Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468230
• Subject: NM_001202855.3
• Aligned Length: 1514
• Identities: 1351
• Gaps: 16

Alignment

Query    1  ATGGACCTCATCCCAAATTTGGCGGTGGAAACCTGGCTTCTCCTGGCTGTCAGCCTGGTGCTCCTCTATCTATA  74
            ||||..|||||||||.|.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTCTCATCCCAGACTTGGCCATGGAAACCTGGCTTCTCCTGGCTGTCAGCCTGGTGCTCCTCTATCTATA  74

Query   75  TGGGACCCGTACACATGGACTTTTTAAGAGACTGGGAATTCCAGGGCCCACACCTCTGCCTTTGTTGGGAAATG  148
            |||.||||.|.||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct   75  TGGAACCCATTCACATGGACTTTTTAAGAAGCTTGGAATTCCAGGGCCCACACCTCTGCCTTTTTTGGGAAATA  148

Query  149  TTTTGTCCTATCGTCAGGGTCTCTGGAAATTTGACACAGAGTGCTATAAAAAGTATGGAAAAATGTGGGGAACG  222
            ||||||||||.|.|.||||..|.||.|..|||||||..||.||..|||||||||||||||||.|||||||....
Sbjct  149  TTTTGTCCTACCATAAGGGCTTTTGTATGTTTGACATGGAATGTCATAAAAAGTATGGAAAAGTGTGGGGCTTT  222

Query  223  TATGAAGGTCAACTCCCTGTGCTGGCCATCACAGATCCCGACGTGATCAGAACAGTGCTAGTGAAAGAATGTTA  296
            |||||.|||||||..|||||||||||.|||||||||||.|||.||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TATGATGGTCAACAGCCTGTGCTGGCTATCACAGATCCTGACATGATCAAAACAGTGCTAGTGAAAGAATGTTA  296

Query  297  TTCTGTCTTCACAAATCGAAGGTCTTTAGGCCCAGTGGGATTTATGAAAAGTGCCATCTCTTTAGCTGAGGATG  370
            |||||||||||||||.||.|||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  297  TTCTGTCTTCACAAACCGGAGGCCTTTTGGTCCAGTGGGATTTATGAAAAGTGCCATCTCTATAGCTGAGGATG  370

Query  371  AAGAATGGAAGAGAATACGGTCATTGCTGTCTCCAACCTTCACCAGCGGAAAACTCAAGGAGATGTTCCCCATC  444
            ||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct  371  AAGAATGGAAGAGATTACGATCATTGCTGTCTCCAACCTTCACCAGTGGAAAACTCAAGGAGATGGTCCCTATC  444

Query  445  ATTGCCCAGTATGGAGATGTATTGGTGAGAAACTTGAGGCGGGAAGCAGAGAAAGGCAAGCCTGTCACCTTGAA  518
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTGCCCAGTATGGAGATGTGTTGGTGAGAAATCTGAGGCGGGAAGCAGAGACAGGCAAGCCTGTCACCTTGAA  518

Query  519  AGACATCTTTGGGGCCTACAGCATGGATGTGATTACTGGCACATCATTTGGAGTGAACATCGACTCTCTCAACA  592
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGACGTCTTTGGGGCCTACAGCATGGATGTGATCACTAGCACATCATTTGGAGTGAACATCGACTCTCTCAACA  592

Query  593  ATCCACAAGACCCCTTTGTGGAGAGCACTAAGAAGTTCCTAAAATTTGGTTTCTTAGATCCATTATTTCTCTCA  666
            ||||||||||||||||||||||.|.|||.||||||.|..|||.|||||.|||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct  593  ATCCACAAGACCCCTTTGTGGAAAACACCAAGAAGCTTTTAAGATTTGATTTTTTGGATCCATTCTTTCTCTCA  666

Query  667  ATAATACTCTTTCCATTCCTTACCCCAGTTTTTGAAGCATTAAATGTCTCTCTGTTTCCAA---AAGATACCAT  737
            ||||   |||||||||||||.|.||||.||.||||||.|||||||.|||.|.|||||||||   |||.|||   
Sbjct  667  ATAA---TCTTTCCATTCCTCATCCCAATTCTTGAAGTATTAAATATCTGTGTGTTTCCAAGAGAAGTTAC---  734

