Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468228
• Subject: NM_001320643.3
• Aligned Length: 2349
• Identities: 2349
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGTTATCATGTCGGAGTTCAGCGCGGACCCCGCGGGCCAGGGTCAGGGCCAGCAGAAGCCCCTCCGGGTGGG  74
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Sbjct    1  ATGGTTATCATGTCGGAGTTCAGCGCGGACCCCGCGGGCCAGGGTCAGGGCCAGCAGAAGCCCCTCCGGGTGGG  74

Query   75  TTTTTACGACATCGAGCGGACCCTGGGCAAAGGCAACTTCGCGGTGGTGAAGCTGGCGCGGCATCGAGTCACCA  148
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Sbjct   75  TTTTTACGACATCGAGCGGACCCTGGGCAAAGGCAACTTCGCGGTGGTGAAGCTGGCGCGGCATCGAGTCACCA  148

Query  149  AAACGCAGGTTGCAATAAAAATAATTGATAAAACACGATTAGATTCAAGCAATTTGGAGAAAATCTATCGTGAG  222
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Sbjct  149  AAACGCAGGTTGCAATAAAAATAATTGATAAAACACGATTAGATTCAAGCAATTTGGAGAAAATCTATCGTGAG  222

Query  223  GTTCAGCTGATGAAGCTTCTGAACCATCCACACATCATAAAGCTTTACCAGGTTATGGAAACAAAGGACATGCT  296
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Sbjct  223  GTTCAGCTGATGAAGCTTCTGAACCATCCACACATCATAAAGCTTTACCAGGTTATGGAAACAAAGGACATGCT  296

Query  297  TTACATCGTCACTGAATTTGCTAAAAATGGAGAAATGTTTGATTATTTGACTTCCAACGGGCACCTGAGTGAGA  370
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Sbjct  297  TTACATCGTCACTGAATTTGCTAAAAATGGAGAAATGTTTGATTATTTGACTTCCAACGGGCACCTGAGTGAGA  370

Query  371  ACGAGGCGCGGAAGAAGTTCTGGCAAATCCTGTCGGCCGTGGAGTACTGTCACGACCATCACATCGTCCACCGG  444
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Sbjct  371  ACGAGGCGCGGAAGAAGTTCTGGCAAATCCTGTCGGCCGTGGAGTACTGTCACGACCATCACATCGTCCACCGG  444

Query  445  GACCTCAAGACCGAGAACCTCCTGCTGGATGGCAACATGGACATCAAGCTGGCAGATTTTGGATTTGGGAATTT  518
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Sbjct  445  GACCTCAAGACCGAGAACCTCCTGCTGGATGGCAACATGGACATCAAGCTGGCAGATTTTGGATTTGGGAATTT  518

Query  519  CTACAAGTCAGGAGAGCCTCTGTCCACGTGGTGTGGGAGCCCCCCGTATGCCGCCCCGGAAGTCTTTGAGGGGA  592
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Sbjct  519  CTACAAGTCAGGAGAGCCTCTGTCCACGTGGTGTGGGAGCCCCCCGTATGCCGCCCCGGAAGTCTTTGAGGGGA  592

Query  593  AGGAGTATGAAGGCCCCCAGCTGGACATCTGGAGCCTGGGCGTGGTGCTGTACGTCCTGGTCTGCGGTTCTCTC  666
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Sbjct  593  AGGAGTATGAAGGCCCCCAGCTGGACATCTGGAGCCTGGGCGTGGTGCTGTACGTCCTGGTCTGCGGTTCTCTC  666

Query  667  CCCTTCGATGGGCCTAACCTGCCGACGCTGAGACAGCGGGTGCTGGAGGGCCGCTTCCGCATCCCCTTCTTCAT  740
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Sbjct  667  CCCTTCGATGGGCCTAACCTGCCGACGCTGAGACAGCGGGTGCTGGAGGGCCGCTTCCGCATCCCCTTCTTCAT  740

Query  741  GTCTCAAGACTGTGAGAGCCTGATCCGCCGCATGCTGGTGGTGGACCCCGCCAGGCGCATCACCATCGCCCAGA  814
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Sbjct  741  GTCTCAAGACTGTGAGAGCCTGATCCGCCGCATGCTGGTGGTGGACCCCGCCAGGCGCATCACCATCGCCCAGA  814

