Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468166
- Subject:
- XM_006496439.3
- Aligned Length:
- 1686
- Identities:
- 1469
- Gaps:
- 102
Alignment
Query 1 ATGGCGGCCAGCGCGAAGCGGAAGCAGGAGGAGAAGCACCTGAAGATGCTGCGGGACATGACCGGCCTCCCGCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1 ATGGCGGCCAGCGCGAAGCGGAAGCAGGAGGAGAAGCACCTGAAGATGCTGCGGGACATGACGGGGCTGCCGCA 74
Query 75 CAACCGAAAGTGCTTCGACTGCGGCCAGCGCGGCCCCACCTACGTTAACATGACGGTCGGCTCCTTCGTGTGTA 148
||||||.|||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 75 CAACCGCAAGTGTTTCGACTGCGACCAGCGCGGCCCCACCTACGTGAACATGACGGTCGGCTCGTTCGTGTGCA 148
Query 149 CCTCCTGCTCCGGCAGCCTGCGAGGATTAAATCCACCACACAGGGTGAAATCTATCTCCATGACAACATTCACA 222
||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 149 CCTCCTGCTCCGGCAGCCTGAGAGGGTTAAATCCACCTCACAGGGTGAAATCTATCTCCATGACAACATTTACA 222
Query 223 CAACAGGAAATTGAATTCTTACAAAAACATGGAAATGAAGTCTGTAAACAGATTTGGCTAGGATTATTTGATGA 296
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAACAGGAAATTGAATTCCTACAAAAACATGGAAATGAAGTCTGCAAACAGATATGGCTAGGATTATTTGATGA 296
Query 297 TAGATCTTCAGCAATTCCAGACTTCAGGGATCCACAAAAAGTGAAAGAGTTTCTACAAGAAAAGTATGAAAAGA 370
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 297 CAGATCTTCAGCAATTCCAGACTTCAGGGATCCACAAAAAGTGAAAGAGTTTCTACAAGAGAAATATGAAAAGA 370
Query 371 AAAGATGGTATGTCCCGCCAGAACAAGCCAAAGTCGTGGCATCAGTTCATGCATCTATTTCAGGGTCCTCTGCC 444
|||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 371 AAAGATGGTATGTTCCGCCAGAGCAAGCCAAAGTGGTGGCCTCGGTTCATGCGTCTATTTCAGGGTCTTCTGCC 444
Query 445 AGTAGCACAAGCAGCACACCTGAGGTCAAACCACTGAAATCTCTTTTAGGGGATTCTGCACCAACACTGCACTT 518
||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.||||||||..||||||||.|
Sbjct 445 AGCAGCACAAGCAGCACCCCGGAGGTCAAGCCCCTGAAATCCCTGTTGGGAGAGTCTGCACCCGCACTGCACCT 518
Query 519 AAATAAGGGCACACCTAGTCAGTCCCCAGTTGTAGGTCGTTCTCAAGGGCAGCAGCAGGAGAAGAAGCAATTTG 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 519 AAATAAGGGCACACCTAGTCAGTCCCCAGTTGTAGGTCGCTCTCAAGGGCAGCAGCAGGAGAAGAAGCAGTTTG 592
Query 593 ACCTTTTAAGTGATCTCGGCTCAGACATCTTTGCTGCTCCAGCTCCTCAGTCAACAGCTACAGCCAATTTTGCT 666
|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACCTTTTGAGTGATCTTGGCTCAGACATCTTTGCTGCTCCAGCTCCTCAGTCAACAGCTACAGCCAATTTTGCT 666
Query 667 AACTTTGCACATTTCAACAGTCATGCAGCTCAGAATTCTGCAAATGCAGATTTTGCAAACTTTGATGCATTTGG 740
|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AACTTTGCACACTTTAACAGTCATGCAGCTCAGAATTCTGCAAATGCAGATTTTGCAAACTTTGATGCATTTGG 740
Query 741 ACAGTCTAGTGGTTCGAGTAATTTTGGAGGTTTCCCCACAGCAAGTCACTCTCCTTTTCAGCCCCAAACTACAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||
Sbjct 741 ACAGTCTAGTGGTTCGAGTAATTTTGGAGGTTTCCCCACAGCAAGTCACTCTTCTTTTCAGCCCCAGACTACAG 814
Query 815 GTGGAAGTGCTGCATCAGTAAATGCTAATTTTGCTCATTTTGATAACTTCCCCAAATCCTCCAGTGCTGATTTT 888
