Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468230
• Subject: NM_001291829.2
• Aligned Length: 1506
• Identities: 1167
• Gaps: 339

Alignment

Query    1  ATGGACCTCATCCCAAATTTGGCGGTGGAAACCTGGCTTCTCCTGGCTGTCAGCCTGGTGCTCCTCTATCTATA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGGGACCCGTACACATGGACTTTTTAAGAGACTGGGAATTCCAGGGCCCACACCTCTGCCTTTGTTGGGAAATG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTTTGTCCTATCGTCAGGGTCTCTGGAAATTTGACACAGAGTGCTATAAAAAGTATGGAAAAATGTGGGGAACG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TATGAAGGTCAACTCCCTGTGCTGGCCATCACAGATCCCGACGTGATCAGAACAGTGCTAGTGAAAGAATGTTA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TTCTGTCTTCACAAATCGAAGGTCTTTAGGCCCAGTGGGATTTATGAAAAGTGCCATCTCTTTAGCTGAGGATG  370
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------ATGAAAAGTGCCATCTCTTTAGCTGAGGATG  31

Query  371  AAGAATGGAAGAGAATACGGTCATTGCTGTCTCCAACCTTCACCAGCGGAAAACTCAAGGAGATGTTCCCCATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   32  AAGAATGGAAGAGAATACGGTCATTGCTGTCTCCAACCTTCACCAGCGGAAAACTCAAGGAGATGTTCCCCATC  105

Query  445  ATTGCCCAGTATGGAGATGTATTGGTGAGAAACTTGAGGCGGGAAGCAGAGAAAGGCAAGCCTGTCACCTTGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  106  ATTGCCCAGTATGGAGATGTATTGGTGAGAAACTTGAGGCGGGAAGCAGAGAAAGGCAAGCCTGTCACCTTGAA  179

Query  519  AGACATCTTTGGGGCCTACAGCATGGATGTGATTACTGGCACATCATTTGGAGTGAACATCGACTCTCTCAACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  180  AGACATCTTTGGGGCCTACAGCATGGATGTGATTACTGGCACATCATTTGGAGTGAACATCGACTCTCTCAACA  253

Query  593  ATCCACAAGACCCCTTTGTGGAGAGCACTAAGAAGTTCCTAAAATTTGGTTTCTTAGATCCATTATTTCTCTCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  254  ATCCACAAGACCCCTTTGTGGAGAGCACTAAGAAGTTCCTAAAATTTGGTTTCTTAGATCCATTATTTCTCTCA  327

Query  667  ATAATACTCTTTCCATTCCTTACCCCAGTTTTTGAAGCATTAAATGTCTCTCTGTTTCCAAAAGATACCATAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  328  ATAATACTCTTTCCATTCCTTACCCCAGTTTTTGAAGCATTAAATGTCTCTCTGTTTCCAAAAGATACCATAAA  401

Query  741  TTTTTTAAGTAAATCTGTAAACAGAATGAAGAAAAGTCGCCTCAACGACAAACAAAAGCACCGACTAGATTTCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  402  TTTTTTAAGTAAATCTGTAAACAGAATGAAGAAAAGTCGCCTCAACGACAAACAAAAGCACCGACTAGATTTCC  475

Query  815  TTCAGCTGATGATTGACTCCCAGAATTCGAAAGAAACTGAGTCCCACAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGCTCGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  476  TTCAGCTGATGATTGACTCCCAGAATTCGAAAGAAACTGAGTCCCACAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGCTCGCA  549

Query  889  GCCCAGTCAATAATCTTCATTTTTGCTGGCTATGAAACCACCAGCAGTGTTCTTTCCTTCACTTTATATGAACT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  550  GCCCAGTCAATAATCTTCATTTTTGCTGGCTATGAAACCACCAGCAGTGTTCTTTCCTTCACTTTATATGAACT  623

Query  963  GGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAAAAGGAGATTGATGCAGTTTTGCCCAATAAGGCACCACCTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  624  GGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAAAAGGAGATTGATGCAGTTTTGCCCAATAAGGCACCACCTA  697

Query 1037  CCTATGATGCCGTGGTACAGATGGAGTACCTTGACATGGTGGTGAATGAAACACTCAGATTATTCCCAGTTGCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  698  CCTATGATGCCGTGGTACAGATGGAGTACCTTGACATGGTGGTGAATGAAACACTCAGATTATTCCCAGTTGCT  771

Query 1111  ATTAGACTTGAGAGGACTTGCAAGAAAGATGTTGAAATCAATGGGGTATTCATTCCCAAAGGGTCAATGGTGGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  772  ATTAGACTTGAGAGGACTTGCAAGAAAGATGTTGAAATCAATGGGGTATTCATTCCCAAAGGGTCAATGGTGGT  845

Query 1185  GATTCCAACTTATGCTCTTCACCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGGAGTTCCGCCCTGAAAGGTTCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  846  GATTCCAACTTATGCTCTTCACCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGGAGTTCCGCCCTGAAAGGTTCA  919

Query 1259  GTAAGAAGAAGGACAGCATAGATCCTTACATATACACACCCTTTGGAACTGGACCCAGAAACTGCATTGGCATG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  920  GTAAGAAGAAGGACAGCATAGATCCTTACATATACACACCCTTTGGAACTGGACCCAGAAACTGCATTGGCATG  993

Query 1333  AGGTTTGCTCTCATGAACATGAAACTTGCTCTAATCAGAGTCCTTCAGAACTTCTCCTTCAAACCTTGTAAAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  994  AGGTTTGCTCTCATGAACATGAAACTTGCTCTAATCAGAGTCCTTCAGAACTTCTCCTTCAAACCTTGTAAAGA  1067

Query 1407  AACACAGATCCCCTTGAAATTAGACACGCAAGGACTTCTTCAACCAGAAAAACCCATTGTTCTAAAGGTGGATT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068  AACACAGATCCCCTTGAAATTAGACACGCAAGGACTTCTTCAACCAGAAAAACCCATTGTTCTAAAGGTGGATT  1141

Query 1481  CAAGAGATGGAACCCTAAGTGGAGAA  1506
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1142  CAAGAGATGGAACCCTAAGTGGAGAA  1167