Query  815  TCCGGCAGCACCGGTGGATGCGGGCTGAGCCCTGCTTGCCGGGACCCGCCTGCCCCGCCTTCTCCGCACACAGC  888
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Sbjct  815  TCCGGCAGCACCGGTGGATGCGGGCTGAGCCCTGCTTGCCGGGACCCGCCTGCCCCGCCTTCTCCGCACACAGC  888

Query  889  TACACCTCCAACCTGGGCGACTACGATGAGCAGGCGCTGGGTATCATGCAGACCCTGGGCGTGGACCGGCAGAG  962
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Sbjct  889  TACACCTCCAACCTGGGCGACTACGATGAGCAGGCGCTGGGTATCATGCAGACCCTGGGCGTGGACCGGCAGAG  962

Query  963  GACGGTGGAGTCACTGCAAAACAGCAGCTATAACCACTTTGCTGCCATTTATTACCTCCTCCTTGAGCGGCTCA  1036
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Sbjct  963  GACGGTGGAGTCACTGCAAAACAGCAGCTATAACCACTTTGCTGCCATTTATTACCTCCTCCTTGAGCGGCTCA  1036

Query 1037  AGGAGTATCGGAATGCCCAGTGCGCCCGCCCCGGGCCTGCCAGGCAGCCGCGGCCTCGGAGCTCGGACCTCAGT  1110
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Sbjct 1037  AGGAGTATCGGAATGCCCAGTGCGCCCGCCCCGGGCCTGCCAGGCAGCCGCGGCCTCGGAGCTCGGACCTCAGT  1110

Query 1111  GGTTTGGAGGTGCCTCAGGAAGGTCTTTCCACCGACCCTTTCCGACCTGCCTTGCTGTGCCCGCAGCCGCAGAC  1184
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Sbjct 1111  GGTTTGGAGGTGCCTCAGGAAGGTCTTTCCACCGACCCTTTCCGACCTGCCTTGCTGTGCCCGCAGCCGCAGAC  1184

Query 1185  CTTGGTGCAGTCCGTCCTCCAGGCCGAGATGGACTGTGAGCTCCAGAGCTCGCTGCAGTGGCCCTTGTTCTTCC  1258
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Sbjct 1185  CTTGGTGCAGTCCGTCCTCCAGGCCGAGATGGACTGTGAGCTCCAGAGCTCGCTGCAGTGGCCCTTGTTCTTCC  1258

Query 1259  CGGTGGATGCCAGCTGCAGCGGAGTGTTCCGGCCCCGGCCCGTGTCCCCAAGCAGCCTGCTGGACACAGCCATC  1332
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Sbjct 1259  CGGTGGATGCCAGCTGCAGCGGAGTGTTCCGGCCCCGGCCCGTGTCCCCAAGCAGCCTGCTGGACACAGCCATC  1332

Query 1333  AGTGAGGAGGCCAGGCAGGGGCCGGGCCTAGAGGAGGAGCAGGACACGCAGGAGTCCCTGCCCAGCAGCACGGG  1406
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Sbjct 1333  AGTGAGGAGGCCAGGCAGGGGCCGGGCCTAGAGGAGGAGCAGGACACGCAGGAGTCCCTGCCCAGCAGCACGGG  1406

Query 1407  CCGGAGGCACACCCTGGCCGAGGTCTCCACCCGCCTCTCCCCACTCACCGCGCCATGTATAGTCGTCTCCCCCT  1480
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Sbjct 1407  CCGGAGGCACACCCTGGCCGAGGTCTCCACCCGCCTCTCCCCACTCACCGCGCCATGTATAGTCGTCTCCCCCT  1480

Query 1481  CCACCACGGCAAGTCCTGCAGAGGGAACCAGCTCTGACAGTTGTCTGACCTTCTCTGCGAGCAAAAGCCCCGCG  1554
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Sbjct 1481  CCACCACGGCAAGTCCTGCAGAGGGAACCAGCTCTGACAGTTGTCTGACCTTCTCTGCGAGCAAAAGCCCCGCG  1554

