Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468166
• Subject: XM_006712478.4
• Aligned Length: 1806
• Identities: 1684
• Gaps: 120

Alignment

Query    1  ATGGCGGCCAGCGCGAAGCGGAAGCAGGAGGAGAAGCACCTGAAGATGCTGCGGGACATGACCGGCCTCCCGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCCAGCGCGAAGCGGAAGCAGGAGGAGAAGCACCTGAAGATGCTGCGGGACATGACCGGCCTCCCGCA  74

Query   75  CAACCGAAAGTGCTTCGACTGCGGCCAGCGCGGCCCCACCTACGTTAACATGACGGTCGGCTCCTTCGTGTGTA  148
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAACCGAAAGTGCTTCGACTGCGACCAGCGCGGCCCCACCTACGTTAACATGACGGTCGGCTCCTTCGTGTGTA  148

Query  149  CCTCCTGCTCCGGCAGCCTGCGAGGATTAAATCCACCACACAGGGTGAAATCTATCTCCATGACAACATTCACA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTCCTGCTCCGGCAGCCTGCGAGGATTAAATCCACCACACAGGGTGAAATCTATCTCCATGACAACATTCACA  222

Query  223  CAACAGGAAATTGAATTCTTACAAAAACATGGAAATGAAGTCTGTAAACAGATTTGGCTAGGATTATTTGATGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAACAGGAAATTGAATTCTTACAAAAACATGGAAATGAAGTCTGTAAACAGATTTGGCTAGGATTATTTGATGA  296

Query  297  TAGATCTTCAGCAATTCCAGACTTCAGGGATCCACAAAAAGTGAAAGAGTTTCTACAAGAAAAGTATGAAAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAGATCTTCAGCAATTCCAGACTTCAGGGATCCACAAAAAGTGAAAGAGTTTCTACAAGAAAAGTATGAAAAGA  370

Query  371  AAAGATGGTATGTCCCGCCAGAACAAGCCAAAGTCGTGGCATCAGTTCATGCATCTATTTCAGGGTCCTCTGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAGATGGTATGTCCCGCCAGAACAAGCCAAAGTCGTGGCATCAGTTCATGCATCTATTTCAGGGTCCTCTGCC  444

Query  445  AGTAGCACAAGCAGCACACCTGAGGTCAAACCACTGAAATCTCTTTTAGGGGATTCTGCACCAACACTGCACTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTAGCACAAGCAGCACACCTGAGGTCAAACCACTGAAATCTCTTTTAGGGGATTCTGCACCAACACTGCACTT  518

Query  519  AAATAAGGGCACACCTAGTCAGTCCCCAGTTGTAGGTCGTTCTCAAGGGCAGCAGCAGGAGAAGAAGCAATTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAATAAGGGCACACCTAGTCAGTCCCCAGTTGTAGGTCGTTCTCAAGGGCAGCAGCAGGAGAAGAAGCAATTTG  592

Query  593  ACCTTTTAAGTGATCTCGGCTCAGACATCTTTGCTGCTCCAGCTCCTCAGTCAACAGCTACAGCCAATTTTGCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCTTTTAAGTGATCTCGGCTCAGACATCTTTGCTGCTCCAGCTCCTCAGTCAACAGCTACAGCCAATTTTGCT  666

Query  667  AACTTTGCACATTTCAACAGTCATGCAGCTCAGAATTCTGCAAATGCAGATTTTGCAAACTTTGATGCATTTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACTTTGCACATTTCAACAGTCATGCAGCTCAGAATTCTGCAAATGCAGATTTTGCAAACTTTGATGCATTTGG  740

Query  741  ACAGTCTAGTGGTTCGAGTAATTTTGGAGGTTTCCCCACAGCAAGTCACTCTCCTTTTCAGCCCCAAACTACAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACAGTCTAGTGGTTCGAGTAATTTTGGAGGTTTCCCCACAGCAAGTCACTCTCCTTTTCAGCCCCAAACTACAG  814

Query  815  ------------------------------------------------------------------------GT  816
                                                                                    ||
Sbjct  815  CATTTAGAATGCTTTCATCTAGCTGCAGTTTTGGTGAATTTACTTCAGCTTTTCCTCTTCAGGCTACCCACAGT  888