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTGGAAGTGCTGGATCAGTAAATGCTAATTTTGCTCATTTTGATAACTTCCCTAAATCCTCCAGTGCTGATTTT 888
Query 889 GGAACCTTCAATACTTCCCAGAGTCATCAAACAGCATCAGCTGTTAGTAAAGTTTCAACGAACAAAGCTGGTTT 962
||||||||||.|||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 889 GGAACCTTCAGTACATCCCAGAGTCATCAGACAGCATCAACTGTTAGTAAAGTTTCAACAAACAAAGCTGGTTT 962
Query 963 ACAGACTGCAGACAAATATGCAGCACTTGCTAATTTAGACAATATCTTCAGTGCCGGGCAAGGTGGTGATCAGG 1036
||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 963 ACAGACAGCAGACAAATATGCGGCACTTGCTAATTTAGACAATATCTTCAGTGCTGGGCAAGGAGGTGATCAAG 1036
Query 1037 GAAGTGGCTTTGGGACCACAGGTAAAGCTCCTGTTGGTTCTGTGGTTTCAGTTCCCAGTCAGTCAAGTGCATCT 1110
|.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037 GGAGTGGTTTTGGGACCACGGGTAAAGCTCCTGTTGGTTCTGTGGTTTCAGTTCCCAGTCATTCAAGTGCATCT 1110
Query 1111 TCAGACAAGTATGCAGCTCTGGCAGAACTAGACAGCGTTTTCAGTTCTGCAGCCACCTCCAGTAATGCGTATAC 1184
|||||||||||||||||.||||||||..||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1111 TCAGACAAGTATGCAGCCCTGGCAGAGTTAGACAGCGTGTTCAGCTCTGCAGCCACCTCCAGTAATGCGTACAC 1184
Query 1185 TTCCACAAGTAATGCTAGCAGCAATGTTTTTGGAACAGTGCCAGTGGTTGCTTCTGCACAGACACAGCCTGCTT 1258
..||||.||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.||||.|||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1185 GCCCACCAGTAATGCTAGCAGCAGTGTCTTTGGAACAGTGCCTGTGGGTGCCTCTGCTCAGACACAACCTGCT- 1257
Query 1259 CATCAAGTGTGCCTGCTCCATTTGGAGCTACGCCTTCCACAAATCCATTTGTTGCTGCTGCTGGTCCTTCTGTG 1332
|||||||..||||||||.|||||
Sbjct 1258 --TCAAGTGGTCCTGCTCCGTTTGG------------------------------------------------- 1280
Query 1333 GCATCTTCTACAAACCCATTTCAGACCAATGCCAGAGGAGCAACAGCGGCAACCTTTGGCACTGCATCCATGAG 1406
.|||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1281 --------------------------------------------GGCGGCAACCTTTGGCACCGCATCTATGAG 1310
Query 1407 CATGCCCACGGGATTCGGCACTCCTGCTCCCTACAGTCTTCCCACCAGCTTTAGTGGCAGCTTTCAGCAGCCTG 1480
.|||||..|.|||||.|||||||||||.|..||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1311 TATGCCAGCAGGATTTGGCACTCCTGCCCAGTATAGTCTCCCTACCAGCTTTAGTGGCAGTTTCCAGCAGCCTG 1384
Query 1481 CCTTTCCAGCCCAAGCAGCTTTCCCTCAACAGACAGCTTTTTCTCAACAGCCCAATGGTGCAGGTTTTGCAGCA 1554
||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||| |||||.||..|.
Sbjct 1385 CCTTCCCAGCCCAAGCAGCTTTCCCTCAGCAGACAGCCTTTTCTCAACAGCCCAAT------GGTTTCGCCACG 1452
Query 1555 TTTGGACAAACAAAGCCAGTAGTAACCCCTTTTGGTCAAGTTGCAGCTGCTGGAGTATCTAGTAATCCTTTTAT 1628
||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1453 TTTGGACAAACAAAACCAGTGGTAACCCCTTTCGGTCAAGTAGCAGCTGCTGGAGTGTCTAGTAATCCTTTTAT 1526
Query 1629 GACTGGTGCACCAACAGGACAATTTCCAACAGGAAGCTCATCAACCAATCCTTTCTTA 1686
|||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1527 GACTGGTGCGCCGACAGGACAACTTCCAACAGGAAGCTCATCCACCAACCCTTTCTTA 1584