Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468178
• Subject: XM_011521447.3
• Aligned Length: 1209
• Identities: 896
• Gaps: 312

Alignment

Query    1  ATGGAGCCGGTAGGCTGCTGCGGCGAGTGCCGCGGCTCCTCCGTAGACCCGCGGAGCACCTTCGTGTTGAGTAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCTGGCGGAGGTGGTGGAGCGTGTGCTCACCTTCCTGCCCGCCAAGGCGTTGCTGCGGGTGGCCTGCGTGTGCC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GCTTATGGAGGGAGTGTGTGCGCAGAGTATTGCGGACCCATCGGAGCGTAACCTGGATCTCCGCAGGCCTGGCG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GAGGCCGGCCACCTGGAGGGGCATTGCTTGGTTCGCGTGGTAGCAGAGGAGCTTGAGAATGTTCGCATCTTACC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  ACATACAGTTCTTTACATGGCTGATTCAGAAACTTTCATTAGTCTGGAAGAGTGTCGTGGCCATAAGAGAGCAA  370
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------ATGGCTGATTCAGAAACTTTCATTAGTCTGGAAGAGTGTCGTGGCCATAAGAGAGCAA  58

Query  371  GGAAAAGAACTAGTATGGAAACAGCACTTGCCCTTGAGAAGCTATTCCCCAAACAATGCCAAGTCCTTGGGATT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   59  GGAAAAGAACTAGTATGGAAACAGCACTTGCCCTTGAGAAGCTATTCCCCAAACAATGCCAAGTCCTTGGGATT  132

Query  445  GTGACCCCAGGAATTGTAGTGACTCCAATGGGATCAGGTAGCAATCGACCTCAGGAAATAGAAATTGGAGAATC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  133  GTGACCCCAGGAATTGTAGTGACTCCAATGGGATCAGGTAGCAATCGACCTCAGGAAATAGAAATTGGAGAATC  206

Query  519  TGGTTTTGCTTTATTATTCCCTCAAATTGAAGGAATAAAAATACAACCCTTTCATTTTATTAAGGATCCAAAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  207  TGGTTTTGCTTTATTATTCCCTCAAATTGAAGGAATAAAAATACAACCCTTTCATTTTATTAAGGATCCAAAGA  280

Query  593  ATTTAACATTAGAAAGACATCAACTCACTGAAGTAGGTCTTTTAGATAACCCTGAACTTCGTGTGGTCCTTGTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  281  ATTTAACATTAGAAAGACATCAACTCACTGAAGTAGGTCTTTTAGATAACCCTGAACTTCGTGTGGTCCTTGTC  354

Query  667  TTTGGTTATAATTGCTGTAAGGTGGGAGCCAGTAATTATCTGCAGCAAGTAGTCAGCACTTTCAGTGATATGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  355  TTTGGTTATAATTGCTGTAAGGTGGGAGCCAGTAATTATCTGCAGCAAGTAGTCAGCACTTTCAGTGATATGAA  428

Query  741  TATCATCTTGGCTGGAGGCCAGGTGGACAACCTGTCATCACTGACTTCTGAAAAGAACCCTCTGGATATTGATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  429  TATCATCTTGGCTGGAGGCCAGGTGGACAACCTGTCATCACTGACTTCTGAAAAGAACCCTCTGGATATTGATG  502

Query  815  CCTCGGGTGTGGTTGGACTGTCATTTAGTGGACACCGAATCCAGAGTGCCACTGTGCTCCTCAACGAGGACGTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  503  CCTCGGGTGTGGTTGGACTGTCATTTAGTGGACACCGAATCCAGAGTGCCACTGTGCTCCTCAACGAGGACGTC  576

Query  889  AGTGATGAGAAGACTGCTGAGGCTGCGATGCAGCGCCTCAAAGCGGCCAACATTCCAGAGCATAACACCATTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  577  AGTGATGAGAAGACTGCTGAGGCTGCGATGCAGCGCCTCAAAGCGGCCAACATTCCAGAGCATAACACCATTGG  650

Query  963  CTTCATGTTTGCATGCGTTGGCAGGGGCTTTCAGTATTACAGAGCCAAGGGGAATGTTGAGGCTGATGCATTTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  651  CTTCATGTTTGCATGCGTTGGCAGGGGCTTTCAGTATTACAGAGCCAAGGGGAATGTTGAGGCTGATGCATTTA  724

Query 1037  GAAAGTTTTTTCCTAGTGTTCCCTTATTCGGCTTCTTTGGAAATGGAGAAATTGGATGTGATCGGATAGTCACT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  725  GAAAGTTTTTTCCTAGTGTTCCCTTATTCGGCTTCTTTGGAAATGGAGAAATTGGATGTGATCGGATAGTCACT  798

Query 1111  GGGAACTTTATATTGAGGAAATGTAATGAGGTAAAAGATGATGATCTGTTTCATAGCTATACAACAATAATGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  799  GGGAACTTTATATTGAGGAAATGTAATGAGGTAAAAGATGATGATCTGTTTCATAGCTATACAACAATAATGGC  872

Query 1185  ACTCATACATCTGGGGTCATTTAAA  1209
            ||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  873  ACTCATACATCTGGGGTCATCTAAA  897