Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468220
• Subject: NM_001310454.1
• Aligned Length: 1290
• Identities: 765
• Gaps: 342

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGCAGAAGCAAACGTGACAACAATTTTTATAGTGTAGAGATTGGAGATTCTACATTCACAGTCCTAAAACG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ATACCAGAATTTAAAGCCTATAGGCTCAGGAGCTCAAGGAATAGTGTGTGCAGCTTATGATGCCATTCTTGAAA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GAAATGTTGCAATCAAGAAGCTCAGCCGGCCATTTCAGAATCAGACCCATGCTAAGCGCGCCTACCGAGAACTA  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GTTCTTATGAAGTGTGTTAATCACAAAAATATAATTGGCCTTTTGAATGTTTTCACACCACAGAAATCCCTAGA  296

Query    1  -------------------------ATGGAACTGATGGATGCCAA-CTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTA  48
                                     |||||.||.||||||||.|| ||| ||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  297  AGAATTTCAAGATGTTTACATAGTCATGGAGCTCATGGATGCAAATCTT-TGCCAAGTGATTCAGATGGAGTTA  369

Query   49  GACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAATGTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTAT  122
            ||.|||||..|||||||.|||||.||.||.||||||.|||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  370  GATCATGAAAGAATGTCCTACCTTCTCTATCAAATGCTGTGTGGAATCAAGCACCTTCACTCTGCTGGAATTAT  443

Query  123  TCACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCAAGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGG  196
            |||..||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||.||.||||||||||
Sbjct  444  TCATCGGGACTTAAAGCCTAGTAATATAGTAGTCAAATCAGACTGCACTTTGAAGATTCTTGATTTTGGACTGG  517

Query  197  CCAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCATATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATC  270
            |.|||||.|||||.||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct  518  CGAGGACTGCAGGAACGAGTTTTATGATGACGCCTTATGTGGTGACTCGCTACTACAGAGCACCAGAGGTCATT  591

Query  271  CTGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTGGATATATGGTCTGTGGGATGCATTATGGGAGAAATGGTTCGCCACAA  344
            ||.||.|||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  592  CTCGGCATGGGCTACAAGGAGAACGTGGACTTATGGTCTGTGGGGTGCATTATGGGAGAAATGGTTTGCCACAA  665

Query  345  AATCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATTGACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAG  418
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||.|
Sbjct  666  AATCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATTGATCAGTGGAATAAAGTTATTGAACAGCTCGGAACACCTTGTCCTG  739

Query  419  AATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGTAAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTC  492
            ||||||||||||||.|.|||||.||||||||.|..|||||.||.||..||||.||.||.||.|||...|.|||.
Sbjct  740  AATTCATGAAGAAACTACAACCAACAGTAAGGACTTATGTTGAAAACAGGCCTAAATACGCTGGATATAGCTTT  813

Query  493  CCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGA  566
            ...|||||.|||||.|||...||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||.||.||
Sbjct  814  GAGAAACTGTTCCCCGATGTGCTTTTCCCAGCTGACTCAGAGCATAACAAACTTAAAGCCAGTCAGGCAAGAGA  887

Query  567  CTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGACCCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACA  640
            .|||||.||.||.||||||||.||.||..||.|.|||||.||.||.||.||.||.||..|.|||||.||.||||
Sbjct  888  TTTGTTATCCAAAATGCTAGTAATAGATGCATCCAAAAGGATCTCCGTAGATGAAGCTCTCCAGCACCCATACA  961

Query  641  TCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGTGGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGA  714
            ||||||||||||||||.||..|.||||..||.||.||.|||||..||||....|||||||||||.|||||.||.
Sbjct  962  TCAACGTCTGGTATGATCCTTCAGAAGCAGAAGCCCCACCACCAAAGATCCCGGACAAGCAGTTAGATGAGAGG  1035

Query  715  GAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAACTTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGG  788
            ||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||.||||||.|||..||.|||...|||||.|||||
Sbjct 1036  GAGCACACAATAGAGGAGTGGAAAGAACTGATATACAAGGAGGTAATGGATTTGGAGGAACGAACTAAGAATGG  1109

Query  789  TGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCAGGTGCAGCAGTGAACA---GCAGTGAGAGTCTC--CCTCCATCCT-  856
            .||..|||.|||.|||||.|||||||.||||||||||.|||.||   ||        ||||  |.||||||.| 
Sbjct 1110  AGTCATAAGAGGGCAGCCGTCTCCTTTAGGTGCAGCAATGATCAATGGC--------TCTCAGCATCCATCGTC  1175

Query  857  -----CGTCTGTCAATGACATCTCCTCCATGTCCACCGACCAGACCCTGGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGG  925
                 ||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|.|||..||||.||.||.||.||||||||.||.|
Sbjct 1176  TTCGCCGTCTGTCAATGACATGTCTTCAATGTCCACAGATCCGACTTTGGCCTCGGATACAGACAGCAGTCTAG  1249

Query  926  AAGCCTCGGCAGGACCCCTGGGTTGTTGCAGG  957
            ||||.||.||.|||||.|||||.||.||.||.
Sbjct 1250  AAGCATCAGCTGGACCTCTGGGCTGCTGTAGA  1281