGCTCCAGCTCCTCAGTCAACAGCTACAGCCAATTTTGCT 666
Query 667 AACTTTGCACATTTCAACAGTCATGCAGCTCAGAATTCTGCAAATGCAGATTTTGCAAACTTTGATGCATTTGG 740
|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 667 AACTTTGCACACTTTAACAGTCATG------------------------------------------------- 691
Query 741 ACAGTCTAGTGGTTCGAGTAATTTTGGAGGTTTCCCCACAGCAAGTCACTCTCCTTTTCAGCCCCAAACTACAG 814
|||
Sbjct 692 -----------------------------------------------------------------------CAG 694
Query 815 GTGGAAGTGCTGCATCAGTAAATGCTAATTTTGCTCATTTTGATAACTTCCCCAAATCCTCCAGTGCTGATTTT 888
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 695 GTGGAAGTGCTGGATCAGTAAATGCTAATTTTGCTCATTTTGATAACTTCCCTAAATCCTCCAGTGCTGATTTT 768
Query 889 GGAACCTTCAATACTTCCCAGAGTCATCAAACAGCATCAGCTGTTAGTAAAGTTTCAACGAACAAAGCTGGTTT 962
||||||||||.|||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 769 GGAACCTTCAGTACATCCCAGAGTCATCAGACAGCATCAACTGTTAGTAAAGTTTCAACAAACAAAGCTGGTTT 842
Query 963 ACAGACTGCAGACAAATATGCAGCACTTGCTAATTTAGACAATATCTTCAGTGCCGGGCAAGGTGGTGATCAGG 1036
||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 843 ACAGACAGCAGACAAATATGCGGCACTTGCTAATTTAGACAATATCTTCAGTGCTGGGCAAGGAGGTGATCAAG 916
Query 1037 GAAGTGGCTTTGGGACCACAGGTAAAGCTCCTGTTGGTTCTGTGGTTTCAGTTCCCAGTCAGTCAAGTGCATCT 1110
|.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 917 GGAGTGGTTTTGGGACCACGGGTAAAGCTCCTGTTGGTTCTGTGGTTTCAGTTCCCAGTCATTCAAGTGCATCT 990
Query 1111 TCAGACAAGTATGCAGCTCTGGCAGAACTAGACAGCGTTTTCAGTTCTGCAGCCACCTCCAGTAATGCGTATAC 1184
|||||||||||||||||.||||||||..||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 991 TCAGACAAGTATGCAGCCCTGGCAGAGTTAGACAGCGTGTTCAGCTCTGCAGCCACCTCCAGTAATGCGTACAC 1064
Query 1185 TTCCACAAGTAATGCTAGCAGCAATGTTTTTGGAACAGTGCCAGTGGTTGCTTCTGCACAGACACAGCCTGCTT 1258
..||||.||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.||||.|||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1065 GCCCACCAGTAATGCTAGCAGCAGTGTCTTTGGAACAGTGCCTGTGGGTGCCTCTGCTCAGACACAACCTGCT- 1137
Query 1259 CATCAAGTGTGCCTGCTCCATTTGGAGCTACGCCTTCCACAAATCCATTTGTTGCTGCTGCTGGTCCTTCTGTG 1332
|||||||..||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||||.|
Sbjct 1138 --TCAAGTGGTCCTGCTCCGTTTGGGGCTACGCCTTCTACGAATCCATTTGTTGCTGCTACTGGTCCTTCTGCG 1209
Query 1333 GCATCTTCTACAAACCCATTTCAGACCAATGCCAGAGGAGCAACA----------------------------- 1377
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210 GCATCGTCTACAAACCCATTTCAGACCAATGCCAGAGGAGCAACAGGCCTTTCTGGAGCAATGCATTCTCAAGT 1283
Query 1378 -------------------GCGGCAACCTTTGGCACTGCATCCATGAGCATGCCCACGGGATTCGGCACTCCTG 1432
|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||..|.|||||.||||||||||
Sbjct 1284 GTTTCCTCACGCTCATTTTGCGGCAACCTTTGGCACCGCATCTATGAGTATGCCAGCAGGATTTGGCACTCCTG 1357
Query 1433 CTCCCTACAGTCTTCCCACCAGCTTTAGTGGCAGCTTTCAGCAGCCTGCCTTTCCAGCCCAAGCAGCTTTCCCT 1506
|.|..||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1358 CCCAGTATAGTCTCCCTACCAGCTTTAGTGGCAGTTTCCAGCAGCCTGCCTTCCCAGCCCAAGCAGCTTTCCCT 1431
Query 1507 CAACAGACAGCTTTTTCTCAACAGCCCAATGGTGCAGGTTTTGCAGCATTTGGACAAACAAAGCCAGTAGTAAC 1580
||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||..|.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1432 CAGCAGACAGCCTTTTCTCAACAGCCCAATGGTGCAGGTTTCGCCACGTTTGGACAAACAAAACCAGTGGTAAC 1505
Query 1581 CCCTTTTGGTCAAGTTGCAGCTGCTGGAGTATCTAGTAATCCTTTTATGACTGGTGCACCAACAGGACAATTTC 1654
||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|||
Sbjct 1506 CCCTTTCGGTCAAGTAGCAGCTGCTGGAGTGTCTAGTAATCCTTTTATGACTGGTGCGCCGACAGGACAACTTC 1579
Query 1655 CAACAGGAAGCTCATCAACCAATCCTTTCTTA 1686
||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1580 CAACAGGAAGCTCATCCACCAACCCTTTCTTA 1611