Query 1555  GGGCTCAGTGGCACCCCGGCCACTCAGGGGCTGCTGGGCGCCTGCTCCCCGGTCAGGCTGGCCTCGCCCTTCCT  1628
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Sbjct 1555  GGGCTCAGTGGCACCCCGGCCACTCAGGGGCTGCTGGGCGCCTGCTCCCCGGTCAGGCTGGCCTCGCCCTTCCT  1628

Query 1629  GGGGTCGCAGTCCGCCACCCCAGTGCTGCAGGCTCAGGGGGGCTTGGGAGGAGCTGTTCTGCTCCCTGTCAGCT  1702
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Sbjct 1629  GGGGTCGCAGTCCGCCACCCCAGTGCTGCAGGCTCAGGGGGGCTTGGGAGGAGCTGTTCTGCTCCCTGTCAGCT  1702

Query 1703  TCCAGGAGGGACGGCGGGCGTCGGACACCTCACTGACTCAAGGGCTGAAGGCCTTTCGGCAGCAGCTGAGGAAG  1776
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Sbjct 1703  TCCAGGAGGGACGGCGGGCGTCGGACACCTCACTGACTCAAGGGCTGAAGGCCTTTCGGCAGCAGCTGAGGAAG  1776

Query 1777  ACCACGCGGACCAAAGGGTTTCTGGGACTGAACAAAATCAAGGGGCTGGCTCGCCAGGTGTGCCAGGTCCCTGC  1850
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Sbjct 1777  ACCACGCGGACCAAAGGGTTTCTGGGACTGAACAAAATCAAGGGGCTGGCTCGCCAGGTGTGCCAGGTCCCTGC  1850

Query 1851  CAGCCGGGCCAGCAGGGGCGGCCTGAGCCCCTTCCACGCCCCTGCACAGAGCCCAGGCCTGCACGGCGGCGCAG  1924
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Sbjct 1851  CAGCCGGGCCAGCAGGGGCGGCCTGAGCCCCTTCCACGCCCCTGCACAGAGCCCAGGCCTGCACGGCGGCGCAG  1924

Query 1925  CCGGCAGCCGGGAGGGCTGGAGCCTGCTGGAGGAGGTGCTAGAGCAGCAGAGGCTGCTCCAGTTACAGCACCAC  1998
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Sbjct 1925  CCGGCAGCCGGGAGGGCTGGAGCCTGCTGGAGGAGGTGCTAGAGCAGCAGAGGCTGCTCCAGTTACAGCACCAC  1998

Query 1999  CCGGCCGCTGCACCCGGCTGCTCCCAGGCCCCCCAGCCGGCCCCTGCCCCGTTTGTGATCGCCCCCTGTGATGG  2072
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Sbjct 1999  CCGGCCGCTGCACCCGGCTGCTCCCAGGCCCCCCAGCCGGCCCCTGCCCCGTTTGTGATCGCCCCCTGTGATGG  2072

Query 2073  CCCTGGGGCTGCCCCGCTCCCCAGCACCCTCCTCACGTCGGGGCTCCCGCTGCTGCCGCCCCCACTCCTGCAGA  2146
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Sbjct 2073  CCCTGGGGCTGCCCCGCTCCCCAGCACCCTCCTCACGTCGGGGCTCCCGCTGCTGCCGCCCCCACTCCTGCAGA  2146

Query 2147  CCGGCGCGTCCCCGGTGGCCTCAGCGGCGCAGCTCCTGGACACACACCTGCACATTGGCACCGGCCCCACCGCC  2220
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Sbjct 2147  CCGGCGCGTCCCCGGTGGCCTCAGCGGCGCAGCTCCTGGACACACACCTGCACATTGGCACCGGCCCCACCGCC  2220

Query 2221  CTCCCCGCTGTGCCCCCACCACGCCTGGCCAGGCTGGCCCCAGGTTGTGAGCCCCTGGGGCTGCTGCAGGGGGA  2294
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Sbjct 2221  CTCCCCGCTGTGCCCCCACCACGCCTGGCCAGGCTGGCCCCAGGTTGTGAGCCCCTGGGGCTGCTGCAGGGGGA  2294

Query 2295  CTGTGAGATGGAGGACCTGATGCCCTGCTCCCTAGGCACGTTTGTCCTGGTGCAG  2349
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Sbjct 2295  CTGTGAGATGGAGGACCTGATGCCCTGCTCCCTAGGCACGTTTGTCCTGGTGCAG  2349