Query  738  AAATTTTTTAAGTAAATCTGTAAACAGAATGAAGAAAAGTCGCCTCAACGACAAACAAAAGCACCGACTAGATT  811
            ||||||||||||.|||||||||||.||.|||||..|||||||||||.|.||.|.|||||||||||||.|.||||
Sbjct  735  AAATTTTTTAAGAAAATCTGTAAAAAGGATGAAAGAAAGTCGCCTCGAAGATACACAAAAGCACCGAGTGGATT  808

Query  812  TCCTTCAGCTGATGATTGACTCCCAGAATTCGAAAGAAACTGAGTCCCACAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGCTC  885
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  809  TCCTTCAGCTGATGATTGACTCTCAGAATTCAAAAGAAACTGAGTCCCACAAAGCTCTGTCCGATCTGGAGCTC  882

Query  886  GCAGCCCAGTCAATAATCTTCATTTTTGCTGGCTATGAAACCACCAGCAGTGTTCTTTCCTTCACTTTATATGA  959
            |..|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||.|.|.|||||
Sbjct  883  GTGGCCCAATCAATTATCTTTATTTTTGCTGGCTATGAAACCACGAGCAGTGTTCTCTCCTTCATTATGTATGA  956

Query  960  ACTGGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAAAAGGAGATTGATGCAGTTTTGCCCAATAAGGCACCAC  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  957  ACTGGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAGGAGGAAATTGATGCAGTTTTACCCAATAAGGCACCAC  1030

Query 1034  CTACCTATGATGCCGTGGTACAGATGGAGTACCTTGACATGGTGGTGAATGAAACACTCAGATTATTCCCAGTT  1107
            |.|||||||||.|.|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||
Sbjct 1031  CCACCTATGATACTGTGCTACAGATGGAGTATCTTGACATGGTGGTGAATGAAACGCTCAGATTATTCCCAATT  1104

Query 1108  GCTATTAGACTTGAGAGGACTTGCAAGAAAGATGTTGAAATCAATGGGGTATTCATTCCCAAAGGGTCAATGGT  1181
            |||||.||||||||||||...|||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||....||||
Sbjct 1105  GCTATGAGACTTGAGAGGGTCTGCAAAAAAGATGTTGAGATCAATGGGATGTTCATTCCCAAAGGGGTGGTGGT  1178

Query 1182  GGTGATTCCAACTTATGCTCTTCACCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGGAGTTCCGCCCTGAAAGGT  1255
            |.|||||||||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||.|
Sbjct 1179  GATGATTCCAAGCTATGCTCTTCACCGTGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCCTCCCTGAAAGAT  1252

Query 1256  TCAGTAAGAAG---AAGGACAGCATAGATCCTTACATATACACACCCTTTGGAACTGGACCCAGAAACTGCATT  1326
            ||||.||||||   |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1253  TCAGCAAGAAGAACAAGGACAACATAGATCCTTACATATACACACCCTTTGGAAGTGGACCCAGAAACTGCATT  1326

Query 1327  GGCATGAGGTTTGCTCTCATGAACATGAAACTTGCTCTAATCAGAGTCCTTCAGAACTTCTCCTTCAAACCTTG  1400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327  GGCATGAGGTTTGCTCTCATGAACATGAAACTTGCTCTAATCAGAGTCCTTCAGAACTTCTCCTTCAAACCTTG  1400

Query 1401  TAAAGAAACACAGATCCCCTTGAAATTAGAC--ACGCAAGGACTTCTTCAACCAGAAAAACCCATTGTTCTAAA  1472
            |||||||||||||||||||.||||||||..|  |.|  |||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1401  TAAAGAAACACAGATCCCCCTGAAATTAAGCTTAGG--AGGACTTCTTCAACCAGAAAAACCCGTTGTTCTAAA  1472

Query 1473  GGTGGATTCAAGAGATGGAACCCTAAGTGGAGAA  1506
            |||.||.|||||.|||||.|||.|||||||||..
Sbjct 1473  GGTTGAGTCAAGGGATGGCACCGTAAGTGGAGCC  1506