Query  817  GGAAGTGCTGCATCAGTAAATGCTAATTTTGCTCATTTTGATAACTTCCCCAAATCCTCCAGTGCTGATTTTGG  890
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGAAGTGCTGCATCAGTAAATGCTAATTTTGCTCATTTTGATAACTTCCCCAAATCCTCCAGTGCTGATTTTGG  962

Query  891  AACCTTCAATACTTCCCAGAGTCATCAAACAGCATCAGCTGTTAGTAAAGTTTCAACGAACAAAGCTGGTTTAC  964
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AACCTTCAATACTTCCCAGAGTCATCAAACAGCATCAGCTGTTAGTAAAGTTTCAACGAACAAAGCTGGTTTAC  1036

Query  965  AGACTGCAGACAAATATGCAGCACTTGCTAATTTAGACAATATCTTCAGTGCCGGGCAAGGTGGTGATCAGGGA  1038
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGACTGCAGACAAATATGCAGCACTTGCTAATTTAGACAATATCTTCAGTGCCGGGCAAGGTGGTGATCAGGGA  1110

Query 1039  AGTGGCTTTGGGACCACAGGTAAAGCTCCTGTTGGTTCTGTGGTTTCAGTTCCCAGTCAGTCAAGTGCATCTTC  1112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGTGGCTTTGGGACCACAGGTAAAGCTCCTGTTGGTTCTGTGGTTTCAGTTCCCAGTCAGTCAAGTGCATCTTC  1184

Query 1113  AGACAAGTATGCAGCTCTGGCAGAACTAGACAGCGTTTTCAGTTCTGCAGCCACCTCCAGTAATGCGTATACTT  1186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGACAAGTATGCAGCTCTGGCAGAACTAGACAGCGTTTTCAGTTCTGCAGCCACCTCCAGTAATGCGTATACTT  1258

Query 1187  CCACAAGTAATGCTAGCAGCAATGTTTTTGGAACAGTGCCAGTGGTTGCTTCTGCACAGACACAGCCTGCTTCA  1260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCACAAGTAATGCTAGCAGCAATGTTTTTGGAACAGTGCCAGTGGTTGCTTCTGCACAGACACAGCCTGCTTCA  1332

Query 1261  TCAAGTGTGCCTGCTCCATTTGGAGCTACGCCTTCCACAAATCCATTTGTTGCTGCTGCTGGTCCTTCTGTGGC  1334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCAAGTGTGCCTGCTCCATTTGGAGCTACGCCTTCCACAAATCCATTTGTTGCTGCTGCTGGTCCTTCTGTGGC  1406

Query 1335  ATCTTCTACAAACCCATTTCAGACCAATGCCAGAGGAGCAACA-------------------------------  1377
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct 1407  ATCTTCTACAAACCCATTTCAGACCAATGCCAGAGGAGCAACAGGCCTTTCTGGAGCAATGCATTCTCAAGTGT  1480

Query 1378  -----------------GCGGCAACCTTTGGCACTGCATCCATGAGCATGCCCACGGGATTCGGCACTCCTGCT  1434
                             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTCCTCACGCTCATTTTGCGGCAACCTTTGGCACTGCATCCATGAGCATGCCCACAGGATTCGGCACTCCTGCT  1554

Query 1435  CCCTACAGTCTTCCCACCAGCTTTAGTGGCAGCTTTCAGCAGCCTGCCTTTCCAGCCCAAGCAGCTTTCCCTCA  1508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCCTACAGTCTTCCCACCAGCTTTAGTGGCAGCTTTCAGCAGCCTGCCTTTCCAGCCCAAGCAGCTTTCCCTCA  1628

Query 1509  ACAGACAGCTTTTTCTCAACAGCCCAATGGTGCAGGTTTTGCAGCATTTGGACAAACAAAGCCAGTAGTAACCC  1582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACAGACAGCTTTTTCTCAACAGCCCAATGGTGCAGGTTTTGCAGCATTTGGACAAACAAAGCCAGTAGTAACCC  1702

Query 1583  CTTTTGGTCAAGTTGCAGCTGCTGGAGTATCTAGTAATCCTTTTATGACTGGTGCACCAACAGGACAATTTCCA  1656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTTTTGGTCAAGTTGCAGCTGCTGGAGTATCTAGTAATCCTTTTATGACTGGTGCACCAACAGGACAATTTCCA  1776

Query 1657  ACAGGAAGCTCATCAACCAATCCTTTCTTA  1686
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ACAGGAAGCTCATCAACCAATCCTTTCTTA  1806