Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468196
• Subject: NM_016116.3
• Aligned Length: 1280
• Identities: 1036
• Gaps: 235

Alignment

Query    1  ATGGACGGCACCACTGCCCCTGTCACTAAATCTGGAGCTGCCAAGTTAGTTAAGAGAAATTTCCTTGAGGCGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGGCACCACTGCCCCTGTCACTAAATCTGGAGCTGCCAAGTTAGTTAAGAGAAATTTCCTTGAGGCGCT  74

Query   75  AAAGTCCAATGACTTCGGAAAATTGAAGGCTATTTTGATCCAAAGGCAAATAGATGTGGACACTGTTTTTGAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAAGTCCAATGACTTCGGAAAATTGAAGGCTATTTTGATCCAAAGGCAAATAGATGTGGACACTGTTTTTGAAG  148

Query  149  TCGAAGATGAGAATATGGTTTTGGCATCTTATAAACAAGGTTACTGGTTGCCTAGCTATAAATTGAAGTCTTCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCGAAGATGAGAATATGGTTTTGGCATCTTATAAACAAGGTTACTGGTTGCCTAGCTATAAATTGAAGTCTTCC  222

Query  223  TGGGCCACAGGCCTCCATCTCTCTGTCTTGTTTGGCCATGTGGAATGTCTTCTGGTGCTACTGGACCACAATGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGGCCACAGGCCTCCATCTCTCTGTCTTGTTTGGCCATGTGGAATGTCTTCTGGTGCTACTGGACCACAATGC  296

Query  297  TACAATCAACTGTAGACCCAATGGGAAAACCCCTCTTCACGTGGCTTGTGAAATGGCCAATGTGGATTGTGTTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TACAATCAACTGTAGACCCAATGGGAAAACCCCTCTTCACGTGGCTTGTGAAATGGCCAATGTGGATTGTGTTA  370

Query  371  AGATCCTCTGTGATCGTGGGGCAAAGCTCAATTGCTACTCCTTAAGTGGACACACAGCTTTGCACTTTTGTACA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGATCCTCTGTGATCGTGGGGCAAAGCTCAATTGCTACTCCTTAAGTGGACACACAGCTTTGCACTTTTGTACA  444

Query  445  ACTCCAAGTTCCATTCTCTGTGCCAAGCAATTGGTTTGGAGAGGGGCGAATGTGAACATGAAGACCAACAACCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACTCCAAGTTCCATTCTCTGTGCCAAGCAATTGGTTTGGAGAGGGGCGAATGTGAACATGAAGACCAACAACCA  518

Query  519  AGATGAGGAGACGCCCTTGCACACGGCTGCCCACTTCGGCCTTTCGGAGCTGGTGGCCTTCTACGTGGAACACG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGATGAGGAGACGCCCTTGCACACGGCTGCCCACTTCGGCCTTTCGGAGCTGGTGGCCTTCTACGTGGAACACG  592

Query  593  GGGCCATAGTGGACAGCGTGAATGCCCACATGGAGACCCCCCTGGCCATCGCCGCCTACTGGGCCCTCCGCTTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGCCATAGTGGACAGCGTGAATGCCCACATGGAGACCCCCCTGGCCATCGCCGCCTACTGGGCCCTCCGCTTT  666

Query  667  AAGGAGCAGGAGTACAGCACGGAGCACCACCTGGTCTGCCGCATGCTGCTTGACTACAAAGCCGAAGTCAATGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGGAGCAGGAGTACAGCACGGAGCACCACCTGGTCTGCCGCATGCTGCTTGACTACAAAGCCGAAGTCAATGC  740

Query  741  CCGAGATGACGACTTTAAATCTCCCCTCCACAAGGCAGCCTGGAACTGTGACCACGTGCTCATGCACATGATGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCGAGATGACGACTTTAAATCTCCCCTCCACAAGGCAGCCTGGAACTGTGACCACGTGCTCATGCACATGATGC  814

Query  815  TGGAAGCTGGCGCCGAAGCCAATCTCATGGATATCAACGGCTGTGCTGCCATCCAGTACGTGCTGAAGGTCACC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGAAGCTGGCGCCGAAGCCAATCTCATGGATATCAACGGCTGTGCTGCCATCCAGTACGTGCTGAAGGTCACC  888

Query  889  TCCGTGCGCCCTGCTGCCCAGCCTGAGATCTGCTACCAGCTCCTGTTGAACCATGGGGCTGCCCGAATATACCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCCGTGCGCCCTGCTGCCCAGCCTGAGATCTGCTACCAGCTCCTGTTGAACCATGGGGCTGCCCGAATATACCC  962

Query  963  TCCACAGTTCCATAAGGTG----AGGCTCTGCC---------------------CAGTGGT-------------  998
            |||||||||||||||||||    |||| |||||                     .|||.||             
Sbjct  963  TCCACAGTTCCATAAGGTGATACAGGC-CTGCCATTCTTGTCCTAAAGCAATTGAAGTTGTAGTCAATGCCTAT  1035

Query  999  -----CAGCAG------------GTTGAGGAAGA------------------TT---CAAA---TGG-------  1024
                 ||.|||            ||.|| |||||                  ||   .|||   |||       
Sbjct 1036  GAACACATCAGATGGAACACAAAGTGGA-GAAGAGCTATCCCCGATGATGACTTGGAGAAATACTGGGATTTTT  1108

Query 1025  --CAGCCT--------TGTCTG----AAATCTCCAAG-------------------------------------  1047
              ||..||        |||.||    ||.||||||||                                     
Sbjct 1109  ACCACTCTCTCTTTACTGTGTGCTGTAACTCTCCAAGGACTCTCATGCACTTATCGAGATGTGCCATTAGAAGA  1182

Query 1048  --------------------------------------------------------------------------  1047
                                                                                      
Sbjct 1183  ACATTACACAACAGATGCCATAGAGCAATTCCTTTGCTTTCCCTCCCATTGTCATTGAAAAAGTACTTGCTTTT  1256

Query 1048  ----------------------  1047
                                  
Sbjct 1257  AGAGCCAGAGGGAATTATTTAT  1278